EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSHBUG00000018237 (Gene tree)
Gene ID: 102300794
Gene Symbol: si:dkey-86e18.1
Alias: im:6912651
Full Name: uncharacterized LOC102300794
Gene Type: protein_coding
Species: Haplochromis_burtoni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8199 bases
Position: chrJH425376.1:432922-441120
Accession: 102300794
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHBUP00000016294	Isy1	PF06246.12	4.4e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHBUT00000024772	-	4881	XM_005923213	ENSHBUP00000016294	286 (aa)	XP_005923275	UPI0003BD87D5

Gene Model

Click here to download ENSHBUG00000018237's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSHBUG00000018237's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	99	65.287	ENSAPOG00000002792	si:dkey-86e18.1	97	65.033	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	72.378	ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	96	72.202	Amphilophus_citrinellus
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	99	61.324	ENSAOCG00000014440	si:dkey-86e18.1	96	60.932	Amphiprion_ocellaris
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	99	64.356	ENSAPEG00000011831	si:dkey-86e18.1	97	64.068	Amphiprion_percula
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	99	63.973	ENSATEG00000018061	si:dkey-86e18.1	98	63.574	Anabas_testudineus
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	98.951	ENSACLG00000012308	si:dkey-86e18.1	100	98.951	Astatotilapia_calliptera
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	99	50.865	ENSAMXG00000038638	si:dkey-86e18.1	97	50.890	Astyanax_mexicanus
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	99	59.310	ENSCSEG00000007482	-	97	59.155	Cynoglossus_semilaevis
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	57.372	ENSCVAG00000020099	si:dkey-86e18.1	97	57.426	Cyprinodon_variegatus
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	99	51.761	ENSDARG00000043536	si:dkey-86e18.1	97	51.079	Danio_rerio
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	49.684	ENSELUG00000007229	si:dkey-86e18.1	97	49.511	Esox_lucius
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	99	56.688	ENSFHEG00000023250	si:dkey-86e18.1	97	56.536	Fundulus_heteroclitus
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	75	66.949	ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	66.949	Gambusia_affinis
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	99	49.833	ENSIPUG00000012213	si:dkey-86e18.1	97	49.828	Ictalurus_punctatus
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	99	63.694	ENSKMAG00000008387	si:dkey-86e18.1	97	63.399	Kryptolebias_marmoratus
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	97	55.401	ENSLBEG00000008055	si:dkey-86e18.1	96	56.993	Labrus_bergylta
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	99	40.065	ENSLACG00000003926	si:dkey-86e18.1	84	45.570	Latimeria_chalumnae
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	99	49.315	ENSLOCG00000008902	si:dkey-86e18.1	97	49.123	Lepisosteus_oculatus
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	65.190	ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	97	64.821	Mastacembelus_armatus
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	98.951	ENSMZEG00005019446	si:dkey-86e18.1	100	98.951	Maylandia_zebra
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	59.790	ENSMMOG00000002257	si:dkey-86e18.1	96	59.206	Mola_mola
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	63.548	ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	96	60.432	Monopterus_albus
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	97	83.394	ENSNBRG00000023611	si:dkey-86e18.1	96	83.394	Neolamprologus_brichardi
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	97	94.585	ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	97	94.585	Oreochromis_niloticus
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	56.678	ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	97	56.376	Oryzias_latipes
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	57.667	ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	97	57.388	Oryzias_latipes_hni
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	56.678	ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	97	56.376	Oryzias_latipes_hsok
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	99	56.250	ENSOMEG00000001778	si:dkey-86e18.1	98	56.040	Oryzias_melastigma
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	99	45.775	ENSPKIG00000009550	si:dkey-86e18.1	96	48.207	Paramormyrops_kingsleyae
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	99	51.736	ENSPMGG00000008481	si:dkey-86e18.1	96	51.786	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	59.810	ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	97	59.609	Poecilia_formosa
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	59.494	ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	97	59.283	Poecilia_latipinna
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	59.494	ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	97	59.283	Poecilia_mexicana
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	58.741	ENSPREG00000002081	si:dkey-86e18.1	96	58.484	Poecilia_reticulata
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	98.601	ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	98.601	Pundamilia_nyererei
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	99	51.379	ENSPNAG00000008048	si:dkey-86e18.1	97	51.237	Pygocentrus_nattereri
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	99	45.485	ENSSFOG00015002284	si:dkey-86e18.1	97	45.734	Scleropages_formosus
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	96	63.333	ENSSMAG00000017672	si:dkey-86e18.1	96	63.696	Scophthalmus_maximus
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	66.667	ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	97	66.019	Seriola_dumerili
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	66.144	ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	97	65.484	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	67.197	ENSSPAG00000014712	si:dkey-86e18.1	97	67.213	Stegastes_partitus
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	59.122	ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	97	59.375	Takifugu_rubripes
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	57.343	ENSXCOG00000008851	si:dkey-86e18.1	96	57.040	Xiphophorus_couchianus
ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	60.317	ENSXMAG00000011403	si:dkey-86e18.1	97	60.131	Xiphophorus_maculatus