EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSHBUG00000008068 (Gene tree)
Gene ID: 102292593
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Haplochromis_burtoni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 23330 bases
Position: chrJH425432.1:14784-38113
Accession: 102292593
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHBUP00000006585	IBN_N	PF03810.19	1.7e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHBUT00000005049	-	5978	XM_005929757	ENSHBUP00000006585	890 (aa)	XP_005929819	UPI0003BD27B9

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSHBUG00000008068	tnpo1	99	85.473	ENSHBUG00000014849	tnpo2	99	85.473
ENSHBUG00000008068	tnpo1	99	86.486	ENSHBUG00000018317	-	99	86.486

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.146	ENSG00000083312	TNPO1	100	93.782	Homo_sapiens
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	98.652	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	98.652	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	92.205	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.316	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHBUG00000008068	tnpo1	87	98.966	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	98.966	Amphilophus_citrinellus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	98.652	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	98.652	Amphiprion_ocellaris
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	98.652	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	98.652	Amphiprion_percula
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	98.202	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	98.202	Anabas_testudineus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	99	89.402	ENSAPLG00000009619	-	97	90.138	Anas_platyrhynchos
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.371	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	93.371	Anolis_carolinensis
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	83.146	ENSANAG00000025351	-	99	83.146	Aotus_nancymaae
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	60.421	ENSANAG00000027118	-	99	60.310	Aotus_nancymaae
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	92.697	ENSANAG00000022453	-	99	92.697	Aotus_nancymaae
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	98.202	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	98.202	Astatotilapia_calliptera
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	94.170	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	93.498	Astyanax_mexicanus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.258	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	93.258	Bos_taurus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	92.809	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	92.809	Callithrix_jacchus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	96	93.116	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	93.116	Canis_familiaris
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	90.787	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	90.787	Canis_lupus_dingo
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.146	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	93.146	Capra_hircus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	99	89.605	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	91.930	Carlito_syrichta
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	92.697	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	92.697	Cebus_capucinus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.146	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	93.146	Cercocebus_atys
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	92.697	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	92.697	Chinchilla_lanigera
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.146	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	93.146	Chlorocebus_sabaeus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	94	81.526	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.526	Choloepus_hoffmanni
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.596	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.596	Chrysemys_picta_bellii
ENSHBUG00000008068	tnpo1	99	76.094	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.421	Ciona_savignyi
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.146	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	93.146	Colobus_angolensis_palliatus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.258	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	93.258	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSHBUG00000008068	tnpo1	96	93.450	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	93.450	Cricetulus_griseus_crigri
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	96.292	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	96.292	Cynoglossus_semilaevis
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	96.966	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	96.966	Cyprinodon_variegatus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	94.388	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	93.939	Danio_rerio
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	87.682	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	87.682	Dasypus_novemcinctus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	93	93.373	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	93.366	Dipodomys_ordii
ENSHBUG00000008068	tnpo1	99	58.625	FBgn0035693	CG8219	99	58.174	Drosophila_melanogaster
ENSHBUG00000008068	tnpo1	86	94.382	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.382	Echinops_telfairi
ENSHBUG00000008068	tnpo1	94	85.119	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.119	Eptatretus_burgeri
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.146	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	93.146	Equus_asinus_asinus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.146	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	93.146	Equus_caballus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	88.235	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	88.126	Esox_lucius
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.146	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	93.146	Felis_catus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.708	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.708	Ficedula_albicollis
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	92.809	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.809	Fukomys_damarensis
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	97.082	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	97.082	Fundulus_heteroclitus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	92.833	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.833	Gadus_morhua
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	92.921	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	92.921	Gallus_gallus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	96.525	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	96.525	Gambusia_affinis
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	96.404	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	96.404	Gasterosteus_aculeatus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.483	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	93.483	Gopherus_agassizii
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	78.027	ENSGGOG00000022535	-	98	78.027	Gorilla_gorilla
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.146	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	93.146	Gorilla_gorilla
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	92.697	ENSHGLG00000000970	-	99	92.697	Heterocephalus_glaber_female
ENSHBUG00000008068	tnpo1	97	72.558	ENSHGLG00100000963	-	99	71.977	Heterocephalus_glaber_male
ENSHBUG00000008068	tnpo1	96	92.757	ENSHGLG00100017090	-	99	92.757	Heterocephalus_glaber_male
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.258	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	93.258	Jaculus_jaculus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	96.742	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	96.742	Kryptolebias_marmoratus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	92	93.040	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	94.205	Labrus_bergylta
ENSHBUG00000008068	tnpo1	96	86.977	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	86.977	Latimeria_chalumnae
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	94.382	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	94.382	Lepisosteus_oculatus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	97	92.494	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.494	Loxodonta_africana
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.146	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	93.146	Macaca_fascicularis
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.034	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	93.115	Macaca_mulatta
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.146	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	93.146	Macaca_nemestrina
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.146	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	93.146	Mandrillus_leucophaeus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	98.652	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	98.652	Mastacembelus_armatus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	99.551	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	99.551	Maylandia_zebra
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.258	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.820	Mesocricetus_auratus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	89.551	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.551	Microcebus_murinus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.258	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	93.258	Microtus_ochrogaster
ENSHBUG00000008068	tnpo1	87	96.907	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.907	Mola_mola
ENSHBUG00000008068	tnpo1	99	93.830	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	93.830	Monodelphis_domestica
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	97.303	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	97.303	Monopterus_albus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.258	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	93.820	Mus_caroli
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.258	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	93.820	Mus_musculus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.371	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.820	Mus_pahari
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.034	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	93.820	Mus_spretus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.146	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	93.146	Mustela_putorius_furo
ENSHBUG00000008068	tnpo1	96	92.782	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.782	Myotis_lucifugus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.371	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.371	Nannospalax_galili
ENSHBUG00000008068	tnpo1	87	99.225	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	99.225	Neolamprologus_brichardi
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.146	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	93.146	Nomascus_leucogenys
ENSHBUG00000008068	tnpo1	90	87.935	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	87.935	Ochotona_princeps
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	92.472	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.472	Octodon_degus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	99.219	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	99.219	Oreochromis_niloticus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	92	93.902	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	93.902	Ornithorhynchus_anatinus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	96	87.033	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	87.033	Oryctolagus_cuniculus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	87	97.017	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	97.017	Oryzias_latipes
ENSHBUG00000008068	tnpo1	99	97.182	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	97.182	Oryzias_latipes_hni
ENSHBUG00000008068	tnpo1	99	97.520	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	97.520	Oryzias_latipes_hsok
ENSHBUG00000008068	tnpo1	99	97.069	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	97.069	Oryzias_melastigma
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.146	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	93.146	Otolemur_garnettii
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.258	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	93.258	Ovis_aries
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.146	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	93.146	Pan_paniscus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.146	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	93.146	Panthera_pardus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.146	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	93.146	Panthera_tigris_altaica
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.146	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	93.146	Pan_troglodytes
ENSHBUG00000008068	tnpo1	94	82.044	ENSPTRG00000047731	-	100	82.044	Pan_troglodytes
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.146	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	93.146	Papio_anubis
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	90.674	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.674	Paramormyrops_kingsleyae
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.596	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.596	Pelodiscus_sinensis
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	94.388	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	94.052	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	96	93.450	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	93.450	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	94.157	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	94.157	Phascolarctos_cinereus
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	96.865	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	96.865	Poecilia_formosa
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	96.865	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	96.865	Poecilia_latipinna
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	97.303	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	97.303	Poecilia_mexicana
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	97.085	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	97.085	Poecilia_reticulata
ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.034	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	93.034	Pongo_abelii
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ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.034	ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	93.034	Pteropus_vampyrus
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