EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSHCOG00000010077 (Gene tree)
Gene ID: 109522561
Gene Symbol: pusl1
Alias: -
Full Name: pseudouridine synthase like 1
Gene Type: protein_coding
Species: Hippocampus_comes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 26812 bases
Position: chrKV880150.1:2613012-2639823
Accession: 109522561
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHCOP00000022392	PseudoU_synth_1	PF01416.20	1.2e-32	1	2
ENSHCOP00000022392	PseudoU_synth_1	PF01416.20	1.2e-32	2	2
ENSHCOP00000007898	PseudoU_synth_1	PF01416.20	1.4e-32	1	2
ENSHCOP00000007898	PseudoU_synth_1	PF01416.20	1.4e-32	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHCOT00000001178	-	825	XM_019881246	ENSHCOP00000022392	274 (aa)	XP_019736805	-
ENSHCOT00000001219	-	795	-	ENSHCOP00000007898	265 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	50.730	ENSG00000169972	PUSL1	98	50.400	Homo_sapiens
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	74.182	ENSAPOG00000016290	pusl1	92	74.182	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	49.817	ENSAMEG00000013752	PUSL1	91	49.286	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	74.170	ENSACIG00000015240	pusl1	100	74.170	Amphilophus_citrinellus
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	73.455	ENSAOCG00000019419	pusl1	83	73.455	Amphiprion_ocellaris
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	73.091	ENSAPEG00000005452	pusl1	92	73.091	Amphiprion_percula
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	72.464	ENSATEG00000024154	pusl1	94	71.530	Anabas_testudineus
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	52.174	ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	52.174	Anas_platyrhynchos
ENSHCOG00000010077	pusl1	94	54.826	ENSACAG00000014111	PUSL1	98	54.826	Anolis_carolinensis
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	50.730	ENSANAG00000037456	PUSL1	90	50.730	Aotus_nancymaae
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	75.362	ENSACLG00000008675	pusl1	94	74.468	Astatotilapia_calliptera
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	59.058	ENSAMXG00000044007	pusl1	95	58.077	Astyanax_mexicanus
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	51.825	ENSBTAG00000007619	PUSL1	95	51.786	Bos_taurus
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	50.730	ENSCJAG00000010972	PUSL1	90	50.730	Callithrix_jacchus
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	49.084	ENSCAFG00000019291	PUSL1	91	48.029	Canis_familiaris
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	50.183	ENSCAFG00020011568	PUSL1	89	50.183	Canis_lupus_dingo
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	51.460	ENSCHIG00000012615	PUSL1	97	51.429	Capra_hircus
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	50.182	ENSCPOG00000005149	PUSL1	89	50.182	Cavia_porcellus
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	50.730	ENSCCAG00000027475	PUSL1	90	50.730	Cebus_capucinus
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	51.825	ENSCATG00000018260	PUSL1	91	50.896	Cercocebus_atys
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	49.635	ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	49.104	Chinchilla_lanigera
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	51.095	ENSCSAG00000000680	PUSL1	91	50.357	Chlorocebus_sabaeus
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	55.072	ENSCPBG00000022621	PUSL1	95	55.072	Chrysemys_picta_bellii
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	51.095	ENSCANG00000034373	PUSL1	91	50.179	Colobus_angolensis_palliatus
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	50.000	ENSCGRG00001012429	Pusl1	95	49.104	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	50.000	ENSCGRG00000006466	Pusl1	95	49.104	Cricetulus_griseus_crigri
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	70.652	ENSCSEG00000005159	pusl1	94	70.107	Cynoglossus_semilaevis
ENSHCOG00000010077	pusl1	86	61.572	ENSCVAG00000012923	pusl1	92	62.338	Cyprinodon_variegatus
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	61.957	ENSDARG00000074565	pusl1	97	61.151	Danio_rerio
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	34.323	FBgn0083976	CG34140	99	34.653	Drosophila_melanogaster
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	51.460	ENSECAG00000006248	PUSL1	91	50.896	Equus_caballus
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	49.458	ENSEEUG00000000837	PUSL1	93	49.458	Erinaceus_europaeus
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	63.370	ENSELUG00000015945	pusl1	94	63.538	Esox_lucius
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	52.015	ENSFCAG00000007617	PUSL1	90	52.015	Felis_catus
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	72.464	ENSFHEG00000006370	pusl1	94	71.174	Fundulus_heteroclitus
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	70.397	ENSGMOG00000019388	pusl1	100	71.378	Gadus_morhua
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	51.449	ENSGALG00000001714	PUSL1	96	51.071	Gallus_gallus
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	68.478	ENSGAFG00000007546	pusl1	96	67.376	Gambusia_affinis
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	72.202	ENSGACG00000007848	pusl1	93	70.567	Gasterosteus_aculeatus
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	55.072	ENSGAGG00000004730	PUSL1	95	55.072	Gopherus_agassizii
ENSHCOG00000010077	pusl1	86	51.867	ENSGGOG00000005364	PUSL1	93	51.867	Gorilla_gorilla
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	76.087	ENSHBUG00000001264	pusl1	94	75.177	Haplochromis_burtoni
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	49.818	ENSHGLG00000017570	PUSL1	91	48.399	Heterocephalus_glaber_female
ENSHCOG00000010077	pusl1	89	51.406	ENSHGLG00100007641	PUSL1	82	51.406	Heterocephalus_glaber_male
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	61.957	ENSIPUG00000023921	pusl1	95	61.957	Ictalurus_punctatus
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	50.730	ENSSTOG00000001783	PUSL1	88	49.470	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	51.095	ENSJJAG00000020471	Pusl1	92	51.095	Jaculus_jaculus
ENSHCOG00000010077	pusl1	96	68.302	ENSKMAG00000005154	pusl1	90	68.302	Kryptolebias_marmoratus
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	76.087	ENSLBEG00000013469	pusl1	95	76.087	Labrus_bergylta
ENSHCOG00000010077	pusl1	69	53.886	ENSLACG00000018795	PUSL1	95	54.404	Latimeria_chalumnae
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	56.318	ENSLOCG00000002210	pusl1	96	54.770	Lepisosteus_oculatus
ENSHCOG00000010077	pusl1	89	54.839	ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	54.839	Loxodonta_africana
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	51.095	ENSMFAG00000046288	PUSL1	91	50.179	Macaca_fascicularis
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	44.322	ENSMMUG00000016279	PUSL1	89	44.322	Macaca_mulatta
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	51.460	ENSMNEG00000037989	PUSL1	91	50.538	Macaca_nemestrina
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	72.464	ENSMAMG00000016538	pusl1	93	71.174	Mastacembelus_armatus
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	75.362	ENSMZEG00005026990	pusl1	94	74.468	Maylandia_zebra
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	51.449	ENSMGAG00000003037	PUSL1	95	51.246	Meleagris_gallopavo
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	50.000	ENSMAUG00000019924	Pusl1	95	49.462	Mesocricetus_auratus
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	50.549	ENSMICG00000014171	PUSL1	94	49.462	Microcebus_murinus
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	51.825	ENSMOCG00000005602	Pusl1	95	50.896	Microtus_ochrogaster
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	73.188	ENSMMOG00000003269	pusl1	99	73.188	Mola_mola
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	74.729	ENSMALG00000021686	pusl1	93	74.113	Monopterus_albus
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	51.095	MGP_CAROLIEiJ_G0026911	Pusl1	95	51.064	Mus_caroli
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	50.730	ENSMUSG00000051557	Pusl1	95	51.064	Mus_musculus
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	51.095	MGP_PahariEiJ_G0029260	Pusl1	95	51.418	Mus_pahari
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	51.460	MGP_SPRETEiJ_G0027906	Pusl1	95	51.773	Mus_spretus
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	49.818	ENSMPUG00000014313	PUSL1	91	49.643	Mustela_putorius_furo
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	50.725	ENSNGAG00000004647	Pusl1	83	50.709	Nannospalax_galili
ENSHCOG00000010077	pusl1	88	72.358	ENSNBRG00000014762	pusl1	89	72.358	Neolamprologus_brichardi
ENSHCOG00000010077	pusl1	90	52.400	ENSNLEG00000000051	PUSL1	90	52.400	Nomascus_leucogenys
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	52.190	ENSMEUG00000011649	-	96	52.347	Notamacropus_eugenii
ENSHCOG00000010077	pusl1	98	43.015	ENSMEUG00000005176	-	98	43.015	Notamacropus_eugenii
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	49.635	ENSODEG00000008247	PUSL1	89	49.104	Octodon_degus
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	76.087	ENSONIG00000019361	pusl1	96	72.125	Oreochromis_niloticus
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	69.203	ENSORLG00000016228	pusl1	95	68.327	Oryzias_latipes
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	69.565	ENSORLG00020013710	pusl1	95	68.683	Oryzias_latipes_hni
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	69.203	ENSORLG00015008715	pusl1	100	67.958	Oryzias_latipes_hsok
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	71.377	ENSOMEG00000018897	pusl1	97	70.213	Oryzias_melastigma
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	51.095	ENSOGAG00000031692	PUSL1	95	51.095	Otolemur_garnettii
ENSHCOG00000010077	pusl1	89	52.823	ENSOARG00000004905	PUSL1	94	51.984	Ovis_aries
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	51.095	ENSPPAG00000029283	PUSL1	91	50.179	Pan_paniscus
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	51.648	ENSPPRG00000023329	PUSL1	90	51.648	Panthera_pardus
ENSHCOG00000010077	pusl1	89	53.441	ENSPTIG00000018532	PUSL1	93	52.174	Panthera_tigris_altaica
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	51.095	ENSPTRG00000000021	PUSL1	91	50.179	Pan_troglodytes
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	51.460	ENSPANG00000000591	PUSL1	91	50.538	Papio_anubis
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	58.696	ENSPKIG00000002447	pusl1	97	59.220	Paramormyrops_kingsleyae
ENSHCOG00000010077	pusl1	90	58.000	ENSPSIG00000002781	PUSL1	93	58.000	Pelodiscus_sinensis
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	68.015	ENSPMGG00000011051	pusl1	99	68.015	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	50.730	ENSPEMG00000013541	Pusl1	95	50.179	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	51.095	ENSPCIG00000007816	-	62	51.095	Phascolarctos_cinereus
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	71.014	ENSPFOG00000015448	pusl1	93	69.858	Poecilia_formosa
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	71.014	ENSPLAG00000004348	pusl1	95	69.751	Poecilia_latipinna
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	71.014	ENSPMEG00000000931	pusl1	95	69.751	Poecilia_mexicana
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	69.203	ENSPREG00000002324	pusl1	95	68.683	Poecilia_reticulata
ENSHCOG00000010077	pusl1	87	50.617	ENSPPYG00000002014	PUSL1	88	48.988	Pongo_abelii
ENSHCOG00000010077	pusl1	84	46.383	ENSPCAG00000002272	PUSL1	95	46.383	Procavia_capensis
ENSHCOG00000010077	pusl1	72	54.930	ENSPVAG00000001016	PUSL1	64	54.930	Pteropus_vampyrus
ENSHCOG00000010077	pusl1	85	77.447	ENSPNYG00000006588	pusl1	100	76.349	Pundamilia_nyererei
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	61.455	ENSPNAG00000024441	pusl1	95	61.455	Pygocentrus_nattereri
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	51.460	ENSRNOG00000022354	Pusl1	98	50.794	Rattus_norvegicus
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	50.730	ENSRBIG00000036842	PUSL1	91	49.821	Rhinopithecus_bieti
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	50.730	ENSRROG00000030704	PUSL1	91	49.821	Rhinopithecus_roxellana
ENSHCOG00000010077	pusl1	89	51.210	ENSSBOG00000032249	PUSL1	89	51.210	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSHCOG00000010077	pusl1	51	56.934	ENSSHAG00000004840	-	84	47.305	Sarcophilus_harrisii
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	61.594	ENSSFOG00015008281	pusl1	92	61.871	Scleropages_formosus
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	69.203	ENSSMAG00000007187	pusl1	93	67.616	Scophthalmus_maximus
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	75.000	ENSSDUG00000000287	pusl1	96	65.845	Seriola_dumerili
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	75.000	ENSSLDG00000009605	pusl1	90	73.310	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSHCOG00000010077	pusl1	65	53.179	ENSSARG00000005323	-	91	53.179	Sorex_araneus
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	71.483	ENSSPAG00000002528	pusl1	100	71.483	Stegastes_partitus
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	51.625	ENSSSCG00000003338	PUSL1	89	51.625	Sus_scrofa
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	50.549	ENSTGUG00000003214	PUSL1	96	50.549	Taeniopygia_guttata
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	72.464	ENSTRUG00000010102	pusl1	95	70.819	Takifugu_rubripes
ENSHCOG00000010077	pusl1	64	66.480	ENSTNIG00000005789	pusl1	81	66.480	Tetraodon_nigroviridis
ENSHCOG00000010077	pusl1	62	48.295	ENSTBEG00000005001	PUSL1	73	48.295	Tupaia_belangeri
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	46.545	ENSTTRG00000017030	PUSL1	90	46.545	Tursiops_truncatus
ENSHCOG00000010077	pusl1	87	51.452	ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	50.000	Ursus_americanus
ENSHCOG00000010077	pusl1	87	51.867	ENSUMAG00000002084	PUSL1	81	50.407	Ursus_maritimus
ENSHCOG00000010077	pusl1	99	50.183	ENSVVUG00000004320	PUSL1	91	43.533	Vulpes_vulpes
ENSHCOG00000010077	pusl1	80	52.915	ENSXETG00000011145	pusl1	97	53.363	Xenopus_tropicalis
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	64.727	ENSXCOG00000017748	pusl1	100	63.509	Xiphophorus_couchianus
ENSHCOG00000010077	pusl1	100	69.928	ENSXMAG00000018846	pusl1	95	68.683	Xiphophorus_maculatus