EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSHBUG00000008331 (Gene tree)
Gene ID: 102303189
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC102303189
Gene Type: protein_coding
Species: Haplochromis_burtoni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9642 bases
Position: chrJH425603.1:344455-354096
Accession: 102303189
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHBUP00000006850	MMR_HSR1	PF01926.23	2.7e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHBUT00000004616	-	1424	XM_005940166	ENSHBUP00000006850	448 (aa)	XP_005940228	UPI0003AFED04

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	60.177	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	60.177

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	60.444	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	60.444	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	92.857	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	92.857	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	95.312	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	95.312	Amphilophus_citrinellus
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	58.980	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	58.980	Amphilophus_citrinellus
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	60.667	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	60.667	Amphiprion_ocellaris
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	93.080	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	93.080	Amphiprion_ocellaris
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	60.444	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	60.444	Amphiprion_percula
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	93.080	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	93.080	Amphiprion_percula
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	91.518	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	91.518	Anabas_testudineus
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	60.444	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	60.444	Anabas_testudineus
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	99	58.036	ENSACAG00000028632	-	99	58.129	Anolis_carolinensis
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	59.956	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	59.956	Astatotilapia_calliptera
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	99.554	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	99.554	Astatotilapia_calliptera
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	60.132	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	60.132	Astyanax_mexicanus
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	80.846	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	80.846	Astyanax_mexicanus
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	79	62.079	ENSCING00000020807	-	94	62.079	Ciona_intestinalis
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	98	56.591	ENSCSAVG00000009987	-	98	56.818	Ciona_savignyi
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	89.509	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	87.028	Cynoglossus_semilaevis
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	58.444	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Cynoglossus_semilaevis
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	60.667	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	60.667	Cyprinodon_variegatus
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	90.848	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	90.848	Cyprinodon_variegatus
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	98	83.864	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	83.864	Danio_rerio
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	61.111	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	75.000	Danio_rerio
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	80	56.546	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	96	56.546	Eptatretus_burgeri
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	99	81.166	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	81.166	Esox_lucius
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	91.741	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	91.741	Fundulus_heteroclitus
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	60.089	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	60.089	Fundulus_heteroclitus
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	89	55.860	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	99	55.860	Gadus_morhua
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Gambusia_affinis
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	91.964	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	91.964	Gambusia_affinis
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	58	94.574	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	94.574	Gasterosteus_aculeatus
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	85	64.136	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	99	62.095	Gasterosteus_aculeatus
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Hippocampus_comes
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	99	85.135	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	85.135	Hippocampus_comes
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	96	60.508	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	60.508	Ictalurus_punctatus
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	77.060	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	77.060	Ictalurus_punctatus
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	84	59.043	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	83	59.043	Ictalurus_punctatus
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Kryptolebias_marmoratus
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	92.634	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	92.634	Kryptolebias_marmoratus
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	91.518	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	91.518	Labrus_bergylta
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	99	62.472	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	62.697	Latimeria_chalumnae
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	99	70.495	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	70.495	Latimeria_chalumnae
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	62.361	ENSLACG00000004899	-	99	62.361	Latimeria_chalumnae
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	99	75.168	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	75.168	Lepisosteus_oculatus
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	92.188	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	92.188	Mastacembelus_armatus
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	96	60.970	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	99	60.970	Mastacembelus_armatus
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	59.735	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	99	59.735	Maylandia_zebra
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	99.777	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	99.777	Maylandia_zebra
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	58.093	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	58.093	Mola_mola
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	98	90.433	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	90.433	Monopterus_albus
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	61.111	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	99	61.111	Monopterus_albus
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	99.330	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	99.330	Neolamprologus_brichardi
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	96	60.739	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	98	60.739	Neolamprologus_brichardi
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	98.884	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	98.884	Oreochromis_niloticus
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	59.513	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	99	59.513	Oreochromis_niloticus
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	60.889	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	60.889	Oryzias_latipes
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	86.830	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	86.830	Oryzias_latipes
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	89.955	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	89.955	Oryzias_latipes_hni
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	60.667	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	99	60.667	Oryzias_latipes_hni
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	90.402	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	90.402	Oryzias_latipes_hsok
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	61.111	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	99	61.111	Oryzias_latipes_hsok
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	61.111	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	99	61.111	Oryzias_melastigma
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	91.964	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	91.964	Oryzias_melastigma
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	58.797	ENSPKIG00000023918	-	98	58.797	Paramormyrops_kingsleyae
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	77.728	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	77.728	Paramormyrops_kingsleyae
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Paramormyrops_kingsleyae
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	86.830	ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	86.830	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	60.177	ENSPMGG00000016507	si:ch211-11k18.4	99	60.177	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	91.131	ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	91.131	Poecilia_formosa
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ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	91.518	ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	91.518	Poecilia_latipinna
ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	91.964	ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	91.964	Poecilia_mexicana
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ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	98	58.542	ENSPREG00000015319	si:ch211-11k18.4	98	58.542	Poecilia_reticulata
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ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	59.912	ENSPNAG00000022138	si:ch211-11k18.4	99	60.132	Pygocentrus_nattereri
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