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Description

Ensembl ID: ENSHBUG00000001525 (Gene tree)
Gene ID: 102300448
Gene Symbol: ago4
Alias: Ago4|eif2c4|fd14f04|wu:fd14f04
Full Name: protein argonaute-4
Gene Type: protein_coding
Species: Haplochromis_burtoni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 23940 bases
Position: chrJH425576.1:329604-353543
Accession: 102300448
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHBUP00000021675	PAZ	PF02170.22	2.2e-28	1	1
ENSHBUP00000000360	PAZ	PF02170.22	2.2e-28	1	1
ENSHBUP00000021679	PAZ	PF02170.22	2.3e-28	1	1
ENSHBUP00000021675	Piwi	PF02171.17	1.2e-105	1	1
ENSHBUP00000000360	Piwi	PF02171.17	1.3e-105	1	1
ENSHBUP00000021679	Piwi	PF02171.17	1.4e-105	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHBUT00000015619	-	7550	-	ENSHBUP00000000360	888 (aa)	-	-
ENSHBUT00000015625	-	7508	XM_005938768	ENSHBUP00000021675	874 (aa)	XP_005938830	UPI00025FB626
ENSHBUT00000015614	-	7625	XM_005938771	ENSHBUP00000021679	913 (aa)	XP_005938833	UPI0003BD223B

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSHBUG00000001525	ago4	99	78.862	ENSHBUG00000018515	ago2	98	81.241
ENSHBUG00000001525	ago4	100	78.822	ENSHBUG00000017794	-	100	78.822
ENSHBUG00000001525	ago4	99	81.401	ENSHBUG00000010459	ago1	98	85.650
ENSHBUG00000001525	ago4	89	77.399	ENSHBUG00000010542	ago3a	97	77.399

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHBUG00000001525	ago4	100	96.224	ENSG00000134698	AGO4	100	96.224	Homo_sapiens
ENSHBUG00000001525	ago4	96	99.881	ENSAPOG00000023867	ago4	99	99.881	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHBUG00000001525	ago4	99	95.757	ENSAMEG00000000573	AGO4	100	95.757	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHBUG00000001525	ago4	92	98.634	ENSACIG00000014548	ago4	100	98.634	Amphilophus_citrinellus
ENSHBUG00000001525	ago4	92	94.161	ENSAPEG00000022426	ago4	100	96.889	Amphiprion_percula
ENSHBUG00000001525	ago4	100	99.886	ENSATEG00000006717	ago4	100	100.000	Anabas_testudineus
ENSHBUG00000001525	ago4	98	96.387	ENSAPLG00000010882	AGO4	100	96.387	Anas_platyrhynchos
ENSHBUG00000001525	ago4	99	95.183	ENSACAG00000017275	AGO4	99	95.183	Anolis_carolinensis
ENSHBUG00000001525	ago4	100	96.110	ENSANAG00000031428	AGO4	100	96.110	Aotus_nancymaae
ENSHBUG00000001525	ago4	100	100.000	ENSACLG00000005181	ago4	100	100.000	Astatotilapia_calliptera
ENSHBUG00000001525	ago4	100	99.657	ENSAMXG00000010318	ago4	100	99.657	Astyanax_mexicanus
ENSHBUG00000001525	ago4	99	95.522	ENSBTAG00000015220	AGO4	99	95.522	Bos_taurus
ENSHBUG00000001525	ago4	100	96.224	ENSCJAG00000001610	AGO4	100	96.224	Callithrix_jacchus
ENSHBUG00000001525	ago4	92	96.398	ENSCAFG00000024306	AGO4	100	96.398	Canis_familiaris
ENSHBUG00000001525	ago4	100	96.339	ENSCHIG00000026564	AGO4	100	96.339	Capra_hircus
ENSHBUG00000001525	ago4	99	96.412	ENSTSYG00000014007	AGO4	99	96.412	Carlito_syrichta
ENSHBUG00000001525	ago4	94	91.087	ENSCAPG00000009369	AGO4	100	91.087	Cavia_aperea
ENSHBUG00000001525	ago4	99	93.814	ENSCPOG00000011557	AGO4	99	93.814	Cavia_porcellus
ENSHBUG00000001525	ago4	100	96.224	ENSCCAG00000001397	AGO4	100	96.224	Cebus_capucinus
ENSHBUG00000001525	ago4	100	96.224	ENSCATG00000043421	AGO4	100	97.674	Cercocebus_atys
ENSHBUG00000001525	ago4	99	96.181	ENSCLAG00000012097	AGO4	99	96.181	Chinchilla_lanigera
ENSHBUG00000001525	ago4	100	96.224	ENSCSAG00000001090	AGO4	100	96.224	Chlorocebus_sabaeus
ENSHBUG00000001525	ago4	87	97.170	ENSCHOG00000006867	AGO4	89	97.170	Choloepus_hoffmanni
ENSHBUG00000001525	ago4	99	96.198	ENSCPBG00000018602	AGO4	98	96.198	Chrysemys_picta_bellii
ENSHBUG00000001525	ago4	99	96.198	ENSCANG00000016914	AGO4	100	96.198	Colobus_angolensis_palliatus
ENSHBUG00000001525	ago4	100	95.652	ENSCGRG00001002701	Ago4	100	95.652	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSHBUG00000001525	ago4	99	95.833	ENSCGRG00000013335	Ago4	99	95.833	Cricetulus_griseus_crigri
ENSHBUG00000001525	ago4	92	92.317	ENSCSEG00000010696	ago4	100	92.317	Cynoglossus_semilaevis
ENSHBUG00000001525	ago4	100	98.398	ENSDARG00000100854	ago4	100	98.398	Danio_rerio
ENSHBUG00000001525	ago4	100	96.110	ENSDNOG00000015674	AGO4	100	96.110	Dasypus_novemcinctus
ENSHBUG00000001525	ago4	100	96.224	ENSDORG00000008933	Ago4	100	96.224	Dipodomys_ordii
ENSHBUG00000001525	ago4	59	97.044	ENSETEG00000018390	AGO4	83	97.044	Echinops_telfairi
ENSHBUG00000001525	ago4	100	96.224	ENSEASG00005012079	AGO4	100	96.224	Equus_asinus_asinus
ENSHBUG00000001525	ago4	100	96.224	ENSECAG00000024686	AGO4	100	96.224	Equus_caballus
ENSHBUG00000001525	ago4	78	94.035	ENSEEUG00000000745	AGO4	79	94.035	Erinaceus_europaeus
ENSHBUG00000001525	ago4	100	98.975	ENSELUG00000023873	ago4	100	98.975	Esox_lucius
ENSHBUG00000001525	ago4	100	96.110	ENSFCAG00000006218	AGO4	100	96.110	Felis_catus
ENSHBUG00000001525	ago4	99	96.412	ENSFDAG00000021483	AGO4	99	96.412	Fukomys_damarensis
ENSHBUG00000001525	ago4	97	89.256	ENSFHEG00000019658	ago4	100	89.256	Fundulus_heteroclitus
ENSHBUG00000001525	ago4	99	97.701	ENSGMOG00000009544	ago4	99	97.701	Gadus_morhua
ENSHBUG00000001525	ago4	100	96.224	ENSGALG00000039713	AGO4	100	96.398	Gallus_gallus
ENSHBUG00000001525	ago4	100	99.771	ENSGAFG00000017239	ago4	100	99.771	Gambusia_affinis
ENSHBUG00000001525	ago4	99	98.278	ENSGACG00000002683	ago4	99	98.278	Gasterosteus_aculeatus
ENSHBUG00000001525	ago4	92	96.398	ENSGAGG00000012897	AGO4	100	96.398	Gopherus_agassizii
ENSHBUG00000001525	ago4	99	93.039	ENSGGOG00000036532	AGO4	100	93.039	Gorilla_gorilla
ENSHBUG00000001525	ago4	100	96.224	ENSHGLG00000010241	AGO4	100	96.224	Heterocephalus_glaber_female
ENSHBUG00000001525	ago4	99	96.400	ENSHGLG00100005233	AGO4	99	96.400	Heterocephalus_glaber_male
ENSHBUG00000001525	ago4	100	99.657	ENSHCOG00000003725	ago4	100	99.657	Hippocampus_comes
ENSHBUG00000001525	ago4	100	99.657	ENSIPUG00000015600	ago4	100	99.657	Ictalurus_punctatus
ENSHBUG00000001525	ago4	99	96.220	ENSSTOG00000004725	AGO4	100	96.220	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSHBUG00000001525	ago4	100	99.886	ENSKMAG00000018602	ago4	100	99.886	Kryptolebias_marmoratus
ENSHBUG00000001525	ago4	100	99.091	ENSLBEG00000010670	ago4	100	99.091	Labrus_bergylta
ENSHBUG00000001525	ago4	100	96.339	ENSLACG00000016888	AGO4	100	96.339	Latimeria_chalumnae
ENSHBUG00000001525	ago4	100	99.199	ENSLOCG00000000584	ago4	100	99.199	Lepisosteus_oculatus
ENSHBUG00000001525	ago4	93	95.813	ENSLAFG00000010394	AGO4	100	95.813	Loxodonta_africana
ENSHBUG00000001525	ago4	100	96.224	ENSMFAG00000035543	AGO4	100	96.224	Macaca_fascicularis
ENSHBUG00000001525	ago4	99	95.982	ENSMMUG00000003343	AGO4	100	96.825	Macaca_mulatta
ENSHBUG00000001525	ago4	100	96.224	ENSMNEG00000037723	AGO4	100	96.825	Macaca_nemestrina
ENSHBUG00000001525	ago4	99	96.296	ENSMLEG00000039490	AGO4	99	96.296	Mandrillus_leucophaeus
ENSHBUG00000001525	ago4	100	99.771	ENSMAMG00000003874	ago4	100	99.865	Mastacembelus_armatus
ENSHBUG00000001525	ago4	100	100.000	ENSMZEG00005026346	ago4	100	100.000	Maylandia_zebra
ENSHBUG00000001525	ago4	99	95.853	ENSMGAG00000003851	AGO4	99	95.853	Meleagris_gallopavo
ENSHBUG00000001525	ago4	84	97.122	ENSMAUG00000021743	Ago4	97	94.812	Mesocricetus_auratus
ENSHBUG00000001525	ago4	99	96.069	ENSMICG00000033507	AGO4	99	96.069	Microcebus_murinus
ENSHBUG00000001525	ago4	100	95.767	ENSMOCG00000005772	Ago4	100	95.767	Microtus_ochrogaster
ENSHBUG00000001525	ago4	92	97.143	ENSMMOG00000013473	ago4	100	97.143	Mola_mola
ENSHBUG00000001525	ago4	100	96.339	ENSMODG00000017888	AGO4	100	96.339	Monodelphis_domestica
ENSHBUG00000001525	ago4	99	96.544	ENSMALG00000011797	ago4	99	96.544	Monopterus_albus
ENSHBUG00000001525	ago4	100	95.423	MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	95.423	Mus_caroli
ENSHBUG00000001525	ago4	100	95.195	ENSMUSG00000042500	Ago4	100	95.195	Mus_musculus
ENSHBUG00000001525	ago4	100	94.966	MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	94.966	Mus_pahari
ENSHBUG00000001525	ago4	100	95.195	MGP_SPRETEiJ_G0027458	Ago4	100	95.195	Mus_spretus
ENSHBUG00000001525	ago4	92	96.398	ENSMPUG00000014876	AGO4	100	96.398	Mustela_putorius_furo
ENSHBUG00000001525	ago4	99	95.742	ENSMLUG00000017102	AGO4	98	95.742	Myotis_lucifugus
ENSHBUG00000001525	ago4	99	96.412	ENSNGAG00000020544	Ago4	99	96.412	Nannospalax_galili
ENSHBUG00000001525	ago4	100	100.000	ENSNBRG00000013492	ago4	100	100.000	Neolamprologus_brichardi
ENSHBUG00000001525	ago4	99	96.296	ENSNLEG00000011125	AGO4	99	96.296	Nomascus_leucogenys
ENSHBUG00000001525	ago4	88	96.296	ENSMEUG00000001023	AGO4	90	96.296	Notamacropus_eugenii
ENSHBUG00000001525	ago4	99	89.236	ENSOPRG00000012309	AGO4	99	89.236	Ochotona_princeps
ENSHBUG00000001525	ago4	93	96.292	ENSODEG00000006355	AGO4	97	96.292	Octodon_degus
ENSHBUG00000001525	ago4	100	100.000	ENSONIG00000013603	ago4	100	100.000	Oreochromis_niloticus
ENSHBUG00000001525	ago4	92	96.522	ENSOANG00000002082	AGO4	100	96.522	Ornithorhynchus_anatinus
ENSHBUG00000001525	ago4	100	96.110	ENSOCUG00000004076	AGO4	100	96.110	Oryctolagus_cuniculus
ENSHBUG00000001525	ago4	100	99.886	ENSORLG00000009865	ago4	92	99.886	Oryzias_latipes
ENSHBUG00000001525	ago4	100	99.886	ENSORLG00020016978	ago4	92	99.886	Oryzias_latipes_hni
ENSHBUG00000001525	ago4	100	99.886	ENSORLG00015008800	ago4	92	99.886	Oryzias_latipes_hsok
ENSHBUG00000001525	ago4	100	99.886	ENSOMEG00000006399	ago4	100	99.886	Oryzias_melastigma
ENSHBUG00000001525	ago4	100	87.757	ENSOGAG00000027107	-	100	87.757	Otolemur_garnettii
ENSHBUG00000001525	ago4	93	95.432	ENSOGAG00000004233	-	100	95.432	Otolemur_garnettii
ENSHBUG00000001525	ago4	99	95.528	ENSOARG00000019568	AGO4	98	95.528	Ovis_aries
ENSHBUG00000001525	ago4	99	96.296	ENSPPAG00000031752	AGO4	99	96.296	Pan_paniscus
ENSHBUG00000001525	ago4	100	96.110	ENSPPRG00000006520	AGO4	100	96.110	Panthera_pardus
ENSHBUG00000001525	ago4	99	96.296	ENSPTIG00000020262	AGO4	99	96.296	Panthera_tigris_altaica
ENSHBUG00000001525	ago4	100	96.224	ENSPTRG00000000527	AGO4	100	96.224	Pan_troglodytes
ENSHBUG00000001525	ago4	92	96.398	ENSPANG00000007232	AGO4	100	96.398	Papio_anubis
ENSHBUG00000001525	ago4	100	99.199	ENSPKIG00000022598	ago4	100	99.199	Paramormyrops_kingsleyae
ENSHBUG00000001525	ago4	99	96.198	ENSPSIG00000013832	AGO4	99	96.198	Pelodiscus_sinensis
ENSHBUG00000001525	ago4	92	98.509	ENSPMGG00000023325	ago4	100	98.509	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSHBUG00000001525	ago4	89	97.143	ENSPEMG00000022651	-	97	97.143	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSHBUG00000001525	ago4	100	96.339	ENSPCIG00000000092	AGO4	100	96.339	Phascolarctos_cinereus
ENSHBUG00000001525	ago4	100	99.886	ENSPFOG00000001935	ago4	100	99.886	Poecilia_formosa
ENSHBUG00000001525	ago4	100	98.627	ENSPLAG00000011534	ago4	100	98.627	Poecilia_latipinna
ENSHBUG00000001525	ago4	100	99.886	ENSPMEG00000005049	ago4	100	99.886	Poecilia_mexicana
ENSHBUG00000001525	ago4	100	99.886	ENSPREG00000010315	ago4	100	99.886	Poecilia_reticulata
ENSHBUG00000001525	ago4	99	96.296	ENSPPYG00000001552	AGO4	99	96.296	Pongo_abelii
ENSHBUG00000001525	ago4	99	96.185	ENSPCOG00000015935	AGO4	99	96.185	Propithecus_coquereli
ENSHBUG00000001525	ago4	88	96.970	ENSPVAG00000005079	AGO4	88	96.970	Pteropus_vampyrus
ENSHBUG00000001525	ago4	100	100.000	ENSPNYG00000002089	ago4	100	100.000	Pundamilia_nyererei
ENSHBUG00000001525	ago4	100	97.826	ENSPNAG00000005191	ago4	100	97.826	Pygocentrus_nattereri
ENSHBUG00000001525	ago4	70	95.230	ENSRNOG00000025596	Ago4	100	95.230	Rattus_norvegicus
ENSHBUG00000001525	ago4	99	95.244	ENSRBIG00000040185	AGO4	100	96.825	Rhinopithecus_bieti
ENSHBUG00000001525	ago4	92	96.398	ENSRROG00000035783	AGO4	100	96.398	Rhinopithecus_roxellana
ENSHBUG00000001525	ago4	99	92.317	ENSSBOG00000026529	AGO4	100	96.094	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSHBUG00000001525	ago4	99	95.652	ENSSHAG00000017320	AGO4	99	95.652	Sarcophilus_harrisii
ENSHBUG00000001525	ago4	100	99.314	ENSSFOG00015022028	ago4	100	99.503	Scleropages_formosus
ENSHBUG00000001525	ago4	100	97.207	ENSSMAG00000000808	ago4	93	99.051	Scophthalmus_maximus
ENSHBUG00000001525	ago4	100	98.867	ENSSDUG00000020781	ago4	100	98.012	Seriola_dumerili
ENSHBUG00000001525	ago4	92	98.634	ENSSLDG00000021841	ago4	100	98.634	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSHBUG00000001525	ago4	77	97.257	ENSSARG00000011504	AGO4	79	97.257	Sorex_araneus
ENSHBUG00000001525	ago4	100	95.995	ENSSPUG00000000889	AGO4	100	95.995	Sphenodon_punctatus
ENSHBUG00000001525	ago4	99	91.405	ENSTGUG00000001631	AGO4	99	90.815	Taeniopygia_guttata
ENSHBUG00000001525	ago4	100	99.542	ENSTRUG00000008052	ago4	100	99.542	Takifugu_rubripes
ENSHBUG00000001525	ago4	99	98.387	ENSTNIG00000006331	ago4	99	98.387	Tetraodon_nigroviridis
ENSHBUG00000001525	ago4	78	97.143	ENSTBEG00000016478	AGO4	77	97.143	Tupaia_belangeri
ENSHBUG00000001525	ago4	99	92.708	ENSTTRG00000015086	AGO4	99	92.708	Tursiops_truncatus
ENSHBUG00000001525	ago4	92	96.398	ENSUAMG00000027156	-	100	96.398	Ursus_americanus
ENSHBUG00000001525	ago4	99	94.037	ENSUMAG00000006297	AGO4	99	92.874	Ursus_maritimus
ENSHBUG00000001525	ago4	88	95.584	ENSVPAG00000006662	AGO4	100	95.584	Vicugna_pacos
ENSHBUG00000001525	ago4	92	96.398	ENSVVUG00000000465	-	100	96.398	Vulpes_vulpes
ENSHBUG00000001525	ago4	100	82.554	ENSXETG00000009664	ago4	93	92.077	Xenopus_tropicalis
ENSHBUG00000001525	ago4	100	99.886	ENSXMAG00000016657	ago4	100	99.886	Xiphophorus_maculatus