EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSHBUG00000017410 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rpl39
Alias: fb09f11|wu:fb09f11|zgc:92371
Full Name: ribosomal protein L39
Gene Type: protein_coding
Species: Haplochromis_burtoni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3589 bases
Position: chrJH425325.1:1303296-1306884
Accession: ZDB-GENE-040625-51
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHBUP00000031620	Ribosomal_L39	PF00832.20	9e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHBUT00000023797	-	168	-	ENSHBUP00000031620	55 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHBUG00000017410	rpl39	91	100.000	ENSG00000198918	RPL39	98	100.000	Homo_sapiens
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ENSHBUG00000017410	rpl39	91	100.000	ENSACIG00000013617	rpl39	96	100.000	Amphilophus_citrinellus
ENSHBUG00000017410	rpl39	91	100.000	ENSAOCG00000011218	rpl39	98	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSHBUG00000017410	rpl39	96	92.453	ENSAPEG00000005525	rpl39	100	92.453	Amphiprion_percula
ENSHBUG00000017410	rpl39	91	100.000	ENSATEG00000018783	rpl39	98	100.000	Anabas_testudineus
ENSHBUG00000017410	rpl39	91	98.000	ENSACAG00000003624	RPL39	98	98.000	Anolis_carolinensis
ENSHBUG00000017410	rpl39	91	100.000	ENSANAG00000012309	-	98	100.000	Aotus_nancymaae
ENSHBUG00000017410	rpl39	91	100.000	ENSANAG00000031269	-	98	100.000	Aotus_nancymaae
ENSHBUG00000017410	rpl39	91	98.000	ENSANAG00000012093	-	98	98.000	Aotus_nancymaae
ENSHBUG00000017410	rpl39	91	100.000	ENSANAG00000033543	-	98	100.000	Aotus_nancymaae
ENSHBUG00000017410	rpl39	91	96.000	ENSANAG00000015996	-	98	96.000	Aotus_nancymaae
ENSHBUG00000017410	rpl39	93	96.078	ENSANAG00000011451	-	69	96.078	Aotus_nancymaae
ENSHBUG00000017410	rpl39	100	100.000	ENSACLG00000001657	rpl39	100	100.000	Astatotilapia_calliptera
ENSHBUG00000017410	rpl39	78	100.000	ENSAMXG00000000196	rpl39	86	100.000	Astyanax_mexicanus
ENSHBUG00000017410	rpl39	91	94.000	ENSBTAG00000048422	-	98	94.000	Bos_taurus
ENSHBUG00000017410	rpl39	91	100.000	ENSBTAG00000047136	RPL39	98	100.000	Bos_taurus
ENSHBUG00000017410	rpl39	91	100.000	ENSBTAG00000049441	RPL39	98	100.000	Bos_taurus
ENSHBUG00000017410	rpl39	91	96.000	ENSBTAG00000048605	-	98	96.000	Bos_taurus
ENSHBUG00000017410	rpl39	91	100.000	ENSBTAG00000054736	RPL39	98	100.000	Bos_taurus
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ENSHBUG00000017410	rpl39	91	100.000	ENSBTAG00000034844	RPL39	98	100.000	Bos_taurus
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ENSHBUG00000017410	rpl39	91	90.000	ENSCJAG00000045028	-	67	90.000	Callithrix_jacchus
ENSHBUG00000017410	rpl39	91	100.000	ENSCAFG00000031092	-	98	100.000	Canis_familiaris
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ENSHBUG00000017410	rpl39	91	100.000	ENSCAFG00000032122	-	98	100.000	Canis_familiaris
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