EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSHCOG00000016854 (Gene tree)
Gene ID: 109514237
Gene Symbol: ipo4
Alias: si:ch211-196f5.1
Full Name: importin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Hippocampus_comes
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9447 bases
Position: chrKV879872.1:774841-784287
Accession: 109514237
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHCOP00000026174	IBN_N	PF03810.19	4.9e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHCOT00000021063	-	4505	XM_019867161	ENSHCOP00000026174	1106 (aa)	XP_019722720	UPI00094EB749

Gene Model

Click here to download ENSHCOG00000016854's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSHCOG00000016854's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHCOG00000016854	ipo4	98	44.231	ENSG00000196497	IPO4	99	44.022	Homo_sapiens
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	75.656	ENSAPOG00000019018	ipo4	99	75.747	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	43.506	ENSAMEG00000016271	IPO4	85	43.155	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	75.703	ENSACIG00000004246	ipo4	99	75.521	Amphilophus_citrinellus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	78.643	ENSAOCG00000004773	ipo4	99	78.733	Amphiprion_ocellaris
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	78.552	ENSAPEG00000002112	ipo4	99	78.643	Amphiprion_percula
ENSHCOG00000016854	ipo4	92	80.294	ENSATEG00000017082	ipo4	99	80.294	Anabas_testudineus
ENSHCOG00000016854	ipo4	84	44.526	ENSACAG00000003973	-	97	44.503	Anolis_carolinensis
ENSHCOG00000016854	ipo4	95	44.182	ENSANAG00000037973	IPO4	99	43.608	Aotus_nancymaae
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	74.661	ENSACLG00000019742	ipo4	99	74.661	Astatotilapia_calliptera
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	66.636	ENSAMXG00000037878	ipo4	99	66.546	Astyanax_mexicanus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	43.285	ENSBTAG00000002707	IPO4	99	43.207	Bos_taurus
ENSHCOG00000016854	ipo4	96	44.319	ENSCJAG00000006937	IPO4	99	44.062	Callithrix_jacchus
ENSHCOG00000016854	ipo4	98	44.679	ENSCAFG00000012049	IPO4	99	44.909	Canis_familiaris
ENSHCOG00000016854	ipo4	98	44.190	ENSCAFG00020002873	IPO4	99	43.824	Canis_lupus_dingo
ENSHCOG00000016854	ipo4	98	43.315	ENSCHIG00000009413	IPO4	96	43.466	Capra_hircus
ENSHCOG00000016854	ipo4	98	43.773	ENSTSYG00000002643	IPO4	99	43.478	Carlito_syrichta
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	43.909	ENSCPOG00000014783	IPO4	99	43.829	Cavia_porcellus
ENSHCOG00000016854	ipo4	95	44.560	ENSCCAG00000037929	IPO4	99	43.971	Cebus_capucinus
ENSHCOG00000016854	ipo4	98	44.505	ENSCATG00000040395	IPO4	99	44.293	Cercocebus_atys
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	44.364	ENSCLAG00000012817	IPO4	99	44.283	Chinchilla_lanigera
ENSHCOG00000016854	ipo4	90	43.956	ENSCPBG00000025757	IPO4	94	44.167	Chrysemys_picta_bellii
ENSHCOG00000016854	ipo4	92	36.189	ENSCING00000008639	-	99	35.783	Ciona_intestinalis
ENSHCOG00000016854	ipo4	91	36.054	ENSCSAVG00000011482	-	97	36.152	Ciona_savignyi
ENSHCOG00000016854	ipo4	98	43.956	ENSCANG00000029513	IPO4	99	43.841	Colobus_angolensis_palliatus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	42.883	ENSCGRG00001001217	Ipo4	99	42.715	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	42.883	ENSCGRG00000014404	Ipo4	99	42.715	Cricetulus_griseus_crigri
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	73.846	ENSCSEG00000009606	ipo4	99	73.756	Cynoglossus_semilaevis
ENSHCOG00000016854	ipo4	98	71.168	ENSCVAG00000002281	ipo4	99	71.145	Cyprinodon_variegatus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	70.690	ENSDARG00000041493	ipo4	99	70.588	Danio_rerio
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	44.091	ENSDNOG00000000366	IPO4	99	44.011	Dasypus_novemcinctus
ENSHCOG00000016854	ipo4	98	43.853	ENSDORG00000009274	Ipo4	99	43.739	Dipodomys_ordii
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	43.025	ENSETEG00000018381	IPO4	99	42.948	Echinops_telfairi
ENSHCOG00000016854	ipo4	90	44.910	ENSEASG00005011954	IPO4	96	44.920	Equus_asinus_asinus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	43.727	ENSECAG00000009909	IPO4	99	43.739	Equus_caballus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	71.000	ENSELUG00000020628	ipo4	99	69.910	Esox_lucius
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	44.273	ENSFCAG00000005587	IPO4	99	44.636	Felis_catus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	40.435	ENSFDAG00000000725	IPO4	99	40.362	Fukomys_damarensis
ENSHCOG00000016854	ipo4	88	76.933	ENSFHEG00000009351	ipo4	98	74.967	Fundulus_heteroclitus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	71.429	ENSGMOG00000001801	ipo4	99	70.927	Gadus_morhua
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	75.634	ENSGAFG00000005601	ipo4	99	75.181	Gambusia_affinis
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	75.815	ENSGACG00000002276	ipo4	99	75.725	Gasterosteus_aculeatus
ENSHCOG00000016854	ipo4	98	44.231	ENSGGOG00000016062	IPO4	99	44.022	Gorilla_gorilla
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	75.385	ENSHBUG00000023269	ipo4	99	75.385	Haplochromis_burtoni
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	43.636	ENSHGLG00000002923	IPO4	99	43.648	Heterocephalus_glaber_female
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	43.545	ENSHGLG00100003725	IPO4	99	43.557	Heterocephalus_glaber_male
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	67.271	ENSIPUG00000001185	ipo4	99	67.362	Ictalurus_punctatus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	44.596	ENSSTOG00000002288	IPO4	99	44.515	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSHCOG00000016854	ipo4	98	44.099	ENSJJAG00000019002	Ipo4	99	43.801	Jaculus_jaculus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	75.656	ENSKMAG00000004627	ipo4	99	75.837	Kryptolebias_marmoratus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	77.516	ENSLBEG00000024952	ipo4	99	77.516	Labrus_bergylta
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	48.675	ENSLACG00000001428	IPO4	99	48.889	Latimeria_chalumnae
ENSHCOG00000016854	ipo4	79	68.286	ENSLOCG00000001149	ipo4	78	68.031	Lepisosteus_oculatus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	44.051	ENSLAFG00000015852	IPO4	99	43.790	Loxodonta_africana
ENSHCOG00000016854	ipo4	98	44.505	ENSMFAG00000000743	IPO4	99	44.293	Macaca_fascicularis
ENSHCOG00000016854	ipo4	98	44.505	ENSMMUG00000012481	IPO4	99	44.293	Macaca_mulatta
ENSHCOG00000016854	ipo4	98	44.597	ENSMNEG00000043531	IPO4	99	44.384	Macaca_nemestrina
ENSHCOG00000016854	ipo4	98	44.505	ENSMLEG00000042067	IPO4	99	44.293	Mandrillus_leucophaeus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	76.833	ENSMAMG00000021976	ipo4	99	76.833	Mastacembelus_armatus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	75.475	ENSMZEG00005017273	ipo4	99	75.475	Maylandia_zebra
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	44.011	ENSMAUG00000017565	Ipo4	99	43.439	Mesocricetus_auratus
ENSHCOG00000016854	ipo4	98	44.455	ENSMICG00000001719	IPO4	99	44.334	Microcebus_murinus
ENSHCOG00000016854	ipo4	98	43.407	ENSMOCG00000020462	Ipo4	99	43.155	Microtus_ochrogaster
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	74.640	ENSMMOG00000005264	ipo4	99	75.180	Mola_mola
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	42.029	ENSMODG00000003337	IPO4	97	42.096	Monodelphis_domestica
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	75.790	ENSMALG00000001587	ipo4	99	75.881	Monopterus_albus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	42.391	MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	98	43.961	Mus_caroli
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	42.105	ENSMUSG00000002319	Ipo4	98	43.599	Mus_musculus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	42.325	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	98	43.531	Mus_pahari
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	42.377	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	98	43.720	Mus_spretus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	44.545	ENSMPUG00000005916	IPO4	99	44.555	Mustela_putorius_furo
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	43.273	ENSMLUG00000025277	IPO4	86	43.285	Myotis_lucifugus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	43.233	ENSNGAG00000019340	Ipo4	99	43.155	Nannospalax_galili
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	78.281	ENSNBRG00000005870	ipo4	99	78.281	Neolamprologus_brichardi
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	44.152	ENSOPRG00000016615	IPO4	99	44.424	Ochotona_princeps
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	44.273	ENSODEG00000002609	IPO4	99	44.283	Octodon_degus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	78.824	ENSONIG00000014574	ipo4	99	78.824	Oreochromis_niloticus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	43.880	ENSOCUG00000002881	IPO4	99	43.710	Oryctolagus_cuniculus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	75.373	ENSORLG00000006457	ipo4	99	75.635	Oryzias_latipes
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	75.373	ENSORLG00020004286	ipo4	99	74.593	Oryzias_latipes_hni
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	75.373	ENSORLG00015021856	ipo4	99	75.045	Oryzias_latipes_hsok
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	72.968	ENSOMEG00000016203	ipo4	99	72.966	Oryzias_melastigma
ENSHCOG00000016854	ipo4	98	43.223	ENSOGAG00000010642	IPO4	99	43.297	Otolemur_garnettii
ENSHCOG00000016854	ipo4	98	42.831	ENSOARG00000019188	IPO4	99	42.752	Ovis_aries
ENSHCOG00000016854	ipo4	98	44.139	ENSPPAG00000035476	IPO4	99	43.829	Pan_paniscus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	44.455	ENSPPRG00000023607	IPO4	99	44.818	Panthera_pardus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	44.364	ENSPTIG00000008720	IPO4	99	44.727	Panthera_tigris_altaica
ENSHCOG00000016854	ipo4	98	44.322	ENSPTRG00000006200	IPO4	99	44.022	Pan_troglodytes
ENSHCOG00000016854	ipo4	98	44.597	ENSPANG00000026278	IPO4	99	44.384	Papio_anubis
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	63.249	ENSPKIG00000007683	-	99	62.060	Paramormyrops_kingsleyae
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	63.571	ENSPKIG00000007830	ipo4	99	63.390	Paramormyrops_kingsleyae
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	69.419	ENSPMGG00000020871	ipo4	99	69.691	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	42.598	ENSPEMG00000016160	Ipo4	99	42.405	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSHCOG00000016854	ipo4	93	44.112	ENSPCIG00000010718	IPO4	96	44.273	Phascolarctos_cinereus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	75.634	ENSPFOG00000009255	ipo4	99	75.272	Poecilia_formosa
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	75.725	ENSPLAG00000020556	ipo4	99	75.362	Poecilia_latipinna
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	75.634	ENSPMEG00000013102	ipo4	99	75.272	Poecilia_mexicana
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	75.181	ENSPREG00000017605	ipo4	99	74.728	Poecilia_reticulata
ENSHCOG00000016854	ipo4	98	44.180	ENSPPYG00000005688	IPO4	99	44.062	Pongo_abelii
ENSHCOG00000016854	ipo4	98	45.005	ENSPCAG00000015669	IPO4	99	45.240	Procavia_capensis
ENSHCOG00000016854	ipo4	98	43.905	ENSPCOG00000015319	IPO4	99	43.790	Propithecus_coquereli
ENSHCOG00000016854	ipo4	98	43.171	ENSPVAG00000010755	IPO4	99	43.155	Pteropus_vampyrus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	76.742	ENSPNYG00000021414	ipo4	99	76.742	Pundamilia_nyererei
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	69.419	ENSPNAG00000027964	ipo4	99	69.356	Pygocentrus_nattereri
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	42.779	ENSRNOG00000019553	Ipo4	99	42.935	Rattus_norvegicus
ENSHCOG00000016854	ipo4	98	43.956	ENSRBIG00000027704	IPO4	99	43.750	Rhinopithecus_bieti
ENSHCOG00000016854	ipo4	98	43.956	ENSRROG00000011492	IPO4	99	43.750	Rhinopithecus_roxellana
ENSHCOG00000016854	ipo4	98	43.171	ENSSBOG00000020162	IPO4	99	42.883	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	43.336	ENSSHAG00000002619	IPO4	96	43.671	Sarcophilus_harrisii
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	63.702	ENSSFOG00015012267	ipo4	99	63.751	Scleropages_formosus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	61.762	ENSSFOG00015014437	IPO4	99	61.413	Scleropages_formosus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	79.457	ENSSMAG00000019912	ipo4	99	79.747	Scophthalmus_maximus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	76.087	ENSSDUG00000017513	ipo4	99	76.449	Seriola_dumerili
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	78.876	ENSSLDG00000003869	ipo4	99	79.238	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSHCOG00000016854	ipo4	74	43.341	ENSSARG00000010701	IPO4	81	43.373	Sorex_araneus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	78.714	ENSSPAG00000008486	ipo4	99	78.804	Stegastes_partitus
ENSHCOG00000016854	ipo4	98	43.028	ENSSSCG00000002000	IPO4	99	42.909	Sus_scrofa
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	73.098	ENSTRUG00000012832	ipo4	99	72.826	Takifugu_rubripes
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	71.000	ENSTNIG00000005191	ipo4	99	70.909	Tetraodon_nigroviridis
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	42.248	ENSTBEG00000009781	IPO4	99	38.600	Tupaia_belangeri
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	43.455	ENSTTRG00000008626	IPO4	99	43.103	Tursiops_truncatus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	42.650	ENSUAMG00000024037	IPO4	99	42.831	Ursus_americanus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	44.414	ENSXETG00000014621	ipo4	99	44.565	Xenopus_tropicalis
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	73.889	ENSXCOG00000005208	ipo4	99	72.760	Xiphophorus_couchianus
ENSHCOG00000016854	ipo4	99	75.725	ENSXMAG00000006041	ipo4	99	75.272	Xiphophorus_maculatus