EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSHCOG00000020781 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: prpf38a
Alias: fa04h11|fc83e08|wu:fa04h11|wu:fc83e08|zgc:92059
Full Name: pre-mRNA processing factor 38A
Gene Type: protein_coding
Species: Hippocampus_comes
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 12178 bases
Position: chrKV880314.1:552593-564770
Accession: ZDB-GENE-040801-225
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHCOP00000028264	PRP38	PF03371.15	1.7e-62	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHCOT00000025220	-	954	-	ENSHCOP00000028264	317 (aa)	-	-

Gene Model

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.957	ENSG00000134748	PRPF38A	87	69.373	Homo_sapiens
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	94.149	ENSAPOG00000011652	prpf38a	59	93.956	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.957	ENSAMEG00000009319	PRPF38A	87	69.373	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	93.617	ENSACIG00000012292	prpf38a	59	93.407	Amphilophus_citrinellus
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	94.149	ENSAOCG00000018004	prpf38a	59	93.956	Amphiprion_ocellaris
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	94.149	ENSAPEG00000021414	prpf38a	59	93.956	Amphiprion_percula
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	94.652	ENSATEG00000004608	prpf38a	59	94.505	Anabas_testudineus
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.426	ENSACAG00000008249	PRPF38A	87	68.635	Anolis_carolinensis
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	55.208	ENSANAG00000029204	-	55	51.546	Aotus_nancymaae
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.957	ENSANAG00000027839	PRPF38A	87	69.373	Aotus_nancymaae
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	94.149	ENSACLG00000021595	prpf38a	61	93.956	Astatotilapia_calliptera
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	92.553	ENSAMXG00000029274	prpf38a	58	92.308	Astyanax_mexicanus
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.957	ENSBTAG00000002720	PRPF38A	87	69.373	Bos_taurus
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	64.362	WBGene00008380	prp-38	55	66.102	Caenorhabditis_elegans
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.957	ENSCJAG00000021594	PRPF38A	87	69.373	Callithrix_jacchus
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.957	ENSCAFG00000003740	PRPF38A	87	69.373	Canis_familiaris
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.957	ENSCAFG00020010939	PRPF38A	87	69.373	Canis_lupus_dingo
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.957	ENSCHIG00000024730	PRPF38A	87	69.373	Capra_hircus
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.957	ENSTSYG00000009868	-	87	69.373	Carlito_syrichta
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.957	ENSCPOG00000005079	PRPF38A	87	69.373	Cavia_porcellus
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.957	ENSCCAG00000026502	PRPF38A	87	69.373	Cebus_capucinus
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.957	ENSCATG00000032296	PRPF38A	87	69.373	Cercocebus_atys
ENSHCOG00000020781	prpf38a	60	56.085	ENSCATG00000044190	-	55	54.945	Cercocebus_atys
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.957	ENSCLAG00000005816	PRPF38A	87	69.373	Chinchilla_lanigera
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.957	ENSCPBG00000014791	PRPF38A	87	69.373	Chrysemys_picta_bellii
ENSHCOG00000020781	prpf38a	64	72.059	ENSCSAVG00000009580	-	90	57.762	Ciona_savignyi
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.957	ENSCANG00000032608	PRPF38A	91	69.373	Colobus_angolensis_palliatus
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.957	ENSCGRG00001018502	-	87	69.373	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	75.532	ENSCGRG00001002557	-	60	75.275	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.957	ENSCGRG00000014868	Prpf38a	87	69.373	Cricetulus_griseus_crigri
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	92.021	ENSCSEG00000001269	prpf38a	70	86.538	Cynoglossus_semilaevis
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	94.681	ENSCVAG00000012305	prpf38a	59	94.505	Cyprinodon_variegatus
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	92.553	ENSDARG00000039213	prpf38a	87	69.675	Danio_rerio
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.957	ENSDNOG00000042326	PRPF38A	88	69.373	Dasypus_novemcinctus
ENSHCOG00000020781	prpf38a	83	69.202	ENSDORG00000025371	-	65	86.264	Dipodomys_ordii
ENSHCOG00000020781	prpf38a	83	69.202	ENSDORG00000023691	-	65	86.264	Dipodomys_ordii
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	70.745	ENSDORG00000023857	-	85	55.882	Dipodomys_ordii
ENSHCOG00000020781	prpf38a	63	70.149	FBgn0050342	Prp38	55	72.527	Drosophila_melanogaster
ENSHCOG00000020781	prpf38a	60	84.127	ENSEBUG00000012588	prpf38a	58	84.066	Eptatretus_burgeri
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.957	ENSEASG00005014427	PRPF38A	87	69.373	Equus_asinus_asinus
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.957	ENSECAG00000022628	PRPF38A	87	69.373	Equus_caballus
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	92.021	ENSELUG00000021094	prpf38a	66	87.895	Esox_lucius
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.957	ENSFCAG00000002518	PRPF38A	87	69.373	Felis_catus
ENSHCOG00000020781	prpf38a	71	76.754	ENSFALG00000003612	-	61	87.363	Ficedula_albicollis
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.957	ENSFDAG00000011287	PRPF38A	87	69.373	Fukomys_damarensis
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	95.213	ENSFHEG00000014317	prpf38a	88	74.632	Fundulus_heteroclitus
ENSHCOG00000020781	prpf38a	52	93.373	ENSGMOG00000011384	prpf38a	54	93.373	Gadus_morhua
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	91.489	ENSGALG00000010627	PRPF38A	87	69.742	Gallus_gallus
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	94.149	ENSGAFG00000012422	prpf38a	59	93.956	Gambusia_affinis
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	93.617	ENSGACG00000005423	prpf38a	58	93.407	Gasterosteus_aculeatus
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.957	ENSGAGG00000020547	PRPF38A	87	69.373	Gopherus_agassizii
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.957	ENSGGOG00000003940	PRPF38A	87	69.373	Gorilla_gorilla
ENSHCOG00000020781	prpf38a	60	94.180	ENSHBUG00000020572	prpf38a	77	93.956	Haplochromis_burtoni
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ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.957	ENSHGLG00000000475	PRPF38A	87	69.373	Heterocephalus_glaber_female
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ENSHCOG00000020781	prpf38a	60	92.593	ENSIPUG00000005757	prpf38a	62	92.308	Ictalurus_punctatus
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ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	89.894	ENSJJAG00000015811	Prpf38a	87	68.635	Jaculus_jaculus
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ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.426	ENSLACG00000011495	PRPF38A	87	69.373	Latimeria_chalumnae
ENSHCOG00000020781	prpf38a	60	92.063	ENSLOCG00000006262	prpf38a	84	72.862	Lepisosteus_oculatus
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.957	ENSLAFG00000025862	PRPF38A	87	69.373	Loxodonta_africana
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ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.957	ENSMNEG00000031221	PRPF38A	87	69.373	Macaca_nemestrina
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ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	94.149	ENSMZEG00005017838	prpf38a	59	93.956	Maylandia_zebra
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	91.489	ENSMGAG00000011176	PRPF38A	91	69.742	Meleagris_gallopavo
ENSHCOG00000020781	prpf38a	58	86.957	ENSMAUG00000018029	-	99	67.293	Mesocricetus_auratus
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ENSHCOG00000020781	prpf38a	70	83.111	ENSMMOG00000016972	prpf38a	64	93.956	Mola_mola
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ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.957	ENSMPUG00000006896	PRPF38A	87	69.373	Mustela_putorius_furo
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.957	ENSNGAG00000011884	Prpf38a	87	69.373	Nannospalax_galili
ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	92.553	ENSNBRG00000004013	prpf38a	58	92.308	Neolamprologus_brichardi
ENSHCOG00000020781	prpf38a	60	58.421	ENSNLEG00000012592	-	52	57.692	Nomascus_leucogenys
ENSHCOG00000020781	prpf38a	52	90.303	ENSNLEG00000017999	PRPF38A	79	66.935	Nomascus_leucogenys
ENSHCOG00000020781	prpf38a	60	90.526	ENSMEUG00000003860	PRPF38A	58	91.209	Notamacropus_eugenii
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ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	91.579	ENSXCOG00000007393	prpf38a	61	91.304	Xiphophorus_couchianus
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