EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSHCOG00000017689 (Gene tree)
Gene ID: 109519335
Gene Symbol: eftud2
Alias: wu:fi20f05|zgc:66214
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Hippocampus_comes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10508 bases
Position: chrKV880069.1:92501-103008
Accession: 109519335
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHCOP00000026605	GTP_EFTU	PF00009.27	5.9e-44	1	1
ENSHCOP00000026605	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	2.5e-12	1	1
ENSHCOP00000026605	EFG_IV	PF03764.18	9.4e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHCOT00000027655	-	3126	XM_019875781	ENSHCOP00000026605	972 (aa)	XP_019731340	UPI00094DFE54

Gene Model

Click here to download ENSHCOG00000017689's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
hcq03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSHCOG00000017689's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSHCOG00000017689	eftud2	85	38.480	ENSHCOG00000001471	-	99	38.239
ENSHCOG00000017689	eftud2	58	31.646	ENSHCOG00000008208	gfm2	66	32.704
ENSHCOG00000017689	eftud2	85	38.273	ENSHCOG00000001360	eef2b	98	38.266

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	97.325	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	97.325	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.152	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	91.152	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.770	ENSACIG00000009096	eftud2	100	92.798	Amphilophus_citrinellus
ENSHCOG00000017689	eftud2	87	91.294	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	91.294	Amphiprion_ocellaris
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	97.325	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	97.325	Amphiprion_percula
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	97.428	ENSATEG00000000457	eftud2	100	97.428	Anabas_testudineus
ENSHCOG00000017689	eftud2	99	87.848	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	87.848	Anas_platyrhynchos
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.638	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	90.638	Anolis_carolinensis
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	91.049	Aotus_nancymaae
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	97.119	ENSACLG00000001296	eftud2	100	97.119	Astatotilapia_calliptera
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	93.449	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	93.449	Astyanax_mexicanus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	91.049	Bos_taurus
ENSHCOG00000017689	eftud2	99	70.588	WBGene00001166	eftu-2	99	70.248	Caenorhabditis_elegans
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	91.049	Callithrix_jacchus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.152	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	91.152	Canis_familiaris
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.152	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.152	Canis_lupus_dingo
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	91.049	Capra_hircus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	91.049	Carlito_syrichta
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.947	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	90.947	Cavia_aperea
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.947	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	90.947	Cavia_porcellus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	91.049	Cebus_capucinus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	91.049	Cercocebus_atys
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.844	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	90.844	Chinchilla_lanigera
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	91.049	Chlorocebus_sabaeus
ENSHCOG00000017689	eftud2	91	80.631	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	80.631	Choloepus_hoffmanni
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	91.049	Chrysemys_picta_bellii
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	78.667	ENSCING00000009372	-	100	78.462	Ciona_intestinalis
ENSHCOG00000017689	eftud2	99	78.039	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.717	Ciona_savignyi
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	91.049	Colobus_angolensis_palliatus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.741	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	90.741	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.741	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	90.741	Cricetulus_griseus_crigri
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	96.708	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	96.708	Cynoglossus_semilaevis
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	96.811	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	96.811	Cyprinodon_variegatus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	93.936	ENSDARG00000012261	eftud2	100	94.650	Danio_rerio
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.741	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	90.741	Dasypus_novemcinctus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.049	Dipodomys_ordii
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	75.333	FBgn0039566	CG4849	100	74.974	Drosophila_melanogaster
ENSHCOG00000017689	eftud2	92	97.826	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	Echinops_telfairi
ENSHCOG00000017689	eftud2	74	93.532	ENSEBUG00000004047	-	96	87.622	Eptatretus_burgeri
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.152	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	91.152	Equus_asinus_asinus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	91.049	Equus_caballus
ENSHCOG00000017689	eftud2	83	99.153	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	Erinaceus_europaeus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	94.342	ENSELUG00000017169	eftud2	100	94.959	Esox_lucius
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.255	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.255	Felis_catus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.853	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	90.947	Ficedula_albicollis
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.161	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	91.049	Fukomys_damarensis
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	96.811	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	96.811	Fundulus_heteroclitus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	94.856	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	94.959	Gadus_morhua
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.152	Gallus_gallus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	96.605	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	96.605	Gambusia_affinis
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	95.062	ENSGACG00000009163	eftud2	100	95.782	Gasterosteus_aculeatus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	91.049	Gorilla_gorilla
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	97.016	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	97.016	Haplochromis_burtoni
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.059	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	90.844	Heterocephalus_glaber_female
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.059	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	90.844	Heterocephalus_glaber_male
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	93.724	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	93.724	Ictalurus_punctatus
ENSHCOG00000017689	eftud2	91	92.568	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	90.383	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSHCOG00000017689	eftud2	95	93.261	ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.261	Jaculus_jaculus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	96.914	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	96.914	Kryptolebias_marmoratus
ENSHCOG00000017689	eftud2	95	96.872	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	96.353	Labrus_bergylta
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	92.387	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.387	Latimeria_chalumnae
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	94.239	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	95.062	Lepisosteus_oculatus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.844	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	90.844	Loxodonta_africana
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	91.049	Macaca_fascicularis
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	91.049	Macaca_nemestrina
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	91.049	Mandrillus_leucophaeus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	97.325	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	97.325	Mastacembelus_armatus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	97.119	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	97.119	Maylandia_zebra
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.760	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	90.760	Meleagris_gallopavo
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.844	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	90.844	Mesocricetus_auratus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	91.049	Microcebus_murinus
ENSHCOG00000017689	eftud2	92	74.382	ENSMOCG00000017653	-	90	74.382	Microtus_ochrogaster
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.844	ENSMOCG00000009039	-	100	90.844	Microtus_ochrogaster
ENSHCOG00000017689	eftud2	87	98.000	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	98.000	Mola_mola
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	91.049	Monodelphis_domestica
ENSHCOG00000017689	eftud2	87	96.000	ENSMALG00000014501	eftud2	100	96.000	Monopterus_albus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.535	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	90.535	Mus_caroli
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	90.844	Mus_musculus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.535	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	90.535	Mus_pahari
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.535	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	90.535	Mus_spretus
ENSHCOG00000017689	eftud2	97	90.678	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	90.678	Mustela_putorius_furo
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.152	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	91.152	Myotis_lucifugus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.947	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	90.947	Nannospalax_galili
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	97.016	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	97.016	Neolamprologus_brichardi
ENSHCOG00000017689	eftud2	97	88.948	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	88.948	Nomascus_leucogenys
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	87.346	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	87.346	Notamacropus_eugenii
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	83.333	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	83.333	Ochotona_princeps
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.741	ENSODEG00000018041	-	100	90.741	Octodon_degus
ENSHCOG00000017689	eftud2	93	75.466	ENSODEG00000003385	-	100	75.575	Octodon_degus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	97.119	ENSONIG00000000912	eftud2	100	97.119	Oreochromis_niloticus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	91.049	Oryctolagus_cuniculus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	94.753	ENSORLG00000003109	eftud2	100	95.473	Oryzias_latipes
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	94.650	ENSORLG00020009865	eftud2	100	95.576	Oryzias_latipes_hni
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	94.753	ENSORLG00015002611	eftud2	100	97.059	Oryzias_latipes_hsok
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	89.506	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	89.506	Otolemur_garnettii
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	91.049	Ovis_aries
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	91.049	Pan_paniscus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.152	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	91.152	Panthera_pardus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.152	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	91.152	Panthera_tigris_altaica
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	91.049	Pan_troglodytes
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	91.049	Papio_anubis
ENSHCOG00000017689	eftud2	93	89.195	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	89.195	Pelodiscus_sinensis
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	89.095	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	89.095	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.741	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	90.741	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	91.049	Phascolarctos_cinereus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	96.811	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	96.811	Poecilia_formosa
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	96.811	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	96.811	Poecilia_latipinna
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	96.811	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	96.811	Poecilia_mexicana
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	89.815	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	89.815	Pongo_abelii
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	87.243	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	87.243	Procavia_capensis
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	91.049	Propithecus_coquereli
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	86.831	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	86.831	Pteropus_vampyrus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	97.016	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	97.016	Pundamilia_nyererei
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	94.033	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.033	Pygocentrus_nattereri
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.152	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	90.947	Rattus_norvegicus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.947	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	90.947	Rhinopithecus_bieti
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.947	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	90.947	Rhinopithecus_roxellana
ENSHCOG00000017689	eftud2	97	34.418	YKL173W	SNU114	91	35.201	Saccharomyces_cerevisiae
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	91.049	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSHCOG00000017689	eftud2	95	93.261	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.261	Sarcophilus_harrisii
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	94.239	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	94.856	Scleropages_formosus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	97.119	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	97.119	Scophthalmus_maximus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	97.531	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	97.531	Seriola_dumerili
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	97.634	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	97.634	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	82.922	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	82.922	Sorex_araneus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.638	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	90.638	Sphenodon_punctatus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	97.428	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	97.428	Stegastes_partitus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.152	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.152	Sus_scrofa
ENSHCOG00000017689	eftud2	83	92.040	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.040	Taeniopygia_guttata
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	97.016	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	97.016	Takifugu_rubripes
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.676	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	91.701	Tetraodon_nigroviridis
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	85.700	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	85.700	Tupaia_belangeri
ENSHCOG00000017689	eftud2	91	89.330	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	89.330	Tursiops_truncatus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.021	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.021	Ursus_americanus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.152	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	91.152	Ursus_maritimus
ENSHCOG00000017689	eftud2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.152	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	91.152	Vulpes_vulpes
ENSHCOG00000017689	eftud2	96	91.765	ENSXETG00000003394	eftud2	98	92.601	Xenopus_tropicalis
ENSHCOG00000017689	eftud2	81	97.066	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	97.066	Xiphophorus_couchianus
ENSHCOG00000017689	eftud2	100	96.605	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	96.605	Xiphophorus_maculatus