EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSHCOG00000016505 (Gene tree)
Gene ID: 109514227
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC109514227
Gene Type: protein_coding
Species: Hippocampus_comes
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 7989 bases
Position: chrKV879872.1:954205-962193
Accession: 109514227
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHCOP00000025962	MMR_HSR1	PF01926.23	3.5e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHCOT00000020672	-	1341	XM_019867136	ENSHCOP00000025962	446 (aa)	XP_019722695	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	56.726	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	56.726

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	88.940	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	99	88.940	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	57.859	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	57.859	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	55.830	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	56.278	Amphilophus_citrinellus
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	86.036	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	99	86.036	Amphilophus_citrinellus
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	57.623	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	57.623	Amphiprion_ocellaris
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	86.937	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	99	86.937	Amphiprion_ocellaris
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	86.486	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	99	86.486	Amphiprion_percula
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	57.848	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	57.848	Amphiprion_percula
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	57.848	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	57.848	Anabas_testudineus
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	85.586	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	99	85.586	Anabas_testudineus
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	84	62.400	ENSACAG00000028632	-	98	57.303	Anolis_carolinensis
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	56.696	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	56.696	Astatotilapia_calliptera
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	84.910	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	99	84.910	Astatotilapia_calliptera
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	58.333	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	58.333	Astyanax_mexicanus
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	76.351	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	99	76.351	Astyanax_mexicanus
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	81	59.780	ENSCING00000020807	-	96	59.780	Ciona_intestinalis
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	84	58.886	ENSCSAVG00000009987	-	100	53.084	Ciona_savignyi
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	84.009	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	81.132	Cynoglossus_semilaevis
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	56.948	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	57.175	Cynoglossus_semilaevis
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	58.124	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	58.810	Cyprinodon_variegatus
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	83.333	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	99	83.333	Cyprinodon_variegatus
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	95	80.460	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	99	80.460	Danio_rerio
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	57.623	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	98	75.648	Danio_rerio
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	82	54.496	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	98	54.496	Eptatretus_burgeri
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	77.027	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	77.027	Esox_lucius
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	84.234	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	99	84.234	Fundulus_heteroclitus
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	57.047	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	57.047	Fundulus_heteroclitus
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	89	55.164	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	98	55.164	Gadus_morhua
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	56.347	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	57.175	Gambusia_affinis
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	84.009	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	84.009	Gambusia_affinis
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	85	63.061	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	98	60.957	Gasterosteus_aculeatus
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	57	94.094	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	98	94.094	Gasterosteus_aculeatus
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	85.135	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	99	85.135	Haplochromis_burtoni
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	56.920	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	56.920	Haplochromis_burtoni
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	82	59.615	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	81	59.615	Ictalurus_punctatus
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	81	66.482	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	89	66.482	Ictalurus_punctatus
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	75.510	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	75.510	Ictalurus_punctatus
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	56.570	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	57.399	Kryptolebias_marmoratus
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	83.559	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	99	83.559	Kryptolebias_marmoratus
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	85.586	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	99	85.586	Labrus_bergylta
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	83	67.292	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	60.135	Latimeria_chalumnae
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	61.124	ENSLACG00000004899	-	99	61.124	Latimeria_chalumnae
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	65.914	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	65.914	Latimeria_chalumnae
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	72.160	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	72.160	Lepisosteus_oculatus
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	85.135	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	99	85.135	Mastacembelus_armatus
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	79	68.182	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	91	61.965	Mastacembelus_armatus
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	85.135	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	99	85.135	Maylandia_zebra
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	56.696	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	99	56.696	Maylandia_zebra
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	55.580	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	55.580	Mola_mola
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	95	83.333	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	99	83.333	Monopterus_albus
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	57.871	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	99	58.166	Monopterus_albus
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	81	66.205	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	90	61.209	Neolamprologus_brichardi
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	85.747	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	99	85.747	Neolamprologus_brichardi
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	85.586	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	99	85.586	Oreochromis_niloticus
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	81	65.840	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	99	56.696	Oreochromis_niloticus
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	58.296	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	58.296	Oryzias_latipes
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	79.730	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	99	79.730	Oryzias_latipes
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	58.296	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	99	58.296	Oryzias_latipes_hni
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	82.658	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	99	82.658	Oryzias_latipes_hni
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	83.333	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	99	83.333	Oryzias_latipes_hsok
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	58.559	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	99	58.559	Oryzias_latipes_hsok
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	58.824	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	99	58.824	Oryzias_melastigma
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	83.108	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	99	83.108	Oryzias_melastigma
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	55.955	ENSPKIG00000023918	-	98	55.955	Paramormyrops_kingsleyae
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	71.622	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	99	71.622	Paramormyrops_kingsleyae
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	71	71.835	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	99	57.494	Paramormyrops_kingsleyae
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	58.705	ENSPMGG00000016507	si:ch211-11k18.4	99	58.705	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	82.432	ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	99	82.432	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	83.445	ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	99	83.445	Poecilia_formosa
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	58.969	ENSPFOG00000007976	si:ch211-11k18.4	99	58.969	Poecilia_formosa
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	83.784	ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	99	83.784	Poecilia_latipinna
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	58.407	ENSPLAG00000019794	si:ch211-11k18.4	99	58.969	Poecilia_latipinna
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	58.969	ENSPMEG00000024198	si:ch211-11k18.4	99	58.969	Poecilia_mexicana
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	83.559	ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	93	83.559	Poecilia_mexicana
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	95	81.567	ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	99	81.567	Poecilia_reticulata
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	85	64.380	ENSPREG00000015319	si:ch211-11k18.4	87	64.380	Poecilia_reticulata
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	56.920	ENSPNYG00000017099	si:ch211-11k18.4	99	56.920	Pundamilia_nyererei
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	85.135	ENSPNYG00000017266	si:dkey-98f17.5	99	85.135	Pundamilia_nyererei
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	77.477	ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	99	77.477	Pygocentrus_nattereri
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	85	63.852	ENSPNAG00000022138	si:ch211-11k18.4	99	57.718	Pygocentrus_nattereri
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	57.048	ENSSFOG00015000985	si:ch211-11k18.4	94	57.048	Scleropages_formosus
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	70.270	ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	99	70.270	Scleropages_formosus
ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	85.135	ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	99	85.135	Scophthalmus_maximus
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