EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSHCOG00000012786 (Gene tree)
Gene ID: 109522857
Gene Symbol: gemin2
Alias: sip1|wu:fc52a05|zgc:110274
Full Name: gem nuclear organelle associated protein 2
Gene Type: protein_coding
Species: Hippocampus_comes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5852 bases
Position: chrKV880157.1:232760-238611
Accession: 109522857
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHCOP00000010221	SIP1	PF04938.12	5.3e-75	1	1
ENSHCOP00000023885	SIP1	PF04938.12	1.4e-65	1	1
ENSHCOP00000023896	SIP1	PF04938.12	2.4e-63	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHCOT00000026104	-	964	-	ENSHCOP00000023896	272 (aa)	-	-
ENSHCOT00000016553	-	717	-	ENSHCOP00000023885	238 (aa)	-	-
ENSHCOT00000016567	-	943	XM_019881688	ENSHCOP00000010221	265 (aa)	XP_019737247	UPI00094E5958

Gene Model

Click here to download ENSHCOG00000012786's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
hcq03013	RNA transport	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSHCOG00000012786's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.738	ENSG00000092208	GEMIN2	94	62.738	Homo_sapiens
ENSHCOG00000012786	gemin2	51	81.343	ENSAPOG00000012870	gemin2	82	81.343	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.264	ENSAMEG00000003856	GEMIN2	95	62.264	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHCOG00000012786	gemin2	97	77.907	ENSACIG00000014430	gemin2	95	77.907	Amphilophus_citrinellus
ENSHCOG00000012786	gemin2	100	82.642	ENSAOCG00000012349	gemin2	100	82.642	Amphiprion_ocellaris
ENSHCOG00000012786	gemin2	100	82.264	ENSAPEG00000002529	gemin2	100	82.264	Amphiprion_percula
ENSHCOG00000012786	gemin2	100	79.623	ENSATEG00000009574	gemin2	100	79.623	Anabas_testudineus
ENSHCOG00000012786	gemin2	87	63.203	ENSAPLG00000012052	GEMIN2	99	63.203	Anas_platyrhynchos
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	58.175	ENSACAG00000015872	GEMIN2	98	58.175	Anolis_carolinensis
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	48.120	ENSANAG00000026213	GEMIN2	96	48.120	Aotus_nancymaae
ENSHCOG00000012786	gemin2	95	74.603	ENSACLG00000024473	gemin2	99	74.603	Astatotilapia_calliptera
ENSHCOG00000012786	gemin2	98	68.582	ENSAMXG00000033969	gemin2	99	68.582	Astyanax_mexicanus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.500	ENSBTAG00000020930	GEMIN2	94	62.500	Bos_taurus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	61.977	ENSCJAG00000016248	GEMIN2	94	61.977	Callithrix_jacchus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.642	ENSCAFG00000013859	GEMIN2	97	62.642	Canis_familiaris
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.642	ENSCAFG00020022243	GEMIN2	97	62.642	Canis_lupus_dingo
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.879	ENSCHIG00000009881	GEMIN2	97	62.879	Capra_hircus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	60.456	ENSTSYG00000032612	-	99	60.456	Carlito_syrichta
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.500	ENSTSYG00000003528	-	94	62.500	Carlito_syrichta
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	55.894	ENSCPOG00000011338	GEMIN2	97	55.894	Cavia_porcellus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	50.204	ENSCCAG00000030361	-	89	50.204	Cebus_capucinus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.738	ENSCCAG00000035944	GEMIN2	94	62.738	Cebus_capucinus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	45.247	ENSCATG00000031373	-	91	45.247	Cercocebus_atys
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.738	ENSCATG00000042473	GEMIN2	97	62.738	Cercocebus_atys
ENSHCOG00000012786	gemin2	95	61.111	ENSCLAG00000008967	GEMIN2	98	61.111	Chinchilla_lanigera
ENSHCOG00000012786	gemin2	98	44.706	ENSCSAG00000016872	-	92	44.706	Chlorocebus_sabaeus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	51.894	ENSCHOG00000011644	GEMIN2	94	51.894	Choloepus_hoffmanni
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	61.132	ENSCPBG00000026207	GEMIN2	99	61.132	Chrysemys_picta_bellii
ENSHCOG00000012786	gemin2	88	33.213	ENSCING00000012240	-	85	32.491	Ciona_intestinalis
ENSHCOG00000012786	gemin2	89	32.246	ENSCSAVG00000009875	-	85	32.246	Ciona_savignyi
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	44.922	ENSCANG00000033060	-	88	44.922	Colobus_angolensis_palliatus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.738	ENSCANG00000035266	GEMIN2	94	62.738	Colobus_angolensis_palliatus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.879	ENSCGRG00001017720	Gemin2	97	62.879	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.879	ENSCGRG00000007060	Gemin2	97	62.879	Cricetulus_griseus_crigri
ENSHCOG00000012786	gemin2	100	72.453	ENSCSEG00000016057	gemin2	100	72.453	Cynoglossus_semilaevis
ENSHCOG00000012786	gemin2	95	79.921	ENSCVAG00000003125	gemin2	100	79.921	Cyprinodon_variegatus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	69.202	ENSDARG00000015638	gemin2	99	69.202	Danio_rerio
ENSHCOG00000012786	gemin2	74	59.184	ENSDNOG00000018278	GEMIN2	89	59.184	Dasypus_novemcinctus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.121	ENSDORG00000003814	Gemin2	97	62.121	Dipodomys_ordii
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	61.887	ENSETEG00000006463	GEMIN2	94	61.887	Echinops_telfairi
ENSHCOG00000012786	gemin2	85	42.797	ENSEBUG00000002198	gemin2	78	42.797	Eptatretus_burgeri
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.879	ENSEASG00005007617	GEMIN2	94	62.879	Equus_asinus_asinus
ENSHCOG00000012786	gemin2	95	62.055	ENSECAG00000007554	GEMIN2	84	62.055	Equus_caballus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	57.955	ENSEEUG00000008438	GEMIN2	94	57.955	Erinaceus_europaeus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	70.342	ENSELUG00000005266	gemin2	99	70.342	Esox_lucius
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.264	ENSFCAG00000029921	GEMIN2	94	62.264	Felis_catus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.172	ENSFALG00000006169	GEMIN2	94	62.172	Ficedula_albicollis
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	61.364	ENSFDAG00000001562	GEMIN2	97	61.364	Fukomys_damarensis
ENSHCOG00000012786	gemin2	100	78.195	ENSFHEG00000020705	gemin2	100	78.195	Fundulus_heteroclitus
ENSHCOG00000012786	gemin2	88	70.085	ENSGMOG00000009379	gemin2	99	70.085	Gadus_morhua
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	61.798	ENSGALG00000010154	GEMIN2	99	61.798	Gallus_gallus
ENSHCOG00000012786	gemin2	100	72.761	ENSGAFG00000019641	gemin2	100	72.761	Gambusia_affinis
ENSHCOG00000012786	gemin2	100	77.358	ENSGACG00000012444	gemin2	99	77.358	Gasterosteus_aculeatus
ENSHCOG00000012786	gemin2	88	61.538	ENSGAGG00000003982	GEMIN2	97	61.538	Gopherus_agassizii
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	43.939	ENSGGOG00000043428	-	84	38.298	Gorilla_gorilla
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	53.232	ENSGGOG00000016691	GEMIN2	93	53.232	Gorilla_gorilla
ENSHCOG00000012786	gemin2	100	80.075	ENSHBUG00000016285	gemin2	100	80.075	Haplochromis_burtoni
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	61.742	ENSHGLG00000004890	GEMIN2	97	61.742	Heterocephalus_glaber_female
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	61.742	ENSHGLG00100009949	GEMIN2	97	61.742	Heterocephalus_glaber_male
ENSHCOG00000012786	gemin2	96	68.093	ENSIPUG00000012821	gemin2	99	68.093	Ictalurus_punctatus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.500	ENSSTOG00000006357	GEMIN2	97	62.500	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.500	ENSJJAG00000022975	Gemin2	97	62.500	Jaculus_jaculus
ENSHCOG00000012786	gemin2	100	78.947	ENSKMAG00000007880	gemin2	100	78.947	Kryptolebias_marmoratus
ENSHCOG00000012786	gemin2	95	66.953	ENSLBEG00000022377	gemin2	100	66.953	Labrus_bergylta
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	65.019	ENSLACG00000004723	GEMIN2	99	65.019	Latimeria_chalumnae
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	65.530	ENSLOCG00000009221	gemin2	99	65.530	Lepisosteus_oculatus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	63.636	ENSLAFG00000010321	GEMIN2	97	63.636	Loxodonta_africana
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.738	ENSMFAG00000014362	GEMIN2	94	62.738	Macaca_fascicularis
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	44.656	ENSMFAG00000003283	-	90	44.656	Macaca_fascicularis
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.738	ENSMMUG00000021028	GEMIN2	97	62.738	Macaca_mulatta
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	45.420	ENSMMUG00000001073	-	87	45.420	Macaca_mulatta
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.738	ENSMNEG00000033286	GEMIN2	97	62.738	Macaca_nemestrina
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	45.420	ENSMNEG00000033555	-	89	45.420	Macaca_nemestrina
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.738	ENSMLEG00000035575	GEMIN2	95	62.738	Mandrillus_leucophaeus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	45.038	ENSMLEG00000008946	-	89	45.038	Mandrillus_leucophaeus
ENSHCOG00000012786	gemin2	96	73.828	ENSMAMG00000012985	gemin2	99	73.828	Mastacembelus_armatus
ENSHCOG00000012786	gemin2	100	79.699	ENSMZEG00005007915	gemin2	100	79.699	Maylandia_zebra
ENSHCOG00000012786	gemin2	87	63.636	ENSMGAG00000012566	GEMIN2	99	63.636	Meleagris_gallopavo
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.879	ENSMAUG00000017447	Gemin2	97	62.879	Mesocricetus_auratus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	50.566	ENSMICG00000043979	-	97	50.566	Microcebus_murinus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.500	ENSMICG00000004811	-	92	62.500	Microcebus_murinus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	63.258	ENSMOCG00000023031	Gemin2	97	63.258	Microtus_ochrogaster
ENSHCOG00000012786	gemin2	95	74.206	ENSMMOG00000004604	gemin2	100	69.650	Mola_mola
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.121	ENSMODG00000011946	GEMIN2	99	62.121	Monodelphis_domestica
ENSHCOG00000012786	gemin2	100	76.226	ENSMALG00000021507	gemin2	100	76.226	Monopterus_albus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.500	MGP_CAROLIEiJ_G0017777	Gemin2	97	62.500	Mus_caroli
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.121	ENSMUSG00000060121	Gemin2	97	62.121	Mus_musculus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.500	MGP_PahariEiJ_G0029533	Gemin2	97	62.500	Mus_pahari
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.500	MGP_SPRETEiJ_G0018622	Gemin2	97	62.500	Mus_spretus
ENSHCOG00000012786	gemin2	98	62.977	ENSMPUG00000016240	GEMIN2	96	62.977	Mustela_putorius_furo
ENSHCOG00000012786	gemin2	97	61.089	ENSMLUG00000002619	GEMIN2	97	61.089	Myotis_lucifugus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.879	ENSNGAG00000001053	Gemin2	97	62.879	Nannospalax_galili
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.738	ENSNLEG00000004013	GEMIN2	96	62.879	Nomascus_leucogenys
ENSHCOG00000012786	gemin2	95	57.371	ENSMEUG00000011734	-	92	57.371	Notamacropus_eugenii
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	57.955	ENSOPRG00000007714	GEMIN2	94	57.955	Ochotona_princeps
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	61.742	ENSODEG00000000272	GEMIN2	97	61.742	Octodon_degus
ENSHCOG00000012786	gemin2	100	79.323	ENSONIG00000019495	gemin2	100	79.323	Oreochromis_niloticus
ENSHCOG00000012786	gemin2	98	60.769	ENSOANG00000014013	-	95	60.769	Ornithorhynchus_anatinus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	60.227	ENSOCUG00000000673	GEMIN2	93	60.227	Oryctolagus_cuniculus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	71.103	ENSORLG00000017666	gemin2	99	71.103	Oryzias_latipes
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	75.665	ENSORLG00020016613	gemin2	99	75.665	Oryzias_latipes_hni
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	76.046	ENSORLG00015013224	gemin2	99	76.046	Oryzias_latipes_hsok
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	76.806	ENSOMEG00000011576	gemin2	99	76.806	Oryzias_melastigma
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.500	ENSOGAG00000007906	GEMIN2	94	62.500	Otolemur_garnettii
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.642	ENSOARG00000008466	GEMIN2	94	62.642	Ovis_aries
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	45.247	ENSPPAG00000033797	-	79	47.458	Pan_paniscus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	57.143	ENSPPAG00000043467	GEMIN2	94	57.143	Pan_paniscus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.264	ENSPPRG00000009485	GEMIN2	94	62.264	Panthera_pardus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.264	ENSPTIG00000018115	GEMIN2	97	62.264	Panthera_tigris_altaica
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	45.247	ENSPTRG00000045455	-	78	45.247	Pan_troglodytes
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.738	ENSPTRG00000006291	GEMIN2	94	62.738	Pan_troglodytes
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	43.529	ENSPANG00000034146	-	89	43.529	Papio_anubis
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	54.321	ENSPANG00000011343	-	95	54.321	Papio_anubis
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	67.557	ENSPKIG00000010339	gemin2	99	67.557	Paramormyrops_kingsleyae
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	60.755	ENSPSIG00000013560	GEMIN2	88	60.755	Pelodiscus_sinensis
ENSHCOG00000012786	gemin2	98	74.330	ENSPMGG00000008763	gemin2	100	74.330	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.879	ENSPEMG00000008079	Gemin2	97	62.879	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSHCOG00000012786	gemin2	92	47.191	ENSPMAG00000009804	gemin2	100	47.191	Petromyzon_marinus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.500	ENSPCIG00000025754	GEMIN2	79	62.500	Phascolarctos_cinereus
ENSHCOG00000012786	gemin2	100	77.903	ENSPFOG00000014660	gemin2	100	77.903	Poecilia_formosa
ENSHCOG00000012786	gemin2	100	78.571	ENSPLAG00000020265	gemin2	100	78.571	Poecilia_latipinna
ENSHCOG00000012786	gemin2	100	77.444	ENSPMEG00000011134	gemin2	100	77.444	Poecilia_mexicana
ENSHCOG00000012786	gemin2	100	72.556	ENSPREG00000007692	gemin2	100	72.556	Poecilia_reticulata
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.738	ENSPPYG00000005764	GEMIN2	94	62.738	Pongo_abelii
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	55.133	ENSPCAG00000005387	GEMIN2	93	55.133	Procavia_capensis
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	58.712	ENSPCOG00000016964	GEMIN2	93	58.712	Propithecus_coquereli
ENSHCOG00000012786	gemin2	95	61.111	ENSPVAG00000002586	GEMIN2	95	61.111	Pteropus_vampyrus
ENSHCOG00000012786	gemin2	100	79.699	ENSPNYG00000022626	gemin2	100	79.699	Pundamilia_nyererei
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	68.421	ENSPNAG00000017346	gemin2	99	68.421	Pygocentrus_nattereri
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.879	ENSRNOG00000004360	Gemin2	97	62.879	Rattus_norvegicus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.738	ENSRBIG00000034601	GEMIN2	97	62.738	Rhinopithecus_bieti
ENSHCOG00000012786	gemin2	94	43.966	ENSRBIG00000038026	-	85	43.966	Rhinopithecus_bieti
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.738	ENSRROG00000042627	GEMIN2	94	62.738	Rhinopithecus_roxellana
ENSHCOG00000012786	gemin2	95	62.451	ENSSBOG00000022280	GEMIN2	97	62.451	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSHCOG00000012786	gemin2	59	57.325	ENSSHAG00000000156	-	95	57.325	Sarcophilus_harrisii
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	71.103	ENSSFOG00015012315	gemin2	99	71.103	Scleropages_formosus
ENSHCOG00000012786	gemin2	100	76.981	ENSSMAG00000011151	gemin2	100	76.981	Scophthalmus_maximus
ENSHCOG00000012786	gemin2	100	80.755	ENSSDUG00000017275	gemin2	100	80.755	Seriola_dumerili
ENSHCOG00000012786	gemin2	96	79.216	ENSSLDG00000023429	gemin2	98	79.216	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSHCOG00000012786	gemin2	94	61.355	ENSSARG00000010294	GEMIN2	93	61.355	Sorex_araneus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	56.439	ENSSPUG00000017222	GEMIN2	99	56.439	Sphenodon_punctatus
ENSHCOG00000012786	gemin2	100	81.132	ENSSPAG00000001354	gemin2	100	81.132	Stegastes_partitus
ENSHCOG00000012786	gemin2	98	62.308	ENSSSCG00000004985	GEMIN2	93	62.308	Sus_scrofa
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.121	ENSTGUG00000012039	GEMIN2	99	62.121	Taeniopygia_guttata
ENSHCOG00000012786	gemin2	100	72.830	ENSTRUG00000021760	gemin2	98	72.830	Takifugu_rubripes
ENSHCOG00000012786	gemin2	100	74.717	ENSTNIG00000016875	gemin2	100	74.717	Tetraodon_nigroviridis
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.879	ENSTBEG00000002654	GEMIN2	94	62.879	Tupaia_belangeri
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	53.030	ENSTTRG00000017126	GEMIN2	94	53.030	Tursiops_truncatus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.121	ENSUAMG00000021811	GEMIN2	97	62.121	Ursus_americanus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.121	ENSUMAG00000008366	GEMIN2	97	62.121	Ursus_maritimus
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.738	ENSVPAG00000006856	GEMIN2	94	62.738	Vicugna_pacos
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	62.642	ENSVVUG00000020954	GEMIN2	94	62.642	Vulpes_vulpes
ENSHCOG00000012786	gemin2	99	61.832	ENSXETG00000000298	gemin2	96	61.832	Xenopus_tropicalis
ENSHCOG00000012786	gemin2	100	73.408	ENSXCOG00000014021	gemin2	100	73.408	Xiphophorus_couchianus
ENSHCOG00000012786	gemin2	100	73.308	ENSXMAG00000009532	gemin2	100	73.308	Xiphophorus_maculatus