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Description

Ensembl ID: ENSHGLG00100005233 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: AGO4
Alias: EIF2C4|FLJ20033|KIAA1567|hAGO4
Full Name: argonaute 4%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Heterocephalus_glaber_male
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 42253 bases
Position: chrJH173559.1:921829-964081
Accession: 101715103
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHGLP00100006972	PAZ	PF02170.22	6.8e-28	1	1
ENSHGLP00100006971	PAZ	PF02170.22	6.9e-28	1	1
ENSHGLP00100006972	Piwi	PF02171.17	3.1e-105	1	1
ENSHGLP00100006971	Piwi	PF02171.17	3.2e-105	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHGLT00100007064	AGO4-202	6257	XM_004850940	ENSHGLP00100006972	852 (aa)	XP_004850997	-
ENSHGLT00100007063	AGO4-201	2589	-	ENSHGLP00100006971	862 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	83.765	ENSHGLG00100005568	AGO1	98	83.765
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	78.916	ENSHGLG00100015994	-	98	78.916
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	70.671	ENSHGLG00100000694	-	97	70.671
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	81.024	ENSHGLG00100006043	AGO3	99	81.024

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	100.000	ENSG00000134698	AGO4	99	100.000	Homo_sapiens
ENSHGLG00100005233	AGO4	96	96.485	ENSAPOG00000023867	ago4	98	96.485	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	100.000	ENSAMEG00000000573	AGO4	99	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHGLG00100005233	AGO4	93	97.733	ENSACIG00000014548	ago4	100	97.733	Amphilophus_citrinellus
ENSHGLG00100005233	AGO4	93	93.073	ENSAPEG00000022426	ago4	100	93.073	Amphiprion_percula
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	96.516	ENSATEG00000006717	ago4	100	96.398	Anabas_testudineus
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	99.528	ENSAPLG00000010882	AGO4	100	99.528	Anas_platyrhynchos
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	98.588	ENSACAG00000017275	AGO4	98	98.588	Anolis_carolinensis
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	99.882	ENSANAG00000031428	AGO4	99	99.882	Aotus_nancymaae
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	96.400	ENSACLG00000005181	ago4	99	96.400	Astatotilapia_calliptera
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	96.632	ENSAMXG00000010318	ago4	100	96.474	Astyanax_mexicanus
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	98.941	ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.941	Bos_taurus
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	100.000	ENSCJAG00000001610	AGO4	99	100.000	Callithrix_jacchus
ENSHGLG00100005233	AGO4	93	100.000	ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	Canis_familiaris
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	99.882	ENSCHIG00000026564	AGO4	99	99.882	Capra_hircus
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	100.000	ENSTSYG00000014007	AGO4	99	100.000	Carlito_syrichta
ENSHGLG00100005233	AGO4	94	96.154	ENSCAPG00000009369	AGO4	99	96.154	Cavia_aperea
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	98.000	ENSCPOG00000011557	AGO4	99	98.000	Cavia_porcellus
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	100.000	ENSCCAG00000001397	AGO4	99	100.000	Cebus_capucinus
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	100.000	ENSCATG00000043421	AGO4	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	99.882	ENSCLAG00000012097	AGO4	99	99.882	Chinchilla_lanigera
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	100.000	ENSCSAG00000001090	AGO4	99	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSHGLG00100005233	AGO4	80	100.000	ENSCHOG00000006867	AGO4	81	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	99.529	ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.529	Chrysemys_picta_bellii
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	100.000	ENSCANG00000016914	AGO4	99	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	99.529	ENSCGRG00001002701	Ago4	99	99.529	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	99.529	ENSCGRG00000013335	Ago4	99	99.529	Cricetulus_griseus_crigri
ENSHGLG00100005233	AGO4	93	91.709	ENSCSEG00000010696	ago4	100	91.709	Cynoglossus_semilaevis
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	97.882	ENSDARG00000100854	ago4	98	97.882	Danio_rerio
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	100.000	ENSDNOG00000015674	AGO4	99	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	100.000	ENSDORG00000008933	Ago4	99	100.000	Dipodomys_ordii
ENSHGLG00100005233	AGO4	61	100.000	ENSETEG00000018390	AGO4	83	100.000	Echinops_telfairi
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	100.000	ENSEASG00005012079	AGO4	99	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	100.000	ENSECAG00000024686	AGO4	99	100.000	Equus_caballus
ENSHGLG00100005233	AGO4	79	97.426	ENSEEUG00000000745	AGO4	78	97.426	Erinaceus_europaeus
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	96.400	ENSELUG00000023873	ago4	98	96.400	Esox_lucius
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	100.000	ENSFCAG00000006218	AGO4	99	100.000	Felis_catus
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	100.000	ENSFDAG00000021483	AGO4	99	100.000	Fukomys_damarensis
ENSHGLG00100005233	AGO4	98	88.756	ENSFHEG00000019658	ago4	100	88.756	Fundulus_heteroclitus
ENSHGLG00100005233	AGO4	100	97.535	ENSGMOG00000009544	ago4	99	97.535	Gadus_morhua
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	99.529	ENSGALG00000039713	AGO4	100	99.496	Gallus_gallus
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	96.400	ENSGAFG00000017239	ago4	99	96.400	Gambusia_affinis
ENSHGLG00100005233	AGO4	100	97.770	ENSGACG00000002683	ago4	99	97.770	Gasterosteus_aculeatus
ENSHGLG00100005233	AGO4	93	99.496	ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	Gopherus_agassizii
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	96.592	ENSGGOG00000036532	AGO4	100	96.592	Gorilla_gorilla
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	96.400	ENSHBUG00000001525	ago4	99	96.400	Haplochromis_burtoni
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	100.000	ENSHGLG00000010241	AGO4	99	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	96.400	ENSHCOG00000003725	ago4	99	96.400	Hippocampus_comes
ENSHGLG00100005233	AGO4	100	96.408	ENSIPUG00000015600	ago4	99	96.408	Ictalurus_punctatus
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	100.000	ENSSTOG00000004725	AGO4	99	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	96.516	ENSKMAG00000018602	ago4	99	96.516	Kryptolebias_marmoratus
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	95.848	ENSLBEG00000010670	ago4	99	95.848	Labrus_bergylta
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	98.588	ENSLACG00000016888	AGO4	99	98.588	Latimeria_chalumnae
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	96.516	ENSLOCG00000000584	ago4	99	96.516	Lepisosteus_oculatus
ENSHGLG00100005233	AGO4	94	99.251	ENSLAFG00000010394	AGO4	100	99.251	Loxodonta_africana
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	100.000	ENSMFAG00000035543	AGO4	99	100.000	Macaca_fascicularis
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	99.882	ENSMMUG00000003343	AGO4	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSHGLG00100005233	AGO4	100	99.766	ENSMNEG00000037723	AGO4	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	100.000	ENSMLEG00000039490	AGO4	99	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	96.400	ENSMAMG00000003874	ago4	100	96.221	Mastacembelus_armatus
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	96.400	ENSMZEG00005026346	ago4	99	96.400	Maylandia_zebra
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	99.176	ENSMGAG00000003851	AGO4	99	99.176	Meleagris_gallopavo
ENSHGLG00100005233	AGO4	82	100.000	ENSMAUG00000021743	Ago4	97	98.545	Mesocricetus_auratus
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	99.765	ENSMICG00000033507	AGO4	99	99.765	Microcebus_murinus
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	99.529	ENSMOCG00000005772	Ago4	99	99.529	Microtus_ochrogaster
ENSHGLG00100005233	AGO4	93	96.725	ENSMMOG00000013473	ago4	100	96.725	Mola_mola
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	99.647	ENSMODG00000017888	AGO4	99	99.647	Monodelphis_domestica
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	95.882	ENSMALG00000011797	ago4	99	95.882	Monopterus_albus
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	99.059	MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	99.059	Mus_caroli
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	98.824	ENSMUSG00000042500	Ago4	99	98.824	Mus_musculus
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	98.471	MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	98.471	Mus_pahari
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	98.588	MGP_SPRETEiJ_G0027458	Ago4	99	98.588	Mus_spretus
ENSHGLG00100005233	AGO4	93	100.000	ENSMPUG00000014876	AGO4	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	98.706	ENSMLUG00000017102	AGO4	98	98.706	Myotis_lucifugus
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	100.000	ENSNGAG00000020544	Ago4	99	100.000	Nannospalax_galili
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	96.400	ENSNBRG00000013492	ago4	99	96.400	Neolamprologus_brichardi
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	100.000	ENSNLEG00000011125	AGO4	99	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSHGLG00100005233	AGO4	90	98.442	ENSMEUG00000001023	AGO4	90	98.442	Notamacropus_eugenii
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	92.471	ENSOPRG00000012309	AGO4	99	92.471	Ochotona_princeps
ENSHGLG00100005233	AGO4	94	99.875	ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	Octodon_degus
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	97.176	ENSONIG00000013603	ago4	99	96.400	Oreochromis_niloticus
ENSHGLG00100005233	AGO4	93	99.622	ENSOANG00000002082	AGO4	100	99.622	Ornithorhynchus_anatinus
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	99.882	ENSOCUG00000004076	AGO4	99	99.882	Oryctolagus_cuniculus
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	96.516	ENSORLG00000009865	ago4	91	96.516	Oryzias_latipes
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	96.516	ENSORLG00020016978	ago4	91	96.516	Oryzias_latipes_hni
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	96.516	ENSORLG00015008800	ago4	91	96.516	Oryzias_latipes_hsok
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	96.516	ENSOMEG00000006399	ago4	99	96.516	Oryzias_melastigma
ENSHGLG00100005233	AGO4	94	98.498	ENSOGAG00000004233	-	100	98.498	Otolemur_garnettii
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	91.529	ENSOGAG00000027107	-	99	91.529	Otolemur_garnettii
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	99.412	ENSOARG00000019568	AGO4	97	99.412	Ovis_aries
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	100.000	ENSPPAG00000031752	AGO4	99	100.000	Pan_paniscus
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	100.000	ENSPPRG00000006520	AGO4	99	100.000	Panthera_pardus
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	100.000	ENSPTIG00000020262	AGO4	99	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	100.000	ENSPTRG00000000527	AGO4	99	100.000	Pan_troglodytes
ENSHGLG00100005233	AGO4	93	100.000	ENSPANG00000007232	AGO4	100	100.000	Papio_anubis
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	96.516	ENSPKIG00000022598	ago4	99	96.516	Paramormyrops_kingsleyae
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	99.529	ENSPSIG00000013832	AGO4	99	99.529	Pelodiscus_sinensis
ENSHGLG00100005233	AGO4	93	97.607	ENSPMGG00000023325	ago4	100	97.607	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	89.202	ENSPEMG00000022651	-	95	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	99.647	ENSPCIG00000000092	AGO4	99	99.647	Phascolarctos_cinereus
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	96.516	ENSPFOG00000001935	ago4	99	96.516	Poecilia_formosa
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	97.765	ENSPLAG00000011534	ago4	98	97.765	Poecilia_latipinna
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	96.516	ENSPMEG00000005049	ago4	99	96.516	Poecilia_mexicana
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	96.516	ENSPREG00000010315	ago4	99	96.516	Poecilia_reticulata
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	100.000	ENSPPYG00000001552	AGO4	99	100.000	Pongo_abelii
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	99.765	ENSPCOG00000015935	AGO4	99	99.765	Propithecus_coquereli
ENSHGLG00100005233	AGO4	88	100.000	ENSPVAG00000005079	AGO4	88	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSHGLG00100005233	AGO4	99	96.400	ENSPNYG00000002089	ago4	99	96.400	Pundamilia_nyererei
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