EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSHBUG00000020572 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: prpf38a
Alias: fa04h11|fc83e08|wu:fa04h11|wu:fc83e08|zgc:92059
Full Name: pre-mRNA processing factor 38A
Gene Type: protein_coding
Species: Haplochromis_burtoni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5894 bases
Position: chrJH425545.1:452012-457905
Accession: 102297532
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHBUP00000033566	PRP38	PF03371.15	1.6e-62	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHBUT00000027522	-	1501	XM_014338446	ENSHBUP00000033566	235 (aa)	XP_014193932	-

Gene Model

Click here to download ENSHBUG00000020572's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSHBUG00000020572's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSG00000134748	PRPF38A	61	91.005	Homo_sapiens
ENSHBUG00000020572	prpf38a	86	97.537	ENSAPOG00000011652	prpf38a	66	97.537	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSAMEG00000009319	PRPF38A	61	91.005	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	95.745	ENSACIG00000012292	prpf38a	62	95.767	Amphilophus_citrinellus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	86	97.537	ENSAOCG00000018004	prpf38a	66	97.537	Amphiprion_ocellaris
ENSHBUG00000020572	prpf38a	86	97.537	ENSAPEG00000021414	prpf38a	66	97.537	Amphiprion_percula
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	95.187	ENSATEG00000004608	prpf38a	61	95.238	Anabas_testudineus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	52	89.431	ENSAPLG00000005827	PRPF38A	50	89.516	Anas_platyrhynchos
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	92.021	ENSACAG00000008249	PRPF38A	61	92.063	Anolis_carolinensis
ENSHBUG00000020572	prpf38a	81	54.359	ENSANAG00000029204	-	58	54.688	Aotus_nancymaae
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSANAG00000027839	PRPF38A	61	91.005	Aotus_nancymaae
ENSHBUG00000020572	prpf38a	87	99.510	ENSACLG00000021595	prpf38a	68	99.510	Astatotilapia_calliptera
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	95.213	ENSAMXG00000029274	prpf38a	60	95.238	Astyanax_mexicanus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSBTAG00000002720	PRPF38A	64	91.005	Bos_taurus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	83	63.077	WBGene00008380	prp-38	59	64.894	Caenorhabditis_elegans
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSCJAG00000021594	PRPF38A	63	91.005	Callithrix_jacchus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSCAFG00000003740	PRPF38A	61	91.005	Canis_familiaris
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSCAFG00020010939	PRPF38A	61	91.005	Canis_lupus_dingo
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSCHIG00000024730	PRPF38A	61	91.005	Capra_hircus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	62	87.586	ENSTSYG00000031994	-	52	87.671	Carlito_syrichta
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSTSYG00000009868	-	61	91.005	Carlito_syrichta
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSCPOG00000005079	PRPF38A	61	91.005	Cavia_porcellus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSCCAG00000026502	PRPF38A	61	91.005	Cebus_capucinus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	55.556	ENSCATG00000044190	-	57	55.556	Cercocebus_atys
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSCATG00000032296	PRPF38A	61	91.005	Cercocebus_atys
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSCLAG00000005816	PRPF38A	61	91.005	Chinchilla_lanigera
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSCPBG00000014791	PRPF38A	61	91.005	Chrysemys_picta_bellii
ENSHBUG00000020572	prpf38a	85	75.377	ENSCSAVG00000009580	-	63	77.249	Ciona_savignyi
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSCANG00000032608	PRPF38A	63	91.005	Colobus_angolensis_palliatus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSCGRG00001018502	-	61	91.005	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	75.532	ENSCGRG00001002557	-	63	75.661	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSCGRG00000014868	Prpf38a	61	91.005	Cricetulus_griseus_crigri
ENSHBUG00000020572	prpf38a	86	95.567	ENSCSEG00000001269	prpf38a	69	95.567	Cynoglossus_semilaevis
ENSHBUG00000020572	prpf38a	86	96.552	ENSCVAG00000012305	prpf38a	66	96.552	Cyprinodon_variegatus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	95.213	ENSDARG00000039213	prpf38a	60	95.238	Danio_rerio
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSDNOG00000042326	PRPF38A	62	91.005	Dasypus_novemcinctus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	78	86.339	ENSDORG00000025371	-	67	86.243	Dipodomys_ordii
ENSHBUG00000020572	prpf38a	59	95.833	ENSDORG00000023857	-	52	95.833	Dipodomys_ordii
ENSHBUG00000020572	prpf38a	78	86.339	ENSDORG00000023691	-	67	86.243	Dipodomys_ordii
ENSHBUG00000020572	prpf38a	87	69.903	FBgn0050342	Prp38	57	73.016	Drosophila_melanogaster
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	84.127	ENSEBUG00000012588	prpf38a	61	84.127	Eptatretus_burgeri
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSEASG00005014427	PRPF38A	61	91.005	Equus_asinus_asinus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSECAG00000022628	PRPF38A	61	91.005	Equus_caballus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	94.149	ENSELUG00000021094	prpf38a	69	90.355	Esox_lucius
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSFCAG00000002518	PRPF38A	61	91.005	Felis_catus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	63	89.796	ENSFALG00000005598	-	55	89.865	Ficedula_albicollis
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	86.702	ENSFALG00000003612	-	63	86.772	Ficedula_albicollis
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSFDAG00000011287	PRPF38A	61	91.005	Fukomys_damarensis
ENSHBUG00000020572	prpf38a	86	96.552	ENSFHEG00000014317	prpf38a	69	96.552	Fundulus_heteroclitus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	71	96.988	ENSGMOG00000011384	prpf38a	54	96.988	Gadus_morhua
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	92.021	ENSGALG00000010627	PRPF38A	61	92.063	Gallus_gallus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	86	96.059	ENSGAFG00000012422	prpf38a	66	96.059	Gambusia_affinis
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	95.745	ENSGACG00000005423	prpf38a	61	95.767	Gasterosteus_aculeatus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSGAGG00000020547	PRPF38A	61	91.005	Gopherus_agassizii
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSGGOG00000003940	PRPF38A	61	91.005	Gorilla_gorilla
ENSHBUG00000020572	prpf38a	83	78.351	ENSHGLG00000007918	-	60	79.255	Heterocephalus_glaber_female
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSHGLG00000000475	PRPF38A	61	91.005	Heterocephalus_glaber_female
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSHGLG00100008935	PRPF38A	61	91.005	Heterocephalus_glaber_male
ENSHBUG00000020572	prpf38a	83	78.351	ENSHGLG00100003928	-	60	79.255	Heterocephalus_glaber_male
ENSHBUG00000020572	prpf38a	77	93.956	ENSHCOG00000020781	prpf38a	60	94.180	Hippocampus_comes
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	94.180	ENSIPUG00000005757	prpf38a	65	94.180	Ictalurus_punctatus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSSTOG00000015610	PRPF38A	61	91.005	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.426	ENSJJAG00000015811	Prpf38a	61	90.476	Jaculus_jaculus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	95.745	ENSKMAG00000006588	prpf38a	61	95.767	Kryptolebias_marmoratus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	94.709	ENSLBEG00000020585	prpf38a	61	94.709	Labrus_bergylta
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.426	ENSLACG00000011495	PRPF38A	61	90.476	Latimeria_chalumnae
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	92.593	ENSLOCG00000006262	prpf38a	61	92.593	Lepisosteus_oculatus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSLAFG00000025862	PRPF38A	61	91.005	Loxodonta_africana
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSMFAG00000039449	PRPF38A	63	91.005	Macaca_fascicularis
ENSHBUG00000020572	prpf38a	63	87.838	ENSMMUG00000014333	PRPF38A	54	87.919	Macaca_mulatta
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	56.085	ENSMNEG00000040242	-	57	56.085	Macaca_nemestrina
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSMNEG00000031221	PRPF38A	61	91.005	Macaca_nemestrina
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSMLEG00000041105	PRPF38A	61	91.005	Mandrillus_leucophaeus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	86	97.537	ENSMAMG00000015431	prpf38a	68	97.537	Mastacembelus_armatus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	87	99.510	ENSMZEG00005017838	prpf38a	66	99.510	Maylandia_zebra
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	92.021	ENSMGAG00000011176	PRPF38A	63	92.063	Meleagris_gallopavo
ENSHBUG00000020572	prpf38a	78	86.957	ENSMAUG00000018029	-	71	86.772	Mesocricetus_auratus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSMICG00000014193	PRPF38A	61	91.005	Microcebus_murinus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSMOCG00000013080	Prpf38a	61	91.005	Microtus_ochrogaster
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	95.745	ENSMMOG00000016972	prpf38a	66	95.767	Mola_mola
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSMODG00000000644	PRPF38A	60	91.005	Monodelphis_domestica
ENSHBUG00000020572	prpf38a	86	97.044	ENSMALG00000019363	prpf38a	64	97.044	Monopterus_albus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.426	MGP_CAROLIEiJ_G0026269	Prpf38a	61	90.476	Mus_caroli
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.426	ENSMUSG00000063800	Prpf38a	61	90.476	Mus_musculus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.426	MGP_PahariEiJ_G0028602	Prpf38a	61	90.476	Mus_pahari
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.426	MGP_SPRETEiJ_G0027238	Prpf38a	93	90.476	Mus_spretus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSMPUG00000006896	PRPF38A	61	91.005	Mustela_putorius_furo
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSNGAG00000011884	Prpf38a	62	91.005	Nannospalax_galili
ENSHBUG00000020572	prpf38a	87	98.039	ENSNBRG00000004013	prpf38a	65	98.039	Neolamprologus_brichardi
ENSHBUG00000020572	prpf38a	81	58.115	ENSNLEG00000012592	-	55	58.201	Nomascus_leucogenys
ENSHBUG00000020572	prpf38a	70	90.303	ENSNLEG00000017999	PRPF38A	53	90.361	Nomascus_leucogenys
ENSHBUG00000020572	prpf38a	81	90.576	ENSMEUG00000003860	PRPF38A	61	91.005	Notamacropus_eugenii
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSOPRG00000008985	PRPF38A	79	91.005	Ochotona_princeps
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSODEG00000005869	PRPF38A	61	91.005	Octodon_degus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	87	98.039	ENSONIG00000007816	prpf38a	66	98.039	Oreochromis_niloticus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	40.000	ENSOANG00000009541	-	61	40.314	Ornithorhynchus_anatinus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSOCUG00000000963	PRPF38A	61	91.005	Oryctolagus_cuniculus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	95.213	ENSORLG00000013485	prpf38a	67	95.238	Oryzias_latipes
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	95.213	ENSORLG00020002130	prpf38a	67	95.238	Oryzias_latipes_hni
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	95.213	ENSORLG00015021393	prpf38a	65	95.238	Oryzias_latipes_hsok
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	95.745	ENSOMEG00000016333	prpf38a	61	95.767	Oryzias_melastigma
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSOGAG00000005423	PRPF38A	61	91.005	Otolemur_garnettii
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSOARG00000005373	PRPF38A	61	91.005	Ovis_aries
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSPPAG00000030905	PRPF38A	61	91.005	Pan_paniscus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	74	73.410	ENSPPAG00000033867	-	57	69.312	Pan_paniscus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSPPRG00000013268	PRPF38A	61	91.005	Panthera_pardus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSPTIG00000015419	PRPF38A	61	91.005	Panthera_tigris_altaica
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSPTRG00000000739	PRPF38A	63	91.005	Pan_troglodytes
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSPANG00000015483	PRPF38A	61	91.005	Papio_anubis
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	94.149	ENSPKIG00000011439	prpf38a	61	94.180	Paramormyrops_kingsleyae
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	91.489	ENSPSIG00000017487	PRPF38A	61	91.534	Pelodiscus_sinensis
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	93.617	ENSPMGG00000021352	prpf38a	65	93.651	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	81	84.293	ENSPEMG00000011212	-	59	84.656	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSPEMG00000023277	-	61	91.005	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSHBUG00000020572	prpf38a	58	89.781	ENSPMAG00000005561	prpf38a	100	89.781	Petromyzon_marinus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.426	ENSPCIG00000022369	-	60	90.476	Phascolarctos_cinereus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	86	96.059	ENSPFOG00000004248	prpf38a	66	96.059	Poecilia_formosa
ENSHBUG00000020572	prpf38a	86	96.059	ENSPLAG00000010328	prpf38a	66	96.059	Poecilia_latipinna
ENSHBUG00000020572	prpf38a	86	96.059	ENSPMEG00000011804	prpf38a	66	96.059	Poecilia_mexicana
ENSHBUG00000020572	prpf38a	86	96.059	ENSPREG00000002835	prpf38a	63	96.059	Poecilia_reticulata
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	77.720	ENSPPYG00000001348	PRPF38A	61	77.835	Pongo_abelii
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	91.489	ENSPCAG00000013328	PRPF38A	61	91.534	Procavia_capensis
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSPCOG00000016387	-	61	91.005	Propithecus_coquereli
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	77.660	ENSPCOG00000020709	-	64	77.778	Propithecus_coquereli
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSPVAG00000009803	PRPF38A	61	91.005	Pteropus_vampyrus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	87	99.510	ENSPNYG00000005571	prpf38a	66	99.510	Pundamilia_nyererei
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	95.213	ENSPNAG00000010399	prpf38a	60	95.238	Pygocentrus_nattereri
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	91.489	ENSRNOG00000009451	Prpf38a	61	91.534	Rattus_norvegicus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSRBIG00000036442	PRPF38A	63	91.005	Rhinopithecus_bieti
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSRROG00000032788	PRPF38A	61	91.005	Rhinopithecus_roxellana
ENSHBUG00000020572	prpf38a	81	73.298	ENSRROG00000040003	-	61	73.545	Rhinopithecus_roxellana
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSSBOG00000019515	PRPF38A	61	91.005	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSHBUG00000020572	prpf38a	62	88.356	ENSSHAG00000006906	-	54	88.435	Sarcophilus_harrisii
ENSHBUG00000020572	prpf38a	83	80.412	ENSSHAG00000006029	-	63	80.952	Sarcophilus_harrisii
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	93.617	ENSSFOG00015013572	prpf38a	61	93.651	Scleropages_formosus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	95.745	ENSSMAG00000015379	prpf38a	61	95.767	Scophthalmus_maximus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	86	96.552	ENSSDUG00000001324	prpf38a	66	96.552	Seriola_dumerili
ENSHBUG00000020572	prpf38a	86	96.552	ENSSLDG00000014803	prpf38a	66	96.552	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	63.830	ENSSARG00000014458	PRPF38A	61	64.021	Sorex_araneus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	93.085	ENSSPUG00000013259	PRPF38A	61	93.122	Sphenodon_punctatus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	86	76.355	ENSSPAG00000010449	prpf38a	61	76.355	Stegastes_partitus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSSSCG00000028288	PRPF38A	61	91.005	Sus_scrofa
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	85.638	ENSTGUG00000008995	PRPF38A	61	85.714	Taeniopygia_guttata
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	94.149	ENSTRUG00000003374	prpf38a	58	94.180	Takifugu_rubripes
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	93.158	ENSTNIG00000005533	prpf38a	61	93.194	Tetraodon_nigroviridis
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSTBEG00000000725	PRPF38A	61	91.005	Tupaia_belangeri
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSTTRG00000016139	PRPF38A	61	91.005	Tursiops_truncatus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSUAMG00000000625	PRPF38A	61	91.005	Ursus_americanus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSUMAG00000022674	PRPF38A	61	91.005	Ursus_maritimus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSVPAG00000000907	PRPF38A	61	91.005	Vicugna_pacos
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSVVUG00000004475	PRPF38A	61	91.005	Vulpes_vulpes
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	90.957	ENSXETG00000008060	prpf38a	61	91.005	Xenopus_tropicalis
ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	93.684	ENSXCOG00000007393	prpf38a	63	93.717	Xiphophorus_couchianus
ENSHBUG00000020572	prpf38a	86	96.059	ENSXMAG00000026143	prpf38a	66	96.059	Xiphophorus_maculatus