EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGMOG00000019138 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: syf2
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: SYF2 pre-mRNA-splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Gadus_morhua
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4869 bases
Position: chrGeneScaffold_1441:1111942-1116810
Accession: ZDB-GENE-040801-170
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGMOP00000020585	SYF2	PF08231.12	2.2e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGMOT00000021087	-	675	-	ENSGMOP00000020585	224 (aa)	-	UPI00023F43F8

Gene Model

Click here to download ENSGMOG00000019138's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSGMOG00000019138's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.186	ENSG00000117614	SYF2	90	83.028	Homo_sapiens
ENSGMOG00000019138	syf2	96	91.628	ENSAPOG00000001174	syf2	90	91.628	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGMOG00000019138	syf2	97	82.110	ENSAMEG00000010115	-	90	82.110	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGMOG00000019138	syf2	87	83.590	ENSAMEG00000010134	-	100	83.590	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGMOG00000019138	syf2	96	88.837	ENSACIG00000023688	syf2	86	88.837	Amphilophus_citrinellus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	92.093	ENSAOCG00000022046	syf2	91	92.093	Amphiprion_ocellaris
ENSGMOG00000019138	syf2	88	91.414	ENSAOCG00000010912	syf2	62	91.414	Amphiprion_ocellaris
ENSGMOG00000019138	syf2	96	92.093	ENSAPEG00000018858	syf2	83	92.093	Amphiprion_percula
ENSGMOG00000019138	syf2	96	89.767	ENSATEG00000007745	syf2	90	89.767	Anabas_testudineus
ENSGMOG00000019138	syf2	89	81.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	81.000	Anas_platyrhynchos
ENSGMOG00000019138	syf2	91	80.882	ENSACAG00000013653	-	100	80.882	Anolis_carolinensis
ENSGMOG00000019138	syf2	74	68.263	ENSACAG00000026777	-	100	68.263	Anolis_carolinensis
ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.651	ENSANAG00000032473	SYF2	88	84.651	Aotus_nancymaae
ENSGMOG00000019138	syf2	96	88.837	ENSACLG00000019916	syf2	90	88.837	Astatotilapia_calliptera
ENSGMOG00000019138	syf2	96	89.302	ENSAMXG00000004051	syf2	90	89.302	Astyanax_mexicanus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.186	ENSBTAG00000001651	SYF2	91	84.186	Bos_taurus
ENSGMOG00000019138	syf2	93	53.081	WBGene00019402	syf-2	90	52.830	Caenorhabditis_elegans
ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.651	ENSCJAG00000046570	SYF2	90	83.486	Callithrix_jacchus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	83.256	ENSCAFG00000012895	-	89	82.110	Canis_familiaris
ENSGMOG00000019138	syf2	93	78.947	ENSCAFG00000030331	-	92	78.947	Canis_familiaris
ENSGMOG00000019138	syf2	96	83.256	ENSCAFG00020021091	-	89	82.110	Canis_lupus_dingo
ENSGMOG00000019138	syf2	81	75.275	ENSCAFG00020021094	-	95	75.275	Canis_lupus_dingo
ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.186	ENSCHIG00000020874	SYF2	90	83.028	Capra_hircus
ENSGMOG00000019138	syf2	97	82.569	ENSTSYG00000005114	SYF2	90	82.569	Carlito_syrichta
ENSGMOG00000019138	syf2	88	83.333	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	83.333	Cavia_aperea
ENSGMOG00000019138	syf2	96	83.721	ENSCPOG00000005326	SYF2	88	83.721	Cavia_porcellus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.651	ENSCCAG00000022459	SYF2	90	83.486	Cebus_capucinus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	83.721	ENSCATG00000026917	SYF2	88	83.721	Cercocebus_atys
ENSGMOG00000019138	syf2	97	83.945	ENSCLAG00000008474	SYF2	89	83.945	Chinchilla_lanigera
ENSGMOG00000019138	syf2	96	83.721	ENSCSAG00000000948	SYF2	88	83.721	Chlorocebus_sabaeus
ENSGMOG00000019138	syf2	72	65.432	ENSCHOG00000005273	-	89	65.432	Choloepus_hoffmanni
ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.651	ENSCPBG00000025073	SYF2	87	84.651	Chrysemys_picta_bellii
ENSGMOG00000019138	syf2	94	54.930	ENSCING00000003017	-	89	55.399	Ciona_intestinalis
ENSGMOG00000019138	syf2	94	51.174	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.174	Ciona_savignyi
ENSGMOG00000019138	syf2	96	73.488	ENSCANG00000037322	SYF2	88	72.477	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	85.116	ENSCGRG00001020733	Syf2	90	83.945	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGMOG00000019138	syf2	88	85.204	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	84.925	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGMOG00000019138	syf2	96	86.512	ENSCSEG00000000117	syf2	90	86.512	Cynoglossus_semilaevis
ENSGMOG00000019138	syf2	96	87.442	ENSCVAG00000019543	syf2	90	87.442	Cyprinodon_variegatus
ENSGMOG00000019138	syf2	97	87.156	ENSDARG00000004706	syf2	92	87.156	Danio_rerio
ENSGMOG00000019138	syf2	97	83.945	ENSDNOG00000047605	SYF2	89	83.945	Dasypus_novemcinctus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	85.116	ENSDORG00000001274	Syf2	89	83.945	Dipodomys_ordii
ENSGMOG00000019138	syf2	97	57.534	FBgn0033556	CG12343	96	57.534	Drosophila_melanogaster
ENSGMOG00000019138	syf2	91	69.118	ENSETEG00000015729	SYF2	89	69.118	Echinops_telfairi
ENSGMOG00000019138	syf2	88	58.883	ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.883	Eptatretus_burgeri
ENSGMOG00000019138	syf2	99	82.805	ENSEASG00005004224	-	90	82.805	Equus_asinus_asinus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	76.744	ENSEASG00005004232	-	90	75.688	Equus_asinus_asinus
ENSGMOG00000019138	syf2	100	82.143	ENSECAG00000010440	-	94	82.143	Equus_caballus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.651	ENSECAG00000012023	-	88	84.651	Equus_caballus
ENSGMOG00000019138	syf2	69	72.727	ENSEEUG00000015084	SYF2	86	71.338	Erinaceus_europaeus
ENSGMOG00000019138	syf2	98	90.045	ENSELUG00000003465	syf2	93	90.045	Esox_lucius
ENSGMOG00000019138	syf2	97	83.028	ENSFCAG00000043095	-	89	83.028	Felis_catus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.651	ENSFCAG00000010324	-	74	84.651	Felis_catus
ENSGMOG00000019138	syf2	91	78.922	ENSFALG00000000460	SYF2	87	78.605	Ficedula_albicollis
ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.186	ENSFDAG00000008310	SYF2	90	83.028	Fukomys_damarensis
ENSGMOG00000019138	syf2	96	72.222	ENSFHEG00000007238	syf2	96	72.222	Fundulus_heteroclitus
ENSGMOG00000019138	syf2	98	80.365	ENSGALG00000013639	SYF2	87	80.365	Gallus_gallus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	86.512	ENSGAFG00000019435	syf2	90	86.512	Gambusia_affinis
ENSGMOG00000019138	syf2	96	90.233	ENSGACG00000007305	syf2	90	90.233	Gasterosteus_aculeatus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.651	ENSGAGG00000010670	SYF2	87	84.651	Gopherus_agassizii
ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.186	ENSGGOG00000012796	SYF2	90	83.028	Gorilla_gorilla
ENSGMOG00000019138	syf2	96	88.837	ENSHBUG00000020477	syf2	92	88.837	Haplochromis_burtoni
ENSGMOG00000019138	syf2	96	72.558	ENSHGLG00000004304	-	89	73.023	Heterocephalus_glaber_female
ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.186	ENSHGLG00000014393	SYF2	89	83.028	Heterocephalus_glaber_female
ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.186	ENSHGLG00100014722	SYF2	89	83.028	Heterocephalus_glaber_male
ENSGMOG00000019138	syf2	96	89.815	ENSHCOG00000012904	syf2	71	89.815	Hippocampus_comes
ENSGMOG00000019138	syf2	98	87.273	ENSIPUG00000019859	syf2	92	87.273	Ictalurus_punctatus
ENSGMOG00000019138	syf2	65	78.767	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	78.767	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGMOG00000019138	syf2	89	84.422	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	84.422	Jaculus_jaculus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	88.372	ENSKMAG00000013856	syf2	91	88.372	Kryptolebias_marmoratus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	89.767	ENSLBEG00000014425	syf2	90	89.767	Labrus_bergylta
ENSGMOG00000019138	syf2	98	82.192	ENSLACG00000012064	SYF2	92	82.192	Latimeria_chalumnae
ENSGMOG00000019138	syf2	98	86.758	ENSLOCG00000002728	syf2	87	86.758	Lepisosteus_oculatus
ENSGMOG00000019138	syf2	82	57.065	ENSLAFG00000030814	-	100	57.065	Loxodonta_africana
ENSGMOG00000019138	syf2	97	84.404	ENSLAFG00000023150	-	89	84.404	Loxodonta_africana
ENSGMOG00000019138	syf2	96	83.721	ENSMFAG00000041831	SYF2	90	82.569	Macaca_fascicularis
ENSGMOG00000019138	syf2	96	83.721	ENSMMUG00000002968	SYF2	90	82.569	Macaca_mulatta
ENSGMOG00000019138	syf2	96	83.721	ENSMNEG00000030180	SYF2	90	82.569	Macaca_nemestrina
ENSGMOG00000019138	syf2	96	83.721	ENSMLEG00000030248	SYF2	88	83.721	Mandrillus_leucophaeus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	89.767	ENSMAMG00000010403	syf2	91	88.128	Mastacembelus_armatus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	88.837	ENSMZEG00005006429	syf2	90	88.837	Maylandia_zebra
ENSGMOG00000019138	syf2	89	81.407	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	81.407	Meleagris_gallopavo
ENSGMOG00000019138	syf2	97	84.404	ENSMAUG00000018974	Syf2	90	84.404	Mesocricetus_auratus
ENSGMOG00000019138	syf2	89	84.422	ENSMICG00000016191	SYF2	100	84.422	Microcebus_murinus
ENSGMOG00000019138	syf2	97	84.862	ENSMOCG00000022938	Syf2	90	84.862	Microtus_ochrogaster
ENSGMOG00000019138	syf2	96	89.302	ENSMMOG00000002396	syf2	90	89.302	Mola_mola
ENSGMOG00000019138	syf2	97	78.182	ENSMODG00000013951	-	96	78.182	Monodelphis_domestica
ENSGMOG00000019138	syf2	96	88.889	ENSMALG00000010706	syf2	90	89.352	Monopterus_albus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	86.512	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	90	85.321	Mus_caroli
ENSGMOG00000019138	syf2	96	86.512	ENSMUSG00000028821	Syf2	90	85.321	Mus_musculus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	86.512	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	90	85.321	Mus_pahari
ENSGMOG00000019138	syf2	96	86.512	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	90	85.321	Mus_spretus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	83.256	ENSMPUG00000015802	-	89	82.110	Mustela_putorius_furo
ENSGMOG00000019138	syf2	100	79.913	ENSMPUG00000015801	-	93	79.913	Mustela_putorius_furo
ENSGMOG00000019138	syf2	97	82.569	ENSMLUG00000001885	SYF2	89	82.569	Myotis_lucifugus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.651	ENSNGAG00000007912	Syf2	89	83.486	Nannospalax_galili
ENSGMOG00000019138	syf2	99	76.126	ENSNBRG00000010720	syf2	95	76.126	Neolamprologus_brichardi
ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.186	ENSNLEG00000035185	SYF2	90	83.028	Nomascus_leucogenys
ENSGMOG00000019138	syf2	100	78.541	ENSOPRG00000012870	SYF2	96	78.541	Ochotona_princeps
ENSGMOG00000019138	syf2	96	83.256	ENSODEG00000017664	-	92	82.110	Octodon_degus
ENSGMOG00000019138	syf2	97	75.229	ENSODEG00000014338	-	90	75.229	Octodon_degus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	88.372	ENSONIG00000008213	syf2	90	88.372	Oreochromis_niloticus
ENSGMOG00000019138	syf2	90	84.158	ENSOANG00000009552	SYF2	100	84.158	Ornithorhynchus_anatinus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.651	ENSOCUG00000013050	SYF2	89	83.486	Oryctolagus_cuniculus
ENSGMOG00000019138	syf2	100	84.581	ENSORLG00000028820	syf2	97	84.581	Oryzias_latipes
ENSGMOG00000019138	syf2	96	87.907	ENSORLG00020018333	syf2	91	87.907	Oryzias_latipes_hni
ENSGMOG00000019138	syf2	96	87.907	ENSORLG00015014665	syf2	90	87.907	Oryzias_latipes_hsok
ENSGMOG00000019138	syf2	96	88.837	ENSOMEG00000013911	syf2	90	88.837	Oryzias_melastigma
ENSGMOG00000019138	syf2	97	83.945	ENSOGAG00000009962	SYF2	89	83.945	Otolemur_garnettii
ENSGMOG00000019138	syf2	87	58.974	ENSOARG00000006269	-	100	58.462	Ovis_aries
ENSGMOG00000019138	syf2	96	83.410	ENSOARG00000006348	-	88	83.410	Ovis_aries
ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.186	ENSPPAG00000036579	SYF2	90	83.028	Pan_paniscus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.651	ENSPPRG00000001638	-	89	83.486	Panthera_pardus
ENSGMOG00000019138	syf2	97	83.028	ENSPPRG00000001651	-	89	83.028	Panthera_pardus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.651	ENSPTIG00000005711	-	78	84.651	Panthera_tigris_altaica
ENSGMOG00000019138	syf2	97	83.028	ENSPTIG00000007036	-	89	83.028	Panthera_tigris_altaica
ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.186	ENSPTRG00000000352	SYF2	90	83.028	Pan_troglodytes
ENSGMOG00000019138	syf2	96	83.721	ENSPANG00000008139	SYF2	90	82.569	Papio_anubis
ENSGMOG00000019138	syf2	96	87.907	ENSPKIG00000008130	syf2	91	87.907	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGMOG00000019138	syf2	96	82.791	ENSPSIG00000011816	SYF2	84	82.791	Pelodiscus_sinensis
ENSGMOG00000019138	syf2	96	88.837	ENSPMGG00000008755	syf2	84	88.837	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	85.581	ENSPEMG00000008283	Syf2	90	84.404	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGMOG00000019138	syf2	97	82.110	ENSPCIG00000014235	SYF2	87	82.110	Phascolarctos_cinereus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	87.442	ENSPFOG00000004116	syf2	89	87.442	Poecilia_formosa
ENSGMOG00000019138	syf2	96	86.977	ENSPLAG00000006691	syf2	92	86.977	Poecilia_latipinna
ENSGMOG00000019138	syf2	100	81.250	ENSPMEG00000011684	syf2	92	83.256	Poecilia_mexicana
ENSGMOG00000019138	syf2	96	86.977	ENSPREG00000003009	syf2	90	86.977	Poecilia_reticulata
ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.186	ENSPPYG00000001713	SYF2	90	83.028	Pongo_abelii
ENSGMOG00000019138	syf2	96	57.209	ENSPCOG00000027011	SYF2	83	57.209	Propithecus_coquereli
ENSGMOG00000019138	syf2	96	73.953	ENSPVAG00000005841	SYF2	88	73.953	Pteropus_vampyrus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	88.837	ENSPNYG00000004979	syf2	90	88.837	Pundamilia_nyererei
ENSGMOG00000019138	syf2	98	89.041	ENSPNAG00000015570	syf2	92	89.041	Pygocentrus_nattereri
ENSGMOG00000019138	syf2	96	86.512	ENSRNOG00000060597	Syf2	90	85.321	Rattus_norvegicus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	81.395	ENSRBIG00000042970	SYF2	88	81.395	Rhinopithecus_bieti
ENSGMOG00000019138	syf2	96	83.721	ENSRROG00000001347	SYF2	90	82.569	Rhinopithecus_roxellana
ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.186	ENSSBOG00000020184	SYF2	90	83.028	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGMOG00000019138	syf2	96	82.326	ENSSHAG00000015630	-	88	81.193	Sarcophilus_harrisii
ENSGMOG00000019138	syf2	92	82.524	ENSSHAG00000007152	-	100	82.524	Sarcophilus_harrisii
ENSGMOG00000019138	syf2	96	88.372	ENSSFOG00015023647	syf2	91	88.372	Scleropages_formosus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	87.442	ENSSMAG00000009867	syf2	90	87.442	Scophthalmus_maximus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	90.698	ENSSDUG00000013072	syf2	90	90.698	Seriola_dumerili
ENSGMOG00000019138	syf2	96	90.698	ENSSLDG00000012677	syf2	90	90.698	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGMOG00000019138	syf2	96	66.047	ENSSARG00000012889	SYF2	88	66.047	Sorex_araneus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	83.721	ENSSPUG00000005251	SYF2	85	83.721	Sphenodon_punctatus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	90.698	ENSSPAG00000009626	syf2	90	90.698	Stegastes_partitus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.186	ENSSSCG00000037481	SYF2	88	84.186	Sus_scrofa
ENSGMOG00000019138	syf2	67	52.980	ENSTGUG00000001126	SYF2	80	54.321	Taeniopygia_guttata
ENSGMOG00000019138	syf2	96	87.907	ENSTRUG00000001499	syf2	86	87.907	Takifugu_rubripes
ENSGMOG00000019138	syf2	96	85.581	ENSTNIG00000016912	syf2	96	85.581	Tetraodon_nigroviridis
ENSGMOG00000019138	syf2	96	62.791	ENSTBEG00000017370	SYF2	86	62.326	Tupaia_belangeri
ENSGMOG00000019138	syf2	96	83.721	ENSTTRG00000003550	SYF2	89	82.569	Tursiops_truncatus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	82.791	ENSUAMG00000002897	SYF2	87	82.791	Ursus_americanus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	82.791	ENSUMAG00000013108	SYF2	89	81.651	Ursus_maritimus
ENSGMOG00000019138	syf2	96	83.721	ENSVPAG00000005705	SYF2	89	82.569	Vicugna_pacos
ENSGMOG00000019138	syf2	92	82.927	ENSVVUG00000027181	-	87	82.791	Vulpes_vulpes
ENSGMOG00000019138	syf2	96	83.256	ENSVVUG00000027175	-	89	82.110	Vulpes_vulpes
ENSGMOG00000019138	syf2	96	80.930	ENSXETG00000022797	syf2	88	79.817	Xenopus_tropicalis
ENSGMOG00000019138	syf2	96	87.442	ENSXMAG00000022698	syf2	90	87.442	Xiphophorus_maculatus