EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSHCOG00000011784 (Gene tree)
Gene ID: 109523638
Gene Symbol: ctif
Alias: zmp:0000001000
Full Name: cap binding complex dependent translation initiation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Hippocampus_comes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 35080 bases
Position: chrKV880197.1:121588-156667
Accession: 109523638
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHCOP00000023340	MIF4G	PF02854.19	2.6e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHCOT00000025774	-	1704	XM_019882926	ENSHCOP00000023340	567 (aa)	XP_019738485	-

Gene Model

Click here to download ENSHCOG00000011784's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSHCOG00000011784's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.792	ENSG00000134030	CTIF	100	60.377	Homo_sapiens
ENSHCOG00000011784	ctif	99	70.256	ENSAPOG00000020192	ctif	99	70.103	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHCOG00000011784	ctif	85	54.528	ENSAMEG00000006759	CTIF	82	53.396	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHCOG00000011784	ctif	94	70.112	ENSACIG00000017099	ctif	84	69.859	Amphilophus_citrinellus
ENSHCOG00000011784	ctif	98	71.279	ENSAPEG00000016975	ctif	99	65.667	Amphiprion_percula
ENSHCOG00000011784	ctif	97	72.324	ENSATEG00000016752	ctif	99	64.688	Anabas_testudineus
ENSHCOG00000011784	ctif	99	53.762	ENSACAG00000018006	CTIF	99	52.904	Anolis_carolinensis
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.885	ENSANAG00000024925	CTIF	99	55.902	Aotus_nancymaae
ENSHCOG00000011784	ctif	94	70.435	ENSACLG00000005956	ctif	88	70.563	Astatotilapia_calliptera
ENSHCOG00000011784	ctif	98	61.638	ENSAMXG00000015964	ctif	83	61.207	Astyanax_mexicanus
ENSHCOG00000011784	ctif	99	55.319	ENSBTAG00000018901	CTIF	99	54.235	Bos_taurus
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.557	ENSCJAG00000004729	CTIF	99	55.574	Callithrix_jacchus
ENSHCOG00000011784	ctif	96	55.593	ENSCAFG00000019076	CTIF	99	55.241	Canis_familiaris
ENSHCOG00000011784	ctif	96	55.593	ENSCAFG00020026482	CTIF	99	55.241	Canis_lupus_dingo
ENSHCOG00000011784	ctif	99	54.828	ENSCHIG00000014455	CTIF	99	54.010	Capra_hircus
ENSHCOG00000011784	ctif	88	55.128	ENSTSYG00000030461	CTIF	99	54.862	Carlito_syrichta
ENSHCOG00000011784	ctif	99	52.912	ENSCAPG00000011865	CTIF	99	51.980	Cavia_aperea
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.117	ENSCPOG00000001049	CTIF	99	55.139	Cavia_porcellus
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.536	ENSCCAG00000022758	CTIF	99	55.556	Cebus_capucinus
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.628	ENSCATG00000038134	CTIF	99	55.155	Cercocebus_atys
ENSHCOG00000011784	ctif	99	57.309	ENSCLAG00000008174	CTIF	99	56.240	Chinchilla_lanigera
ENSHCOG00000011784	ctif	99	55.591	ENSCSAG00000018021	CTIF	99	53.920	Chlorocebus_sabaeus
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.333	ENSCPBG00000025654	CTIF	99	55.167	Chrysemys_picta_bellii
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.444	ENSCANG00000030916	CTIF	99	55.628	Colobus_angolensis_palliatus
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.557	ENSCGRG00001020158	Ctif	99	55.337	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSHCOG00000011784	ctif	99	52.698	ENSCGRG00000000052	Ctif	99	51.351	Cricetulus_griseus_crigri
ENSHCOG00000011784	ctif	97	68.122	ENSCSEG00000019857	ctif	89	67.965	Cynoglossus_semilaevis
ENSHCOG00000011784	ctif	99	60.741	ENSCVAG00000017158	ctif	99	59.016	Cyprinodon_variegatus
ENSHCOG00000011784	ctif	97	65.054	ENSDARG00000090617	ctif	84	66.289	Danio_rerio
ENSHCOG00000011784	ctif	68	56.120	ENSDNOG00000037310	CTIF	99	54.630	Dasypus_novemcinctus
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.033	ENSDORG00000003221	Ctif	99	55.058	Dipodomys_ordii
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.240	ENSEASG00005016094	CTIF	99	54.742	Equus_asinus_asinus
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.406	ENSECAG00000020473	CTIF	99	54.908	Equus_caballus
ENSHCOG00000011784	ctif	88	51.009	ENSEEUG00000012451	CTIF	99	51.934	Erinaceus_europaeus
ENSHCOG00000011784	ctif	99	65.615	ENSELUG00000008733	ctif	99	64.842	Esox_lucius
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.098	ENSFCAG00000000664	CTIF	99	55.410	Felis_catus
ENSHCOG00000011784	ctif	95	56.477	ENSFALG00000008943	CTIF	97	55.345	Ficedula_albicollis
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.137	ENSFDAG00000017379	CTIF	99	55.016	Fukomys_damarensis
ENSHCOG00000011784	ctif	98	67.624	ENSFHEG00000004334	ctif	99	61.398	Fundulus_heteroclitus
ENSHCOG00000011784	ctif	99	55.281	ENSGALG00000035912	-	99	54.545	Gallus_gallus
ENSHCOG00000011784	ctif	98	68.261	ENSGAFG00000011896	ctif	99	62.193	Gambusia_affinis
ENSHCOG00000011784	ctif	68	52.273	ENSGAGG00000020663	CTIF	85	55.301	Gopherus_agassizii
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.770	ENSGGOG00000015204	CTIF	99	55.791	Gorilla_gorilla
ENSHCOG00000011784	ctif	94	70.870	ENSHBUG00000018092	ctif	88	70.996	Haplochromis_burtoni
ENSHCOG00000011784	ctif	99	57.095	ENSHGLG00000005663	CTIF	99	56.093	Heterocephalus_glaber_female
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.928	ENSHGLG00100006976	CTIF	99	55.927	Heterocephalus_glaber_male
ENSHCOG00000011784	ctif	99	62.240	ENSIPUG00000014050	ctif	83	64.943	Ictalurus_punctatus
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.457	ENSSTOG00000001967	CTIF	99	55.629	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSHCOG00000011784	ctif	99	54.589	ENSJJAG00000013706	Ctif	99	53.462	Jaculus_jaculus
ENSHCOG00000011784	ctif	98	68.848	ENSKMAG00000014651	ctif	99	64.114	Kryptolebias_marmoratus
ENSHCOG00000011784	ctif	98	66.835	ENSLBEG00000018277	ctif	99	67.003	Labrus_bergylta
ENSHCOG00000011784	ctif	98	61.867	ENSLOCG00000011697	ctif	99	54.079	Lepisosteus_oculatus
ENSHCOG00000011784	ctif	99	49.300	ENSLAFG00000016335	CTIF	99	70.189	Loxodonta_africana
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.628	ENSMFAG00000037903	CTIF	99	55.628	Macaca_fascicularis
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.628	ENSMMUG00000020898	CTIF	99	55.155	Macaca_mulatta
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.628	ENSMNEG00000039395	CTIF	99	55.155	Macaca_nemestrina
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.607	ENSMLEG00000041132	CTIF	99	55.628	Mandrillus_leucophaeus
ENSHCOG00000011784	ctif	98	71.123	ENSMAMG00000014741	ctif	99	63.881	Mastacembelus_armatus
ENSHCOG00000011784	ctif	83	70.000	ENSMZEG00005019767	ctif	82	70.130	Maylandia_zebra
ENSHCOG00000011784	ctif	86	41.078	ENSMGAG00000001378	CTIF	100	40.775	Meleagris_gallopavo
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.607	ENSMAUG00000000656	Ctif	99	55.229	Mesocricetus_auratus
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.414	ENSMICG00000010167	CTIF	99	54.992	Microcebus_murinus
ENSHCOG00000011784	ctif	99	55.974	ENSMOCG00000020507	Ctif	99	54.770	Microtus_ochrogaster
ENSHCOG00000011784	ctif	99	53.859	ENSMODG00000003464	CTIF	99	52.349	Monodelphis_domestica
ENSHCOG00000011784	ctif	82	68.098	ENSMALG00000020553	ctif	99	67.901	Monopterus_albus
ENSHCOG00000011784	ctif	99	55.047	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	99	53.943	Mus_caroli
ENSHCOG00000011784	ctif	99	55.821	ENSMUSG00000052928	Ctif	99	54.705	Mus_musculus
ENSHCOG00000011784	ctif	99	57.026	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	99	55.882	Mus_pahari
ENSHCOG00000011784	ctif	99	55.821	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	86	77.536	Mus_spretus
ENSHCOG00000011784	ctif	99	55.772	ENSMPUG00000000844	CTIF	99	54.426	Mustela_putorius_furo
ENSHCOG00000011784	ctif	99	55.464	ENSMLUG00000003025	CTIF	99	54.620	Myotis_lucifugus
ENSHCOG00000011784	ctif	99	57.616	ENSNGAG00000011452	Ctif	99	56.457	Nannospalax_galili
ENSHCOG00000011784	ctif	99	63.447	ENSNBRG00000008679	ctif	99	61.699	Neolamprologus_brichardi
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.607	ENSNLEG00000011503	CTIF	99	55.628	Nomascus_leucogenys
ENSHCOG00000011784	ctif	99	52.326	ENSMEUG00000000218	CTIF	99	51.414	Notamacropus_eugenii
ENSHCOG00000011784	ctif	99	54.739	ENSOPRG00000003558	CTIF	99	54.173	Ochotona_princeps
ENSHCOG00000011784	ctif	99	54.675	ENSODEG00000018390	CTIF	99	53.651	Octodon_degus
ENSHCOG00000011784	ctif	99	70.978	ENSONIG00000007750	ctif	99	71.547	Oreochromis_niloticus
ENSHCOG00000011784	ctif	82	50.089	ENSOANG00000001337	CTIF	99	48.750	Ornithorhynchus_anatinus
ENSHCOG00000011784	ctif	99	55.500	ENSOCUG00000024842	CTIF	99	54.925	Oryctolagus_cuniculus
ENSHCOG00000011784	ctif	98	69.565	ENSORLG00000005786	ctif	99	66.230	Oryzias_latipes
ENSHCOG00000011784	ctif	99	68.249	ENSORLG00020005385	ctif	99	67.763	Oryzias_latipes_hni
ENSHCOG00000011784	ctif	98	68.696	ENSORLG00015011872	ctif	99	64.484	Oryzias_latipes_hsok
ENSHCOG00000011784	ctif	98	70.000	ENSOMEG00000007917	ctif	99	61.203	Oryzias_melastigma
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.230	ENSOGAG00000013927	CTIF	99	55.246	Otolemur_garnettii
ENSHCOG00000011784	ctif	99	55.263	ENSOARG00000003754	CTIF	99	54.441	Ovis_aries
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.770	ENSPPAG00000023554	CTIF	99	55.791	Pan_paniscus
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.078	ENSPPRG00000002265	CTIF	99	55.392	Panthera_pardus
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.078	ENSPTIG00000013761	CTIF	99	55.392	Panthera_tigris_altaica
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.607	ENSPTRG00000010009	CTIF	99	55.139	Pan_troglodytes
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.607	ENSPANG00000017087	CTIF	99	55.628	Papio_anubis
ENSHCOG00000011784	ctif	82	58.763	ENSPKIG00000011234	ctif	99	57.938	Paramormyrops_kingsleyae
ENSHCOG00000011784	ctif	99	55.387	ENSPSIG00000006508	CTIF	99	54.806	Pelodiscus_sinensis
ENSHCOG00000011784	ctif	98	64.151	ENSPMGG00000022958	ctif	83	64.069	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.393	ENSPEMG00000022746	Ctif	99	55.246	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSHCOG00000011784	ctif	73	54.688	ENSPCIG00000026247	CTIF	97	57.764	Phascolarctos_cinereus
ENSHCOG00000011784	ctif	99	69.130	ENSPFOG00000009243	ctif	99	68.482	Poecilia_formosa
ENSHCOG00000011784	ctif	98	68.261	ENSPLAG00000019171	ctif	99	66.343	Poecilia_latipinna
ENSHCOG00000011784	ctif	98	68.261	ENSPMEG00000020089	ctif	99	57.918	Poecilia_mexicana
ENSHCOG00000011784	ctif	98	67.826	ENSPREG00000017326	ctif	87	67.965	Poecilia_reticulata
ENSHCOG00000011784	ctif	82	56.286	ENSPPYG00000009147	CTIF	99	55.039	Pongo_abelii
ENSHCOG00000011784	ctif	99	54.276	ENSPCOG00000013391	CTIF	99	53.289	Propithecus_coquereli
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.457	ENSPVAG00000001965	CTIF	99	55.408	Pteropus_vampyrus
ENSHCOG00000011784	ctif	99	69.565	ENSPNYG00000007879	ctif	99	72.203	Pundamilia_nyererei
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.393	ENSRNOG00000018342	Ctif	99	54.754	Rattus_norvegicus
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.954	ENSRBIG00000043937	CTIF	99	55.791	Rhinopithecus_bieti
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.444	ENSRROG00000006039	CTIF	99	55.139	Rhinopithecus_roxellana
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.721	ENSSBOG00000028468	CTIF	99	55.738	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSHCOG00000011784	ctif	99	54.424	ENSSHAG00000016321	CTIF	99	53.088	Sarcophilus_harrisii
ENSHCOG00000011784	ctif	99	55.489	ENSSFOG00015022594	ctif	99	55.146	Scleropages_formosus
ENSHCOG00000011784	ctif	97	86.772	ENSSMAG00000005707	ctif	99	68.196	Scophthalmus_maximus
ENSHCOG00000011784	ctif	94	87.500	ENSSDUG00000016033	ctif	80	87.368	Seriola_dumerili
ENSHCOG00000011784	ctif	94	71.739	ENSSLDG00000007282	ctif	99	63.142	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSHCOG00000011784	ctif	99	57.621	ENSSPUG00000014734	CTIF	99	57.983	Sphenodon_punctatus
ENSHCOG00000011784	ctif	99	69.357	ENSSPAG00000003721	ctif	99	69.205	Stegastes_partitus
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.312	ENSSSCG00000004506	CTIF	99	54.934	Sus_scrofa
ENSHCOG00000011784	ctif	99	54.839	ENSTGUG00000000030	CTIF	99	53.560	Taeniopygia_guttata
ENSHCOG00000011784	ctif	58	64.265	ENSTRUG00000002320	ctif	99	64.706	Takifugu_rubripes
ENSHCOG00000011784	ctif	99	65.109	ENSTNIG00000018763	ctif	99	64.933	Tetraodon_nigroviridis
ENSHCOG00000011784	ctif	87	62.500	ENSTBEG00000002613	CTIF	73	62.963	Tupaia_belangeri
ENSHCOG00000011784	ctif	99	52.751	ENSTTRG00000004347	CTIF	99	52.350	Tursiops_truncatus
ENSHCOG00000011784	ctif	83	52.652	ENSUAMG00000007299	CTIF	88	51.718	Ursus_americanus
ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.117	ENSUMAG00000002735	CTIF	99	54.770	Ursus_maritimus
ENSHCOG00000011784	ctif	51	61.111	ENSVPAG00000001497	-	72	60.829	Vicugna_pacos
ENSHCOG00000011784	ctif	96	55.593	ENSVVUG00000014347	CTIF	99	55.241	Vulpes_vulpes
ENSHCOG00000011784	ctif	71	66.923	ENSXETG00000026836	ctif	71	66.795	Xenopus_tropicalis
ENSHCOG00000011784	ctif	64	64.175	ENSXCOG00000002477	ctif	84	62.857	Xiphophorus_couchianus
ENSHCOG00000011784	ctif	98	68.261	ENSXMAG00000004236	ctif	99	61.943	Xiphophorus_maculatus