EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSHBUG00000020155 (Gene tree)
Gene ID: 102311804
Gene Symbol: twistnb
Alias: -
Full Name: TWIST neighbor
Gene Type: protein_coding
Species: Haplochromis_burtoni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5404 bases
Position: chrJH425419.1:141267-146670
Accession: 102311804
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHBUP00000018096	SHS2_Rpb7-N	PF03876.17	4.1e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHBUT00000027153	-	3622	XM_005928548	ENSHBUP00000018096	401 (aa)	XP_005928610	UPI0003BC995B

Gene Model

Click here to download ENSHBUG00000020155's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSHBUG00000020155's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHBUG00000020155	twistnb	75	47.195	ENSG00000105849	TWISTNB	55	56.216	Homo_sapiens
ENSHBUG00000020155	twistnb	94	69.452	ENSAPOG00000011796	twistnb	100	70.235	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHBUG00000020155	twistnb	52	54.067	ENSAMEG00000008558	TWISTNB	51	55.446	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHBUG00000020155	twistnb	91	77.507	ENSACIG00000020400	twistnb	96	76.111	Amphilophus_citrinellus
ENSHBUG00000020155	twistnb	93	69.291	ENSAOCG00000024200	twistnb	99	70.079	Amphiprion_ocellaris
ENSHBUG00000020155	twistnb	93	69.029	ENSAPEG00000016750	twistnb	99	70.604	Amphiprion_percula
ENSHBUG00000020155	twistnb	89	67.598	ENSATEG00000017956	twistnb	95	68.056	Anabas_testudineus
ENSHBUG00000020155	twistnb	78	44.272	ENSANAG00000026418	TWISTNB	92	42.090	Aotus_nancymaae
ENSHBUG00000020155	twistnb	100	99.501	ENSACLG00000022280	twistnb	100	99.501	Astatotilapia_calliptera
ENSHBUG00000020155	twistnb	51	55.814	ENSAMXG00000035868	twistnb	65	55.814	Astyanax_mexicanus
ENSHBUG00000020155	twistnb	74	46.557	ENSBTAG00000006721	TWISTNB	89	42.994	Bos_taurus
ENSHBUG00000020155	twistnb	78	46.519	ENSCJAG00000001148	TWISTNB	58	54.822	Callithrix_jacchus
ENSHBUG00000020155	twistnb	75	46.795	ENSTSYG00000001471	TWISTNB	90	42.424	Carlito_syrichta
ENSHBUG00000020155	twistnb	75	45.695	ENSCATG00000035621	TWISTNB	87	42.173	Cercocebus_atys
ENSHBUG00000020155	twistnb	75	45.695	ENSCSAG00000013544	TWISTNB	87	42.173	Chlorocebus_sabaeus
ENSHBUG00000020155	twistnb	75	46.026	ENSCANG00000038759	TWISTNB	87	45.981	Colobus_angolensis_palliatus
ENSHBUG00000020155	twistnb	87	60.326	ENSCVAG00000014324	twistnb	95	55.956	Cyprinodon_variegatus
ENSHBUG00000020155	twistnb	51	58.738	ENSDARG00000024416	twistnb	56	56.364	Danio_rerio
ENSHBUG00000020155	twistnb	89	44.722	ENSEASG00005021702	TWISTNB	65	51.092	Equus_asinus_asinus
ENSHBUG00000020155	twistnb	51	53.623	ENSECAG00000014563	TWISTNB	69	49.590	Equus_caballus
ENSHBUG00000020155	twistnb	92	52.815	ENSELUG00000000098	TWISTNB	96	51.397	Esox_lucius
ENSHBUG00000020155	twistnb	68	41.071	ENSFALG00000009761	TWISTNB	51	54.487	Ficedula_albicollis
ENSHBUG00000020155	twistnb	90	59.239	ENSFHEG00000013318	twistnb	95	59.722	Fundulus_heteroclitus
ENSHBUG00000020155	twistnb	58	73.504	ENSGAFG00000018309	twistnb	95	57.584	Gambusia_affinis
ENSHBUG00000020155	twistnb	63	68.254	ENSGACG00000006425	twistnb	93	68.254	Gasterosteus_aculeatus
ENSHBUG00000020155	twistnb	78	44.409	ENSGGOG00000026888	TWISTNB	55	56.216	Gorilla_gorilla
ENSHBUG00000020155	twistnb	83	47.198	ENSHGLG00000010976	TWISTNB	55	57.297	Heterocephalus_glaber_female
ENSHBUG00000020155	twistnb	89	56.140	ENSHCOG00000010590	twistnb	96	56.030	Hippocampus_comes
ENSHBUG00000020155	twistnb	92	48.138	ENSIPUG00000004117	twistnb	95	49.296	Ictalurus_punctatus
ENSHBUG00000020155	twistnb	94	60.212	ENSKMAG00000001591	twistnb	100	60.743	Kryptolebias_marmoratus
ENSHBUG00000020155	twistnb	94	65.625	ENSLBEG00000024225	twistnb	100	65.969	Labrus_bergylta
ENSHBUG00000020155	twistnb	92	45.553	ENSLACG00000010508	TWISTNB	61	55.204	Latimeria_chalumnae
ENSHBUG00000020155	twistnb	75	45.364	ENSMFAG00000045328	TWISTNB	87	42.173	Macaca_fascicularis
ENSHBUG00000020155	twistnb	84	43.917	ENSMMUG00000009609	TWISTNB	87	42.173	Macaca_mulatta
ENSHBUG00000020155	twistnb	75	45.033	ENSMNEG00000041159	TWISTNB	87	41.853	Macaca_nemestrina
ENSHBUG00000020155	twistnb	75	45.695	ENSMLEG00000042783	TWISTNB	87	42.173	Mandrillus_leucophaeus
ENSHBUG00000020155	twistnb	100	99.501	ENSMZEG00005007561	twistnb	100	99.501	Maylandia_zebra
ENSHBUG00000020155	twistnb	73	47.635	ENSMOCG00000003458	Twistnb	59	58.115	Microtus_ochrogaster
ENSHBUG00000020155	twistnb	94	59.898	ENSMMOG00000020085	twistnb	100	59.391	Mola_mola
ENSHBUG00000020155	twistnb	89	58.621	ENSMALG00000016407	twistnb	95	58.090	Monopterus_albus
ENSHBUG00000020155	twistnb	94	96.809	ENSNBRG00000008652	twistnb	100	96.809	Neolamprologus_brichardi
ENSHBUG00000020155	twistnb	75	46.382	ENSNLEG00000035755	TWISTNB	87	41.667	Nomascus_leucogenys
ENSHBUG00000020155	twistnb	73	44.702	ENSOPRG00000016109	TWISTNB	87	42.453	Ochotona_princeps
ENSHBUG00000020155	twistnb	85	47.414	ENSODEG00000007222	TWISTNB	93	44.411	Octodon_degus
ENSHBUG00000020155	twistnb	95	65.526	ENSORLG00000004005	twistnb	89	65.957	Oryzias_latipes
ENSHBUG00000020155	twistnb	94	64.721	ENSORLG00020002579	twistnb	95	65.642	Oryzias_latipes_hni
ENSHBUG00000020155	twistnb	100	64.677	ENSORLG00015013403	twistnb	90	65.535	Oryzias_latipes_hsok
ENSHBUG00000020155	twistnb	74	45.752	ENSOARG00000009803	TWISTNB	88	43.218	Ovis_aries
ENSHBUG00000020155	twistnb	84	44.048	ENSPPAG00000034623	TWISTNB	55	56.216	Pan_paniscus
ENSHBUG00000020155	twistnb	78	43.034	ENSPPRG00000005877	TWISTNB	59	54.592	Panthera_pardus
ENSHBUG00000020155	twistnb	75	45.695	ENSPTRG00000018962	TWISTNB	87	42.173	Pan_troglodytes
ENSHBUG00000020155	twistnb	75	45.364	ENSPANG00000015736	TWISTNB	87	42.173	Papio_anubis
ENSHBUG00000020155	twistnb	60	52.227	ENSPKIG00000025635	twistnb	67	52.227	Paramormyrops_kingsleyae
ENSHBUG00000020155	twistnb	89	63.612	ENSPMGG00000019023	twistnb	94	62.060	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSHBUG00000020155	twistnb	76	43.548	ENSPCIG00000017456	TWISTNB	91	40.741	Phascolarctos_cinereus
ENSHBUG00000020155	twistnb	75	47.682	ENSPPYG00000017752	TWISTNB	55	57.297	Pongo_abelii
ENSHBUG00000020155	twistnb	94	99.202	ENSPNYG00000002674	twistnb	100	99.202	Pundamilia_nyererei
ENSHBUG00000020155	twistnb	89	42.382	ENSPNAG00000011956	twistnb	61	50.870	Pygocentrus_nattereri
ENSHBUG00000020155	twistnb	75	47.213	ENSRBIG00000043007	TWISTNB	86	45.981	Rhinopithecus_bieti
ENSHBUG00000020155	twistnb	75	46.026	ENSRROG00000040155	TWISTNB	87	45.981	Rhinopithecus_roxellana
ENSHBUG00000020155	twistnb	78	45.426	ENSSBOG00000023188	TWISTNB	58	54.315	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSHBUG00000020155	twistnb	94	64.021	ENSSMAG00000012792	twistnb	100	65.079	Scophthalmus_maximus
ENSHBUG00000020155	twistnb	94	68.668	ENSSDUG00000007038	twistnb	100	68.930	Seriola_dumerili
ENSHBUG00000020155	twistnb	81	37.764	ENSSPUG00000007595	TWISTNB	61	49.231	Sphenodon_punctatus
ENSHBUG00000020155	twistnb	94	68.407	ENSSPAG00000005871	twistnb	100	68.930	Stegastes_partitus
ENSHBUG00000020155	twistnb	58	50.213	ENSSSCG00000025298	TWISTNB	65	51.818	Sus_scrofa
ENSHBUG00000020155	twistnb	84	58.333	ENSTNIG00000017778	twistnb	96	58.359	Tetraodon_nigroviridis
ENSHBUG00000020155	twistnb	88	61.732	ENSXCOG00000020199	twistnb	98	58.981	Xiphophorus_couchianus