EuRBPDB

Description

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSHGLG00100005410 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: TWISTNB
Alias: -
Full Name: TWIST neighbor
Gene Type: protein_coding
Species: Heterocephalus_glaber_male
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 12150 bases
Position: chrJH172608.1:2232670-2244819
Accession: 101704623
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHGLP00100007212	SHS2_Rpb7-N	PF03876.17	2.2e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHGLT00100007306	TWISTNB-201	5350	-	ENSHGLP00100007212	337 (aa)	XP_021109802	G5BZJ2

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	99	82.738	ENSG00000105849	TWISTNB	97	83.082	Homo_sapiens
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	58	54.639	ENSAPOG00000011796	twistnb	51	54.639	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	71.429	ENSAMEG00000008558	TWISTNB	97	71.504	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	93	42.773	ENSACIG00000020400	twistnb	80	45.667	Amphilophus_citrinellus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	60	53.960	ENSAOCG00000024200	twistnb	52	53.960	Amphiprion_ocellaris
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	60	53.960	ENSAPEG00000016750	twistnb	52	53.960	Amphiprion_percula
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	54	63.587	ENSACAG00000011817	TWISTNB	93	63.587	Anolis_carolinensis
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	98	81.024	ENSANAG00000026418	TWISTNB	98	81.024	Aotus_nancymaae
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	58	57.143	ENSAMXG00000035868	twistnb	57	57.143	Astyanax_mexicanus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	79.228	ENSBTAG00000006721	TWISTNB	98	78.248	Bos_taurus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	98	81.381	ENSCJAG00000001148	TWISTNB	98	81.381	Callithrix_jacchus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	74.640	ENSCAFG00000002511	TWISTNB	97	76.833	Canis_familiaris
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	76.385	ENSCAFG00020002140	TWISTNB	91	78.338	Canis_lupus_dingo
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	78.466	ENSCHIG00000024078	TWISTNB	98	78.679	Capra_hircus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	99	82.544	ENSTSYG00000001471	TWISTNB	97	82.883	Carlito_syrichta
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	89.645	ENSCPOG00000031651	TWISTNB	98	89.759	Cavia_porcellus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	99	81.548	ENSCCAG00000026416	TWISTNB	97	81.571	Cebus_capucinus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	82.196	ENSCATG00000035621	TWISTNB	97	82.779	Cercocebus_atys
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	89.053	ENSCLAG00000012696	TWISTNB	98	89.458	Chinchilla_lanigera
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	82.196	ENSCSAG00000013544	TWISTNB	97	82.779	Chlorocebus_sabaeus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	79	88.636	ENSCHOG00000006034	TWISTNB	77	88.636	Choloepus_hoffmanni
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	93	60.870	ENSCPBG00000000367	TWISTNB	86	63.066	Chrysemys_picta_bellii
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	82.493	ENSCANG00000038759	TWISTNB	97	83.082	Colobus_angolensis_palliatus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	99	74.405	ENSCGRG00001000499	Twistnb	97	76.947	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	61	56.250	ENSDARG00000024416	twistnb	53	56.522	Danio_rerio
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	81.009	ENSDNOG00000006438	-	98	81.571	Dasypus_novemcinctus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	91	79.288	ENSDORG00000007795	Twistnb	95	79.355	Dipodomys_ordii
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	84.273	ENSEASG00005021702	TWISTNB	94	84.592	Equus_asinus_asinus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	84.570	ENSECAG00000014563	TWISTNB	94	84.894	Equus_caballus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	97	44.928	ENSELUG00000000098	TWISTNB	84	45.806	Esox_lucius
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	81.306	ENSFCAG00000025987	TWISTNB	98	81.818	Felis_catus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	85	51.307	ENSFALG00000009761	TWISTNB	87	51.648	Ficedula_albicollis
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	98	92.470	ENSFDAG00000017368	TWISTNB	98	92.470	Fukomys_damarensis
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	93	55.864	ENSGALG00000010863	TWISTNB	69	54.795	Gallus_gallus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	56	57.979	ENSGAFG00000018309	twistnb	51	57.979	Gambusia_affinis
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	60	51.923	ENSGACG00000006425	twistnb	66	56.897	Gasterosteus_aculeatus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	99	82.738	ENSGGOG00000026888	TWISTNB	97	83.082	Gorilla_gorilla
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	100.000	ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	93	41.194	ENSIPUG00000004117	twistnb	55	52.970	Ictalurus_punctatus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	99	82.143	ENSSTOG00000022702	TWISTNB	91	82.175	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	77.448	ENSJJAG00000015887	Twistnb	98	77.341	Jaculus_jaculus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	52	59.770	ENSKMAG00000001591	twistnb	53	57.360	Kryptolebias_marmoratus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	91	43.478	ENSLBEG00000024225	twistnb	79	48.344	Labrus_bergylta
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	94	54.799	ENSLACG00000010508	TWISTNB	88	54.777	Latimeria_chalumnae
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	53	64.045	ENSLOCG00000011399	twistnb	53	64.045	Lepisosteus_oculatus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	99	82.985	ENSLAFG00000008755	TWISTNB	99	83.082	Loxodonta_africana
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	82.196	ENSMFAG00000045328	TWISTNB	97	82.779	Macaca_fascicularis
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	99	82.440	ENSMMUG00000009609	TWISTNB	96	82.779	Macaca_mulatta
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	99	81.845	ENSMNEG00000041159	TWISTNB	97	82.175	Macaca_nemestrina
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	82.493	ENSMLEG00000042783	TWISTNB	97	83.082	Mandrillus_leucophaeus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	82.544	ENSMICG00000036489	TWISTNB	98	84.000	Microcebus_murinus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	91	76.375	ENSMOCG00000003458	Twistnb	95	76.699	Microtus_ochrogaster
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	83	61.484	ENSMODG00000001402	-	64	61.224	Monodelphis_domestica
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	54	56.284	ENSMALG00000016407	twistnb	81	41.956	Monopterus_albus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	99	76.036	MGP_CAROLIEiJ_G0017692	Twistnb	98	77.914	Mus_caroli
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	99	76.261	ENSMUSG00000020561	Twistnb	98	77.914	Mus_musculus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	96	77.778	MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	98	77.778	Mus_pahari
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	99	75.964	MGP_SPRETEiJ_G0018534	Twistnb	98	77.607	Mus_spretus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	81.306	ENSMPUG00000013948	TWISTNB	92	81.571	Mustela_putorius_furo
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	93	77.885	ENSMLUG00000008848	TWISTNB	98	79.085	Myotis_lucifugus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	59	83.920	ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	83.920	Nannospalax_galili
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	55	57.297	ENSNBRG00000008652	twistnb	83	48.254	Neolamprologus_brichardi
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	95	83.750	ENSNLEG00000035755	TWISTNB	93	83.810	Nomascus_leucogenys
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	75.660	ENSOPRG00000016109	TWISTNB	97	76.877	Ochotona_princeps
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	86.686	ENSODEG00000007222	TWISTNB	98	87.048	Octodon_degus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	81.416	ENSOGAG00000009189	TWISTNB	98	82.282	Otolemur_garnettii
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	78.994	ENSOARG00000009803	TWISTNB	97	79.217	Ovis_aries
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	99	82.440	ENSPPAG00000034623	TWISTNB	97	83.082	Pan_paniscus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	80.415	ENSPPRG00000005877	TWISTNB	98	80.909	Panthera_pardus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	89	80.936	ENSPTIG00000021539	TWISTNB	97	81.507	Panthera_tigris_altaica
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	99	83.036	ENSPTRG00000018962	TWISTNB	97	83.384	Pan_troglodytes
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	82.196	ENSPANG00000015736	TWISTNB	97	82.779	Papio_anubis
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	58	61.421	ENSPKIG00000025635	twistnb	54	61.421	Paramormyrops_kingsleyae
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	85	57.986	ENSPCIG00000017456	TWISTNB	85	58.188	Phascolarctos_cinereus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	99	81.306	ENSPPYG00000017752	TWISTNB	97	81.627	Pongo_abelii
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	80.236	ENSPCOG00000017601	TWISTNB	97	82.822	Propithecus_coquereli
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	99	77.515	ENSPVAG00000015574	TWISTNB	97	78.078	Pteropus_vampyrus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	95	43.402	ENSPNAG00000011956	twistnb	54	55.665	Pygocentrus_nattereri
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	95	77.640	ENSRNOG00000010750	Twistnb	99	77.950	Rattus_norvegicus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	82.493	ENSRBIG00000043007	TWISTNB	96	83.082	Rhinopithecus_bieti
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	99	82.738	ENSRROG00000040155	TWISTNB	97	83.082	Rhinopithecus_roxellana
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	98	80.723	ENSSBOG00000023188	TWISTNB	98	80.723	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	88	46.349	ENSSFOG00015012788	twistnb	59	57.527	Scleropages_formosus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	94	42.353	ENSSMAG00000012792	twistnb	82	46.254	Scophthalmus_maximus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	89	53.311	ENSSPUG00000007595	TWISTNB	92	52.218	Sphenodon_punctatus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	81.416	ENSSSCG00000025298	TWISTNB	98	81.381	Sus_scrofa
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	85	44.000	ENSTNIG00000017778	twistnb	84	44.330	Tetraodon_nigroviridis
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	99	81.845	ENSTBEG00000003554	TWISTNB	97	82.477	Tupaia_belangeri
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	82.196	ENSUAMG00000017593	TWISTNB	98	82.477	Ursus_americanus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	81.899	ENSUMAG00000022203	TWISTNB	98	82.175	Ursus_maritimus
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	76.968	ENSVVUG00000008386	TWISTNB	98	78.635	Vulpes_vulpes
ENSHGLG00100005410	TWISTNB	74	55.556	ENSXETG00000013443	twistnb	54	53.208	Xenopus_tropicalis