EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSHGLG00000010976 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: TWISTNB
Alias: -
Full Name: TWIST neighbor
Gene Type: protein_coding
Species: Heterocephalus_glaber_female
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 12144 bases
Position: chrJH602052.1:10904932-10917075
Accession: 101704623
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHGLP00000015358	SHS2_Rpb7-N	PF03876.17	2.3e-10	1	1
ENSHGLP00000015359	SHS2_Rpb7-N	PF03876.17	2.6e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHGLT00000015518	TWISTNB-202	1187	XM_004839579	ENSHGLP00000015359	358 (aa)	XP_004839636	UPI00034F75A8
ENSHGLT00000015517	TWISTNB-201	5350	-	ENSHGLP00000015358	337 (aa)	XP_021109802	G5BZJ2

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	99	82.738	ENSG00000105849	TWISTNB	99	82.249	Homo_sapiens
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	58	54.639	ENSAPOG00000011796	twistnb	51	54.639	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	71.429	ENSAMEG00000008558	TWISTNB	98	71.540	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	93	42.773	ENSACIG00000020400	twistnb	88	44.713	Amphilophus_citrinellus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	60	53.960	ENSAOCG00000024200	twistnb	52	53.960	Amphiprion_ocellaris
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	60	53.960	ENSAPEG00000016750	twistnb	52	53.960	Amphiprion_percula
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	54	59.341	ENSATEG00000017956	twistnb	90	46.532	Anabas_testudineus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	54	63.587	ENSACAG00000011817	TWISTNB	93	63.587	Anolis_carolinensis
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	98	81.024	ENSANAG00000026418	TWISTNB	99	81.250	Aotus_nancymaae
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	55	57.297	ENSACLG00000022280	twistnb	83	47.198	Astatotilapia_calliptera
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	58	57.143	ENSAMXG00000035868	twistnb	57	57.143	Astyanax_mexicanus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	79.228	ENSBTAG00000006721	TWISTNB	99	78.209	Bos_taurus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	98	81.381	ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	81.602	Callithrix_jacchus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	74.640	ENSCAFG00000002511	TWISTNB	99	76.812	Canis_familiaris
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	76.385	ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	78.299	Canis_lupus_dingo
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	78.466	ENSCHIG00000024078	TWISTNB	99	78.635	Capra_hircus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	99	82.544	ENSTSYG00000001471	TWISTNB	99	82.059	Carlito_syrichta
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	89.645	ENSCPOG00000031651	TWISTNB	100	89.349	Cavia_porcellus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	99	81.548	ENSCCAG00000026416	TWISTNB	99	81.065	Cebus_capucinus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	82.196	ENSCATG00000035621	TWISTNB	99	81.953	Cercocebus_atys
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	89.053	ENSCLAG00000012696	TWISTNB	100	89.349	Chinchilla_lanigera
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	82.196	ENSCSAG00000013544	TWISTNB	99	81.953	Chlorocebus_sabaeus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	79	88.636	ENSCHOG00000006034	TWISTNB	79	88.636	Choloepus_hoffmanni
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	93	60.870	ENSCPBG00000000367	TWISTNB	96	60.125	Chrysemys_picta_bellii
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	82.493	ENSCANG00000038759	TWISTNB	99	82.249	Colobus_angolensis_palliatus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	99	74.405	ENSCGRG00001000499	Twistnb	100	74.702	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	61	56.250	ENSDARG00000024416	twistnb	53	56.522	Danio_rerio
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	81.009	ENSDNOG00000006438	-	99	81.194	Dasypus_novemcinctus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	91	79.288	ENSDORG00000007795	Twistnb	95	79.355	Dipodomys_ordii
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	84.273	ENSEASG00005021702	TWISTNB	96	83.976	Equus_asinus_asinus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	84.570	ENSECAG00000014563	TWISTNB	96	84.273	Equus_caballus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	97	44.928	ENSELUG00000000098	TWISTNB	84	45.806	Esox_lucius
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	81.306	ENSFCAG00000025987	TWISTNB	99	81.493	Felis_catus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	85	51.307	ENSFALG00000009761	TWISTNB	98	51.466	Ficedula_albicollis
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	98	92.470	ENSFDAG00000017368	TWISTNB	100	92.308	Fukomys_damarensis
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	93	55.864	ENSGALG00000010863	TWISTNB	77	54.154	Gallus_gallus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	56	57.979	ENSGAFG00000018309	twistnb	51	57.979	Gambusia_affinis
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	60	51.923	ENSGACG00000006425	twistnb	66	56.897	Gasterosteus_aculeatus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	99	82.738	ENSGGOG00000026888	TWISTNB	99	82.249	Gorilla_gorilla
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	55	57.297	ENSHBUG00000020155	twistnb	83	47.198	Haplochromis_burtoni
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	100.000	ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	93	41.194	ENSIPUG00000004117	twistnb	91	42.690	Ictalurus_punctatus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	99	82.143	ENSSTOG00000022702	TWISTNB	93	81.657	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	77.448	ENSJJAG00000015887	Twistnb	100	77.151	Jaculus_jaculus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	52	59.770	ENSKMAG00000001591	twistnb	53	57.360	Kryptolebias_marmoratus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	91	43.478	ENSLBEG00000024225	twistnb	89	47.507	Labrus_bergylta
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	94	54.799	ENSLACG00000010508	TWISTNB	91	54.799	Latimeria_chalumnae
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	53	64.045	ENSLOCG00000011399	twistnb	53	64.045	Lepisosteus_oculatus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	99	82.985	ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	82.985	Loxodonta_africana
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	82.196	ENSMFAG00000045328	TWISTNB	99	81.953	Macaca_fascicularis
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	99	82.440	ENSMMUG00000009609	TWISTNB	98	82.440	Macaca_mulatta
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	99	81.845	ENSMNEG00000041159	TWISTNB	99	81.361	Macaca_nemestrina
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	82.493	ENSMLEG00000042783	TWISTNB	99	82.249	Mandrillus_leucophaeus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	55	57.297	ENSMZEG00005007561	twistnb	83	47.198	Maylandia_zebra
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	82.544	ENSMICG00000036489	TWISTNB	98	84.000	Microcebus_murinus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	91	76.375	ENSMOCG00000003458	Twistnb	95	76.699	Microtus_ochrogaster
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	83	61.484	ENSMODG00000001402	-	71	60.429	Monodelphis_domestica
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	54	56.284	ENSMALG00000016407	twistnb	81	41.956	Monopterus_albus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	99	76.036	MGP_CAROLIEiJ_G0017692	Twistnb	100	76.331	Mus_caroli
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	99	76.261	ENSMUSG00000020561	Twistnb	100	76.331	Mus_musculus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	96	77.778	MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	98	77.778	Mus_pahari
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	99	75.964	MGP_SPRETEiJ_G0018534	Twistnb	100	76.036	Mus_spretus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	81.306	ENSMPUG00000013948	TWISTNB	93	81.493	Mustela_putorius_furo
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	93	77.885	ENSMLUG00000008848	TWISTNB	100	78.846	Myotis_lucifugus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	59	83.920	ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	83.920	Nannospalax_galili
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	55	57.297	ENSNBRG00000008652	twistnb	89	47.181	Neolamprologus_brichardi
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	95	83.750	ENSNLEG00000035755	TWISTNB	95	83.230	Nomascus_leucogenys
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	75.660	ENSOPRG00000016109	TWISTNB	99	75.439	Ochotona_princeps
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	86.686	ENSODEG00000007222	TWISTNB	100	86.391	Octodon_degus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	91	43.302	ENSORLG00000004005	twistnb	79	46.018	Oryzias_latipes
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	81.416	ENSOGAG00000009189	TWISTNB	99	81.711	Otolemur_garnettii
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	78.994	ENSOARG00000009803	TWISTNB	99	78.655	Ovis_aries
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	99	82.440	ENSPPAG00000034623	TWISTNB	99	82.249	Pan_paniscus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	80.415	ENSPPRG00000005877	TWISTNB	99	80.597	Panthera_pardus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	89	80.936	ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	81.145	Panthera_tigris_altaica
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	99	83.036	ENSPTRG00000018962	TWISTNB	99	82.544	Pan_troglodytes
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	82.196	ENSPANG00000015736	TWISTNB	99	81.953	Papio_anubis
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	58	61.421	ENSPKIG00000025635	twistnb	54	61.421	Paramormyrops_kingsleyae
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	85	57.986	ENSPCIG00000017456	TWISTNB	96	56.037	Phascolarctos_cinereus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	99	81.306	ENSPPYG00000017752	TWISTNB	99	80.826	Pongo_abelii
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	80.236	ENSPCOG00000017601	TWISTNB	99	80.882	Propithecus_coquereli
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	99	77.515	ENSPVAG00000015574	TWISTNB	99	77.353	Pteropus_vampyrus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	55	57.297	ENSPNYG00000002674	twistnb	89	47.198	Pundamilia_nyererei
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	95	43.402	ENSPNAG00000011956	twistnb	54	55.665	Pygocentrus_nattereri
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	95	77.640	ENSRNOG00000010750	Twistnb	99	77.950	Rattus_norvegicus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	82.493	ENSRBIG00000043007	TWISTNB	98	82.249	Rhinopithecus_bieti
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	99	82.738	ENSRROG00000040155	TWISTNB	99	82.738	Rhinopithecus_roxellana
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	98	80.723	ENSSBOG00000023188	TWISTNB	99	80.952	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	88	46.349	ENSSFOG00015012788	twistnb	59	57.527	Scleropages_formosus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	94	42.353	ENSSMAG00000012792	twistnb	92	44.928	Scophthalmus_maximus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	93	42.470	ENSSDUG00000007038	twistnb	90	44.220	Seriola_dumerili
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	89	53.311	ENSSPUG00000007595	TWISTNB	92	52.560	Sphenodon_punctatus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	52	59.195	ENSSPAG00000005871	twistnb	88	45.946	Stegastes_partitus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	81.416	ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	81.306	Sus_scrofa
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	85	44.000	ENSTNIG00000017778	twistnb	84	44.330	Tetraodon_nigroviridis
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	99	81.845	ENSTBEG00000003554	TWISTNB	99	81.361	Tupaia_belangeri
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	82.196	ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	82.388	Ursus_americanus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	81.899	ENSUMAG00000022203	TWISTNB	99	82.090	Ursus_maritimus
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	76.968	ENSVVUG00000008386	TWISTNB	99	78.592	Vulpes_vulpes
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	74	55.556	ENSXETG00000013443	twistnb	54	53.208	Xenopus_tropicalis
ENSHGLG00000010976	TWISTNB	56	58.511	ENSXCOG00000020199	twistnb	52	58.511	Xiphophorus_couchianus