EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSHBUG00000002640 (Gene tree)
Gene ID: 102292801
Gene Symbol: tyw1
Alias: im:6898509|wu:fb74d01|zgc:153368
Full Name: S-adenosyl-L-methionine-dependent tRNA 4-demethylwyosine synthase-like
Gene Type: protein_coding
Species: Haplochromis_burtoni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 54070 bases
Position: chrJH425468.1:139202-193271
Accession: 102292801
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHBUP00000022391	Wyosine_form	PF08608.12	2.2e-27	1	1
ENSHBUP00000001452	Wyosine_form	PF08608.12	6.3e-20	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHBUT00000013777	-	2031	-	ENSHBUP00000001452	676 (aa)	-	-
ENSHBUT00000013757	-	3865	XM_005932582	ENSHBUP00000022391	746 (aa)	XP_005932644	UPI0003BD33A0

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHBUG00000002640	tyw1	95	67.818	ENSG00000198874	TYW1	98	68.414	Homo_sapiens
ENSHBUG00000002640	tyw1	99	52.712	ENSG00000277149	TYW1B	93	65.177	Homo_sapiens
ENSHBUG00000002640	tyw1	100	84.154	ENSAPOG00000014391	tyw1	100	84.421	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHBUG00000002640	tyw1	96	86.389	ENSACIG00000007325	tyw1	100	86.389	Amphilophus_citrinellus
ENSHBUG00000002640	tyw1	100	84.154	ENSAOCG00000016792	tyw1	100	84.154	Amphiprion_ocellaris
ENSHBUG00000002640	tyw1	100	84.554	ENSAPEG00000015939	tyw1	100	84.554	Amphiprion_percula
ENSHBUG00000002640	tyw1	90	83.847	ENSATEG00000006856	tyw1	94	83.847	Anabas_testudineus
ENSHBUG00000002640	tyw1	97	66.395	ENSANAG00000037051	-	99	66.395	Aotus_nancymaae
ENSHBUG00000002640	tyw1	100	99.598	ENSACLG00000018688	tyw1	100	99.598	Astatotilapia_calliptera
ENSHBUG00000002640	tyw1	97	74.387	ENSAMXG00000004157	tyw1	99	75.441	Astyanax_mexicanus
ENSHBUG00000002640	tyw1	95	68.188	ENSBTAG00000008446	TYW1	98	68.188	Bos_taurus
ENSHBUG00000002640	tyw1	97	66.213	ENSCJAG00000004295	-	99	66.213	Callithrix_jacchus
ENSHBUG00000002640	tyw1	97	67.302	ENSCAFG00000010867	-	99	67.935	Canis_familiaris
ENSHBUG00000002640	tyw1	93	62.787	ENSCAFG00020005367	-	99	63.610	Canis_lupus_dingo
ENSHBUG00000002640	tyw1	95	68.377	ENSCHIG00000019510	-	98	68.377	Capra_hircus
ENSHBUG00000002640	tyw1	88	65.919	ENSTSYG00000008236	-	99	65.919	Carlito_syrichta
ENSHBUG00000002640	tyw1	85	64.953	ENSCAPG00000013569	-	100	64.953	Cavia_aperea
ENSHBUG00000002640	tyw1	95	65.432	ENSCPOG00000011182	-	99	65.353	Cavia_porcellus
ENSHBUG00000002640	tyw1	97	66.349	ENSCCAG00000026643	-	99	66.621	Cebus_capucinus
ENSHBUG00000002640	tyw1	97	66.395	ENSCATG00000043677	-	99	66.984	Cercocebus_atys
ENSHBUG00000002640	tyw1	96	65.574	ENSCLAG00000006321	-	99	66.074	Chinchilla_lanigera
ENSHBUG00000002640	tyw1	89	70.073	ENSCSAG00000018274	-	99	70.856	Chlorocebus_sabaeus
ENSHBUG00000002640	tyw1	99	66.886	ENSCPBG00000014896	-	99	67.323	Chrysemys_picta_bellii
ENSHBUG00000002640	tyw1	79	59.259	ENSCING00000004125	-	97	58.754	Ciona_intestinalis
ENSHBUG00000002640	tyw1	88	54.282	ENSCSAVG00000005712	-	100	55.251	Ciona_savignyi
ENSHBUG00000002640	tyw1	97	66.576	ENSCANG00000033209	-	99	67.164	Colobus_angolensis_palliatus
ENSHBUG00000002640	tyw1	67	76.815	ENSCGRG00001003679	Tyw1	89	74.723	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSHBUG00000002640	tyw1	99	79.893	ENSCSEG00000005810	tyw1	98	80.831	Cynoglossus_semilaevis
ENSHBUG00000002640	tyw1	90	80.265	ENSCVAG00000001054	tyw1	96	80.265	Cyprinodon_variegatus
ENSHBUG00000002640	tyw1	99	72.948	ENSDARG00000062987	tyw1	99	74.099	Danio_rerio
ENSHBUG00000002640	tyw1	99	66.358	ENSDNOG00000024165	-	98	68.283	Dasypus_novemcinctus
ENSHBUG00000002640	tyw1	100	50.000	ENSDORG00000014772	Tyw1	91	63.854	Dipodomys_ordii
ENSHBUG00000002640	tyw1	58	73.611	ENSEBUG00000004494	tyw1	91	73.611	Eptatretus_burgeri
ENSHBUG00000002640	tyw1	95	68.188	ENSEASG00005008818	-	98	68.741	Equus_asinus_asinus
ENSHBUG00000002640	tyw1	95	63.092	ENSECAG00000023164	-	98	62.829	Equus_caballus
ENSHBUG00000002640	tyw1	58	79.381	ENSEEUG00000005950	-	60	78.571	Erinaceus_europaeus
ENSHBUG00000002640	tyw1	99	73.360	ENSELUG00000008449	tyw1	98	72.534	Esox_lucius
ENSHBUG00000002640	tyw1	95	67.452	ENSFCAG00000014262	-	98	67.452	Felis_catus
ENSHBUG00000002640	tyw1	95	64.315	ENSFALG00000013810	-	98	65.055	Ficedula_albicollis
ENSHBUG00000002640	tyw1	97	65.940	ENSFDAG00000013270	-	98	67.033	Fukomys_damarensis
ENSHBUG00000002640	tyw1	81	80.619	ENSFHEG00000020824	tyw1	81	80.619	Fundulus_heteroclitus
ENSHBUG00000002640	tyw1	97	64.595	ENSGALG00000001110	-	99	66.262	Gallus_gallus
ENSHBUG00000002640	tyw1	97	78.747	ENSGACG00000012692	tyw1	99	78.747	Gasterosteus_aculeatus
ENSHBUG00000002640	tyw1	97	67.655	ENSGAGG00000022393	-	99	67.968	Gopherus_agassizii
ENSHBUG00000002640	tyw1	87	59.578	ENSGGOG00000001473	TYW1	99	59.789	Gorilla_gorilla
ENSHBUG00000002640	tyw1	86	67.188	ENSHGLG00000012093	-	100	67.188	Heterocephalus_glaber_female
ENSHBUG00000002640	tyw1	97	65.442	ENSHGLG00100011743	TYW1	98	66.118	Heterocephalus_glaber_male
ENSHBUG00000002640	tyw1	97	68.603	ENSHCOG00000019949	tyw1	97	68.603	Hippocampus_comes
ENSHBUG00000002640	tyw1	99	71.238	ENSIPUG00000016330	tyw1	99	72.776	Ictalurus_punctatus
ENSHBUG00000002640	tyw1	96	65.062	ENSSTOG00000004067	-	90	65.475	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSHBUG00000002640	tyw1	95	65.594	ENSJJAG00000022959	Tyw1	98	66.252	Jaculus_jaculus
ENSHBUG00000002640	tyw1	100	80.000	ENSKMAG00000018599	tyw1	100	80.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSHBUG00000002640	tyw1	99	63.900	ENSLACG00000018917	tyw1	99	65.079	Latimeria_chalumnae
ENSHBUG00000002640	tyw1	99	71.202	ENSLOCG00000004035	tyw1	99	71.202	Lepisosteus_oculatus
ENSHBUG00000002640	tyw1	97	66.667	ENSMFAG00000035457	-	99	67.255	Macaca_fascicularis
ENSHBUG00000002640	tyw1	97	66.667	ENSMMUG00000030374	-	99	67.255	Macaca_mulatta
ENSHBUG00000002640	tyw1	97	66.531	ENSMNEG00000041992	-	99	71.038	Macaca_nemestrina
ENSHBUG00000002640	tyw1	97	66.485	ENSMLEG00000039741	-	99	67.120	Mandrillus_leucophaeus
ENSHBUG00000002640	tyw1	98	84.290	ENSMAMG00000016089	tyw1	99	83.578	Mastacembelus_armatus
ENSHBUG00000002640	tyw1	92	97.661	ENSMZEG00005024386	tyw1	100	97.661	Maylandia_zebra
ENSHBUG00000002640	tyw1	95	65.978	ENSMGAG00000002176	-	98	66.437	Meleagris_gallopavo
ENSHBUG00000002640	tyw1	96	66.205	ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	66.667	Mesocricetus_auratus
ENSHBUG00000002640	tyw1	97	67.711	ENSMICG00000014374	-	99	67.575	Microcebus_murinus
ENSHBUG00000002640	tyw1	96	64.503	ENSMOCG00000017720	Tyw1	98	65.884	Microtus_ochrogaster
ENSHBUG00000002640	tyw1	98	75.546	ENSMMOG00000005064	tyw1	99	76.616	Mola_mola
ENSHBUG00000002640	tyw1	96	65.211	ENSMODG00000025697	-	98	67.123	Monodelphis_domestica
ENSHBUG00000002640	tyw1	100	83.733	ENSMALG00000010238	tyw1	100	83.733	Monopterus_albus
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ENSHBUG00000002640	tyw1	96	66.759	ENSMUSG00000056310	Tyw1	99	67.220	Mus_musculus
ENSHBUG00000002640	tyw1	96	66.620	MGP_PahariEiJ_G0024383	Tyw1	99	66.713	Mus_pahari
ENSHBUG00000002640	tyw1	96	66.343	MGP_SPRETEiJ_G0028799	Tyw1	99	66.805	Mus_spretus
ENSHBUG00000002640	tyw1	89	70.482	ENSMPUG00000016191	-	96	70.482	Mustela_putorius_furo
ENSHBUG00000002640	tyw1	95	65.199	ENSMLUG00000013582	-	98	65.612	Myotis_lucifugus
ENSHBUG00000002640	tyw1	96	66.295	ENSNGAG00000002742	Tyw1	99	66.481	Nannospalax_galili
ENSHBUG00000002640	tyw1	92	92.442	ENSNBRG00000016996	tyw1	99	92.442	Neolamprologus_brichardi
ENSHBUG00000002640	tyw1	97	65.765	ENSNLEG00000013210	-	98	66.440	Nomascus_leucogenys
ENSHBUG00000002640	tyw1	88	54.955	ENSOPRG00000008734	-	87	54.955	Ochotona_princeps
ENSHBUG00000002640	tyw1	88	63.788	ENSODEG00000014729	-	95	63.939	Octodon_degus
ENSHBUG00000002640	tyw1	100	95.845	ENSONIG00000005872	tyw1	100	95.845	Oreochromis_niloticus
ENSHBUG00000002640	tyw1	95	66.759	ENSOCUG00000003173	-	98	66.758	Oryctolagus_cuniculus
ENSHBUG00000002640	tyw1	100	79.088	ENSORLG00000001393	tyw1	99	80.054	Oryzias_latipes
ENSHBUG00000002640	tyw1	100	78.686	ENSORLG00020019361	tyw1	100	79.652	Oryzias_latipes_hni
ENSHBUG00000002640	tyw1	100	78.743	ENSORLG00015008095	tyw1	99	79.706	Oryzias_latipes_hsok
ENSHBUG00000002640	tyw1	89	71.642	ENSOGAG00000016555	-	98	68.263	Otolemur_garnettii
ENSHBUG00000002640	tyw1	95	68.044	ENSOARG00000010673	-	98	68.044	Ovis_aries
ENSHBUG00000002640	tyw1	95	68.061	ENSPPRG00000004945	-	98	68.061	Panthera_pardus
ENSHBUG00000002640	tyw1	95	67.827	ENSPTIG00000019545	-	98	67.827	Panthera_tigris_altaica
ENSHBUG00000002640	tyw1	97	62.162	ENSPTRG00000023076	TYW1B	98	62.483	Pan_troglodytes
ENSHBUG00000002640	tyw1	97	66.259	ENSPANG00000019053	-	99	66.757	Papio_anubis
ENSHBUG00000002640	tyw1	99	67.204	ENSPKIG00000006545	tyw1	99	67.383	Paramormyrops_kingsleyae
ENSHBUG00000002640	tyw1	94	78.470	ENSPMGG00000004240	tyw1	100	78.612	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSHBUG00000002640	tyw1	96	66.575	ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	66.851	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSHBUG00000002640	tyw1	100	78.486	ENSPFOG00000015855	tyw1	99	79.973	Poecilia_formosa
ENSHBUG00000002640	tyw1	100	78.146	ENSPLAG00000000838	tyw1	100	78.543	Poecilia_latipinna
ENSHBUG00000002640	tyw1	100	78.353	ENSPMEG00000019437	tyw1	100	78.752	Poecilia_mexicana
ENSHBUG00000002640	tyw1	98	74.864	ENSPREG00000018773	tyw1	99	75.272	Poecilia_reticulata
ENSHBUG00000002640	tyw1	97	66.984	ENSPPYG00000017514	TYW1	99	67.436	Pongo_abelii
ENSHBUG00000002640	tyw1	97	51.962	ENSPCOG00000015294	-	99	51.962	Propithecus_coquereli
ENSHBUG00000002640	tyw1	100	99.464	ENSPNYG00000022381	tyw1	100	99.464	Pundamilia_nyererei
ENSHBUG00000002640	tyw1	96	74.722	ENSPNAG00000009001	tyw1	98	76.210	Pygocentrus_nattereri
ENSHBUG00000002640	tyw1	96	65.884	ENSRNOG00000024352	Tyw1	98	66.345	Rattus_norvegicus
ENSHBUG00000002640	tyw1	97	66.440	ENSRBIG00000039619	-	99	67.028	Rhinopithecus_bieti
ENSHBUG00000002640	tyw1	97	66.440	ENSRROG00000039780	-	99	67.028	Rhinopithecus_roxellana
ENSHBUG00000002640	tyw1	92	40.510	YPL207W	-	76	40.510	Saccharomyces_cerevisiae
ENSHBUG00000002640	tyw1	95	65.837	ENSSBOG00000025873	-	98	66.113	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSHBUG00000002640	tyw1	97	65.854	ENSSHAG00000010346	-	99	67.310	Sarcophilus_harrisii
ENSHBUG00000002640	tyw1	99	70.133	ENSSFOG00015001054	tyw1	98	71.450	Scleropages_formosus
ENSHBUG00000002640	tyw1	98	83.333	ENSSMAG00000020514	tyw1	100	82.667	Scophthalmus_maximus
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ENSHBUG00000002640	tyw1	96	65.698	ENSSPUG00000002715	-	98	66.529	Sphenodon_punctatus
ENSHBUG00000002640	tyw1	95	66.989	ENSSSCG00000007733	-	98	67.448	Sus_scrofa
ENSHBUG00000002640	tyw1	88	66.667	ENSTGUG00000003428	-	99	67.463	Taeniopygia_guttata
ENSHBUG00000002640	tyw1	99	81.258	ENSTRUG00000016107	tyw1	97	81.258	Takifugu_rubripes
ENSHBUG00000002640	tyw1	88	84.281	ENSTNIG00000018999	tyw1	100	84.281	Tetraodon_nigroviridis
ENSHBUG00000002640	tyw1	96	67.078	ENSUMAG00000015343	-	100	67.791	Ursus_maritimus
ENSHBUG00000002640	tyw1	97	66.530	ENSVVUG00000016457	-	99	67.030	Vulpes_vulpes
ENSHBUG00000002640	tyw1	97	67.391	ENSXETG00000010094	tyw1	100	67.755	Xenopus_tropicalis
ENSHBUG00000002640	tyw1	100	77.540	ENSXMAG00000013125	tyw1	100	78.933	Xiphophorus_maculatus