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Description

Ensembl ID: ENSHCOG00000016782 (Gene tree)
Gene ID: 109526123
Gene Symbol: pelo
Alias: wu:fa12c12|wu:fb97f07|zgc:56550
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Hippocampus_comes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4753 bases
Position: chrKV879664.1:401505-406257
Accession: 109526123
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHCOP00000013596	eRF1_2	PF03464.15	5.4e-33	1	1
ENSHCOP00000013596	eRF1_3	PF03465.15	1.7e-24	1	1
ENSHCOP00000013596	eRF1_1	PF03463.15	2.1e-52	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHCOT00000020996	-	2385	XM_019887232	ENSHCOP00000013596	385 (aa)	XP_019742791	UPI00094E2FA9

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
hcq03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.662	ENSG00000152684	PELO	100	77.662	Homo_sapiens
ENSHCOG00000016782	pelo	64	92.308	ENSAPOG00000023700	-	90	92.308	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHCOG00000016782	pelo	64	92.308	ENSAPOG00000000616	pelo	90	92.308	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	91.429	ENSAPOG00000023072	pelo	100	91.429	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.403	ENSAMEG00000007734	PELO	100	77.403	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHCOG00000016782	pelo	97	86.059	ENSACIG00000014386	pelo	97	91.150	Amphilophus_citrinellus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	91.688	ENSAOCG00000023717	pelo	100	91.688	Amphiprion_ocellaris
ENSHCOG00000016782	pelo	100	91.688	ENSAPEG00000011235	pelo	100	91.688	Amphiprion_percula
ENSHCOG00000016782	pelo	100	91.688	ENSATEG00000019550	pelo	100	91.688	Anabas_testudineus
ENSHCOG00000016782	pelo	77	68.792	ENSAPLG00000013265	PELO	100	68.792	Anas_platyrhynchos
ENSHCOG00000016782	pelo	97	78.667	ENSACAG00000004352	PELO	100	78.182	Anolis_carolinensis
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.143	ENSANAG00000014096	PELO	100	77.143	Aotus_nancymaae
ENSHCOG00000016782	pelo	100	90.909	ENSACLG00000010305	pelo	100	90.909	Astatotilapia_calliptera
ENSHCOG00000016782	pelo	97	89.812	ENSAMXG00000020299	pelo	99	88.831	Astyanax_mexicanus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.403	ENSBTAG00000003268	PELO	99	77.403	Bos_taurus
ENSHCOG00000016782	pelo	97	60.533	WBGene00011280	pelo-1	98	60.533	Caenorhabditis_elegans
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.403	ENSCJAG00000035190	PELO	100	77.403	Callithrix_jacchus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.662	ENSCAFG00020023234	PELO	100	77.662	Canis_lupus_dingo
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.662	ENSCHIG00000016410	PELO	99	77.662	Capra_hircus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	78.182	ENSTSYG00000005203	PELO	100	78.182	Carlito_syrichta
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.922	ENSCPOG00000027406	PELO	100	77.922	Cavia_porcellus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.403	ENSCCAG00000035600	PELO	100	77.403	Cebus_capucinus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.662	ENSCATG00000011829	PELO	100	77.662	Cercocebus_atys
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.922	ENSCLAG00000005043	PELO	100	77.922	Chinchilla_lanigera
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.662	ENSCSAG00000016692	PELO	100	77.662	Chlorocebus_sabaeus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.922	ENSCHOG00000000523	PELO	100	77.922	Choloepus_hoffmanni
ENSHCOG00000016782	pelo	97	77.600	ENSCPBG00000007544	PELO	100	77.143	Chrysemys_picta_bellii
ENSHCOG00000016782	pelo	96	64.865	ENSCING00000001979	-	100	64.323	Ciona_intestinalis
ENSHCOG00000016782	pelo	99	65.104	ENSCSAVG00000006158	-	100	65.104	Ciona_savignyi
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.662	ENSCANG00000023382	PELO	100	77.662	Colobus_angolensis_palliatus
ENSHCOG00000016782	pelo	97	78.552	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	78.182	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSHCOG00000016782	pelo	97	79.357	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	78.961	Cricetulus_griseus_crigri
ENSHCOG00000016782	pelo	100	89.351	ENSCSEG00000008807	pelo	100	89.351	Cynoglossus_semilaevis
ENSHCOG00000016782	pelo	100	89.091	ENSCVAG00000016082	pelo	100	89.091	Cyprinodon_variegatus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	87.532	ENSDARG00000055477	pelo	100	87.532	Danio_rerio
ENSHCOG00000016782	pelo	96	77.568	ENSDNOG00000036721	PELO	96	77.568	Dasypus_novemcinctus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	78.442	ENSDORG00000016689	Pelo	100	78.442	Dipodomys_ordii
ENSHCOG00000016782	pelo	96	66.757	FBgn0011207	pelo	96	65.699	Drosophila_melanogaster
ENSHCOG00000016782	pelo	71	78.947	ENSEBUG00000004955	pelo	100	78.947	Eptatretus_burgeri
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.403	ENSEASG00005013348	PELO	100	77.403	Equus_asinus_asinus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	88.831	ENSELUG00000023229	pelo	100	88.831	Esox_lucius
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.662	ENSFCAG00000032341	PELO	100	77.662	Felis_catus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	78.182	ENSFALG00000004559	PELO	100	78.182	Ficedula_albicollis
ENSHCOG00000016782	pelo	74	79.930	ENSFDAG00000002076	PELO	88	79.930	Fukomys_damarensis
ENSHCOG00000016782	pelo	100	89.610	ENSFHEG00000009769	pelo	100	89.646	Fundulus_heteroclitus
ENSHCOG00000016782	pelo	98	87.268	ENSGMOG00000005849	pelo	100	87.273	Gadus_morhua
ENSHCOG00000016782	pelo	100	88.312	ENSGAFG00000019350	pelo	100	88.312	Gambusia_affinis
ENSHCOG00000016782	pelo	100	90.130	ENSGACG00000007245	pelo	100	90.130	Gasterosteus_aculeatus
ENSHCOG00000016782	pelo	97	77.600	ENSGAGG00000004018	PELO	100	77.143	Gopherus_agassizii
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.662	ENSGGOG00000012635	PELO	100	77.662	Gorilla_gorilla
ENSHCOG00000016782	pelo	100	90.909	ENSHBUG00000005866	pelo	100	90.909	Haplochromis_burtoni
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.922	ENSHGLG00000005932	PELO	100	77.922	Heterocephalus_glaber_female
ENSHCOG00000016782	pelo	100	76.104	ENSHGLG00100017627	PELO	100	76.104	Heterocephalus_glaber_male
ENSHCOG00000016782	pelo	100	87.273	ENSIPUG00000020627	pelo	100	87.273	Ictalurus_punctatus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	78.442	ENSSTOG00000027378	PELO	100	78.442	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.143	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	77.143	Jaculus_jaculus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	89.870	ENSKMAG00000021305	pelo	100	89.870	Kryptolebias_marmoratus
ENSHCOG00000016782	pelo	99	91.667	ENSLBEG00000022399	pelo	100	91.667	Labrus_bergylta
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.662	ENSLAFG00000020551	PELO	100	77.662	Loxodonta_africana
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.662	ENSMFAG00000000651	PELO	100	77.662	Macaca_fascicularis
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.662	ENSMMUG00000039101	PELO	100	77.662	Macaca_mulatta
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.662	ENSMNEG00000035538	PELO	100	77.662	Macaca_nemestrina
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.662	ENSMLEG00000039113	PELO	100	77.662	Mandrillus_leucophaeus
ENSHCOG00000016782	pelo	97	93.298	ENSMAMG00000013260	pelo	100	92.727	Mastacembelus_armatus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	90.909	ENSMZEG00005014258	pelo	100	90.909	Maylandia_zebra
ENSHCOG00000016782	pelo	100	78.442	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	78.442	Mesocricetus_auratus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.922	ENSMICG00000044040	PELO	100	77.922	Microcebus_murinus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	78.442	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	78.442	Microtus_ochrogaster
ENSHCOG00000016782	pelo	100	90.649	ENSMMOG00000001324	pelo	100	90.649	Mola_mola
ENSHCOG00000016782	pelo	100	91.169	ENSMALG00000008194	pelo	100	91.169	Monopterus_albus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	78.701	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	78.701	Mus_caroli
ENSHCOG00000016782	pelo	100	78.182	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	78.182	Mus_musculus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	78.442	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	78.442	Mus_pahari
ENSHCOG00000016782	pelo	100	78.182	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	78.182	Mus_spretus
ENSHCOG00000016782	pelo	99	77.604	ENSMLUG00000024132	PELO	100	77.604	Myotis_lucifugus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	78.442	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	78.442	Nannospalax_galili
ENSHCOG00000016782	pelo	100	90.909	ENSNBRG00000011799	pelo	100	90.909	Neolamprologus_brichardi
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.662	ENSNLEG00000035970	PELO	100	77.662	Nomascus_leucogenys
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.403	ENSMEUG00000005468	PELO	100	77.403	Notamacropus_eugenii
ENSHCOG00000016782	pelo	98	77.045	ENSOPRG00000018793	PELO	100	77.045	Ochotona_princeps
ENSHCOG00000016782	pelo	100	78.182	ENSODEG00000017579	PELO	100	78.182	Octodon_degus
ENSHCOG00000016782	pelo	96	92.183	ENSONIG00000011511	pelo	100	91.169	Oreochromis_niloticus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.922	ENSOCUG00000023902	PELO	100	77.922	Oryctolagus_cuniculus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	89.351	ENSORLG00000005827	pelo	100	89.351	Oryzias_latipes
ENSHCOG00000016782	pelo	100	89.091	ENSORLG00020016456	pelo	100	89.091	Oryzias_latipes_hni
ENSHCOG00000016782	pelo	100	89.351	ENSORLG00015014447	pelo	100	89.444	Oryzias_latipes_hsok
ENSHCOG00000016782	pelo	100	89.610	ENSOMEG00000021567	pelo	100	89.610	Oryzias_melastigma
ENSHCOG00000016782	pelo	100	78.182	ENSOGAG00000027940	PELO	100	78.182	Otolemur_garnettii
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.403	ENSOARG00000008324	PELO	99	77.403	Ovis_aries
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.662	ENSPPAG00000038951	PELO	100	77.662	Pan_paniscus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.662	ENSPPRG00000018800	PELO	100	77.662	Panthera_pardus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.662	ENSPTIG00000019988	PELO	100	77.662	Panthera_tigris_altaica
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.403	ENSPTRG00000034409	PELO	100	77.403	Pan_troglodytes
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.662	ENSPANG00000010902	PELO	100	77.662	Papio_anubis
ENSHCOG00000016782	pelo	100	86.753	ENSPKIG00000015190	pelo	100	86.753	Paramormyrops_kingsleyae
ENSHCOG00000016782	pelo	97	77.867	ENSPSIG00000004971	PELO	100	77.403	Pelodiscus_sinensis
ENSHCOG00000016782	pelo	66	91.339	ENSPMGG00000014561	pelo	94	91.339	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	78.701	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	78.701	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSHCOG00000016782	pelo	100	78.442	ENSPCIG00000004880	PELO	100	78.442	Phascolarctos_cinereus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	89.351	ENSPFOG00000007277	pelo	100	89.351	Poecilia_formosa
ENSHCOG00000016782	pelo	100	89.351	ENSPLAG00000020787	pelo	100	89.351	Poecilia_latipinna
ENSHCOG00000016782	pelo	100	89.351	ENSPMEG00000016964	pelo	100	89.351	Poecilia_mexicana
ENSHCOG00000016782	pelo	100	89.351	ENSPREG00000023071	pelo	100	89.351	Poecilia_reticulata
ENSHCOG00000016782	pelo	97	77.748	ENSPPYG00000015451	PELO	96	77.662	Pongo_abelii
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.922	ENSPCOG00000021178	PELO	100	77.922	Propithecus_coquereli
ENSHCOG00000016782	pelo	100	90.909	ENSPNYG00000017325	pelo	100	90.909	Pundamilia_nyererei
ENSHCOG00000016782	pelo	97	90.349	ENSPNAG00000012458	pelo	99	89.351	Pygocentrus_nattereri
ENSHCOG00000016782	pelo	100	78.701	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	78.701	Rattus_norvegicus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.662	ENSRBIG00000007299	PELO	100	77.662	Rhinopithecus_bieti
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.662	ENSRROG00000035507	PELO	100	77.662	Rhinopithecus_roxellana
ENSHCOG00000016782	pelo	97	32.105	YNL001W	-	97	32.105	Saccharomyces_cerevisiae
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.662	ENSSBOG00000036140	PELO	100	77.662	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSHCOG00000016782	pelo	63	74.590	ENSSHAG00000010770	PELO	100	74.590	Sarcophilus_harrisii
ENSHCOG00000016782	pelo	98	88.064	ENSSFOG00015013399	pelo	100	88.052	Scleropages_formosus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	90.909	ENSSMAG00000017171	pelo	100	90.909	Scophthalmus_maximus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	91.429	ENSSDUG00000022938	pelo	100	91.429	Seriola_dumerili
ENSHCOG00000016782	pelo	100	87.792	ENSSLDG00000017884	pelo	100	87.792	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSHCOG00000016782	pelo	97	78.933	ENSSPUG00000005545	PELO	100	78.442	Sphenodon_punctatus
ENSHCOG00000016782	pelo	98	92.042	ENSSPAG00000008501	pelo	100	91.948	Stegastes_partitus
ENSHCOG00000016782	pelo	100	76.364	ENSSSCG00000016884	PELO	100	76.364	Sus_scrofa
ENSHCOG00000016782	pelo	100	78.182	ENSTGUG00000002416	PELO	100	78.182	Taeniopygia_guttata
ENSHCOG00000016782	pelo	100	89.870	ENSTRUG00000005809	pelo	100	89.870	Takifugu_rubripes
ENSHCOG00000016782	pelo	100	90.649	ENSTNIG00000018937	pelo	100	90.649	Tetraodon_nigroviridis
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ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.662	ENSVPAG00000001113	PELO	100	77.662	Vicugna_pacos
ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.662	ENSVVUG00000025499	PELO	100	77.662	Vulpes_vulpes
ENSHCOG00000016782	pelo	81	76.129	ENSXETG00000018368	pelo	100	74.540	Xenopus_tropicalis
ENSHCOG00000016782	pelo	100	89.870	ENSXMAG00000018474	pelo	100	89.870	Xiphophorus_maculatus