EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSHBUG00000020477 (Gene tree)
Gene ID: 102295122
Gene Symbol: syf2
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Haplochromis_burtoni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9870 bases
Position: chrJH425369.1:804162-814031
Accession: 102295122
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHBUP00000033495	SYF2	PF08231.12	2.9e-54	1	1
ENSHBUP00000018363	SYF2	PF08231.12	3.1e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHBUT00000027411	-	2543	-	ENSHBUP00000033495	233 (aa)	-	-
ENSHBUT00000027402	-	2253	XM_005922302	ENSHBUP00000018363	238 (aa)	XP_005922364	UPI0003BD9456

Gene Model

Click here to download ENSHBUG00000020477's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSHBUG00000020477's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHBUG00000020477	syf2	93	82.407	ENSG00000117614	SYF2	90	81.279	Homo_sapiens
ENSHBUG00000020477	syf2	100	91.176	ENSAPOG00000001174	syf2	100	91.176	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHBUG00000020477	syf2	84	81.538	ENSAMEG00000010134	-	100	81.538	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHBUG00000020477	syf2	100	76.569	ENSAMEG00000010115	-	98	76.569	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHBUG00000020477	syf2	100	95.279	ENSACIG00000023688	syf2	93	95.279	Amphilophus_citrinellus
ENSHBUG00000020477	syf2	100	90.336	ENSAOCG00000022046	syf2	99	90.086	Amphiprion_ocellaris
ENSHBUG00000020477	syf2	93	89.593	ENSAOCG00000010912	syf2	69	89.593	Amphiprion_ocellaris
ENSHBUG00000020477	syf2	100	90.336	ENSAPEG00000018858	syf2	92	90.336	Amphiprion_percula
ENSHBUG00000020477	syf2	100	92.857	ENSATEG00000007745	syf2	100	92.857	Anabas_testudineus
ENSHBUG00000020477	syf2	86	83.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	83.000	Anas_platyrhynchos
ENSHBUG00000020477	syf2	71	67.066	ENSACAG00000026777	-	100	67.066	Anolis_carolinensis
ENSHBUG00000020477	syf2	88	81.373	ENSACAG00000013653	-	100	81.373	Anolis_carolinensis
ENSHBUG00000020477	syf2	93	82.870	ENSANAG00000032473	SYF2	93	79.221	Aotus_nancymaae
ENSHBUG00000020477	syf2	100	99.580	ENSACLG00000019916	syf2	100	99.580	Astatotilapia_calliptera
ENSHBUG00000020477	syf2	100	82.773	ENSAMXG00000004051	syf2	100	82.773	Astyanax_mexicanus
ENSHBUG00000020477	syf2	100	79.399	ENSBTAG00000001651	SYF2	97	79.399	Bos_taurus
ENSHBUG00000020477	syf2	89	50.476	WBGene00019402	syf-2	90	50.000	Caenorhabditis_elegans
ENSHBUG00000020477	syf2	93	82.870	ENSCJAG00000046570	SYF2	90	81.735	Callithrix_jacchus
ENSHBUG00000020477	syf2	93	81.481	ENSCAFG00000012895	-	92	78.112	Canis_familiaris
ENSHBUG00000020477	syf2	100	72.961	ENSCAFG00000030331	-	97	72.961	Canis_familiaris
ENSHBUG00000020477	syf2	78	72.527	ENSCAFG00020021094	-	95	72.527	Canis_lupus_dingo
ENSHBUG00000020477	syf2	93	81.481	ENSCAFG00020021091	-	92	78.112	Canis_lupus_dingo
ENSHBUG00000020477	syf2	100	78.970	ENSCHIG00000020874	SYF2	95	78.970	Capra_hircus
ENSHBUG00000020477	syf2	99	78.788	ENSTSYG00000005114	SYF2	93	78.788	Carlito_syrichta
ENSHBUG00000020477	syf2	85	81.818	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	81.818	Cavia_aperea
ENSHBUG00000020477	syf2	100	78.541	ENSCPOG00000005326	SYF2	94	78.541	Cavia_porcellus
ENSHBUG00000020477	syf2	93	82.870	ENSCCAG00000022459	SYF2	93	79.654	Cebus_capucinus
ENSHBUG00000020477	syf2	100	76.050	ENSCATG00000026917	SYF2	90	80.365	Cercocebus_atys
ENSHBUG00000020477	syf2	100	78.970	ENSCLAG00000008474	SYF2	94	78.970	Chinchilla_lanigera
ENSHBUG00000020477	syf2	94	80.365	ENSCSAG00000000948	SYF2	90	80.365	Chlorocebus_sabaeus
ENSHBUG00000020477	syf2	76	60.000	ENSCHOG00000005273	-	99	60.000	Choloepus_hoffmanni
ENSHBUG00000020477	syf2	96	81.333	ENSCPBG00000025073	SYF2	92	79.828	Chrysemys_picta_bellii
ENSHBUG00000020477	syf2	99	53.017	ENSCING00000003017	-	97	53.448	Ciona_intestinalis
ENSHBUG00000020477	syf2	91	52.113	ENSCSAVG00000006627	-	97	52.113	Ciona_savignyi
ENSHBUG00000020477	syf2	100	67.227	ENSCANG00000037322	SYF2	89	70.776	Colobus_angolensis_palliatus
ENSHBUG00000020477	syf2	99	79.399	ENSCGRG00001020733	Syf2	96	79.399	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSHBUG00000020477	syf2	84	82.653	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	82.828	Cricetulus_griseus_crigri
ENSHBUG00000020477	syf2	94	88.991	ENSCSEG00000000117	syf2	97	86.695	Cynoglossus_semilaevis
ENSHBUG00000020477	syf2	100	90.377	ENSCVAG00000019543	syf2	100	90.795	Cyprinodon_variegatus
ENSHBUG00000020477	syf2	99	87.826	ENSDARG00000004706	syf2	100	86.555	Danio_rerio
ENSHBUG00000020477	syf2	99	78.298	ENSDNOG00000047605	SYF2	96	78.298	Dasypus_novemcinctus
ENSHBUG00000020477	syf2	98	80.087	ENSDORG00000001274	Syf2	95	80.087	Dipodomys_ordii
ENSHBUG00000020477	syf2	92	56.481	FBgn0033556	CG12343	94	56.481	Drosophila_melanogaster
ENSHBUG00000020477	syf2	94	65.471	ENSETEG00000015729	SYF2	90	67.633	Echinops_telfairi
ENSHBUG00000020477	syf2	85	58.376	ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.376	Eptatretus_burgeri
ENSHBUG00000020477	syf2	99	78.723	ENSEASG00005004224	-	96	78.723	Equus_asinus_asinus
ENSHBUG00000020477	syf2	99	70.386	ENSEASG00005004232	-	96	70.386	Equus_asinus_asinus
ENSHBUG00000020477	syf2	99	78.723	ENSECAG00000012023	-	96	78.723	Equus_caballus
ENSHBUG00000020477	syf2	100	78.112	ENSECAG00000010440	-	98	78.298	Equus_caballus
ENSHBUG00000020477	syf2	73	68.208	ENSEEUG00000015084	SYF2	95	68.208	Erinaceus_europaeus
ENSHBUG00000020477	syf2	100	83.193	ENSELUG00000003465	syf2	97	83.621	Esox_lucius
ENSHBUG00000020477	syf2	99	79.221	ENSFCAG00000010324	-	76	81.735	Felis_catus
ENSHBUG00000020477	syf2	100	78.112	ENSFCAG00000043095	-	93	78.112	Felis_catus
ENSHBUG00000020477	syf2	88	80.882	ENSFALG00000000460	SYF2	94	76.824	Ficedula_albicollis
ENSHBUG00000020477	syf2	99	77.778	ENSFDAG00000008310	SYF2	96	77.778	Fukomys_damarensis
ENSHBUG00000020477	syf2	97	77.434	ENSFHEG00000007238	syf2	100	77.434	Fundulus_heteroclitus
ENSHBUG00000020477	syf2	92	88.837	ENSGMOG00000019138	syf2	96	88.837	Gadus_morhua
ENSHBUG00000020477	syf2	97	80.176	ENSGALG00000013639	SYF2	90	80.176	Gallus_gallus
ENSHBUG00000020477	syf2	100	89.916	ENSGAFG00000019435	syf2	100	89.916	Gambusia_affinis
ENSHBUG00000020477	syf2	95	90.991	ENSGACG00000007305	syf2	96	89.956	Gasterosteus_aculeatus
ENSHBUG00000020477	syf2	96	81.778	ENSGAGG00000010670	SYF2	94	79.915	Gopherus_agassizii
ENSHBUG00000020477	syf2	93	82.407	ENSGGOG00000012796	SYF2	90	81.279	Gorilla_gorilla
ENSHBUG00000020477	syf2	99	78.632	ENSHGLG00000014393	SYF2	96	78.632	Heterocephalus_glaber_female
ENSHBUG00000020477	syf2	95	71.171	ENSHGLG00000004304	-	98	70.085	Heterocephalus_glaber_female
ENSHBUG00000020477	syf2	99	78.632	ENSHGLG00100014722	SYF2	96	78.632	Heterocephalus_glaber_male
ENSHBUG00000020477	syf2	100	89.916	ENSHCOG00000012904	syf2	78	89.916	Hippocampus_comes
ENSHBUG00000020477	syf2	100	84.100	ENSIPUG00000019859	syf2	100	82.353	Ictalurus_punctatus
ENSHBUG00000020477	syf2	63	76.027	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	76.027	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSHBUG00000020477	syf2	85	82.412	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	82.412	Jaculus_jaculus
ENSHBUG00000020477	syf2	100	92.017	ENSKMAG00000013856	syf2	97	93.013	Kryptolebias_marmoratus
ENSHBUG00000020477	syf2	100	90.756	ENSLBEG00000014425	syf2	100	90.756	Labrus_bergylta
ENSHBUG00000020477	syf2	95	80.090	ENSLACG00000012064	SYF2	93	80.090	Latimeria_chalumnae
ENSHBUG00000020477	syf2	99	84.348	ENSLOCG00000002728	syf2	95	83.193	Lepisosteus_oculatus
ENSHBUG00000020477	syf2	79	54.348	ENSLAFG00000030814	-	100	54.348	Loxodonta_africana
ENSHBUG00000020477	syf2	99	79.149	ENSLAFG00000023150	-	96	79.149	Loxodonta_africana
ENSHBUG00000020477	syf2	100	76.050	ENSMFAG00000041831	SYF2	90	80.365	Macaca_fascicularis
ENSHBUG00000020477	syf2	93	81.481	ENSMMUG00000002968	SYF2	90	80.365	Macaca_mulatta
ENSHBUG00000020477	syf2	100	76.050	ENSMNEG00000030180	SYF2	90	80.365	Macaca_nemestrina
ENSHBUG00000020477	syf2	100	76.050	ENSMLEG00000030248	SYF2	90	80.365	Mandrillus_leucophaeus
ENSHBUG00000020477	syf2	100	91.597	ENSMAMG00000010403	syf2	98	91.597	Mastacembelus_armatus
ENSHBUG00000020477	syf2	100	99.160	ENSMZEG00005006429	syf2	100	99.160	Maylandia_zebra
ENSHBUG00000020477	syf2	85	82.915	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	82.915	Meleagris_gallopavo
ENSHBUG00000020477	syf2	99	80.258	ENSMAUG00000018974	Syf2	96	80.258	Mesocricetus_auratus
ENSHBUG00000020477	syf2	85	82.412	ENSMICG00000016191	SYF2	100	82.412	Microcebus_murinus
ENSHBUG00000020477	syf2	99	79.828	ENSMOCG00000022938	Syf2	96	79.828	Microtus_ochrogaster
ENSHBUG00000020477	syf2	100	88.085	ENSMMOG00000002396	syf2	98	88.085	Mola_mola
ENSHBUG00000020477	syf2	95	76.786	ENSMODG00000013951	-	98	76.786	Monodelphis_domestica
ENSHBUG00000020477	syf2	100	89.212	ENSMALG00000010706	syf2	100	89.212	Monopterus_albus
ENSHBUG00000020477	syf2	99	80.258	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	96	80.258	Mus_caroli
ENSHBUG00000020477	syf2	99	80.258	ENSMUSG00000028821	Syf2	96	80.258	Mus_musculus
ENSHBUG00000020477	syf2	99	80.258	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	96	80.258	Mus_pahari
ENSHBUG00000020477	syf2	99	80.258	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	96	80.258	Mus_spretus
ENSHBUG00000020477	syf2	99	76.695	ENSMPUG00000015801	-	96	76.695	Mustela_putorius_furo
ENSHBUG00000020477	syf2	93	81.481	ENSMPUG00000015802	-	93	77.253	Mustela_putorius_furo
ENSHBUG00000020477	syf2	100	78.541	ENSMLUG00000001885	SYF2	93	78.541	Myotis_lucifugus
ENSHBUG00000020477	syf2	100	76.423	ENSNGAG00000007912	Syf2	96	77.215	Nannospalax_galili
ENSHBUG00000020477	syf2	100	86.777	ENSNBRG00000010720	syf2	99	86.777	Neolamprologus_brichardi
ENSHBUG00000020477	syf2	93	82.407	ENSNLEG00000035185	SYF2	90	81.279	Nomascus_leucogenys
ENSHBUG00000020477	syf2	100	78.390	ENSOPRG00000012870	SYF2	97	78.390	Ochotona_princeps
ENSHBUG00000020477	syf2	98	76.923	ENSODEG00000017664	-	93	79.730	Octodon_degus
ENSHBUG00000020477	syf2	99	68.803	ENSODEG00000014338	-	98	68.803	Octodon_degus
ENSHBUG00000020477	syf2	100	97.899	ENSONIG00000008213	syf2	100	97.899	Oreochromis_niloticus
ENSHBUG00000020477	syf2	87	81.683	ENSOANG00000009552	SYF2	100	81.683	Ornithorhynchus_anatinus
ENSHBUG00000020477	syf2	100	76.639	ENSOCUG00000013050	SYF2	94	79.399	Oryctolagus_cuniculus
ENSHBUG00000020477	syf2	99	90.435	ENSORLG00000028820	syf2	99	90.435	Oryzias_latipes
ENSHBUG00000020477	syf2	99	90.086	ENSORLG00020018333	syf2	100	89.076	Oryzias_latipes_hni
ENSHBUG00000020477	syf2	99	90.517	ENSORLG00015014665	syf2	100	89.496	Oryzias_latipes_hsok
ENSHBUG00000020477	syf2	100	90.558	ENSOMEG00000013911	syf2	100	90.336	Oryzias_melastigma
ENSHBUG00000020477	syf2	99	79.149	ENSOGAG00000009962	SYF2	91	81.532	Otolemur_garnettii
ENSHBUG00000020477	syf2	84	55.385	ENSOARG00000006269	-	100	55.385	Ovis_aries
ENSHBUG00000020477	syf2	100	78.298	ENSOARG00000006348	-	93	78.298	Ovis_aries
ENSHBUG00000020477	syf2	93	82.407	ENSPPAG00000036579	SYF2	90	81.279	Pan_paniscus
ENSHBUG00000020477	syf2	100	78.112	ENSPPRG00000001651	-	93	78.112	Panthera_pardus
ENSHBUG00000020477	syf2	99	79.221	ENSPPRG00000001638	-	89	81.735	Panthera_pardus
ENSHBUG00000020477	syf2	93	82.870	ENSPTIG00000005711	-	80	82.110	Panthera_tigris_altaica
ENSHBUG00000020477	syf2	100	78.112	ENSPTIG00000007036	-	93	78.112	Panthera_tigris_altaica
ENSHBUG00000020477	syf2	93	82.407	ENSPTRG00000000352	SYF2	90	81.279	Pan_troglodytes
ENSHBUG00000020477	syf2	100	76.050	ENSPANG00000008139	SYF2	90	80.365	Papio_anubis
ENSHBUG00000020477	syf2	100	82.773	ENSPKIG00000008130	syf2	94	86.878	Paramormyrops_kingsleyae
ENSHBUG00000020477	syf2	100	80.258	ENSPSIG00000011816	SYF2	89	80.258	Pelodiscus_sinensis
ENSHBUG00000020477	syf2	97	89.868	ENSPMGG00000008755	syf2	89	89.868	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSHBUG00000020477	syf2	99	79.399	ENSPEMG00000008283	Syf2	96	79.399	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSHBUG00000020477	syf2	95	80.631	ENSPCIG00000014235	SYF2	89	80.631	Phascolarctos_cinereus
ENSHBUG00000020477	syf2	99	90.517	ENSPFOG00000004116	syf2	96	90.517	Poecilia_formosa
ENSHBUG00000020477	syf2	100	90.129	ENSPLAG00000006691	syf2	100	89.700	Poecilia_latipinna
ENSHBUG00000020477	syf2	100	87.815	ENSPMEG00000011684	syf2	100	87.815	Poecilia_mexicana
ENSHBUG00000020477	syf2	100	90.756	ENSPREG00000003009	syf2	100	90.756	Poecilia_reticulata
ENSHBUG00000020477	syf2	100	76.471	ENSPPYG00000001713	SYF2	90	81.279	Pongo_abelii
ENSHBUG00000020477	syf2	100	53.498	ENSPCOG00000027011	SYF2	95	54.274	Propithecus_coquereli
ENSHBUG00000020477	syf2	98	71.121	ENSPVAG00000005841	SYF2	95	71.121	Pteropus_vampyrus
ENSHBUG00000020477	syf2	100	99.160	ENSPNYG00000004979	syf2	100	99.160	Pundamilia_nyererei
ENSHBUG00000020477	syf2	97	87.111	ENSPNAG00000015570	syf2	100	84.034	Pygocentrus_nattereri
ENSHBUG00000020477	syf2	99	80.258	ENSRNOG00000060597	Syf2	96	80.258	Rattus_norvegicus
ENSHBUG00000020477	syf2	100	73.950	ENSRBIG00000042970	SYF2	90	78.082	Rhinopithecus_bieti
ENSHBUG00000020477	syf2	100	76.050	ENSRROG00000001347	SYF2	90	80.365	Rhinopithecus_roxellana
ENSHBUG00000020477	syf2	93	82.407	ENSSBOG00000020184	SYF2	93	79.221	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSHBUG00000020477	syf2	88	81.553	ENSSHAG00000007152	-	100	81.553	Sarcophilus_harrisii
ENSHBUG00000020477	syf2	95	79.730	ENSSHAG00000015630	-	89	79.730	Sarcophilus_harrisii
ENSHBUG00000020477	syf2	98	84.716	ENSSFOG00015023647	syf2	93	87.330	Scleropages_formosus
ENSHBUG00000020477	syf2	100	87.815	ENSSMAG00000009867	syf2	100	87.815	Scophthalmus_maximus
ENSHBUG00000020477	syf2	100	89.496	ENSSDUG00000013072	syf2	100	89.496	Seriola_dumerili
ENSHBUG00000020477	syf2	100	89.496	ENSSLDG00000012677	syf2	100	89.496	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSHBUG00000020477	syf2	100	61.373	ENSSARG00000012889	SYF2	93	61.373	Sorex_araneus
ENSHBUG00000020477	syf2	100	79.828	ENSSPUG00000005251	SYF2	91	79.828	Sphenodon_punctatus
ENSHBUG00000020477	syf2	100	89.916	ENSSPAG00000009626	syf2	100	89.916	Stegastes_partitus
ENSHBUG00000020477	syf2	99	77.872	ENSSSCG00000037481	SYF2	96	77.872	Sus_scrofa
ENSHBUG00000020477	syf2	64	52.318	ENSTGUG00000001126	SYF2	86	52.000	Taeniopygia_guttata
ENSHBUG00000020477	syf2	100	85.833	ENSTRUG00000001499	syf2	91	88.053	Takifugu_rubripes
ENSHBUG00000020477	syf2	95	90.090	ENSTNIG00000016912	syf2	99	90.090	Tetraodon_nigroviridis
ENSHBUG00000020477	syf2	100	57.202	ENSTBEG00000017370	SYF2	93	59.130	Tupaia_belangeri
ENSHBUG00000020477	syf2	93	81.944	ENSTTRG00000003550	SYF2	93	78.541	Tursiops_truncatus
ENSHBUG00000020477	syf2	99	76.793	ENSUAMG00000002897	SYF2	96	76.793	Ursus_americanus
ENSHBUG00000020477	syf2	93	81.019	ENSUMAG00000013108	SYF2	96	76.371	Ursus_maritimus
ENSHBUG00000020477	syf2	99	78.448	ENSVPAG00000005705	SYF2	93	78.448	Vicugna_pacos
ENSHBUG00000020477	syf2	93	81.481	ENSVVUG00000027175	-	92	78.112	Vulpes_vulpes
ENSHBUG00000020477	syf2	88	80.976	ENSVVUG00000027181	-	92	77.682	Vulpes_vulpes
ENSHBUG00000020477	syf2	99	78.017	ENSXETG00000022797	syf2	93	78.017	Xenopus_tropicalis
ENSHBUG00000020477	syf2	100	89.076	ENSXMAG00000022698	syf2	100	89.076	Xiphophorus_maculatus