EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSHBUG00000005866 (Gene tree)
Gene ID: 102300496
Gene Symbol: pelo
Alias: wu:fa12c12|wu:fb97f07|zgc:56550
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Haplochromis_burtoni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11528 bases
Position: chrJH425862.1:322422-333949
Accession: 102300496
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHBUP00000024455	eRF1_2	PF03464.15	1e-32	1	1
ENSHBUP00000024455	eRF1_3	PF03465.15	5.9e-26	1	1
ENSHBUP00000024455	eRF1_1	PF03463.15	5.8e-52	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHBUT00000008500	-	5093	XM_005947450	ENSHBUP00000024455	385 (aa)	XP_005947512	UPI000329FF65

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.260	ENSG00000152684	PELO	100	80.260	Homo_sapiens
ENSHBUG00000005866	pelo	100	91.948	ENSAPOG00000023072	pelo	100	91.948	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHBUG00000005866	pelo	64	92.308	ENSAPOG00000000616	pelo	90	92.308	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHBUG00000005866	pelo	64	92.308	ENSAPOG00000023700	-	90	92.308	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.000	ENSAMEG00000007734	PELO	100	80.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHBUG00000005866	pelo	97	88.740	ENSACIG00000014386	pelo	97	93.491	Amphilophus_citrinellus
ENSHBUG00000005866	pelo	100	92.208	ENSAOCG00000023717	pelo	100	92.208	Amphiprion_ocellaris
ENSHBUG00000005866	pelo	100	92.208	ENSAPEG00000011235	pelo	100	92.208	Amphiprion_percula
ENSHBUG00000005866	pelo	100	91.948	ENSATEG00000019550	pelo	100	91.948	Anabas_testudineus
ENSHBUG00000005866	pelo	77	70.470	ENSAPLG00000013265	PELO	100	70.470	Anas_platyrhynchos
ENSHBUG00000005866	pelo	97	79.467	ENSACAG00000004352	PELO	100	78.961	Anolis_carolinensis
ENSHBUG00000005866	pelo	100	79.740	ENSANAG00000014096	PELO	100	79.740	Aotus_nancymaae
ENSHBUG00000005866	pelo	100	100.000	ENSACLG00000010305	pelo	100	100.000	Astatotilapia_calliptera
ENSHBUG00000005866	pelo	97	90.885	ENSAMXG00000020299	pelo	100	90.155	Astyanax_mexicanus
ENSHBUG00000005866	pelo	100	79.740	ENSBTAG00000003268	PELO	99	79.740	Bos_taurus
ENSHBUG00000005866	pelo	97	61.333	WBGene00011280	pelo-1	98	61.333	Caenorhabditis_elegans
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.000	ENSCJAG00000035190	PELO	100	80.000	Callithrix_jacchus
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.260	ENSCAFG00020023234	PELO	100	80.260	Canis_lupus_dingo
ENSHBUG00000005866	pelo	100	79.481	ENSCHIG00000016410	PELO	99	79.481	Capra_hircus
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.519	ENSTSYG00000005203	PELO	100	80.519	Carlito_syrichta
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.260	ENSCPOG00000027406	PELO	100	80.260	Cavia_porcellus
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.000	ENSCCAG00000035600	PELO	100	80.000	Cebus_capucinus
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.260	ENSCATG00000011829	PELO	100	80.260	Cercocebus_atys
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.260	ENSCLAG00000005043	PELO	100	80.260	Chinchilla_lanigera
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.260	ENSCSAG00000016692	PELO	100	80.260	Chlorocebus_sabaeus
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.260	ENSCHOG00000000523	PELO	100	80.260	Choloepus_hoffmanni
ENSHBUG00000005866	pelo	97	80.000	ENSCPBG00000007544	PELO	100	79.481	Chrysemys_picta_bellii
ENSHBUG00000005866	pelo	97	64.611	ENSCING00000001979	-	100	64.935	Ciona_intestinalis
ENSHBUG00000005866	pelo	100	66.753	ENSCSAVG00000006158	-	100	66.753	Ciona_savignyi
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.260	ENSCANG00000023382	PELO	100	80.260	Colobus_angolensis_palliatus
ENSHBUG00000005866	pelo	97	79.893	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	80.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSHBUG00000005866	pelo	97	80.697	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	80.779	Cricetulus_griseus_crigri
ENSHBUG00000005866	pelo	100	90.649	ENSCSEG00000008807	pelo	100	90.649	Cynoglossus_semilaevis
ENSHBUG00000005866	pelo	100	91.169	ENSCVAG00000016082	pelo	100	91.169	Cyprinodon_variegatus
ENSHBUG00000005866	pelo	100	88.831	ENSDARG00000055477	pelo	100	88.831	Danio_rerio
ENSHBUG00000005866	pelo	100	77.720	ENSDNOG00000036721	PELO	100	77.720	Dasypus_novemcinctus
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.779	ENSDORG00000016689	Pelo	100	80.779	Dipodomys_ordii
ENSHBUG00000005866	pelo	96	67.568	FBgn0011207	pelo	97	66.319	Drosophila_melanogaster
ENSHBUG00000005866	pelo	71	77.778	ENSEBUG00000004955	pelo	99	77.778	Eptatretus_burgeri
ENSHBUG00000005866	pelo	100	79.740	ENSEASG00005013348	PELO	100	79.740	Equus_asinus_asinus
ENSHBUG00000005866	pelo	100	90.390	ENSELUG00000023229	pelo	100	90.390	Esox_lucius
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.000	ENSFCAG00000032341	PELO	100	80.000	Felis_catus
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.000	ENSFALG00000004559	PELO	100	80.000	Ficedula_albicollis
ENSHBUG00000005866	pelo	74	80.634	ENSFDAG00000002076	PELO	88	80.634	Fukomys_damarensis
ENSHBUG00000005866	pelo	100	90.130	ENSFHEG00000009769	pelo	100	90.130	Fundulus_heteroclitus
ENSHBUG00000005866	pelo	98	88.329	ENSGMOG00000005849	pelo	100	88.052	Gadus_morhua
ENSHBUG00000005866	pelo	100	89.870	ENSGAFG00000019350	pelo	100	89.870	Gambusia_affinis
ENSHBUG00000005866	pelo	100	90.649	ENSGACG00000007245	pelo	100	90.649	Gasterosteus_aculeatus
ENSHBUG00000005866	pelo	97	80.000	ENSGAGG00000004018	PELO	100	79.481	Gopherus_agassizii
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.260	ENSGGOG00000012635	PELO	100	80.260	Gorilla_gorilla
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.260	ENSHGLG00000005932	PELO	100	80.260	Heterocephalus_glaber_female
ENSHBUG00000005866	pelo	100	78.701	ENSHGLG00100017627	PELO	100	78.701	Heterocephalus_glaber_male
ENSHBUG00000005866	pelo	100	90.909	ENSHCOG00000016782	pelo	100	90.909	Hippocampus_comes
ENSHBUG00000005866	pelo	100	89.091	ENSIPUG00000020627	pelo	100	89.091	Ictalurus_punctatus
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.779	ENSSTOG00000027378	PELO	100	80.779	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSHBUG00000005866	pelo	100	78.182	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	78.182	Jaculus_jaculus
ENSHBUG00000005866	pelo	100	90.649	ENSKMAG00000021305	pelo	100	90.649	Kryptolebias_marmoratus
ENSHBUG00000005866	pelo	100	90.909	ENSLBEG00000022399	pelo	100	90.909	Labrus_bergylta
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.519	ENSLAFG00000020551	PELO	100	80.519	Loxodonta_africana
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.260	ENSMFAG00000000651	PELO	100	80.260	Macaca_fascicularis
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.260	ENSMMUG00000039101	PELO	100	80.260	Macaca_mulatta
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.260	ENSMNEG00000035538	PELO	100	80.260	Macaca_nemestrina
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.260	ENSMLEG00000039113	PELO	100	80.260	Mandrillus_leucophaeus
ENSHBUG00000005866	pelo	97	94.102	ENSMAMG00000013260	pelo	100	93.247	Mastacembelus_armatus
ENSHBUG00000005866	pelo	100	100.000	ENSMZEG00005014258	pelo	100	100.000	Maylandia_zebra
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.519	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	80.519	Mesocricetus_auratus
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.260	ENSMICG00000044040	PELO	100	80.260	Microcebus_murinus
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.519	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	80.519	Microtus_ochrogaster
ENSHBUG00000005866	pelo	100	91.169	ENSMMOG00000001324	pelo	100	91.169	Mola_mola
ENSHBUG00000005866	pelo	100	92.208	ENSMALG00000008194	pelo	100	92.208	Monopterus_albus
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.519	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	80.519	Mus_caroli
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.000	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	80.000	Mus_musculus
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.260	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	80.260	Mus_pahari
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.000	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	80.000	Mus_spretus
ENSHBUG00000005866	pelo	100	79.740	ENSMLUG00000024132	PELO	100	79.740	Myotis_lucifugus
ENSHBUG00000005866	pelo	100	81.039	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	81.039	Nannospalax_galili
ENSHBUG00000005866	pelo	100	99.481	ENSNBRG00000011799	pelo	100	99.481	Neolamprologus_brichardi
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.260	ENSNLEG00000035970	PELO	100	80.260	Nomascus_leucogenys
ENSHBUG00000005866	pelo	100	78.961	ENSMEUG00000005468	PELO	100	78.961	Notamacropus_eugenii
ENSHBUG00000005866	pelo	98	79.420	ENSOPRG00000018793	PELO	100	79.420	Ochotona_princeps
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.000	ENSODEG00000017579	PELO	100	80.000	Octodon_degus
ENSHBUG00000005866	pelo	100	97.922	ENSONIG00000011511	pelo	100	97.922	Oreochromis_niloticus
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.779	ENSOCUG00000023902	PELO	100	80.779	Oryctolagus_cuniculus
ENSHBUG00000005866	pelo	100	90.390	ENSORLG00000005827	pelo	100	90.390	Oryzias_latipes
ENSHBUG00000005866	pelo	100	90.130	ENSORLG00020016456	pelo	100	90.130	Oryzias_latipes_hni
ENSHBUG00000005866	pelo	100	90.130	ENSORLG00015014447	pelo	100	90.130	Oryzias_latipes_hsok
ENSHBUG00000005866	pelo	100	91.429	ENSOMEG00000021567	pelo	100	91.429	Oryzias_melastigma
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.519	ENSOGAG00000027940	PELO	100	80.519	Otolemur_garnettii
ENSHBUG00000005866	pelo	100	79.740	ENSOARG00000008324	PELO	99	79.740	Ovis_aries
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.260	ENSPPAG00000038951	PELO	100	80.260	Pan_paniscus
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.000	ENSPPRG00000018800	PELO	100	80.000	Panthera_pardus
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.000	ENSPTIG00000019988	PELO	100	80.000	Panthera_tigris_altaica
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.000	ENSPTRG00000034409	PELO	100	80.000	Pan_troglodytes
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.260	ENSPANG00000010902	PELO	100	80.260	Papio_anubis
ENSHBUG00000005866	pelo	100	88.312	ENSPKIG00000015190	pelo	100	88.312	Paramormyrops_kingsleyae
ENSHBUG00000005866	pelo	97	79.733	ENSPSIG00000004971	PELO	100	79.221	Pelodiscus_sinensis
ENSHBUG00000005866	pelo	66	91.339	ENSPMGG00000014561	pelo	94	91.339	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.519	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	80.519	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSHBUG00000005866	pelo	100	79.740	ENSPCIG00000004880	PELO	100	79.740	Phascolarctos_cinereus
ENSHBUG00000005866	pelo	100	91.169	ENSPFOG00000007277	pelo	100	91.169	Poecilia_formosa
ENSHBUG00000005866	pelo	100	91.169	ENSPLAG00000020787	pelo	100	91.169	Poecilia_latipinna
ENSHBUG00000005866	pelo	100	91.169	ENSPMEG00000016964	pelo	100	91.169	Poecilia_mexicana
ENSHBUG00000005866	pelo	100	91.169	ENSPREG00000023071	pelo	100	91.169	Poecilia_reticulata
ENSHBUG00000005866	pelo	97	80.697	ENSPPYG00000015451	PELO	96	80.519	Pongo_abelii
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.260	ENSPCOG00000021178	PELO	100	80.260	Propithecus_coquereli
ENSHBUG00000005866	pelo	100	100.000	ENSPNYG00000017325	pelo	100	100.000	Pundamilia_nyererei
ENSHBUG00000005866	pelo	97	91.153	ENSPNAG00000012458	pelo	99	89.870	Pygocentrus_nattereri
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ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.260	ENSRBIG00000007299	PELO	100	80.260	Rhinopithecus_bieti
ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.260	ENSRROG00000035507	PELO	100	80.260	Rhinopithecus_roxellana
ENSHBUG00000005866	pelo	97	32.895	YNL001W	-	97	32.895	Saccharomyces_cerevisiae
ENSHBUG00000005866	pelo	100	79.740	ENSSBOG00000036140	PELO	100	79.740	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSHBUG00000005866	pelo	63	76.639	ENSSHAG00000010770	PELO	100	76.639	Sarcophilus_harrisii
ENSHBUG00000005866	pelo	98	89.390	ENSSFOG00015013399	pelo	100	89.091	Scleropages_formosus
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