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Description

Ensembl ID: ENSHBUG00000006691 (Gene tree)
Gene ID: 102291700
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: wu:fa56c07|wu:fi27f11|zgc:66238
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Haplochromis_burtoni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 58048 bases
Position: chrJH425367.1:408045-466092
Accession: 102291700
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHBUP00000005208	ResIII	PF04851.15	2.5e-08	1	1
ENSHBUP00000005200	ResIII	PF04851.15	2.5e-08	1	1
ENSHBUP00000005200	BRK	PF07533.16	1.9e-17	1	1
ENSHBUP00000005208	BRK	PF07533.16	2e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHBUT00000007423	SMARCA2-202	4722	-	ENSHBUP00000005208	1573 (aa)	-	-
ENSHBUT00000007397	SMARCA2-201	8985	XM_005921928	ENSHBUP00000005200	1588 (aa)	XP_005921990	UPI0003BD113F

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	91	73.093	ENSHBUG00000005447	-	98	73.467
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	94	72.143	ENSHBUG00000021172	smarca4a	99	71.779

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	95	80.534	ENSG00000080503	SMARCA2	99	98.000	Homo_sapiens
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	100	93.392	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	93.392	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	88	77.076	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	85.994	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	100	93.009	ENSACIG00000015607	SMARCA2	99	94.441	Amphilophus_citrinellus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	100	93.836	ENSAOCG00000009647	-	100	93.585	Amphiprion_ocellaris
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	100	93.392	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	100	93.392	Amphiprion_percula
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	99	93.244	ENSATEG00000006916	SMARCA2	98	92.862	Anabas_testudineus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	87	77.983	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	78.606	Anas_platyrhynchos
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	79.807	ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	79.775	Anolis_carolinensis
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	80.257	ENSANAG00000026498	SMARCA2	100	80.376	Aotus_nancymaae
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	98	99.546	ENSACLG00000004248	SMARCA2	99	99.546	Astatotilapia_calliptera
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	99	85.597	ENSAMXG00000012404	smarca2	100	84.816	Astyanax_mexicanus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	96	81.423	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	99	81.759	Bos_taurus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	80.557	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	81.117	Callithrix_jacchus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	96	82.291	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	99	81.965	Canis_familiaris
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	74	87.113	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	94	86.942	Canis_lupus_dingo
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	96	81.555	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	99	81.759	Capra_hircus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	96	78.968	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	80.342	Carlito_syrichta
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	96	78.982	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	99	78.141	Cavia_aperea
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	96	80.691	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	100	80.326	Cavia_porcellus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	80.386	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	100	80.502	Cebus_capucinus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	78.730	ENSCATG00000031470	SMARCA2	100	80.213	Cercocebus_atys
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	79.717	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	80.112	Chinchilla_lanigera
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	91	81.693	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	99	81.880	Chlorocebus_sabaeus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	83	81.690	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	86	81.690	Choloepus_hoffmanni
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	80.873	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	100	83.004	Chrysemys_picta_bellii
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	80.514	ENSCANG00000039597	SMARCA2	100	80.564	Colobus_angolensis_palliatus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	96	75.880	ENSCGRG00001002323	Smarca2	100	75.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	98	87.596	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	99	87.532	Cynoglossus_semilaevis
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	85	87.722	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	98	88.398	Cyprinodon_variegatus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	100	85.000	ENSDARG00000008904	smarca2	100	84.375	Danio_rerio
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	80.077	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	100	79.591	Dasypus_novemcinctus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	79.987	ENSDORG00000014832	Smarca2	100	80.188	Dipodomys_ordii
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	76	62.231	FBgn0000212	brm	83	56.770	Drosophila_melanogaster
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	94	69.960	ENSEBUG00000011442	-	97	69.673	Eptatretus_burgeri
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	86	61.915	ENSEBUG00000002449	-	93	64.366	Eptatretus_burgeri
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	96	81.633	ENSEASG00005010312	SMARCA2	99	81.513	Equus_asinus_asinus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	61	88.235	ENSEEUG00000015540	-	69	83.562	Erinaceus_europaeus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	95	83.968	ENSELUG00000010318	smarca2	99	82.195	Esox_lucius
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	80.307	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	99	81.771	Felis_catus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	80.424	ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	81.794	Ficedula_albicollis
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	96	79.199	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	99	79.458	Fukomys_damarensis
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	100	91.880	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	100	91.812	Fundulus_heteroclitus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	99	82.468	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	83.150	Gadus_morhua
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	80.680	ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	80.100	Gallus_gallus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	95	83.201	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	95	83.712	Gambusia_affinis
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	99	88.783	ENSGACG00000014488	SMARCA2	99	88.023	Gasterosteus_aculeatus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	80.680	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	100	80.038	Gopherus_agassizii
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	88	86.776	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	98	79.974	Gorilla_gorilla
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	96	79.729	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	100	79.141	Heterocephalus_glaber_female
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	96	81.560	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	99	81.830	Heterocephalus_glaber_male
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	88	83.778	ENSHCOG00000015348	-	97	86.545	Hippocampus_comes
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	99	83.891	ENSIPUG00000011060	smarca2	100	82.200	Ictalurus_punctatus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	96	80.742	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	100	80.313	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	96	81.095	ENSJJAG00000010867	Smarca2	100	80.213	Jaculus_jaculus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	100	92.327	ENSKMAG00000015844	-	100	92.010	Kryptolebias_marmoratus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	83.354	ENSLOCG00000011499	smarca2	99	82.647	Lepisosteus_oculatus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	79.859	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	79.551	Loxodonta_africana
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	95	80.432	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	99	81.842	Macaca_fascicularis
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	80.514	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	100	80.564	Macaca_mulatta
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	95	80.641	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	100	80.150	Macaca_nemestrina
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	91	86.486	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	99	81.317	Mandrillus_leucophaeus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	100	92.159	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	91.848	Mastacembelus_armatus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	100	99.428	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	100	99.428	Maylandia_zebra
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	74	68.428	ENSMGAG00000005160	-	100	68.206	Meleagris_gallopavo
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	96	81.508	ENSMICG00000005162	SMARCA2	100	80.627	Microcebus_murinus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	96	81.421	ENSMOCG00000001611	Smarca2	100	80.025	Microtus_ochrogaster
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	99	86.280	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	99	86.599	Mola_mola
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	80.604	ENSMODG00000003578	SMARCA2	100	80.338	Monodelphis_domestica
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	98	92.000	ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	91.871	Monopterus_albus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	95	80.612	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	100	79.476	Mus_caroli
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	80.154	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	98.000	Mus_musculus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	80.488	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	100	79.564	Mus_pahari
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	95	80.612	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	97	90.909	Mus_spretus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	79	86.063	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	94	85.792	Mustela_putorius_furo
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	76.531	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	99	76.600	Myotis_lucifugus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	96	80.000	ENSNGAG00000000108	Smarca2	99	79.811	Nannospalax_galili
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	95	81.506	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	93	100.000	Neolamprologus_brichardi
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	91	85.748	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	79.310	Nomascus_leucogenys
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	93	78.788	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	99	74.326	Notamacropus_eugenii
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	96	76.088	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	76.364	Ochotona_princeps
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	96	79.268	ENSODEG00000005452	SMARCA2	99	79.349	Octodon_degus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	99	97.864	ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	97.864	Oreochromis_niloticus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	79	87.141	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	100	80.326	Oryctolagus_cuniculus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	100	90.766	ENSORLG00000020820	SMARCA2	100	90.698	Oryzias_latipes
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	100	91.075	ENSORLG00015006289	SMARCA2	100	91.201	Oryzias_latipes_hsok
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	100	90.749	ENSOMEG00000009736	-	100	90.749	Oryzias_melastigma
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	80	86.338	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	79.146	Otolemur_garnettii
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	78.937	ENSOARG00000013265	SMARCA2	99	80.968	Ovis_aries
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	90	86.859	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	100	81.812	Pan_paniscus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	80.371	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	99	81.836	Panthera_pardus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	80.231	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	100	80.350	Pan_troglodytes
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	75.827	ENSPANG00000025121	SMARCA2	100	76.452	Papio_anubis
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	100	84.287	ENSPKIG00000018469	-	100	83.470	Paramormyrops_kingsleyae
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	79.949	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	100	79.513	Pelodiscus_sinensis
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	98	85.419	ENSPMGG00000013696	-	99	85.355	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	96	80.547	ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	79.537	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	95	70.562	ENSPMAG00000005337	-	97	69.873	Petromyzon_marinus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	96	81.944	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	99	81.688	Phascolarctos_cinereus
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	100	91.217	ENSPFOG00000001856	SMARCA2	100	91.217	Poecilia_formosa
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	99	90.777	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	96	90.518	Poecilia_latipinna
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	99	90.708	ENSPMEG00000001815	-	99	90.399	Poecilia_mexicana
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	100	90.411	ENSPREG00000013800	SMARCA2	100	90.156	Poecilia_reticulata
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	79.225	ENSPPYG00000019258	SMARCA2	100	80.063	Pongo_abelii
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	77	73.592	ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	73.592	Procavia_capensis
ENSHBUG00000006691	SMARCA2	96	79.423	ENSPCOG00000025709	SMARCA2	100	78.307	Propithecus_coquereli
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