EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSHBUG00000018605 (Gene tree)
Gene ID: 102296374
Gene Symbol: ipo13
Alias: -
Full Name: importin-13-like
Gene Type: protein_coding
Species: Haplochromis_burtoni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 29810 bases
Position: chrJH425376.1:114884-144693
Accession: 102296374
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHBUP00000016572	Xpo1	PF08389.12	1.4e-22	1	1
ENSHBUP00000016590	Xpo1	PF08389.12	1.6e-22	1	1
ENSHBUP00000016572	IBN_N	PF03810.19	4.2e-10	1	1
ENSHBUP00000016590	IBN_N	PF03810.19	4.5e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHBUT00000025148	-	5480	XM_005923197	ENSHBUP00000016590	961 (aa)	XP_005923259	UPI0003BD8C54
ENSHBUT00000025131	-	2751	-	ENSHBUP00000016572	916 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	68.454	ENSHBUG00000015271	si:ch73-182a11.2	99	68.285

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.751	ENSG00000117408	IPO13	99	81.165	Homo_sapiens
ENSHBUG00000018605	ipo13	100	98.855	ENSAPOG00000003308	ipo13	100	98.855	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	69.731	ENSAPOG00000022358	si:ch73-182a11.2	99	69.628	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.646	ENSAMEG00000001123	IPO13	99	81.061	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	91.974	ENSACIG00000008146	ipo13	100	93.804	Amphilophus_citrinellus
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	68.670	ENSACIG00000011776	si:ch73-182a11.2	98	69.767	Amphilophus_citrinellus
ENSHBUG00000018605	ipo13	100	98.751	ENSAOCG00000004943	ipo13	100	98.751	Amphiprion_ocellaris
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	68.492	ENSAOCG00000024622	si:ch73-182a11.2	99	68.388	Amphiprion_ocellaris
ENSHBUG00000018605	ipo13	100	98.647	ENSAPEG00000011282	ipo13	100	98.647	Amphiprion_percula
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	68.595	ENSAPEG00000001137	si:ch73-182a11.2	99	68.492	Amphiprion_percula
ENSHBUG00000018605	ipo13	100	98.231	ENSATEG00000018367	ipo13	100	98.231	Anabas_testudineus
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	67.632	ENSATEG00000001251	si:ch73-182a11.2	99	68.249	Anabas_testudineus
ENSHBUG00000018605	ipo13	100	80.607	ENSAPLG00000001349	IPO13	99	81.106	Anas_platyrhynchos
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	82.068	ENSACAG00000014300	IPO13	99	82.068	Anolis_carolinensis
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.751	ENSANAG00000034183	IPO13	99	81.447	Aotus_nancymaae
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	69.381	ENSACLG00000013726	si:ch73-182a11.2	99	69.215	Astatotilapia_calliptera
ENSHBUG00000018605	ipo13	100	98.048	ENSACLG00000011458	ipo13	100	99.783	Astatotilapia_calliptera
ENSHBUG00000018605	ipo13	100	91.372	ENSAMXG00000005200	ipo13	100	91.372	Astyanax_mexicanus
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	64.000	ENSAMXG00000006313	si:ch73-182a11.2	99	64.000	Astyanax_mexicanus
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.013	ENSBTAG00000018887	IPO13	99	80.437	Bos_taurus
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.857	ENSCJAG00000007453	IPO13	99	81.551	Callithrix_jacchus
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.435	ENSCAFG00000004875	IPO13	99	80.853	Canis_familiaris
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.435	ENSCAFG00020017359	IPO13	99	80.853	Canis_lupus_dingo
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.118	ENSCHIG00000008341	IPO13	99	80.541	Capra_hircus
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.751	ENSTSYG00000035980	IPO13	99	81.165	Carlito_syrichta
ENSHBUG00000018605	ipo13	88	81.489	ENSCAPG00000001972	IPO13	96	82.099	Cavia_aperea
ENSHBUG00000018605	ipo13	98	81.343	ENSCPOG00000012445	IPO13	98	81.038	Cavia_porcellus
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.857	ENSCCAG00000022035	IPO13	99	81.551	Cebus_capucinus
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.751	ENSCATG00000041276	IPO13	99	81.165	Cercocebus_atys
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.435	ENSCLAG00000002914	IPO13	99	80.853	Chinchilla_lanigera
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.751	ENSCSAG00000001190	IPO13	99	81.165	Chlorocebus_sabaeus
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.025	ENSCPBG00000003471	IPO13	100	82.225	Chrysemys_picta_bellii
ENSHBUG00000018605	ipo13	100	37.326	ENSCING00000001863	-	100	38.150	Ciona_intestinalis
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	36.257	ENSCSAVG00000001368	-	99	36.782	Ciona_savignyi
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.751	ENSCANG00000009091	IPO13	99	81.165	Colobus_angolensis_palliatus
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	80.485	ENSCGRG00001021177	Ipo13	99	80.189	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	80.485	ENSCGRG00000012411	Ipo13	99	80.189	Cricetulus_griseus_crigri
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	62.994	ENSCSEG00000016612	si:ch73-182a11.2	99	62.994	Cynoglossus_semilaevis
ENSHBUG00000018605	ipo13	100	94.173	ENSCSEG00000007713	ipo13	100	94.173	Cynoglossus_semilaevis
ENSHBUG00000018605	ipo13	97	65.745	ENSCVAG00000007910	si:ch73-182a11.2	100	65.745	Cyprinodon_variegatus
ENSHBUG00000018605	ipo13	100	97.399	ENSCVAG00000013039	ipo13	100	97.399	Cyprinodon_variegatus
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	91.254	ENSDARG00000060618	ipo13	99	91.254	Danio_rerio
ENSHBUG00000018605	ipo13	100	65.401	ENSDARG00000076996	si:ch73-182a11.2	99	66.175	Danio_rerio
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.435	ENSDNOG00000016583	IPO13	99	80.853	Dasypus_novemcinctus
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.646	ENSDORG00000005471	Ipo13	99	81.061	Dipodomys_ordii
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	68.476	ENSEBUG00000006281	ipo13	100	67.819	Eptatretus_burgeri
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.435	ENSEASG00005001738	IPO13	99	80.853	Equus_asinus_asinus
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.435	ENSECAG00000015508	IPO13	99	80.853	Equus_caballus
ENSHBUG00000018605	ipo13	68	85.450	ENSEEUG00000011681	IPO13	82	85.450	Erinaceus_europaeus
ENSHBUG00000018605	ipo13	100	66.293	ENSELUG00000003341	si:ch73-182a11.2	99	66.090	Esox_lucius
ENSHBUG00000018605	ipo13	100	93.444	ENSELUG00000001498	ipo13	100	93.444	Esox_lucius
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.540	ENSFCAG00000006488	IPO13	99	80.957	Felis_catus
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	80.480	ENSFALG00000005368	IPO13	100	81.897	Ficedula_albicollis
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.329	ENSFDAG00000015599	IPO13	99	80.749	Fukomys_damarensis
ENSHBUG00000018605	ipo13	100	97.294	ENSFHEG00000023271	ipo13	100	97.294	Fundulus_heteroclitus
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	67.355	ENSFHEG00000015719	si:ch73-182a11.2	99	67.250	Fundulus_heteroclitus
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	59.423	ENSGMOG00000016863	si:ch73-182a11.2	99	59.585	Gadus_morhua
ENSHBUG00000018605	ipo13	100	95.010	ENSGMOG00000015856	ipo13	99	95.010	Gadus_morhua
ENSHBUG00000018605	ipo13	100	81.374	ENSGALG00000010087	IPO13	100	81.374	Gallus_gallus
ENSHBUG00000018605	ipo13	100	97.503	ENSGAFG00000006361	ipo13	100	97.503	Gambusia_affinis
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	67.045	ENSGAFG00000011643	si:ch73-182a11.2	99	66.839	Gambusia_affinis
ENSHBUG00000018605	ipo13	100	94.906	ENSGACG00000014562	ipo13	99	94.906	Gasterosteus_aculeatus
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	68.530	ENSGACG00000016242	si:ch73-182a11.2	99	68.530	Gasterosteus_aculeatus
ENSHBUG00000018605	ipo13	100	81.040	ENSGAGG00000008331	IPO13	98	82.535	Gopherus_agassizii
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.751	ENSGGOG00000016375	IPO13	99	81.165	Gorilla_gorilla
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.224	ENSHGLG00000001822	IPO13	99	80.922	Heterocephalus_glaber_female
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.224	ENSHGLG00100015830	IPO13	99	80.922	Heterocephalus_glaber_male
ENSHBUG00000018605	ipo13	100	91.988	ENSHCOG00000018408	ipo13	98	94.707	Hippocampus_comes
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	63.192	ENSHCOG00000005273	si:ch73-182a11.2	99	64.072	Hippocampus_comes
ENSHBUG00000018605	ipo13	100	59.027	ENSIPUG00000010787	si:ch73-182a11.2	100	59.812	Ictalurus_punctatus
ENSHBUG00000018605	ipo13	100	89.906	ENSIPUG00000011283	IPO13	99	89.906	Ictalurus_punctatus
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.646	ENSSTOG00000003611	IPO13	99	81.061	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.435	ENSJJAG00000018591	Ipo13	99	81.132	Jaculus_jaculus
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	69.112	ENSKMAG00000006041	si:ch73-182a11.2	99	68.866	Kryptolebias_marmoratus
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	97.587	ENSKMAG00000007869	ipo13	99	97.587	Kryptolebias_marmoratus
ENSHBUG00000018605	ipo13	100	95.421	ENSLBEG00000007442	ipo13	99	95.421	Labrus_bergylta
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	67.324	ENSLBEG00000011390	si:ch73-182a11.2	100	67.220	Labrus_bergylta
ENSHBUG00000018605	ipo13	75	31.902	ENSLACG00000002351	TNPO3	81	32.812	Latimeria_chalumnae
ENSHBUG00000018605	ipo13	100	75.620	ENSLACG00000016657	IPO13	98	77.200	Latimeria_chalumnae
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	84.896	ENSLOCG00000010620	ipo13	99	84.896	Lepisosteus_oculatus
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	79.916	ENSLAFG00000017144	IPO13	99	79.357	Loxodonta_africana
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.751	ENSMFAG00000032846	IPO13	99	81.165	Macaca_fascicularis
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.751	ENSMMUG00000015142	IPO13	99	81.165	Macaca_mulatta
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.751	ENSMNEG00000041971	IPO13	99	81.165	Macaca_nemestrina
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.751	ENSMLEG00000044330	IPO13	99	81.165	Mandrillus_leucophaeus
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	69.008	ENSMAMG00000000328	si:ch73-182a11.2	99	68.866	Mastacembelus_armatus
ENSHBUG00000018605	ipo13	100	97.919	ENSMAMG00000017290	ipo13	100	97.919	Mastacembelus_armatus
ENSHBUG00000018605	ipo13	100	99.792	ENSMZEG00005019335	ipo13	100	99.792	Maylandia_zebra
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	69.278	ENSMZEG00005009283	si:ch73-182a11.2	99	69.112	Maylandia_zebra
ENSHBUG00000018605	ipo13	100	78.850	ENSMGAG00000009898	IPO13	99	80.597	Meleagris_gallopavo
ENSHBUG00000018605	ipo13	83	82.322	ENSMAUG00000013018	Ipo13	98	82.405	Mesocricetus_auratus
ENSHBUG00000018605	ipo13	92	84.706	ENSMICG00000011003	IPO13	99	81.421	Microcebus_murinus
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.224	ENSMOCG00000008881	Ipo13	99	80.922	Microtus_ochrogaster
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	67.241	ENSMMOG00000018046	si:ch73-182a11.2	99	66.736	Mola_mola
ENSHBUG00000018605	ipo13	100	92.408	ENSMMOG00000001954	ipo13	99	94.243	Mola_mola
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	79.935	ENSMODG00000003017	IPO13	100	81.243	Monodelphis_domestica
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	94.354	ENSMALG00000010805	ipo13	100	95.983	Monopterus_albus
ENSHBUG00000018605	ipo13	81	69.669	ENSMALG00000006451	si:ch73-182a11.2	99	68.640	Monopterus_albus
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ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.329	MGP_SPRETEiJ_G0027339	Ipo13	99	81.027	Mus_spretus
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	75.893	ENSMPUG00000013635	IPO13	99	75.416	Mustela_putorius_furo
ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.540	ENSMLUG00000006360	IPO13	99	81.061	Myotis_lucifugus
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ENSHBUG00000018605	ipo13	87	73.029	ENSNBRG00000006781	si:ch73-182a11.2	96	71.785	Neolamprologus_brichardi
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ENSHBUG00000018605	ipo13	99	67.459	ENSXMAG00000019173	si:ch73-182a11.2	99	67.149	Xiphophorus_maculatus
ENSHBUG00000018605	ipo13	100	97.503	ENSXMAG00000011485	ipo13	100	97.662	Xiphophorus_maculatus