EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSHCOG00000001090 (Gene tree)
Gene ID: 109510614
Gene Symbol: mars
Alias: id:ibd5106
Full Name: methionyl-tRNA synthetase
Gene Type: protein_coding
Species: Hippocampus_comes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 19096 bases
Position: chrKV880532.1:850850-869945
Accession: 109510614
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHCOP00000000298	tRNA-synt_1g	PF09334.11	9.4e-150	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHCOT00000014005	-	5084	XM_019861052	ENSHCOP00000000298	917 (aa)	XP_019716611	UPI00094E1ABA

Gene Model

Click here to download ENSHCOG00000001090's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
hcq00450	Selenocompound metabolism	KEGG
hcq00970	Aminoacyl-tRNA biosynthesis	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSHCOG00000001090's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.388	ENSG00000166986	MARS	91	69.811	Homo_sapiens
ENSHCOG00000001090	mars	100	82.717	ENSAPOG00000020238	mars	99	82.699	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.213	ENSAMEG00000004962	MARS	99	61.430	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHCOG00000001090	mars	100	81.175	ENSACIG00000016271	mars	100	82.540	Amphilophus_citrinellus
ENSHCOG00000001090	mars	100	82.717	ENSAOCG00000011411	mars	99	82.699	Amphiprion_ocellaris
ENSHCOG00000001090	mars	100	82.372	ENSAPEG00000008610	mars	99	82.372	Amphiprion_percula
ENSHCOG00000001090	mars	100	82.213	ENSATEG00000025019	mars	100	82.468	Anabas_testudineus
ENSHCOG00000001090	mars	93	64.576	ENSAPLG00000014821	MARS	100	64.925	Anas_platyrhynchos
ENSHCOG00000001090	mars	99	59.454	ENSACAG00000006698	MARS	99	59.454	Anolis_carolinensis
ENSHCOG00000001090	mars	99	60.912	ENSANAG00000027589	MARS	100	60.912	Aotus_nancymaae
ENSHCOG00000001090	mars	100	81.848	ENSACLG00000018937	mars	100	81.976	Astatotilapia_calliptera
ENSHCOG00000001090	mars	100	73.305	ENSAMXG00000017335	mars	100	67.892	Astyanax_mexicanus
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.255	ENSBTAG00000018405	MARS	99	61.255	Bos_taurus
ENSHCOG00000001090	mars	65	57.571	WBGene00003415	mars-1	88	57.571	Caenorhabditis_elegans
ENSHCOG00000001090	mars	100	60.695	ENSCJAG00000007249	MARS	99	60.695	Callithrix_jacchus
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.255	ENSCAFG00000000229	MARS	99	61.797	Canis_familiaris
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.255	ENSCAFG00020023661	MARS	99	61.797	Canis_lupus_dingo
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.039	ENSCHIG00000027023	MARS	99	61.039	Capra_hircus
ENSHCOG00000001090	mars	100	60.888	ENSTSYG00000005193	MARS	99	61.105	Carlito_syrichta
ENSHCOG00000001090	mars	81	60.533	ENSCAPG00000014448	MARS	98	60.533	Cavia_aperea
ENSHCOG00000001090	mars	100	60.478	ENSCPOG00000012866	MARS	99	60.478	Cavia_porcellus
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.039	ENSCCAG00000032206	MARS	99	61.039	Cebus_capucinus
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.196	ENSCATG00000038907	MARS	99	61.196	Cercocebus_atys
ENSHCOG00000001090	mars	97	62.065	ENSCLAG00000012164	MARS	99	62.065	Chinchilla_lanigera
ENSHCOG00000001090	mars	100	60.345	ENSCSAG00000004852	MARS	99	60.345	Chlorocebus_sabaeus
ENSHCOG00000001090	mars	100	60.893	ENSCPBG00000017136	MARS	99	61.111	Chrysemys_picta_bellii
ENSHCOG00000001090	mars	74	61.233	ENSCING00000018550	-	99	61.071	Ciona_intestinalis
ENSHCOG00000001090	mars	62	64.903	ENSCSAVG00000006145	-	97	64.903	Ciona_savignyi
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.388	ENSCANG00000034583	MARS	99	61.388	Colobus_angolensis_palliatus
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.622	ENSCGRG00001019238	Mars	99	61.622	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.622	ENSCGRG00000017321	Mars	99	61.622	Cricetulus_griseus_crigri
ENSHCOG00000001090	mars	99	80.000	ENSCSEG00000010816	mars	99	80.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSHCOG00000001090	mars	100	80.371	ENSCVAG00000009314	mars	99	80.456	Cyprinodon_variegatus
ENSHCOG00000001090	mars	100	72.964	ENSDARG00000034396	mars	97	72.964	Danio_rerio
ENSHCOG00000001090	mars	100	60.931	ENSDNOG00000017502	MARS	99	60.931	Dasypus_novemcinctus
ENSHCOG00000001090	mars	100	60.606	ENSDORG00000007127	Mars	99	60.606	Dipodomys_ordii
ENSHCOG00000001090	mars	98	50.055	FBgn0034401	MetRS	87	49.305	Drosophila_melanogaster
ENSHCOG00000001090	mars	60	66.969	ENSETEG00000007106	MARS	99	66.969	Echinops_telfairi
ENSHCOG00000001090	mars	59	59.158	ENSEBUG00000010439	mars	87	59.158	Eptatretus_burgeri
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.297	ENSEASG00005007208	MARS	99	61.297	Equus_asinus_asinus
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.297	ENSECAG00000015175	MARS	99	61.297	Equus_caballus
ENSHCOG00000001090	mars	89	58.640	ENSEEUG00000015503	MARS	89	58.640	Erinaceus_europaeus
ENSHCOG00000001090	mars	100	74.538	ENSELUG00000010453	mars	100	74.538	Esox_lucius
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.580	ENSFCAG00000002083	MARS	99	61.580	Felis_catus
ENSHCOG00000001090	mars	100	59.653	ENSFDAG00000010217	MARS	99	59.761	Fukomys_damarensis
ENSHCOG00000001090	mars	100	80.501	ENSFHEG00000016374	mars	100	80.673	Fundulus_heteroclitus
ENSHCOG00000001090	mars	100	76.144	ENSGMOG00000007987	mars	100	76.144	Gadus_morhua
ENSHCOG00000001090	mars	95	59.494	ENSGALG00000039315	MARS	95	60.187	Gallus_gallus
ENSHCOG00000001090	mars	99	79.759	ENSGAFG00000013461	mars	100	77.381	Gambusia_affinis
ENSHCOG00000001090	mars	100	82.646	ENSGACG00000006474	mars	100	82.646	Gasterosteus_aculeatus
ENSHCOG00000001090	mars	96	63.194	ENSGAGG00000011640	MARS	97	63.307	Gopherus_agassizii
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.388	ENSGGOG00000001982	MARS	99	61.388	Gorilla_gorilla
ENSHCOG00000001090	mars	100	70.467	ENSHBUG00000009575	mars	97	70.467	Haplochromis_burtoni
ENSHCOG00000001090	mars	97	51.502	ENSHGLG00000019739	-	95	51.613	Heterocephalus_glaber_female
ENSHCOG00000001090	mars	100	60.649	ENSHGLG00000013493	MARS	100	60.649	Heterocephalus_glaber_female
ENSHCOG00000001090	mars	97	50.501	ENSHGLG00100004906	-	95	50.612	Heterocephalus_glaber_male
ENSHCOG00000001090	mars	100	60.649	ENSHGLG00100006885	MARS	100	60.649	Heterocephalus_glaber_male
ENSHCOG00000001090	mars	90	72.947	ENSIPUG00000024410	mars	98	72.947	Ictalurus_punctatus
ENSHCOG00000001090	mars	66	78.904	ENSIPUG00000024413	mars	98	78.904	Ictalurus_punctatus
ENSHCOG00000001090	mars	100	60.888	ENSSTOG00000001128	MARS	99	60.780	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.797	ENSJJAG00000018827	Mars	99	61.797	Jaculus_jaculus
ENSHCOG00000001090	mars	100	80.978	ENSKMAG00000012408	mars	99	82.593	Kryptolebias_marmoratus
ENSHCOG00000001090	mars	100	82.481	ENSLBEG00000013609	mars	100	82.481	Labrus_bergylta
ENSHCOG00000001090	mars	100	63.221	ENSLACG00000018854	MARS	99	63.221	Latimeria_chalumnae
ENSHCOG00000001090	mars	100	60.412	ENSLAFG00000013525	MARS	99	60.412	Loxodonta_africana
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.280	ENSMFAG00000010123	MARS	99	61.280	Macaca_fascicularis
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.280	ENSMMUG00000011277	MARS	91	69.811	Macaca_mulatta
ENSHCOG00000001090	mars	100	60.304	ENSMNEG00000044464	MARS	99	60.304	Macaca_nemestrina
ENSHCOG00000001090	mars	90	66.600	ENSMLEG00000034638	MARS	99	66.600	Mandrillus_leucophaeus
ENSHCOG00000001090	mars	96	80.225	ENSMAMG00000010012	mars	97	80.225	Mastacembelus_armatus
ENSHCOG00000001090	mars	100	81.848	ENSMZEG00005007092	mars	100	81.976	Maylandia_zebra
ENSHCOG00000001090	mars	100	60.823	ENSMAUG00000011482	Mars	99	60.823	Mesocricetus_auratus
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.189	ENSMICG00000032056	MARS	99	61.189	Microcebus_murinus
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.472	ENSMOCG00000010941	Mars	99	61.472	Microtus_ochrogaster
ENSHCOG00000001090	mars	99	76.739	ENSMMOG00000007461	mars	99	76.739	Mola_mola
ENSHCOG00000001090	mars	100	80.958	ENSMALG00000010005	mars	99	82.410	Monopterus_albus
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.538	MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	61.755	Mus_caroli
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.105	ENSMUSG00000040354	Mars	99	61.322	Mus_musculus
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.147	MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	61.147	Mus_pahari
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.213	MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	61.430	Mus_spretus
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.605	ENSMPUG00000001831	MARS	99	61.605	Mustela_putorius_furo
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.472	ENSMLUG00000001037	MARS	99	61.580	Myotis_lucifugus
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.605	ENSNGAG00000018824	Mars	99	61.605	Nannospalax_galili
ENSHCOG00000001090	mars	95	80.859	ENSNBRG00000004105	mars	100	80.909	Neolamprologus_brichardi
ENSHCOG00000001090	mars	100	60.954	ENSNLEG00000017297	MARS	99	60.954	Nomascus_leucogenys
ENSHCOG00000001090	mars	89	62.241	ENSMEUG00000007195	MARS	99	62.321	Notamacropus_eugenii
ENSHCOG00000001090	mars	100	59.588	ENSOPRG00000006518	MARS	99	59.588	Ochotona_princeps
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.238	ENSODEG00000001752	MARS	99	61.238	Octodon_degus
ENSHCOG00000001090	mars	100	81.378	ENSONIG00000005090	mars	100	81.505	Oreochromis_niloticus
ENSHCOG00000001090	mars	72	62.631	ENSOANG00000013318	MARS	100	62.631	Ornithorhynchus_anatinus
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.580	ENSOCUG00000007373	MARS	99	61.580	Oryctolagus_cuniculus
ENSHCOG00000001090	mars	100	78.953	ENSORLG00000005405	mars	100	79.325	Oryzias_latipes
ENSHCOG00000001090	mars	100	79.498	ENSORLG00020017397	mars	100	79.869	Oryzias_latipes_hni
ENSHCOG00000001090	mars	100	79.171	ENSORLG00015012976	mars	100	79.543	Oryzias_latipes_hsok
ENSHCOG00000001090	mars	100	79.280	ENSOMEG00000018411	mars	100	79.652	Oryzias_melastigma
ENSHCOG00000001090	mars	99	60.259	ENSOGAG00000005226	MARS	100	60.259	Otolemur_garnettii
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.039	ENSOARG00000006477	MARS	99	61.039	Ovis_aries
ENSHCOG00000001090	mars	100	60.652	ENSPPAG00000025147	MARS	99	60.652	Pan_paniscus
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.838	ENSPPRG00000023243	MARS	99	61.838	Panthera_pardus
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.946	ENSPTIG00000006721	MARS	99	61.946	Panthera_tigris_altaica
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.388	ENSPTRG00000005135	MARS	99	61.388	Pan_troglodytes
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.171	ENSPANG00000009140	MARS	99	61.171	Papio_anubis
ENSHCOG00000001090	mars	100	71.133	ENSPKIG00000002833	mars	100	71.133	Paramormyrops_kingsleyae
ENSHCOG00000001090	mars	82	49.074	ENSPSIG00000013607	MARS	99	41.215	Pelodiscus_sinensis
ENSHCOG00000001090	mars	99	78.798	ENSPMGG00000014847	mars	99	78.798	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSHCOG00000001090	mars	100	62.229	ENSPEMG00000000046	Mars	99	62.324	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.848	ENSPCIG00000023765	MARS	99	61.848	Phascolarctos_cinereus
ENSHCOG00000001090	mars	100	80.044	ENSPFOG00000006998	mars	100	80.305	Poecilia_formosa
ENSHCOG00000001090	mars	100	80.262	ENSPLAG00000017870	mars	100	80.522	Poecilia_latipinna
ENSHCOG00000001090	mars	100	80.044	ENSPMEG00000008197	mars	100	80.305	Poecilia_mexicana
ENSHCOG00000001090	mars	100	80.305	ENSPREG00000008123	mars	100	80.305	Poecilia_reticulata
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.280	ENSPPYG00000004691	MARS	99	61.280	Pongo_abelii
ENSHCOG00000001090	mars	85	62.901	ENSPCAG00000016037	MARS	88	62.901	Procavia_capensis
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.622	ENSPCOG00000017598	MARS	99	61.622	Propithecus_coquereli
ENSHCOG00000001090	mars	80	58.245	ENSPVAG00000012112	MARS	81	58.245	Pteropus_vampyrus
ENSHCOG00000001090	mars	100	81.630	ENSPNYG00000013809	mars	100	81.759	Pundamilia_nyererei
ENSHCOG00000001090	mars	100	74.593	ENSPNAG00000017290	mars	100	74.729	Pygocentrus_nattereri
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.297	ENSRNOG00000025459	Mars	99	61.297	Rattus_norvegicus
ENSHCOG00000001090	mars	99	60.989	ENSRBIG00000044782	MARS	99	60.989	Rhinopithecus_bieti
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.522	ENSRROG00000042331	MARS	99	61.522	Rhinopithecus_roxellana
ENSHCOG00000001090	mars	62	52.539	YGR264C	MES1	75	52.539	Saccharomyces_cerevisiae
ENSHCOG00000001090	mars	100	58.162	ENSSBOG00000022875	MARS	99	58.270	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSHCOG00000001090	mars	100	62.065	ENSSHAG00000007182	MARS	99	62.065	Sarcophilus_harrisii
ENSHCOG00000001090	mars	100	70.479	ENSSFOG00015011038	mars	99	70.697	Scleropages_formosus
ENSHCOG00000001090	mars	100	81.670	ENSSMAG00000012409	mars	100	81.562	Scophthalmus_maximus
ENSHCOG00000001090	mars	100	83.279	ENSSDUG00000019070	mars	100	83.406	Seriola_dumerili
ENSHCOG00000001090	mars	90	85.611	ENSSLDG00000005561	mars	95	85.611	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSHCOG00000001090	mars	92	66.183	ENSSARG00000002477	MARS	92	67.427	Sorex_araneus
ENSHCOG00000001090	mars	85	67.347	ENSSPUG00000007756	MARS	99	70.370	Sphenodon_punctatus
ENSHCOG00000001090	mars	100	84.022	ENSSPAG00000022691	mars	100	84.022	Stegastes_partitus
ENSHCOG00000001090	mars	100	60.907	ENSSSCG00000023318	MARS	95	60.907	Sus_scrofa
ENSHCOG00000001090	mars	100	78.081	ENSTRUG00000014774	mars	100	78.540	Takifugu_rubripes
ENSHCOG00000001090	mars	100	72.737	ENSTNIG00000007060	mars	100	73.098	Tetraodon_nigroviridis
ENSHCOG00000001090	mars	66	61.960	ENSTBEG00000000303	MARS	77	61.960	Tupaia_belangeri
ENSHCOG00000001090	mars	76	68.110	ENSTTRG00000013088	MARS	75	68.110	Tursiops_truncatus
ENSHCOG00000001090	mars	53	53.427	ENSUAMG00000019284	-	99	53.427	Ursus_americanus
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.322	ENSUMAG00000019826	MARS	99	61.538	Ursus_maritimus
ENSHCOG00000001090	mars	64	74.342	ENSVPAG00000008665	MARS	66	74.342	Vicugna_pacos
ENSHCOG00000001090	mars	100	61.564	ENSVVUG00000017940	MARS	99	61.564	Vulpes_vulpes
ENSHCOG00000001090	mars	68	71.498	ENSXETG00000025174	mars	99	71.498	Xenopus_tropicalis
ENSHCOG00000001090	mars	100	78.735	ENSXCOG00000013878	mars	100	78.999	Xiphophorus_couchianus
ENSHCOG00000001090	mars	100	80.153	ENSXMAG00000017920	mars	100	80.217	Xiphophorus_maculatus