EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSHCOG00000012904 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: syf2
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Hippocampus_comes
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6971 bases
Position: chrKV880101.1:16565-23535
Accession: 109520808
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHCOP00000023960	SYF2	PF08231.12	1.9e-52	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHCOT00000016692	-	1085	XM_019878313	ENSHCOP00000023960	306 (aa)	XP_019733872	-

Gene Model

Click here to download ENSHCOG00000012904's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSHCOG00000012904's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHCOG00000012904	syf2	79	77.178	ENSG00000117614	SYF2	98	78.008	Homo_sapiens
ENSHCOG00000012904	syf2	78	89.076	ENSAPOG00000001174	syf2	100	89.076	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHCOG00000012904	syf2	78	76.250	ENSAMEG00000010115	-	98	76.250	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHCOG00000012904	syf2	64	83.077	ENSAMEG00000010134	-	100	83.077	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHCOG00000012904	syf2	76	87.983	ENSACIG00000023688	syf2	93	87.983	Amphilophus_citrinellus
ENSHCOG00000012904	syf2	81	86.235	ENSAOCG00000022046	syf2	100	87.815	Amphiprion_ocellaris
ENSHCOG00000012904	syf2	72	87.783	ENSAOCG00000010912	syf2	69	87.783	Amphiprion_ocellaris
ENSHCOG00000012904	syf2	81	86.235	ENSAPEG00000018858	syf2	95	86.235	Amphiprion_percula
ENSHCOG00000012904	syf2	78	90.336	ENSATEG00000007745	syf2	100	90.336	Anabas_testudineus
ENSHCOG00000012904	syf2	65	82.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	82.000	Anas_platyrhynchos
ENSHCOG00000012904	syf2	54	67.665	ENSACAG00000026777	-	100	67.665	Anolis_carolinensis
ENSHCOG00000012904	syf2	67	81.373	ENSACAG00000013653	-	100	81.373	Anolis_carolinensis
ENSHCOG00000012904	syf2	79	77.593	ENSANAG00000032473	SYF2	98	78.008	Aotus_nancymaae
ENSHCOG00000012904	syf2	78	89.916	ENSACLG00000019916	syf2	100	89.916	Astatotilapia_calliptera
ENSHCOG00000012904	syf2	78	83.613	ENSAMXG00000004051	syf2	100	83.613	Astyanax_mexicanus
ENSHCOG00000012904	syf2	79	77.366	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	78.243	Bos_taurus
ENSHCOG00000012904	syf2	68	50.711	WBGene00019402	syf-2	99	47.679	Caenorhabditis_elegans
ENSHCOG00000012904	syf2	79	77.593	ENSCJAG00000046570	SYF2	98	78.423	Callithrix_jacchus
ENSHCOG00000012904	syf2	70	82.791	ENSCAFG00000012895	-	98	76.132	Canis_familiaris
ENSHCOG00000012904	syf2	73	75.336	ENSCAFG00000030331	-	98	75.336	Canis_familiaris
ENSHCOG00000012904	syf2	59	73.626	ENSCAFG00020021094	-	95	73.626	Canis_lupus_dingo
ENSHCOG00000012904	syf2	70	82.791	ENSCAFG00020021091	-	98	76.132	Canis_lupus_dingo
ENSHCOG00000012904	syf2	79	77.178	ENSCHIG00000020874	SYF2	99	77.178	Capra_hircus
ENSHCOG00000012904	syf2	79	77.593	ENSTSYG00000005114	SYF2	98	77.593	Carlito_syrichta
ENSHCOG00000012904	syf2	65	83.333	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	83.333	Cavia_aperea
ENSHCOG00000012904	syf2	78	77.869	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	77.869	Cavia_porcellus
ENSHCOG00000012904	syf2	79	77.593	ENSCCAG00000022459	SYF2	98	78.423	Cebus_capucinus
ENSHCOG00000012904	syf2	79	77.178	ENSCATG00000026917	SYF2	98	77.178	Cercocebus_atys
ENSHCOG00000012904	syf2	78	78.279	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	78.279	Chinchilla_lanigera
ENSHCOG00000012904	syf2	79	76.763	ENSCSAG00000000948	SYF2	98	76.763	Chlorocebus_sabaeus
ENSHCOG00000012904	syf2	57	62.857	ENSCHOG00000005273	-	93	62.857	Choloepus_hoffmanni
ENSHCOG00000012904	syf2	73	81.982	ENSCPBG00000025073	SYF2	94	78.481	Chrysemys_picta_bellii
ENSHCOG00000012904	syf2	72	54.260	ENSCING00000003017	-	89	55.607	Ciona_intestinalis
ENSHCOG00000012904	syf2	69	50.000	ENSCSAVG00000006627	-	98	50.000	Ciona_savignyi
ENSHCOG00000012904	syf2	79	67.220	ENSCANG00000037322	SYF2	97	67.220	Colobus_angolensis_palliatus
ENSHCOG00000012904	syf2	78	77.686	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	77.686	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSHCOG00000012904	syf2	64	83.673	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	83.838	Cricetulus_griseus_crigri
ENSHCOG00000012904	syf2	71	88.532	ENSCSEG00000000117	syf2	100	84.937	Cynoglossus_semilaevis
ENSHCOG00000012904	syf2	78	87.029	ENSCVAG00000019543	syf2	100	87.448	Cyprinodon_variegatus
ENSHCOG00000012904	syf2	78	84.454	ENSDARG00000004706	syf2	100	84.454	Danio_rerio
ENSHCOG00000012904	syf2	79	77.366	ENSDNOG00000047605	SYF2	98	77.366	Dasypus_novemcinctus
ENSHCOG00000012904	syf2	74	82.222	ENSDORG00000001274	Syf2	92	82.222	Dipodomys_ordii
ENSHCOG00000012904	syf2	71	53.636	FBgn0033556	CG12343	97	53.636	Drosophila_melanogaster
ENSHCOG00000012904	syf2	68	67.633	ENSETEG00000015729	SYF2	100	64.629	Echinops_telfairi
ENSHCOG00000012904	syf2	64	58.883	ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.883	Eptatretus_burgeri
ENSHCOG00000012904	syf2	77	70.339	ENSEASG00005004232	-	96	70.339	Equus_asinus_asinus
ENSHCOG00000012904	syf2	78	77.143	ENSEASG00005004224	-	100	77.143	Equus_asinus_asinus
ENSHCOG00000012904	syf2	78	78.571	ENSECAG00000010440	-	98	78.571	Equus_caballus
ENSHCOG00000012904	syf2	78	76.735	ENSECAG00000012023	-	100	76.735	Equus_caballus
ENSHCOG00000012904	syf2	59	66.667	ENSEEUG00000015084	SYF2	97	66.667	Erinaceus_europaeus
ENSHCOG00000012904	syf2	78	85.356	ENSELUG00000003465	syf2	100	85.356	Esox_lucius
ENSHCOG00000012904	syf2	79	76.707	ENSFCAG00000010324	-	86	76.707	Felis_catus
ENSHCOG00000012904	syf2	79	76.735	ENSFCAG00000043095	-	98	76.735	Felis_catus
ENSHCOG00000012904	syf2	67	79.902	ENSFALG00000000460	SYF2	89	78.899	Ficedula_albicollis
ENSHCOG00000012904	syf2	78	77.500	ENSFDAG00000008310	SYF2	97	77.500	Fukomys_damarensis
ENSHCOG00000012904	syf2	73	76.000	ENSFHEG00000007238	syf2	99	76.000	Fundulus_heteroclitus
ENSHCOG00000012904	syf2	71	89.815	ENSGMOG00000019138	syf2	96	89.815	Gadus_morhua
ENSHCOG00000012904	syf2	73	81.081	ENSGALG00000013639	SYF2	100	73.333	Gallus_gallus
ENSHCOG00000012904	syf2	78	88.235	ENSGAFG00000019435	syf2	100	88.235	Gambusia_affinis
ENSHCOG00000012904	syf2	73	91.441	ENSGACG00000007305	syf2	100	88.703	Gasterosteus_aculeatus
ENSHCOG00000012904	syf2	73	82.432	ENSGAGG00000010670	SYF2	94	78.903	Gopherus_agassizii
ENSHCOG00000012904	syf2	79	77.178	ENSGGOG00000012796	SYF2	98	78.008	Gorilla_gorilla
ENSHCOG00000012904	syf2	78	89.916	ENSHBUG00000020477	syf2	100	89.916	Haplochromis_burtoni
ENSHCOG00000012904	syf2	73	70.404	ENSHGLG00000004304	-	100	69.328	Heterocephalus_glaber_female
ENSHCOG00000012904	syf2	78	78.279	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	78.279	Heterocephalus_glaber_female
ENSHCOG00000012904	syf2	78	78.279	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	78.279	Heterocephalus_glaber_male
ENSHCOG00000012904	syf2	78	84.454	ENSIPUG00000019859	syf2	100	84.454	Ictalurus_punctatus
ENSHCOG00000012904	syf2	65	83.920	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	83.920	Jaculus_jaculus
ENSHCOG00000012904	syf2	78	88.235	ENSKMAG00000013856	syf2	100	88.235	Kryptolebias_marmoratus
ENSHCOG00000012904	syf2	78	90.756	ENSLBEG00000014425	syf2	100	90.756	Labrus_bergylta
ENSHCOG00000012904	syf2	73	80.269	ENSLACG00000012064	SYF2	94	80.269	Latimeria_chalumnae
ENSHCOG00000012904	syf2	81	80.800	ENSLOCG00000002728	syf2	99	80.800	Lepisosteus_oculatus
ENSHCOG00000012904	syf2	60	55.435	ENSLAFG00000030814	-	100	55.435	Loxodonta_africana
ENSHCOG00000012904	syf2	78	77.551	ENSLAFG00000023150	-	91	82.883	Loxodonta_africana
ENSHCOG00000012904	syf2	79	77.178	ENSMFAG00000041831	SYF2	98	77.178	Macaca_fascicularis
ENSHCOG00000012904	syf2	79	76.349	ENSMMUG00000002968	SYF2	98	77.178	Macaca_mulatta
ENSHCOG00000012904	syf2	79	77.178	ENSMNEG00000030180	SYF2	98	77.178	Macaca_nemestrina
ENSHCOG00000012904	syf2	79	77.178	ENSMLEG00000030248	SYF2	98	77.178	Mandrillus_leucophaeus
ENSHCOG00000012904	syf2	79	87.552	ENSMAMG00000010403	syf2	99	87.552	Mastacembelus_armatus
ENSHCOG00000012904	syf2	78	89.496	ENSMZEG00005006429	syf2	100	89.496	Maylandia_zebra
ENSHCOG00000012904	syf2	65	82.412	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	82.412	Meleagris_gallopavo
ENSHCOG00000012904	syf2	77	78.423	ENSMAUG00000018974	Syf2	99	78.423	Mesocricetus_auratus
ENSHCOG00000012904	syf2	65	83.920	ENSMICG00000016191	SYF2	100	83.920	Microcebus_murinus
ENSHCOG00000012904	syf2	78	78.099	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	78.099	Microtus_ochrogaster
ENSHCOG00000012904	syf2	75	88.312	ENSMMOG00000002396	syf2	97	88.312	Mola_mola
ENSHCOG00000012904	syf2	73	77.679	ENSMODG00000013951	-	98	77.679	Monodelphis_domestica
ENSHCOG00000012904	syf2	78	87.552	ENSMALG00000010706	syf2	100	87.967	Monopterus_albus
ENSHCOG00000012904	syf2	77	78.423	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	98	78.423	Mus_caroli
ENSHCOG00000012904	syf2	77	78.423	ENSMUSG00000028821	Syf2	98	78.423	Mus_musculus
ENSHCOG00000012904	syf2	77	78.423	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	98	78.423	Mus_pahari
ENSHCOG00000012904	syf2	77	78.423	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	98	78.423	Mus_spretus
ENSHCOG00000012904	syf2	79	77.178	ENSMPUG00000015801	-	97	77.178	Mustela_putorius_furo
ENSHCOG00000012904	syf2	79	75.720	ENSMPUG00000015802	-	98	75.720	Mustela_putorius_furo
ENSHCOG00000012904	syf2	80	77.049	ENSMLUG00000001885	SYF2	99	77.049	Myotis_lucifugus
ENSHCOG00000012904	syf2	78	78.333	ENSNGAG00000007912	Syf2	97	78.333	Nannospalax_galili
ENSHCOG00000012904	syf2	78	78.601	ENSNBRG00000010720	syf2	100	78.601	Neolamprologus_brichardi
ENSHCOG00000012904	syf2	79	77.178	ENSNLEG00000035185	SYF2	98	78.008	Nomascus_leucogenys
ENSHCOG00000012904	syf2	78	76.016	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	76.016	Ochotona_princeps
ENSHCOG00000012904	syf2	73	81.081	ENSODEG00000017664	-	93	81.081	Octodon_degus
ENSHCOG00000012904	syf2	78	68.443	ENSODEG00000014338	-	100	68.443	Octodon_degus
ENSHCOG00000012904	syf2	78	89.916	ENSONIG00000008213	syf2	100	89.916	Oreochromis_niloticus
ENSHCOG00000012904	syf2	66	83.663	ENSOANG00000009552	SYF2	100	83.663	Ornithorhynchus_anatinus
ENSHCOG00000012904	syf2	78	77.049	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	78.689	Oryctolagus_cuniculus
ENSHCOG00000012904	syf2	73	89.640	ENSORLG00000028820	syf2	100	84.583	Oryzias_latipes
ENSHCOG00000012904	syf2	78	85.714	ENSORLG00020018333	syf2	100	85.714	Oryzias_latipes_hni
ENSHCOG00000012904	syf2	78	85.714	ENSORLG00015014665	syf2	100	85.714	Oryzias_latipes_hsok
ENSHCOG00000012904	syf2	78	88.235	ENSOMEG00000013911	syf2	100	88.235	Oryzias_melastigma
ENSHCOG00000012904	syf2	78	78.689	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	78.689	Otolemur_garnettii
ENSHCOG00000012904	syf2	79	76.327	ENSOARG00000006348	-	98	76.327	Ovis_aries
ENSHCOG00000012904	syf2	64	56.410	ENSOARG00000006269	-	100	56.410	Ovis_aries
ENSHCOG00000012904	syf2	79	77.178	ENSPPAG00000036579	SYF2	98	78.008	Pan_paniscus
ENSHCOG00000012904	syf2	74	80.870	ENSPPRG00000001638	-	93	80.870	Panthera_pardus
ENSHCOG00000012904	syf2	79	76.735	ENSPPRG00000001651	-	98	76.735	Panthera_pardus
ENSHCOG00000012904	syf2	70	84.186	ENSPTIG00000005711	-	80	83.486	Panthera_tigris_altaica
ENSHCOG00000012904	syf2	79	76.735	ENSPTIG00000007036	-	98	76.735	Panthera_tigris_altaica
ENSHCOG00000012904	syf2	79	77.178	ENSPTRG00000000352	SYF2	98	78.008	Pan_troglodytes
ENSHCOG00000012904	syf2	79	77.178	ENSPANG00000008139	SYF2	98	77.178	Papio_anubis
ENSHCOG00000012904	syf2	78	82.353	ENSPKIG00000008130	syf2	100	82.353	Paramormyrops_kingsleyae
ENSHCOG00000012904	syf2	77	77.966	ENSPSIG00000011816	SYF2	91	77.966	Pelodiscus_sinensis
ENSHCOG00000012904	syf2	83	83.465	ENSPMGG00000008755	syf2	99	83.465	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSHCOG00000012904	syf2	78	77.778	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	77.778	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSHCOG00000012904	syf2	73	81.982	ENSPCIG00000014235	SYF2	89	81.982	Phascolarctos_cinereus
ENSHCOG00000012904	syf2	74	90.749	ENSPFOG00000004116	syf2	94	90.749	Poecilia_formosa
ENSHCOG00000012904	syf2	83	82.677	ENSPLAG00000006691	syf2	100	88.412	Poecilia_latipinna
ENSHCOG00000012904	syf2	78	84.874	ENSPMEG00000011684	syf2	100	84.874	Poecilia_mexicana
ENSHCOG00000012904	syf2	78	87.815	ENSPREG00000003009	syf2	100	87.815	Poecilia_reticulata
ENSHCOG00000012904	syf2	79	78.008	ENSPPYG00000001713	SYF2	98	78.008	Pongo_abelii
ENSHCOG00000012904	syf2	78	53.498	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	53.498	Propithecus_coquereli
ENSHCOG00000012904	syf2	81	67.339	ENSPVAG00000005841	SYF2	99	67.339	Pteropus_vampyrus
ENSHCOG00000012904	syf2	78	89.916	ENSPNYG00000004979	syf2	100	89.916	Pundamilia_nyererei
ENSHCOG00000012904	syf2	78	83.613	ENSPNAG00000015570	syf2	100	83.613	Pygocentrus_nattereri
ENSHCOG00000012904	syf2	77	78.423	ENSRNOG00000060597	Syf2	98	78.423	Rattus_norvegicus
ENSHCOG00000012904	syf2	79	75.104	ENSRBIG00000042970	SYF2	98	75.104	Rhinopithecus_bieti
ENSHCOG00000012904	syf2	79	77.178	ENSRROG00000001347	SYF2	98	77.178	Rhinopithecus_roxellana
ENSHCOG00000012904	syf2	70	83.721	ENSSBOG00000020184	SYF2	98	77.593	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSHCOG00000012904	syf2	78	75.904	ENSSHAG00000015630	-	96	77.273	Sarcophilus_harrisii
ENSHCOG00000012904	syf2	67	83.010	ENSSHAG00000007152	-	100	83.010	Sarcophilus_harrisii
ENSHCOG00000012904	syf2	78	83.613	ENSSFOG00015023647	syf2	100	83.613	Scleropages_formosus
ENSHCOG00000012904	syf2	78	86.555	ENSSMAG00000009867	syf2	100	86.555	Scophthalmus_maximus
ENSHCOG00000012904	syf2	78	89.496	ENSSDUG00000013072	syf2	100	89.496	Seriola_dumerili
ENSHCOG00000012904	syf2	78	89.496	ENSSLDG00000012677	syf2	100	89.496	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSHCOG00000012904	syf2	79	60.581	ENSSARG00000012889	SYF2	98	60.581	Sorex_araneus
ENSHCOG00000012904	syf2	78	77.083	ENSSPUG00000005251	SYF2	100	73.438	Sphenodon_punctatus
ENSHCOG00000012904	syf2	78	88.655	ENSSPAG00000009626	syf2	100	88.655	Stegastes_partitus
ENSHCOG00000012904	syf2	79	76.955	ENSSSCG00000037481	SYF2	98	76.955	Sus_scrofa
ENSHCOG00000012904	syf2	80	82.329	ENSTRUG00000001499	syf2	96	83.058	Takifugu_rubripes
ENSHCOG00000012904	syf2	73	89.640	ENSTNIG00000016912	syf2	99	89.640	Tetraodon_nigroviridis
ENSHCOG00000012904	syf2	78	58.025	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	58.025	Tupaia_belangeri
ENSHCOG00000012904	syf2	70	83.256	ENSTTRG00000003550	SYF2	98	77.178	Tursiops_truncatus
ENSHCOG00000012904	syf2	79	76.132	ENSUAMG00000002897	SYF2	98	76.132	Ursus_americanus
ENSHCOG00000012904	syf2	70	82.791	ENSUMAG00000013108	SYF2	98	75.720	Ursus_maritimus
ENSHCOG00000012904	syf2	79	77.178	ENSVPAG00000005705	SYF2	98	77.178	Vicugna_pacos
ENSHCOG00000012904	syf2	67	82.439	ENSVVUG00000027181	-	96	76.151	Vulpes_vulpes
ENSHCOG00000012904	syf2	70	82.791	ENSVVUG00000027175	-	98	76.132	Vulpes_vulpes
ENSHCOG00000012904	syf2	79	75.104	ENSXETG00000022797	syf2	100	72.908	Xenopus_tropicalis
ENSHCOG00000012904	syf2	78	87.395	ENSXMAG00000022698	syf2	100	87.395	Xiphophorus_maculatus