EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSHBUG00000023546 (Gene tree)
Gene ID: 102301794
Gene Symbol: eftud2
Alias: wu:fi20f05|zgc:66214
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Haplochromis_burtoni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 16218 bases
Position: chrJH425357.1:2931548-2947765
Accession: 102301794
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHBUP00000035329	GTP_EFTU	PF00009.27	1.1e-44	1	1
ENSHBUP00000021109	GTP_EFTU	PF00009.27	1.2e-44	1	1
ENSHBUP00000035329	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.1e-12	1	1
ENSHBUP00000021109	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.1e-12	1	1
ENSHBUP00000035329	EFG_IV	PF03764.18	1.6e-24	1	1
ENSHBUP00000021109	EFG_IV	PF03764.18	1.7e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHBUT00000036237	-	3369	-	ENSHBUP00000035329	952 (aa)	-	-
ENSHBUT00000030896	-	3265	XM_005920406	ENSHBUP00000021109	971 (aa)	XP_005920468	UPI0003BCD734

Gene Model

Click here to download ENSHBUG00000023546's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSHBUG00000023546's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSHBUG00000023546	eftud2	72	37.736	ENSHBUG00000022667	efl1	70	34.507
ENSHBUG00000023546	eftud2	86	37.803	ENSHBUG00000006381	-	98	37.803
ENSHBUG00000023546	eftud2	86	37.572	ENSHBUG00000021382	eef2b	98	37.572

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	98.970	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	98.970	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.872	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	92.078	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	95.469	ENSACIG00000009096	eftud2	100	95.469	Amphilophus_citrinellus
ENSHBUG00000023546	eftud2	88	92.706	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	92.706	Amphiprion_ocellaris
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	98.970	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	98.970	Amphiprion_percula
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	99.176	ENSATEG00000000457	eftud2	100	99.176	Anabas_testudineus
ENSHBUG00000023546	eftud2	99	88.568	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	88.774	Anas_platyrhynchos
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.255	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.667	Anolis_carolinensis
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	92.181	Aotus_nancymaae
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	99.897	ENSACLG00000001296	eftud2	100	99.897	Astatotilapia_calliptera
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	94.371	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	94.371	Astyanax_mexicanus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.872	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	92.078	Bos_taurus
ENSHBUG00000023546	eftud2	99	71.001	WBGene00001166	eftu-2	99	70.558	Caenorhabditis_elegans
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	92.181	Callithrix_jacchus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.872	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	92.078	Canis_familiaris
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.872	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	92.078	Canis_lupus_dingo
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.872	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	92.078	Capra_hircus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	92.181	Carlito_syrichta
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	92.078	Cavia_aperea
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	92.078	Cavia_porcellus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	92.181	Cebus_capucinus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	92.181	Cercocebus_atys
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.770	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.872	Chinchilla_lanigera
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	92.181	Chlorocebus_sabaeus
ENSHBUG00000023546	eftud2	93	81.081	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.081	Choloepus_hoffmanni
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.770	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	91.975	Chrysemys_picta_bellii
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	78.645	ENSCING00000009372	-	100	78.542	Ciona_intestinalis
ENSHBUG00000023546	eftud2	99	78.243	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.953	Ciona_savignyi
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	92.181	Colobus_angolensis_palliatus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.667	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.770	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.667	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	91.770	Cricetulus_griseus_crigri
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	97.940	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	97.940	Cynoglossus_semilaevis
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	97.528	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	97.528	Cyprinodon_variegatus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	94.245	ENSDARG00000012261	eftud2	100	94.245	Danio_rerio
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.667	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	91.872	Dasypus_novemcinctus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.770	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.872	Dipodomys_ordii
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	74.821	FBgn0039566	CG4849	100	74.769	Drosophila_melanogaster
ENSHBUG00000023546	eftud2	92	97.826	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	Echinops_telfairi
ENSHBUG00000023546	eftud2	74	96.296	ENSEBUG00000004047	-	96	87.483	Eptatretus_burgeri
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.872	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	92.078	Equus_asinus_asinus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.770	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	91.975	Equus_caballus
ENSHBUG00000023546	eftud2	83	99.153	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	Erinaceus_europaeus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	94.336	ENSELUG00000017169	eftud2	100	93.924	Esox_lucius
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.770	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.975	Felis_catus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.667	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.770	Ficedula_albicollis
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	92.078	Fukomys_damarensis
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	97.322	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	97.322	Fundulus_heteroclitus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	95.675	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	95.675	Gadus_morhua
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.564	ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.696	Gallus_gallus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	97.631	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	97.631	Gambusia_affinis
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	98.043	ENSGACG00000009163	eftud2	100	98.043	Gasterosteus_aculeatus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	92.181	Gorilla_gorilla
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.872	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	91.872	Heterocephalus_glaber_female
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.872	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	91.872	Heterocephalus_glaber_male
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	97.016	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	97.016	Hippocampus_comes
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	94.439	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.439	Ictalurus_punctatus
ENSHBUG00000023546	eftud2	91	93.131	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	90.929	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSHBUG00000023546	eftud2	95	93.804	ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.804	Jaculus_jaculus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	97.631	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	97.631	Kryptolebias_marmoratus
ENSHBUG00000023546	eftud2	97	98.056	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.294	Labrus_bergylta
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	93.100	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	93.100	Latimeria_chalumnae
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	94.645	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	94.336	Lepisosteus_oculatus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.770	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.872	Loxodonta_africana
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	92.181	Macaca_fascicularis
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	92.181	Macaca_nemestrina
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	92.181	Mandrillus_leucophaeus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	98.249	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	98.249	Mastacembelus_armatus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	99.897	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	99.897	Maylandia_zebra
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.376	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.581	Meleagris_gallopavo
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.770	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	91.872	Mesocricetus_auratus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	92.181	Microcebus_murinus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.770	ENSMOCG00000009039	-	100	91.872	Microtus_ochrogaster
ENSHBUG00000023546	eftud2	93	75.281	ENSMOCG00000017653	-	90	75.393	Microtus_ochrogaster
ENSHBUG00000023546	eftud2	88	98.824	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	98.824	Mola_mola
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	92.181	Monodelphis_domestica
ENSHBUG00000023546	eftud2	88	96.941	ENSMALG00000014501	eftud2	100	96.941	Monopterus_albus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.872	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	91.975	Mus_caroli
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	92.070	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	92.070	Mus_musculus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.872	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	91.975	Mus_pahari
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.872	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	91.975	Mus_spretus
ENSHBUG00000023546	eftud2	99	91.034	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	91	91.245	Mustela_putorius_furo
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.872	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	92.078	Myotis_lucifugus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.667	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.770	Nannospalax_galili
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	99.794	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	99.794	Neolamprologus_brichardi
ENSHBUG00000023546	eftud2	99	89.831	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	90.117	Nomascus_leucogenys
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	88.272	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.477	Notamacropus_eugenii
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	83.951	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	84.156	Ochotona_princeps
ENSHBUG00000023546	eftud2	94	75.897	ENSODEG00000003385	-	100	76.006	Octodon_degus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.872	ENSODEG00000018041	-	100	91.358	Octodon_degus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	99.897	ENSONIG00000000912	eftud2	100	99.897	Oreochromis_niloticus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.872	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	92.078	Oryctolagus_cuniculus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	97.322	ENSORLG00000003109	eftud2	100	97.322	Oryzias_latipes
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	97.425	ENSORLG00020009865	eftud2	100	97.425	Oryzias_latipes_hni
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	97.322	ENSORLG00015002611	eftud2	100	98.148	Oryzias_latipes_hsok
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	90.329	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	90.535	Otolemur_garnettii
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.872	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	92.078	Ovis_aries
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	92.181	Pan_paniscus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.872	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	92.078	Panthera_pardus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.872	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	92.078	Panthera_tigris_altaica
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	92.181	Pan_troglodytes
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	92.181	Papio_anubis
ENSHBUG00000023546	eftud2	95	90.077	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.298	Pelodiscus_sinensis
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	89.392	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	89.392	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.872	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	91.975	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	92.181	Phascolarctos_cinereus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	97.837	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	97.837	Poecilia_formosa
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	97.837	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	97.837	Poecilia_latipinna
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	97.837	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	97.837	Poecilia_mexicana
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	90.741	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.947	Pongo_abelii
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	88.169	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.374	Procavia_capensis
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	92.181	Propithecus_coquereli
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	87.654	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.860	Pteropus_vampyrus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	99.794	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	99.794	Pundamilia_nyererei
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	94.748	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.748	Pygocentrus_nattereri
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	92.173	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	92.173	Rattus_norvegicus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.872	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	92.078	Rhinopithecus_bieti
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.872	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	92.078	Rhinopithecus_roxellana
ENSHBUG00000023546	eftud2	98	33.665	YKL173W	SNU114	91	34.538	Saccharomyces_cerevisiae
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	92.181	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSHBUG00000023546	eftud2	95	93.804	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.804	Sarcophilus_harrisii
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	94.851	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	95.881	Scleropages_formosus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	97.837	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	97.837	Scophthalmus_maximus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	99.176	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	99.176	Seriola_dumerili
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	99.279	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	99.279	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	83.951	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	84.156	Sorex_araneus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.564	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.770	Sphenodon_punctatus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	99.176	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	99.176	Stegastes_partitus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.770	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.872	Sus_scrofa
ENSHBUG00000023546	eftud2	84	92.662	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.662	Taeniopygia_guttata
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	96.601	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	96.601	Takifugu_rubripes
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.897	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	91.897	Tetraodon_nigroviridis
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	86.626	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.831	Tupaia_belangeri
ENSHBUG00000023546	eftud2	91	89.898	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	89.898	Tursiops_truncatus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	90.741	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.947	Ursus_americanus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.872	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	92.078	Ursus_maritimus
ENSHBUG00000023546	eftud2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.872	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	92.078	Vulpes_vulpes
ENSHBUG00000023546	eftud2	96	92.834	ENSXETG00000003394	eftud2	98	93.580	Xenopus_tropicalis
ENSHBUG00000023546	eftud2	82	98.087	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	98.087	Xiphophorus_couchianus
ENSHBUG00000023546	eftud2	100	97.631	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	97.631	Xiphophorus_maculatus