EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSHGLG00100000149 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Aco1
Alias: -
Full Name: aconitase 1
Gene Type: protein_coding
Species: Heterocephalus_glaber_male
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 39959 bases
Position: chrJH173143.1:136752-176710
Accession: 101716545
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHGLP00100000175	Aconitase	PF00330.20	3.2e-181	1	1
ENSHGLP00100000175	Aconitase_C	PF00694.19	3.4e-46	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHGLT00100000199	-	3564	XM_021252705	ENSHGLP00100000175	889 (aa)	XP_021108364	G5C354

Gene Model

Click here to download ENSHGLG00100000149's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSHGLG00100000149's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	62.308	ENSHGLG00100019429	Ireb2	91	62.308

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	94.601	ENSG00000122729	ACO1	100	94.601	Homo_sapiens
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	81.440	ENSAPOG00000008670	aco1	99	81.440	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.258	ENSAMEG00000003746	ACO1	100	93.258	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	81.777	ENSACIG00000014377	aco1	99	81.777	Amphilophus_citrinellus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	81.665	ENSAOCG00000007699	aco1	99	81.665	Amphiprion_ocellaris
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	81.777	ENSAPEG00000014370	aco1	99	81.777	Amphiprion_percula
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	83.446	ENSATEG00000000560	aco1	99	83.446	Anabas_testudineus
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	87.613	ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.613	Anas_platyrhynchos
ENSHGLG00100000149	Aco1	97	86.628	ENSACAG00000001541	ACO1	99	86.628	Anolis_carolinensis
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	93.131	ENSANAG00000003359	ACO1	99	93.131	Aotus_nancymaae
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	81.440	ENSACLG00000007755	aco1	99	81.440	Astatotilapia_calliptera
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	82.095	ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.095	Astyanax_mexicanus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.926	ENSBTAG00000000555	ACO1	100	93.926	Bos_taurus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.926	ENSCJAG00000007687	ACO1	100	93.926	Callithrix_jacchus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.483	ENSCAFG00000001786	ACO1	99	93.483	Canis_familiaris
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.588	ENSCAFG00020014553	ACO1	100	93.588	Canis_lupus_dingo
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.813	ENSCHIG00000007667	ACO1	100	93.813	Capra_hircus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	95.388	ENSTSYG00000004179	ACO1	99	95.388	Carlito_syrichta
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	75.928	ENSCAPG00000007254	ACO1	100	75.816	Cavia_aperea
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	94.263	ENSCPOG00000003768	ACO1	100	94.263	Cavia_porcellus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.588	ENSCCAG00000022465	ACO1	100	93.588	Cebus_capucinus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	94.038	ENSCATG00000045333	ACO1	100	94.038	Cercocebus_atys
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	94.376	ENSCLAG00000002487	ACO1	100	94.376	Chinchilla_lanigera
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.813	ENSCSAG00000009824	ACO1	99	93.813	Chlorocebus_sabaeus
ENSHGLG00100000149	Aco1	90	75.934	ENSCHOG00000008996	ACO1	90	75.826	Choloepus_hoffmanni
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	88.176	ENSCPBG00000008077	ACO1	99	88.176	Chrysemys_picta_bellii
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.813	ENSCANG00000014847	ACO1	100	93.813	Colobus_angolensis_palliatus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	94.263	ENSCGRG00001024337	Aco1	100	94.263	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.026	ENSCGRG00000004877	-	100	93.026	Cricetulus_griseus_crigri
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	78.129	ENSCSEG00000018262	aco1	99	78.129	Cynoglossus_semilaevis
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	75.423	ENSCVAG00000020264	aco1	99	75.423	Cyprinodon_variegatus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	81.777	ENSDARG00000026376	aco1	99	81.777	Danio_rerio
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	94.038	ENSDNOG00000003951	ACO1	100	94.038	Dasypus_novemcinctus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.363	ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.363	Dipodomys_ordii
ENSHGLG00100000149	Aco1	86	71.958	ENSETEG00000012415	-	85	71.958	Echinops_telfairi
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	57.158	ENSEBUG00000015441	aco1	97	57.158	Eptatretus_burgeri
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	94.826	ENSEASG00005004602	ACO1	100	94.826	Equus_asinus_asinus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	94.713	ENSECAG00000014846	ACO1	100	94.713	Equus_caballus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	81.777	ENSEEUG00000015174	ACO1	100	81.777	Erinaceus_europaeus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	80.765	ENSELUG00000016812	aco1	97	80.765	Esox_lucius
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.813	ENSFCAG00000001293	ACO1	100	93.813	Felis_catus
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	87.050	ENSFALG00000001167	ACO1	99	87.050	Ficedula_albicollis
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	96.625	ENSFDAG00000016058	ACO1	100	96.625	Fukomys_damarensis
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	81.941	ENSFHEG00000005619	aco1	99	81.941	Fundulus_heteroclitus
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	78.330	ENSGMOG00000005514	aco1	99	78.330	Gadus_morhua
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	87.275	ENSGALG00000002162	ACO1	99	87.275	Gallus_gallus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	80.652	ENSGACG00000001637	aco1	99	80.652	Gasterosteus_aculeatus
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	87.613	ENSGAGG00000023315	ACO1	99	87.613	Gopherus_agassizii
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	94.601	ENSGGOG00000016306	ACO1	100	94.601	Gorilla_gorilla
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	81.552	ENSHBUG00000008952	aco1	99	81.552	Haplochromis_burtoni
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	100.000	ENSHGLG00000018922	Aco1	100	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	78.579	ENSHCOG00000015881	aco1	99	78.579	Hippocampus_comes
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	81.890	ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.890	Ictalurus_punctatus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	95.388	ENSSTOG00000006942	ACO1	99	95.388	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.813	ENSJJAG00000013824	Aco1	100	93.813	Jaculus_jaculus
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	81.419	ENSKMAG00000015759	aco1	99	81.419	Kryptolebias_marmoratus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	77.528	ENSLBEG00000013866	aco1	99	77.528	Labrus_bergylta
ENSHGLG00100000149	Aco1	75	72.419	ENSLACG00000000936	ACO1	99	72.404	Latimeria_chalumnae
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	83.202	ENSLOCG00000011082	aco1	99	83.202	Lepisosteus_oculatus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	92.688	ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.688	Loxodonta_africana
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	94.263	ENSMFAG00000001702	ACO1	100	94.263	Macaca_fascicularis
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	94.376	ENSMMUG00000008196	ACO1	100	94.376	Macaca_mulatta
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	94.151	ENSMNEG00000045040	ACO1	100	94.151	Macaca_nemestrina
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	94.151	ENSMLEG00000005636	ACO1	100	94.151	Mandrillus_leucophaeus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	83.015	ENSMAMG00000002915	aco1	99	83.015	Mastacembelus_armatus
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	78.052	ENSMZEG00005012733	aco1	99	77.716	Maylandia_zebra
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	71.987	ENSMGAG00000008851	ACO1	99	71.987	Meleagris_gallopavo
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.588	ENSMAUG00000021408	Aco1	100	93.588	Mesocricetus_auratus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	94.038	ENSMICG00000006540	ACO1	100	94.038	Microcebus_murinus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.701	ENSMOCG00000015393	Aco1	100	93.701	Microtus_ochrogaster
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	80.765	ENSMMOG00000020282	aco1	99	80.765	Mola_mola
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	89.539	ENSMODG00000004463	ACO1	100	89.539	Monodelphis_domestica
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	82.115	ENSMALG00000019764	aco1	99	82.115	Monopterus_albus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.251	MGP_CAROLIEiJ_G0025892	Aco1	100	93.251	Mus_caroli
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.026	ENSMUSG00000028405	Aco1	100	93.026	Mus_musculus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.588	MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	93.588	Mus_pahari
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.138	MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	93.138	Mus_spretus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.701	ENSMPUG00000004340	ACO1	100	93.701	Mustela_putorius_furo
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	92.238	ENSMLUG00000003029	ACO1	100	92.238	Myotis_lucifugus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	94.488	ENSNGAG00000005703	Aco1	100	94.488	Nannospalax_galili
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	63.647	ENSNBRG00000008973	aco1	99	63.423	Neolamprologus_brichardi
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.926	ENSNLEG00000003409	ACO1	100	93.926	Nomascus_leucogenys
ENSHGLG00100000149	Aco1	90	84.055	ENSMEUG00000014756	ACO1	90	84.055	Notamacropus_eugenii
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	90.101	ENSOPRG00000016791	ACO1	100	90.101	Ochotona_princeps
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.926	ENSODEG00000001240	-	100	93.926	Octodon_degus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	91.114	ENSODEG00000015432	-	100	90.664	Octodon_degus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	81.440	ENSONIG00000019869	aco1	99	81.440	Oreochromis_niloticus
ENSHGLG00100000149	Aco1	81	90.595	ENSOANG00000012132	ACO1	100	90.595	Ornithorhynchus_anatinus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	92.325	ENSOCUG00000015960	ACO1	100	92.102	Oryctolagus_cuniculus
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	81.532	ENSORLG00000020656	aco1	99	81.532	Oryzias_latipes
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	81.532	ENSORLG00020010991	aco1	99	81.532	Oryzias_latipes_hni
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	81.419	ENSORLG00015011785	aco1	99	81.419	Oryzias_latipes_hsok
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	79.910	ENSOMEG00000000660	aco1	99	79.910	Oryzias_melastigma
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.476	ENSOGAG00000010522	ACO1	100	93.476	Otolemur_garnettii
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.813	ENSOARG00000014707	ACO1	98	93.813	Ovis_aries
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	94.488	ENSPPAG00000033498	ACO1	100	94.488	Pan_paniscus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.701	ENSPPRG00000009875	ACO1	100	93.701	Panthera_pardus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.588	ENSPTIG00000016606	ACO1	98	93.588	Panthera_tigris_altaica
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	94.488	ENSPTRG00000020843	ACO1	100	94.488	Pan_troglodytes
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	94.151	ENSPANG00000025270	ACO1	100	94.151	Papio_anubis
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	80.202	ENSPKIG00000023168	aco1	99	80.202	Paramormyrops_kingsleyae
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	88.401	ENSPSIG00000008030	ACO1	99	88.401	Pelodiscus_sinensis
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	82.074	ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.074	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.926	ENSPEMG00000018464	Aco1	100	93.926	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	89.314	ENSPCIG00000029321	ACO1	100	89.525	Phascolarctos_cinereus
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	80.791	ENSPFOG00000013405	aco1	99	80.727	Poecilia_formosa
ENSHGLG00100000149	Aco1	90	81.955	ENSPLAG00000023422	aco1	97	81.955	Poecilia_latipinna
ENSHGLG00100000149	Aco1	90	81.875	ENSPMEG00000011800	aco1	98	81.875	Poecilia_mexicana
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	80.722	ENSPREG00000021791	aco1	99	80.722	Poecilia_reticulata
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	94.151	ENSPPYG00000019150	ACO1	95	94.151	Pongo_abelii
ENSHGLG00100000149	Aco1	78	94.340	ENSPCAG00000013222	ACO1	91	94.340	Procavia_capensis
ENSHGLG00100000149	Aco1	89	93.797	ENSPCOG00000021198	ACO1	100	93.797	Propithecus_coquereli
ENSHGLG00100000149	Aco1	96	88.318	ENSPVAG00000002372	ACO1	99	88.318	Pteropus_vampyrus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	81.552	ENSPNYG00000009425	aco1	99	81.552	Pundamilia_nyererei
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	82.790	ENSPNAG00000017918	aco1	100	82.790	Pygocentrus_nattereri
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.138	ENSRNOG00000005849	Aco1	100	93.138	Rattus_norvegicus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.813	ENSRBIG00000034592	ACO1	100	93.813	Rhinopithecus_bieti
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.926	ENSRROG00000042672	ACO1	100	93.926	Rhinopithecus_roxellana
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.926	ENSSBOG00000026008	ACO1	100	93.926	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	89.663	ENSSHAG00000008924	ACO1	100	89.663	Sarcophilus_harrisii
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	82.300	ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.300	Scleropages_formosus
ENSHGLG00100000149	Aco1	75	83.433	ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.333	Scophthalmus_maximus
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	82.525	ENSSDUG00000002984	aco1	99	82.525	Seriola_dumerili
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	82.864	ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.864	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSHGLG00100000149	Aco1	96	90.304	ENSSARG00000008437	ACO1	100	90.304	Sorex_araneus
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	87.035	ENSSPUG00000002916	ACO1	99	87.035	Sphenodon_punctatus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	82.115	ENSSPAG00000019147	aco1	99	82.115	Stegastes_partitus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	94.376	ENSSSCG00000023807	ACO1	100	94.376	Sus_scrofa
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	86.712	ENSTGUG00000001505	ACO1	99	86.712	Taeniopygia_guttata
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	81.264	ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.151	Takifugu_rubripes
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	78.894	ENSTNIG00000005288	aco1	99	78.894	Tetraodon_nigroviridis
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	90.214	ENSTBEG00000012369	ACO1	100	90.214	Tupaia_belangeri
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	94.263	ENSTTRG00000016991	ACO1	99	94.263	Tursiops_truncatus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.476	ENSUAMG00000020699	ACO1	100	93.476	Ursus_americanus
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.476	ENSUMAG00000005807	ACO1	100	93.476	Ursus_maritimus
ENSHGLG00100000149	Aco1	96	93.897	ENSVPAG00000009876	ACO1	100	93.897	Vicugna_pacos
ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.363	ENSVVUG00000021152	ACO1	91	93.363	Vulpes_vulpes
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	84.157	ENSXETG00000009184	aco1	99	84.157	Xenopus_tropicalis
ENSHGLG00100000149	Aco1	50	79.819	ENSXCOG00000005638	aco1	96	79.819	Xiphophorus_couchianus
ENSHGLG00100000149	Aco1	99	80.947	ENSXMAG00000023603	aco1	99	80.947	Xiphophorus_maculatus