EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSHGLG00000014393 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SYF2
Alias: -
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Heterocephalus_glaber_female
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 16201 bases
Position: chrJH602077.1:9463586-9479786
Accession: 101696385
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHGLP00000020102	SYF2	PF08231.12	1e-53	1	1
ENSHGLP00000020103	SYF2	PF08231.12	1e-53	1	1
ENSHGLP00000020104	SYF2	PF08231.12	1e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHGLT00000020304	-	3505	-	ENSHGLP00000020104	244 (aa)	XP_021118740	A0A0P6JFT7
ENSHGLT00000020302	-	3392	-	ENSHGLP00000020102	244 (aa)	XP_021118740	A0A0P6JFT7
ENSHGLT00000020303	-	3581	XM_013074416	ENSHGLP00000020103	244 (aa)	XP_012929870	A0A0P6JFT7

Gene Model

Click here to download ENSHGLG00000014393's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSHGLG00000014393's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSHGLG00000014393	SYF2	93	87.225	ENSHGLG00000004304	-	100	82.787

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	93.443	ENSG00000117614	SYF2	100	93.443	Homo_sapiens
ENSHGLG00000014393	SYF2	91	83.784	ENSAPOG00000001174	syf2	93	83.784	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHGLG00000014393	SYF2	80	95.897	ENSAMEG00000010134	-	100	95.897	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHGLG00000014393	SYF2	97	92.437	ENSAMEG00000010115	-	98	92.437	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHGLG00000014393	SYF2	91	81.532	ENSACIG00000023688	syf2	89	81.532	Amphilophus_citrinellus
ENSHGLG00000014393	SYF2	91	84.234	ENSAOCG00000022046	syf2	94	84.234	Amphiprion_ocellaris
ENSHGLG00000014393	SYF2	84	82.927	ENSAOCG00000010912	syf2	64	82.927	Amphiprion_ocellaris
ENSHGLG00000014393	SYF2	91	84.234	ENSAPEG00000018858	syf2	86	84.234	Amphiprion_percula
ENSHGLG00000014393	SYF2	89	83.410	ENSATEG00000007745	syf2	93	82.432	Anabas_testudineus
ENSHGLG00000014393	SYF2	82	89.500	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.500	Anas_platyrhynchos
ENSHGLG00000014393	SYF2	84	85.784	ENSACAG00000013653	-	100	85.784	Anolis_carolinensis
ENSHGLG00000014393	SYF2	68	76.048	ENSACAG00000026777	-	94	76.433	Anolis_carolinensis
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	93.852	ENSANAG00000032473	SYF2	100	93.852	Aotus_nancymaae
ENSHGLG00000014393	SYF2	91	81.081	ENSACLG00000019916	syf2	100	76.639	Astatotilapia_calliptera
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	77.049	ENSAMXG00000004051	syf2	100	77.049	Astyanax_mexicanus
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	92.653	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	93.644	Bos_taurus
ENSHGLG00000014393	SYF2	85	50.952	WBGene00019402	syf-2	99	47.414	Caenorhabditis_elegans
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	93.852	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	93.852	Callithrix_jacchus
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	91.057	ENSCAFG00000012895	-	100	92.276	Canis_familiaris
ENSHGLG00000014393	SYF2	98	83.613	ENSCAFG00000030331	-	97	84.322	Canis_familiaris
ENSHGLG00000014393	SYF2	74	87.912	ENSCAFG00020021094	-	83	96.154	Canis_lupus_dingo
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	91.057	ENSCAFG00020021091	-	100	92.276	Canis_lupus_dingo
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	92.653	ENSCHIG00000020874	SYF2	100	92.653	Capra_hircus
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	92.213	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	92.213	Carlito_syrichta
ENSHGLG00000014393	SYF2	81	97.980	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	Cavia_aperea
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	94.672	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	94.672	Cavia_porcellus
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	93.852	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	93.852	Cebus_capucinus
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	93.033	ENSCATG00000026917	SYF2	100	93.033	Cercocebus_atys
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	96.311	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	96.311	Chinchilla_lanigera
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	93.033	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	93.033	Chlorocebus_sabaeus
ENSHGLG00000014393	SYF2	71	79.310	ENSCHOG00000005273	-	96	79.310	Choloepus_hoffmanni
ENSHGLG00000014393	SYF2	92	89.286	ENSCPBG00000025073	SYF2	99	84.211	Chrysemys_picta_bellii
ENSHGLG00000014393	SYF2	86	53.052	ENSCING00000003017	-	89	52.582	Ciona_intestinalis
ENSHGLG00000014393	SYF2	86	51.174	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.174	Ciona_savignyi
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	80.328	ENSCANG00000037322	SYF2	100	80.328	Colobus_angolensis_palliatus
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	90.164	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.164	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSHGLG00000014393	SYF2	80	95.408	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	94.975	Cricetulus_griseus_crigri
ENSHGLG00000014393	SYF2	89	78.440	ENSCSEG00000000117	syf2	93	77.130	Cynoglossus_semilaevis
ENSHGLG00000014393	SYF2	91	81.900	ENSCVAG00000019543	syf2	100	77.049	Cyprinodon_variegatus
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	77.869	ENSDARG00000004706	syf2	100	77.869	Danio_rerio
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	92.245	ENSDNOG00000047605	SYF2	100	92.245	Dasypus_novemcinctus
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	92.623	ENSDORG00000001274	Syf2	100	92.623	Dipodomys_ordii
ENSHGLG00000014393	SYF2	93	55.652	FBgn0033556	CG12343	99	55.652	Drosophila_melanogaster
ENSHGLG00000014393	SYF2	91	76.923	ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.522	Echinops_telfairi
ENSHGLG00000014393	SYF2	81	59.204	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.204	Eptatretus_burgeri
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	81.148	ENSEASG00005004232	-	100	81.148	Equus_asinus_asinus
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	92.653	ENSEASG00005004224	-	100	92.653	Equus_asinus_asinus
ENSHGLG00000014393	SYF2	96	93.220	ENSECAG00000010440	-	99	93.220	Equus_caballus
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	92.653	ENSECAG00000012023	-	100	92.653	Equus_caballus
ENSHGLG00000014393	SYF2	75	78.689	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	78.689	Erinaceus_europaeus
ENSHGLG00000014393	SYF2	94	82.051	ENSELUG00000003465	syf2	98	82.051	Esox_lucius
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	93.089	ENSFCAG00000010324	-	85	93.089	Felis_catus
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	92.276	ENSFCAG00000043095	-	100	92.276	Felis_catus
ENSHGLG00000014393	SYF2	84	86.275	ENSFALG00000000460	SYF2	93	81.624	Ficedula_albicollis
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	95.902	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	95.902	Fukomys_damarensis
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	60.887	ENSFHEG00000007238	syf2	99	66.964	Fundulus_heteroclitus
ENSHGLG00000014393	SYF2	89	83.028	ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.186	Gadus_morhua
ENSHGLG00000014393	SYF2	92	88.839	ENSGALG00000013639	SYF2	100	81.746	Gallus_gallus
ENSHGLG00000014393	SYF2	91	79.279	ENSGAFG00000019435	syf2	93	79.279	Gambusia_affinis
ENSHGLG00000014393	SYF2	88	83.721	ENSGACG00000007305	syf2	90	83.721	Gasterosteus_aculeatus
ENSHGLG00000014393	SYF2	92	89.732	ENSGAGG00000010670	SYF2	92	88.646	Gopherus_agassizii
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	93.852	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	93.852	Gorilla_gorilla
ENSHGLG00000014393	SYF2	96	78.632	ENSHBUG00000020477	syf2	99	78.632	Haplochromis_burtoni
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	100.000	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	78.279	ENSHCOG00000012904	syf2	78	78.279	Hippocampus_comes
ENSHGLG00000014393	SYF2	89	83.945	ENSIPUG00000019859	syf2	92	83.945	Ictalurus_punctatus
ENSHGLG00000014393	SYF2	60	96.575	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSHGLG00000014393	SYF2	82	96.985	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	Jaculus_jaculus
ENSHGLG00000014393	SYF2	91	81.532	ENSKMAG00000013856	syf2	94	81.532	Kryptolebias_marmoratus
ENSHGLG00000014393	SYF2	90	83.562	ENSLBEG00000014425	syf2	94	82.511	Labrus_bergylta
ENSHGLG00000014393	SYF2	92	83.556	ENSLACG00000012064	SYF2	95	83.556	Latimeria_chalumnae
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	80.738	ENSLOCG00000002728	syf2	95	80.738	Lepisosteus_oculatus
ENSHGLG00000014393	SYF2	75	65.217	ENSLAFG00000030814	-	100	65.217	Loxodonta_africana
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	92.245	ENSLAFG00000023150	-	100	92.245	Loxodonta_africana
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	93.443	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	93.443	Macaca_fascicularis
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	93.033	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	93.033	Macaca_mulatta
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	93.443	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	93.443	Macaca_nemestrina
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	93.033	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	93.033	Mandrillus_leucophaeus
ENSHGLG00000014393	SYF2	89	82.028	ENSMAMG00000010403	syf2	97	75.820	Mastacembelus_armatus
ENSHGLG00000014393	SYF2	94	78.298	ENSMZEG00005006429	syf2	99	78.298	Maylandia_zebra
ENSHGLG00000014393	SYF2	82	89.950	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.950	Meleagris_gallopavo
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	90.984	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.984	Mesocricetus_auratus
ENSHGLG00000014393	SYF2	82	97.487	ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	Microcebus_murinus
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	91.803	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	91.803	Microtus_ochrogaster
ENSHGLG00000014393	SYF2	96	76.923	ENSMMOG00000002396	syf2	97	76.496	Mola_mola
ENSHGLG00000014393	SYF2	92	89.381	ENSMODG00000013951	-	99	89.381	Monodelphis_domestica
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	77.551	ENSMALG00000010706	syf2	100	77.959	Monopterus_albus
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	90.574	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	90.574	Mus_caroli
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	90.574	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	90.574	Mus_musculus
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	90.574	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	90.574	Mus_pahari
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	90.574	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	90.574	Mus_spretus
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	91.870	ENSMPUG00000015801	-	100	91.870	Mustela_putorius_furo
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	91.870	ENSMPUG00000015802	-	100	91.870	Mustela_putorius_furo
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	89.754	ENSMLUG00000001885	SYF2	97	89.754	Myotis_lucifugus
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	92.308	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.308	Nannospalax_galili
ENSHGLG00000014393	SYF2	95	71.186	ENSNBRG00000010720	syf2	99	71.186	Neolamprologus_brichardi
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	93.852	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	93.852	Nomascus_leucogenys
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	90.984	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	90.984	Ochotona_princeps
ENSHGLG00000014393	SYF2	98	94.118	ENSODEG00000017664	-	99	95.319	Octodon_degus
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	84.016	ENSODEG00000014338	-	99	85.532	Octodon_degus
ENSHGLG00000014393	SYF2	91	81.081	ENSONIG00000008213	syf2	100	76.639	Oreochromis_niloticus
ENSHGLG00000014393	SYF2	83	90.594	ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.594	Ornithorhynchus_anatinus
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	95.492	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	95.492	Oryctolagus_cuniculus
ENSHGLG00000014393	SYF2	94	80.000	ENSORLG00000028820	syf2	99	80.000	Oryzias_latipes
ENSHGLG00000014393	SYF2	91	81.982	ENSORLG00020018333	syf2	94	81.982	Oryzias_latipes_hni
ENSHGLG00000014393	SYF2	89	83.028	ENSORLG00015014665	syf2	92	83.028	Oryzias_latipes_hsok
ENSHGLG00000014393	SYF2	91	82.883	ENSOMEG00000013911	syf2	93	82.883	Oryzias_melastigma
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	94.672	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	94.672	Otolemur_garnettii
ENSHGLG00000014393	SYF2	80	67.179	ENSOARG00000006269	-	100	67.179	Ovis_aries
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	92.713	ENSOARG00000006348	-	100	92.713	Ovis_aries
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	93.852	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	93.852	Pan_paniscus
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	92.276	ENSPPRG00000001651	-	100	92.276	Panthera_pardus
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	91.870	ENSPPRG00000001638	-	100	91.870	Panthera_pardus
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	92.276	ENSPTIG00000007036	-	100	92.276	Panthera_tigris_altaica
ENSHGLG00000014393	SYF2	89	98.624	ENSPTIG00000005711	-	80	98.624	Panthera_tigris_altaica
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	93.852	ENSPTRG00000000352	SYF2	100	93.852	Pan_troglodytes
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	93.443	ENSPANG00000008139	SYF2	100	93.443	Papio_anubis
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	77.869	ENSPKIG00000008130	syf2	100	77.869	Paramormyrops_kingsleyae
ENSHGLG00000014393	SYF2	96	85.532	ENSPSIG00000011816	SYF2	91	85.532	Pelodiscus_sinensis
ENSHGLG00000014393	SYF2	95	79.310	ENSPMGG00000008755	syf2	90	79.310	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	91.393	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	91.393	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSHGLG00000014393	SYF2	92	94.196	ENSPCIG00000014235	SYF2	100	87.600	Phascolarctos_cinereus
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	74.590	ENSPFOG00000004116	syf2	99	74.590	Poecilia_formosa
ENSHGLG00000014393	SYF2	96	77.350	ENSPLAG00000006691	syf2	99	77.350	Poecilia_latipinna
ENSHGLG00000014393	SYF2	98	73.750	ENSPMEG00000011684	syf2	99	73.750	Poecilia_mexicana
ENSHGLG00000014393	SYF2	89	81.481	ENSPREG00000003009	syf2	99	76.667	Poecilia_reticulata
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	93.852	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	93.852	Pongo_abelii
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	63.525	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	63.115	Propithecus_coquereli
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	80.408	ENSPVAG00000005841	SYF2	100	80.408	Pteropus_vampyrus
ENSHGLG00000014393	SYF2	91	81.081	ENSPNYG00000004979	syf2	93	81.081	Pundamilia_nyererei
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	80.738	ENSPNAG00000015570	syf2	100	80.738	Pygocentrus_nattereri
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	90.574	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	90.574	Rattus_norvegicus
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	90.984	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	90.984	Rhinopithecus_bieti
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	93.443	ENSRROG00000001347	SYF2	100	93.443	Rhinopithecus_roxellana
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	92.623	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	92.623	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	86.345	ENSSHAG00000015630	-	100	87.149	Sarcophilus_harrisii
ENSHGLG00000014393	SYF2	84	94.660	ENSSHAG00000007152	-	100	94.660	Sarcophilus_harrisii
ENSHGLG00000014393	SYF2	91	83.710	ENSSFOG00015023647	syf2	93	83.710	Scleropages_formosus
ENSHGLG00000014393	SYF2	91	81.081	ENSSMAG00000009867	syf2	93	81.081	Scophthalmus_maximus
ENSHGLG00000014393	SYF2	89	83.028	ENSSDUG00000013072	syf2	100	76.639	Seriola_dumerili
ENSHGLG00000014393	SYF2	89	83.028	ENSSLDG00000012677	syf2	100	76.639	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSHGLG00000014393	SYF2	99	72.428	ENSSARG00000012889	SYF2	99	72.428	Sorex_araneus
ENSHGLG00000014393	SYF2	94	86.900	ENSSPUG00000005251	SYF2	91	86.900	Sphenodon_punctatus
ENSHGLG00000014393	SYF2	91	82.432	ENSSPAG00000009626	syf2	93	82.432	Stegastes_partitus
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	92.653	ENSSSCG00000037481	SYF2	100	92.653	Sus_scrofa
ENSHGLG00000014393	SYF2	61	58.940	ENSTGUG00000001126	SYF2	87	58.192	Taeniopygia_guttata
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	76.230	ENSTRUG00000001499	syf2	95	76.349	Takifugu_rubripes
ENSHGLG00000014393	SYF2	91	79.730	ENSTNIG00000016912	syf2	99	79.730	Tetraodon_nigroviridis
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	70.082	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.672	Tupaia_belangeri
ENSHGLG00000014393	SYF2	99	91.358	ENSTTRG00000003550	SYF2	99	92.593	Tursiops_truncatus
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	91.057	ENSUAMG00000002897	SYF2	100	91.057	Ursus_americanus
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	90.244	ENSUMAG00000013108	SYF2	100	91.463	Ursus_maritimus
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	92.653	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	92.653	Vicugna_pacos
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	91.057	ENSVVUG00000027175	-	100	92.276	Vulpes_vulpes
ENSHGLG00000014393	SYF2	100	87.903	ENSVVUG00000027181	-	100	89.113	Vulpes_vulpes
ENSHGLG00000014393	SYF2	97	82.278	ENSXETG00000022797	syf2	95	82.278	Xenopus_tropicalis
ENSHGLG00000014393	SYF2	88	81.395	ENSXMAG00000022698	syf2	93	79.279	Xiphophorus_maculatus