EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGMOG00000018772 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: papolg
Alias: zgc:63762
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Gadus_morhua
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 12446 bases
Position: chrGeneScaffold_120:114286-126731
Accession: ZDB-GENE-040426-1256
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGMOP00000020173	PAP_RNA-bind	PF04926.15	6.6e-29	1	2
ENSGMOP00000020173	PAP_RNA-bind	PF04926.15	6.6e-29	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGMOT00000020671	-	1998	-	ENSGMOP00000020173	666 (aa)	-	UPI00023F408D

Gene Model

Click here to download ENSGMOG00000018772's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSGMOG00000018772's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGMOG00000018772	papolg	52	72.779	ENSGMOG00000010209	papola	61	77.358

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGMOG00000018772	papolg	92	84.095	ENSG00000115421	PAPOLG	100	87.179	Homo_sapiens
ENSGMOG00000018772	papolg	94	93.896	ENSAPOG00000004798	papolg	99	83.504	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGMOG00000018772	papolg	92	83.486	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	87	83.486	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGMOG00000018772	papolg	94	93.716	ENSACIG00000010546	papolg	89	93.716	Amphilophus_citrinellus
ENSGMOG00000018772	papolg	94	93.716	ENSAOCG00000010254	papolg	79	93.716	Amphiprion_ocellaris
ENSGMOG00000018772	papolg	94	93.896	ENSAPEG00000006944	papolg	79	93.896	Amphiprion_percula
ENSGMOG00000018772	papolg	94	93.896	ENSATEG00000009007	papolg	79	95.582	Anabas_testudineus
ENSGMOG00000018772	papolg	92	78.716	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	86	78.165	Anas_platyrhynchos
ENSGMOG00000018772	papolg	72	71.913	ENSACAG00000015048	-	83	71.913	Anolis_carolinensis
ENSGMOG00000018772	papolg	92	83.547	ENSANAG00000024627	PAPOLG	87	83.547	Aotus_nancymaae
ENSGMOG00000018772	papolg	94	93.357	ENSACLG00000015592	papolg	78	93.357	Astatotilapia_calliptera
ENSGMOG00000018772	papolg	94	89.388	ENSAMXG00000004611	papolg	88	89.388	Astyanax_mexicanus
ENSGMOG00000018772	papolg	93	82.671	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	87	82.671	Bos_taurus
ENSGMOG00000018772	papolg	92	83.729	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	87	83.729	Callithrix_jacchus
ENSGMOG00000018772	papolg	92	82.671	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	75	82.671	Canis_familiaris
ENSGMOG00000018772	papolg	93	82.852	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	88	83.456	Canis_lupus_dingo
ENSGMOG00000018772	papolg	93	82.671	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	87	82.671	Capra_hircus
ENSGMOG00000018772	papolg	93	82.554	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	87	82.554	Carlito_syrichta
ENSGMOG00000018772	papolg	57	81.102	ENSCAPG00000014901	-	100	81.102	Cavia_aperea
ENSGMOG00000018772	papolg	93	82.852	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	87	82.852	Cavia_porcellus
ENSGMOG00000018772	papolg	92	83.912	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	87	83.912	Cebus_capucinus
ENSGMOG00000018772	papolg	82	82.927	ENSCATG00000044395	PAPOLG	85	82.927	Cercocebus_atys
ENSGMOG00000018772	papolg	92	83.032	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	83	83.032	Chinchilla_lanigera
ENSGMOG00000018772	papolg	92	83.547	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	87	83.547	Chlorocebus_sabaeus
ENSGMOG00000018772	papolg	80	82.627	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	80	82.627	Choloepus_hoffmanni
ENSGMOG00000018772	papolg	74	63.618	ENSCING00000024664	-	91	63.618	Ciona_intestinalis
ENSGMOG00000018772	papolg	73	64.742	ENSCSAVG00000009085	-	97	64.742	Ciona_savignyi
ENSGMOG00000018772	papolg	92	83.547	ENSCANG00000038120	PAPOLG	87	83.547	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGMOG00000018772	papolg	92	83.119	ENSCGRG00001014951	Papolg	87	83.119	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGMOG00000018772	papolg	92	83.119	ENSCGRG00000005552	-	87	83.119	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGMOG00000018772	papolg	100	82.270	ENSCSEG00000000771	papolg	99	82.270	Cynoglossus_semilaevis
ENSGMOG00000018772	papolg	93	92.139	ENSCVAG00000016602	papolg	92	91.845	Cyprinodon_variegatus
ENSGMOG00000018772	papolg	93	89.388	ENSDARG00000012141	papolg	88	89.388	Danio_rerio
ENSGMOG00000018772	papolg	93	79.710	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	87	79.710	Dasypus_novemcinctus
ENSGMOG00000018772	papolg	64	85.315	ENSDORG00000016228	Papolg	100	85.315	Dipodomys_ordii
ENSGMOG00000018772	papolg	90	71.429	ENSETEG00000011815	PAPOLG	81	71.429	Echinops_telfairi
ENSGMOG00000018772	papolg	68	58.901	ENSEBUG00000005042	-	77	58.901	Eptatretus_burgeri
ENSGMOG00000018772	papolg	65	71.615	ENSEBUG00000004020	papolg	77	71.615	Eptatretus_burgeri
ENSGMOG00000018772	papolg	93	83.032	ENSEASG00005002038	PAPOLG	87	83.032	Equus_asinus_asinus
ENSGMOG00000018772	papolg	93	83.032	ENSECAG00000009859	PAPOLG	85	83.486	Equus_caballus
ENSGMOG00000018772	papolg	90	73.285	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	87	73.285	Erinaceus_europaeus
ENSGMOG00000018772	papolg	93	90.991	ENSELUG00000014497	papolg	79	90.991	Esox_lucius
ENSGMOG00000018772	papolg	93	82.852	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	87	82.852	Felis_catus
ENSGMOG00000018772	papolg	87	72.420	ENSFALG00000011079	PAPOLG	76	72.420	Ficedula_albicollis
ENSGMOG00000018772	papolg	93	83.333	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	84	83.333	Fukomys_damarensis
ENSGMOG00000018772	papolg	57	93.204	ENSFHEG00000019080	papolg	74	93.204	Fundulus_heteroclitus
ENSGMOG00000018772	papolg	92	75.229	ENSGALG00000007853	PAPOLG	86	74.589	Gallus_gallus
ENSGMOG00000018772	papolg	94	92.599	ENSGAFG00000003263	papolg	77	92.599	Gambusia_affinis
ENSGMOG00000018772	papolg	94	94.075	ENSGACG00000002718	papolg	88	94.075	Gasterosteus_aculeatus
ENSGMOG00000018772	papolg	92	83.729	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	87	83.729	Gorilla_gorilla
ENSGMOG00000018772	papolg	94	93.357	ENSHBUG00000004882	papolg	78	93.357	Haplochromis_burtoni
ENSGMOG00000018772	papolg	91	83.853	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	82	83.853	Heterocephalus_glaber_female
ENSGMOG00000018772	papolg	92	83.394	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	83	83.394	Heterocephalus_glaber_male
ENSGMOG00000018772	papolg	94	93.345	ENSHCOG00000006782	papolg	89	79.642	Hippocampus_comes
ENSGMOG00000018772	papolg	93	88.768	ENSIPUG00000021642	papolg	90	88.768	Ictalurus_punctatus
ENSGMOG00000018772	papolg	93	83.333	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	87	83.333	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGMOG00000018772	papolg	64	85.548	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	85.548	Jaculus_jaculus
ENSGMOG00000018772	papolg	92	92.714	ENSKMAG00000016439	papolg	85	92.714	Kryptolebias_marmoratus
ENSGMOG00000018772	papolg	94	93.548	ENSLBEG00000023218	papolg	75	93.548	Labrus_bergylta
ENSGMOG00000018772	papolg	91	77.052	ENSLACG00000009543	PAPOLG	84	77.052	Latimeria_chalumnae
ENSGMOG00000018772	papolg	93	88.989	ENSLOCG00000016130	papolg	86	88.989	Lepisosteus_oculatus
ENSGMOG00000018772	papolg	93	82.374	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	85.082	Loxodonta_africana
ENSGMOG00000018772	papolg	92	83.729	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	87	83.729	Macaca_fascicularis
ENSGMOG00000018772	papolg	92	83.729	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	87	83.729	Macaca_mulatta
ENSGMOG00000018772	papolg	92	73.599	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	86	73.599	Macaca_nemestrina
ENSGMOG00000018772	papolg	92	83.729	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	87	83.729	Mandrillus_leucophaeus
ENSGMOG00000018772	papolg	94	92.998	ENSMAMG00000010667	papolg	99	80.918	Mastacembelus_armatus
ENSGMOG00000018772	papolg	94	93.357	ENSMZEG00005018140	papolg	89	93.796	Maylandia_zebra
ENSGMOG00000018772	papolg	93	74.270	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	87	73.905	Meleagris_gallopavo
ENSGMOG00000018772	papolg	91	84.037	ENSMAUG00000009088	Papolg	82	84.037	Mesocricetus_auratus
ENSGMOG00000018772	papolg	93	83.152	ENSMICG00000010042	PAPOLG	88	83.032	Microcebus_murinus
ENSGMOG00000018772	papolg	92	83.514	ENSMOCG00000006857	Papolg	82	83.514	Microtus_ochrogaster
ENSGMOG00000018772	papolg	94	92.948	ENSMMOG00000008020	papolg	88	92.948	Mola_mola
ENSGMOG00000018772	papolg	91	83.738	ENSMODG00000002160	PAPOLG	84	83.738	Monodelphis_domestica
ENSGMOG00000018772	papolg	94	92.460	ENSMALG00000007012	papolg	79	92.460	Monopterus_albus
ENSGMOG00000018772	papolg	92	83.213	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	86.150	Mus_caroli
ENSGMOG00000018772	papolg	92	83.213	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	86.150	Mus_musculus
ENSGMOG00000018772	papolg	92	82.491	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	83	82.936	Mus_pahari
ENSGMOG00000018772	papolg	92	83.032	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	86.150	Mus_spretus
ENSGMOG00000018772	papolg	92	82.852	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	75	82.852	Mustela_putorius_furo
ENSGMOG00000018772	papolg	92	83.794	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	87	83.794	Myotis_lucifugus
ENSGMOG00000018772	papolg	93	83.032	ENSNGAG00000001120	Papolg	87	83.032	Nannospalax_galili
ENSGMOG00000018772	papolg	94	81.149	ENSNBRG00000011943	papolg	87	81.149	Neolamprologus_brichardi
ENSGMOG00000018772	papolg	64	85.315	ENSNLEG00000009507	-	100	85.315	Nomascus_leucogenys
ENSGMOG00000018772	papolg	69	68.987	ENSMEUG00000013605	-	67	68.987	Notamacropus_eugenii
ENSGMOG00000018772	papolg	93	82.491	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	87	82.491	Ochotona_princeps
ENSGMOG00000018772	papolg	63	83.693	ENSODEG00000012424	PAPOLG	98	83.693	Octodon_degus
ENSGMOG00000018772	papolg	94	83.184	ENSONIG00000002985	papolg	90	83.184	Oreochromis_niloticus
ENSGMOG00000018772	papolg	91	83.769	ENSOANG00000012403	PAPOLG	84	83.769	Ornithorhynchus_anatinus
ENSGMOG00000018772	papolg	93	82.852	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	87	82.852	Oryctolagus_cuniculus
ENSGMOG00000018772	papolg	92	92.168	ENSORLG00000001577	papolg	89	76.716	Oryzias_latipes
ENSGMOG00000018772	papolg	92	92.350	ENSORLG00020002482	papolg	89	77.193	Oryzias_latipes_hni
ENSGMOG00000018772	papolg	92	92.350	ENSORLG00015008836	papolg	89	76.716	Oryzias_latipes_hsok
ENSGMOG00000018772	papolg	92	92.153	ENSOMEG00000001406	papolg	77	92.153	Oryzias_melastigma
ENSGMOG00000018772	papolg	93	82.671	ENSOARG00000001563	PAPOLG	79	82.671	Ovis_aries
ENSGMOG00000018772	papolg	92	84.095	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	87	84.095	Pan_paniscus
ENSGMOG00000018772	papolg	93	82.852	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	87	82.852	Panthera_pardus
ENSGMOG00000018772	papolg	93	82.671	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	87	82.671	Panthera_tigris_altaica
ENSGMOG00000018772	papolg	92	84.095	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	87	84.095	Pan_troglodytes
ENSGMOG00000018772	papolg	92	79.053	ENSPANG00000014543	PAPOLG	87	79.053	Papio_anubis
ENSGMOG00000018772	papolg	83	86.691	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	80	86.691	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGMOG00000018772	papolg	93	86.847	ENSPKIG00000003313	papolg	88	86.847	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGMOG00000018772	papolg	90	80.935	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	84	80.935	Pelodiscus_sinensis
ENSGMOG00000018772	papolg	91	83.978	ENSPEMG00000008960	-	83	83.978	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGMOG00000018772	papolg	74	64.056	ENSPMAG00000004864	-	98	64.056	Petromyzon_marinus
ENSGMOG00000018772	papolg	80	63.206	ENSPMAG00000002961	papolg	72	62.523	Petromyzon_marinus
ENSGMOG00000018772	papolg	93	83.364	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	86	83.364	Phascolarctos_cinereus
ENSGMOG00000018772	papolg	94	92.639	ENSPFOG00000012909	papolg	86	93.236	Poecilia_formosa
ENSGMOG00000018772	papolg	94	92.639	ENSPLAG00000018445	papolg	78	92.639	Poecilia_latipinna
ENSGMOG00000018772	papolg	94	92.639	ENSPMEG00000003961	papolg	78	92.639	Poecilia_mexicana
ENSGMOG00000018772	papolg	94	92.101	ENSPREG00000010358	papolg	78	92.101	Poecilia_reticulata
ENSGMOG00000018772	papolg	92	83.729	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	87	83.729	Pongo_abelii
ENSGMOG00000018772	papolg	81	83.015	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	73	82.489	Procavia_capensis
ENSGMOG00000018772	papolg	83	77.174	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	89	77.174	Propithecus_coquereli
ENSGMOG00000018772	papolg	90	80.501	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	82	80.501	Pteropus_vampyrus
ENSGMOG00000018772	papolg	94	93.357	ENSPNYG00000006729	papolg	99	82.225	Pundamilia_nyererei
ENSGMOG00000018772	papolg	94	88.710	ENSPNAG00000015521	papolg	89	88.571	Pygocentrus_nattereri
ENSGMOG00000018772	papolg	93	83.032	ENSRNOG00000006261	Papolg	87	83.032	Rattus_norvegicus
ENSGMOG00000018772	papolg	92	77.331	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	86	77.331	Rhinopithecus_bieti
ENSGMOG00000018772	papolg	92	83.729	ENSRROG00000035954	PAPOLG	87	83.729	Rhinopithecus_roxellana
ENSGMOG00000018772	papolg	92	83.912	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	87	83.912	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGMOG00000018772	papolg	86	85.119	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	84	85.119	Sarcophilus_harrisii
ENSGMOG00000018772	papolg	83	78.175	ENSSFOG00015011874	papolg	90	78.175	Scleropages_formosus
ENSGMOG00000018772	papolg	94	85.432	ENSSFOG00015002383	papolg	100	73.631	Scleropages_formosus
ENSGMOG00000018772	papolg	94	92.171	ENSSMAG00000015598	papolg	81	92.349	Scophthalmus_maximus
ENSGMOG00000018772	papolg	94	93.537	ENSSDUG00000000912	papolg	99	83.724	Seriola_dumerili
ENSGMOG00000018772	papolg	94	93.537	ENSSLDG00000001217	papolg	89	88.889	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGMOG00000018772	papolg	92	81.685	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	85	81.685	Sphenodon_punctatus
ENSGMOG00000018772	papolg	94	93.716	ENSSPAG00000009004	papolg	99	82.754	Stegastes_partitus
ENSGMOG00000018772	papolg	93	83.032	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	87	83.032	Sus_scrofa
ENSGMOG00000018772	papolg	80	71.857	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	98	71.857	Taeniopygia_guttata
ENSGMOG00000018772	papolg	100	79.888	ENSTRUG00000006410	papolg	99	79.888	Takifugu_rubripes
ENSGMOG00000018772	papolg	94	85.284	ENSTNIG00000017106	papolg	90	85.284	Tetraodon_nigroviridis
ENSGMOG00000018772	papolg	92	76.697	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	74	76.697	Tupaia_belangeri
ENSGMOG00000018772	papolg	93	77.617	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	87	77.617	Tursiops_truncatus
ENSGMOG00000018772	papolg	93	83.032	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	87	83.486	Ursus_americanus
ENSGMOG00000018772	papolg	92	83.486	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	79	83.486	Ursus_maritimus
ENSGMOG00000018772	papolg	91	79.705	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	87	79.266	Vicugna_pacos
ENSGMOG00000018772	papolg	93	83.032	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	82	83.032	Vulpes_vulpes
ENSGMOG00000018772	papolg	94	78.058	ENSXETG00000002208	papolg	87	78.058	Xenopus_tropicalis
ENSGMOG00000018772	papolg	76	92.490	ENSXCOG00000006611	papolg	74	92.490	Xiphophorus_couchianus
ENSGMOG00000018772	papolg	84	89.941	ENSXMAG00000007383	papolg	97	89.941	Xiphophorus_maculatus