EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSHBUG00000020037 (Gene tree)
Gene ID: 102296990
Gene Symbol: -
Alias: CRM1|emb
Full Name: exportin-1
Gene Type: protein_coding
Species: Haplochromis_burtoni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 21683 bases
Position: chrJH426023.1:29597-51279
Accession: 102296990
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHBUP00000017884	CRM1_C	PF08767.11	1.9e-134	1	1
ENSHBUP00000017874	CRM1_C	PF08767.11	2.1e-134	1	1
ENSHBUP00000017884	Xpo1	PF08389.12	2e-41	1	1
ENSHBUP00000017874	Xpo1	PF08389.12	2.1e-41	1	1
ENSHBUP00000017874	IBN_N	PF03810.19	1.1e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHBUT00000026758	-	3222	XM_005949447	ENSHBUP00000017874	1071 (aa)	XP_005949509	UPI0003BCAED9
ENSHBUT00000026752	-	1039	-	ENSHBUP00000017863	106 (aa)	-	-
ENSHBUT00000026772	-	3271	XM_005949449	ENSHBUP00000017884	1010 (aa)	XP_005949511	UPI000394033E

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSHBUG00000020037	-	100	92.997	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	92.997

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHBUG00000020037	-	100	95.518	ENSG00000082898	XPO1	100	95.518	Homo_sapiens
ENSHBUG00000020037	-	100	99.533	ENSAPOG00000004984	-	100	99.533	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHBUG00000020037	-	93	91.809	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	91.809	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHBUG00000020037	-	100	96.175	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	96.175	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHBUG00000020037	-	93	99.894	ENSACIG00000010818	-	100	99.894	Amphilophus_citrinellus
ENSHBUG00000020037	-	93	94.043	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	94.043	Amphilophus_citrinellus
ENSHBUG00000020037	-	100	92.904	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	92.904	Amphiprion_ocellaris
ENSHBUG00000020037	-	100	99.627	ENSAOCG00000010121	-	100	99.627	Amphiprion_ocellaris
ENSHBUG00000020037	-	96	93.320	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	93.615	Amphiprion_percula
ENSHBUG00000020037	-	100	99.627	ENSAPEG00000007038	-	100	99.627	Amphiprion_percula
ENSHBUG00000020037	-	100	99.627	ENSATEG00000008816	-	100	99.627	Anabas_testudineus
ENSHBUG00000020037	-	100	92.904	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	92.904	Anabas_testudineus
ENSHBUG00000020037	-	100	96.545	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	96.545	Anas_platyrhynchos
ENSHBUG00000020037	-	100	96.452	ENSACAG00000002501	XPO1	100	96.452	Anolis_carolinensis
ENSHBUG00000020037	-	100	95.518	ENSANAG00000020802	XPO1	100	95.518	Aotus_nancymaae
ENSHBUG00000020037	-	93	94.043	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	94.043	Astatotilapia_calliptera
ENSHBUG00000020037	-	100	99.907	ENSACLG00000015192	-	100	99.907	Astatotilapia_calliptera
ENSHBUG00000020037	-	93	95.127	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	95.127	Astyanax_mexicanus
ENSHBUG00000020037	-	100	98.039	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	98.039	Astyanax_mexicanus
ENSHBUG00000020037	-	100	96.265	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	96.265	Bos_taurus
ENSHBUG00000020037	-	99	51.941	WBGene00002078	xpo-1	99	51.941	Caenorhabditis_elegans
ENSHBUG00000020037	-	100	95.518	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	95.518	Callithrix_jacchus
ENSHBUG00000020037	-	100	96.265	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	96.265	Canis_familiaris
ENSHBUG00000020037	-	96	96.498	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	96.386	Canis_lupus_dingo
ENSHBUG00000020037	-	100	96.265	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	96.265	Capra_hircus
ENSHBUG00000020037	-	100	96.265	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	96.265	Carlito_syrichta
ENSHBUG00000020037	-	56	91.489	ENSCAPG00000006454	-	100	91.489	Cavia_aperea
ENSHBUG00000020037	-	100	94.771	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	94.771	Cavia_porcellus
ENSHBUG00000020037	-	100	77.273	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	77.458	Cebus_capucinus
ENSHBUG00000020037	-	100	93.762	ENSCATG00000032674	XPO1	100	95.957	Cercocebus_atys
ENSHBUG00000020037	-	100	95.985	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	95.985	Chinchilla_lanigera
ENSHBUG00000020037	-	100	95.518	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	95.518	Chlorocebus_sabaeus
ENSHBUG00000020037	-	83	97.276	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	97.276	Choloepus_hoffmanni
ENSHBUG00000020037	-	100	96.545	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	96.545	Chrysemys_picta_bellii
ENSHBUG00000020037	-	99	81.343	ENSCING00000024562	-	99	81.343	Ciona_intestinalis
ENSHBUG00000020037	-	99	80.299	ENSCSAVG00000005965	-	99	80.299	Ciona_savignyi
ENSHBUG00000020037	-	100	91.410	ENSCANG00000028883	XPO1	100	95.390	Colobus_angolensis_palliatus
ENSHBUG00000020037	-	100	95.238	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	95.238	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSHBUG00000020037	-	100	95.238	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	95.238	Cricetulus_griseus_crigri
ENSHBUG00000020037	-	93	98.085	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	98.085	Cynoglossus_semilaevis
ENSHBUG00000020037	-	100	92.063	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	92.063	Cyprinodon_variegatus
ENSHBUG00000020037	-	100	99.533	ENSCVAG00000016788	-	100	99.533	Cyprinodon_variegatus
ENSHBUG00000020037	-	100	98.133	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	98.133	Danio_rerio
ENSHBUG00000020037	-	100	94.585	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	96.130	Danio_rerio
ENSHBUG00000020037	-	100	96.359	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	96.359	Dasypus_novemcinctus
ENSHBUG00000020037	-	92	93.393	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	93.393	Dipodomys_ordii
ENSHBUG00000020037	-	99	71.040	FBgn0020497	emb	99	71.040	Drosophila_melanogaster
ENSHBUG00000020037	-	94	95.756	ENSETEG00000018045	XPO1	94	95.756	Echinops_telfairi
ENSHBUG00000020037	-	95	79.668	ENSEBUG00000012580	-	100	88.402	Eptatretus_burgeri
ENSHBUG00000020037	-	100	96.265	ENSEASG00005007223	XPO1	100	96.265	Equus_asinus_asinus
ENSHBUG00000020037	-	100	96.265	ENSECAG00000024920	XPO1	100	96.265	Equus_caballus
ENSHBUG00000020037	-	92	93.750	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	93.750	Erinaceus_europaeus
ENSHBUG00000020037	-	93	96.489	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	96.489	Esox_lucius
ENSHBUG00000020037	-	92	94.433	ENSELUG00000014306	-	99	94.433	Esox_lucius
ENSHBUG00000020037	-	100	96.265	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	96.265	Felis_catus
ENSHBUG00000020037	-	100	96.359	ENSFALG00000010989	XPO1	100	96.359	Ficedula_albicollis
ENSHBUG00000020037	-	100	94.398	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	94.398	Fukomys_damarensis
ENSHBUG00000020037	-	100	92.530	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	92.530	Fundulus_heteroclitus
ENSHBUG00000020037	-	100	94.118	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	94.118	Gadus_morhua
ENSHBUG00000020037	-	100	92.717	ENSGMOG00000019063	-	100	92.717	Gadus_morhua
ENSHBUG00000020037	-	100	96.545	ENSGALG00000029476	XPO1	100	96.545	Gallus_gallus
ENSHBUG00000020037	-	98	99.392	ENSGAFG00000003355	-	100	99.392	Gambusia_affinis
ENSHBUG00000020037	-	93	94.043	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	94.043	Gambusia_affinis
ENSHBUG00000020037	-	100	92.717	ENSGACG00000019736	xpo1a	100	92.717	Gasterosteus_aculeatus
ENSHBUG00000020037	-	100	99.160	ENSGACG00000002743	-	100	99.160	Gasterosteus_aculeatus
ENSHBUG00000020037	-	100	96.452	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	96.452	Gopherus_agassizii
ENSHBUG00000020037	-	100	95.518	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	95.518	Gorilla_gorilla
ENSHBUG00000020037	-	100	95.892	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	95.892	Heterocephalus_glaber_female
ENSHBUG00000020037	-	100	95.892	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	95.892	Heterocephalus_glaber_male
ENSHBUG00000020037	-	93	98.191	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	98.191	Hippocampus_comes
ENSHBUG00000020037	-	100	98.413	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	98.413	Ictalurus_punctatus
ENSHBUG00000020037	-	100	94.678	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.678	Ictalurus_punctatus
ENSHBUG00000020037	-	100	96.078	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	96.078	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSHBUG00000020037	-	100	96.172	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	96.172	Jaculus_jaculus
ENSHBUG00000020037	-	100	92.530	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	92.530	Kryptolebias_marmoratus
ENSHBUG00000020037	-	100	98.693	ENSKMAG00000016218	-	100	98.784	Kryptolebias_marmoratus
ENSHBUG00000020037	-	93	91.314	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	91.314	Labrus_bergylta
ENSHBUG00000020037	-	100	99.253	ENSLBEG00000005740	-	100	99.253	Labrus_bergylta
ENSHBUG00000020037	-	100	75.808	ENSLACG00000018213	XPO1	100	75.808	Latimeria_chalumnae
ENSHBUG00000020037	-	100	97.946	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	97.946	Lepisosteus_oculatus
ENSHBUG00000020037	-	100	95.985	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	95.985	Loxodonta_africana
ENSHBUG00000020037	-	100	95.518	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	95.518	Macaca_fascicularis
ENSHBUG00000020037	-	100	95.518	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	95.518	Macaca_mulatta
ENSHBUG00000020037	-	100	95.518	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	95.518	Macaca_nemestrina
ENSHBUG00000020037	-	100	93.767	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	93.767	Mandrillus_leucophaeus
ENSHBUG00000020037	-	100	92.810	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	92.810	Mastacembelus_armatus
ENSHBUG00000020037	-	100	99.346	ENSMAMG00000010568	-	100	99.346	Mastacembelus_armatus
ENSHBUG00000020037	-	100	92.997	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	92.997	Maylandia_zebra
ENSHBUG00000020037	-	100	99.907	ENSMZEG00005018158	-	100	99.899	Maylandia_zebra
ENSHBUG00000020037	-	72	96.556	ENSMGAG00000001496	-	100	96.556	Meleagris_gallopavo
ENSHBUG00000020037	-	100	95.238	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	95.238	Mesocricetus_auratus
ENSHBUG00000020037	-	100	96.265	ENSMICG00000027770	XPO1	100	96.265	Microcebus_murinus
ENSHBUG00000020037	-	100	95.518	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	95.518	Microtus_ochrogaster
ENSHBUG00000020037	-	93	98.933	ENSMMOG00000008001	-	99	98.933	Mola_mola
ENSHBUG00000020037	-	93	94.255	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	94.255	Mola_mola
ENSHBUG00000020037	-	100	95.238	ENSMODG00000002831	XPO1	100	95.238	Monodelphis_domestica
ENSHBUG00000020037	-	100	99.253	ENSMALG00000007085	-	100	99.253	Monopterus_albus
ENSHBUG00000020037	-	93	93.199	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	93.199	Monopterus_albus
ENSHBUG00000020037	-	100	95.518	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	95.518	Mus_caroli
ENSHBUG00000020037	-	100	95.425	ENSMUSG00000020290	Xpo1	100	95.425	Mus_musculus
ENSHBUG00000020037	-	100	95.331	MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	95.331	Mus_pahari
ENSHBUG00000020037	-	100	95.425	MGP_SPRETEiJ_G0016979	Xpo1	100	95.425	Mus_spretus
ENSHBUG00000020037	-	100	96.265	ENSMPUG00000005560	XPO1	100	96.265	Mustela_putorius_furo
ENSHBUG00000020037	-	100	96.172	ENSMLUG00000010670	XPO1	100	96.172	Myotis_lucifugus
ENSHBUG00000020037	-	100	96.265	ENSNGAG00000022158	Xpo1	100	96.265	Nannospalax_galili
ENSHBUG00000020037	-	96	99.226	ENSNBRG00000012229	-	100	100.000	Neolamprologus_brichardi
ENSHBUG00000020037	-	100	92.997	ENSNBRG00000003776	xpo1a	100	92.997	Neolamprologus_brichardi
ENSHBUG00000020037	-	100	91.811	ENSNLEG00000009680	XPO1	100	91.811	Nomascus_leucogenys
ENSHBUG00000020037	-	63	97.778	ENSMEUG00000013277	-	63	97.778	Notamacropus_eugenii
ENSHBUG00000020037	-	96	96.392	ENSOPRG00000012615	XPO1	100	90.756	Ochotona_princeps
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ENSHBUG00000020037	-	100	92.997	ENSPNYG00000023463	xpo1a	100	92.997	Pundamilia_nyererei
ENSHBUG00000020037	-	100	95.145	ENSPNAG00000014209	xpo1a	100	95.145	Pygocentrus_nattereri
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ENSHBUG00000020037	-	100	95.518	ENSRROG00000038442	XPO1	100	95.518	Rhinopithecus_roxellana
ENSHBUG00000020037	-	98	47.271	YGR218W	CRM1	99	47.271	Saccharomyces_cerevisiae
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ENSHBUG00000020037	-	100	95.892	ENSXETG00000002224	xpo1	100	95.892	Xenopus_tropicalis
ENSHBUG00000020037	-	93	93.936	ENSXCOG00000011889	XPO1	100	93.936	Xiphophorus_couchianus
ENSHBUG00000020037	-	83	99.233	ENSXCOG00000006625	-	97	99.233	Xiphophorus_couchianus
ENSHBUG00000020037	-	100	99.440	ENSXMAG00000007353	-	100	99.440	Xiphophorus_maculatus
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