EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSHGLG00100010319 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: EFTUD1
Alias: EFTUD1|FAM42A|FLJ13119|HsT19294|RIA1
Full Name: elongation factor like GTPase 1
Gene Type: protein_coding
Species: Heterocephalus_glaber_male
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 146694 bases
Position: chrJH169900.1:2361474-2508167
Accession: 101697880
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHGLP00100013947	GTP_EFTU	PF00009.27	9.5e-62	1	1
ENSHGLP00100013948	GTP_EFTU	PF00009.27	2.6e-20	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHGLT00100014102	-	3403	-	ENSHGLP00100013947	1127 (aa)	XP_021120555	G5BEZ7
ENSHGLT00100014103	-	519	-	ENSHGLP00100013948	83 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSHGLG00100010319's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSHGLG00100010319's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	100	36.047	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	74	34.507
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	95	53.165	ENSHGLG00100015891	EEF2	97	39.583

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	96.341	ENSG00000140598	EFL1	100	96.667	Homo_sapiens
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	94	84.615	ENSAPOG00000000188	efl1	99	68.154	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	95.122	ENSAMEG00000006031	EFL1	100	89.805	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	94	83.333	ENSACIG00000017802	efl1	99	68.579	Amphilophus_citrinellus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	95	84.810	ENSAOCG00000024337	-	83	84.810	Amphiprion_ocellaris
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	94	84.615	ENSAOCG00000023933	efl1	99	67.841	Amphiprion_ocellaris
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	94	84.615	ENSAPEG00000000262	efl1	99	68.449	Amphiprion_percula
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	100	82.143	ENSATEG00000012373	efl1	100	68.222	Anabas_testudineus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	76.637	ENSAPLG00000011147	EFL1	99	76.637	Anas_platyrhynchos
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	98	83.951	ENSACAG00000011040	EFL1	100	74.670	Anolis_carolinensis
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	95.122	ENSANAG00000027459	EFL1	100	90.160	Aotus_nancymaae
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	94	84.615	ENSACLG00000025780	efl1	100	67.575	Astatotilapia_calliptera
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	95	82.278	ENSAMXG00000019529	efl1	100	68.269	Astyanax_mexicanus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	95.122	ENSBTAG00000003410	EFL1	100	88.850	Bos_taurus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	77	73.438	WBGene00010732	K10C3.5	92	57.658	Caenorhabditis_elegans
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	95.122	ENSCJAG00000015607	-	93	99.206	Callithrix_jacchus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	98	95.062	ENSCAFG00000013671	EFL1	100	89.184	Canis_familiaris
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	98	95.062	ENSCAFG00020015837	-	84	95.122	Canis_lupus_dingo
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	95.122	ENSCHIG00000001883	EFL1	100	89.115	Capra_hircus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	95.122	ENSTSYG00000000348	EFL1	100	90.691	Carlito_syrichta
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	98	91.566	ENSCAPG00000017944	EFL1	100	80.919	Cavia_aperea
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	98	100.000	ENSCPOG00000001924	EFL1	100	95.741	Cavia_porcellus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	96.341	ENSCCAG00000034450	EFL1	100	90.603	Cebus_capucinus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	95.122	ENSCATG00000031678	-	100	89.982	Cercocebus_atys
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	98.780	ENSCLAG00000010155	EFL1	100	95.031	Chinchilla_lanigera
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	93.902	ENSCSAG00000015165	EFL1	100	89.716	Chlorocebus_sabaeus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	81	98.507	ENSCHOG00000004666	-	57	98.507	Choloepus_hoffmanni
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	73	86.765	ENSCHOG00000014029	EFL1	78	86.765	Choloepus_hoffmanni
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	85.366	ENSCPBG00000017638	EFL1	99	77.895	Chrysemys_picta_bellii
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	95	74.684	ENSCING00000000792	-	99	63.100	Ciona_intestinalis
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	95	77.215	ENSCSAVG00000001787	-	99	63.073	Ciona_savignyi
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	100	93.976	ENSCANG00000038093	EFL1	100	89.982	Colobus_angolensis_palliatus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	92.683	ENSCGRG00001010826	Efl1	100	85.638	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	91.463	ENSCGRG00000003273	Efl1	100	89.273	Cricetulus_griseus_crigri
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	98	80.488	ENSCSEG00000005856	efl1	99	64.706	Cynoglossus_semilaevis
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	93	65.439	ENSCVAG00000011863	efl1	95	64.844	Cyprinodon_variegatus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	94	83.333	ENSDARG00000079672	efl1	98	69.373	Danio_rerio
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	95	82.278	ENSDARG00000117086	CABZ01090544.1	90	79.630	Danio_rerio
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	98	97.531	ENSDNOG00000006097	EFL1	100	90.957	Dasypus_novemcinctus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	100	87.245	ENSDORG00000000719	Efl1	100	87.245	Dipodomys_ordii
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	90	66.667	FBgn0053158	CG33158	99	44.327	Drosophila_melanogaster
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	93	80.153	ENSETEG00000004309	EFL1	100	80.153	Echinops_telfairi
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	87	79.167	ENSEBUG00000010738	efl1	99	68.009	Eptatretus_burgeri
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	100	93.976	ENSEASG00005007108	EFL1	100	87.688	Equus_asinus_asinus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	95	87.175	ENSECAG00000016354	EFL1	99	87.175	Equus_caballus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	69	85.345	ENSEEUG00000006326	EFL1	79	85.345	Erinaceus_europaeus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	95	84.810	ENSELUG00000002520	efl1	99	75.254	Esox_lucius
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	95.122	ENSFCAG00000007741	EFL1	100	87.589	Felis_catus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	84.146	ENSFALG00000011103	EFL1	100	76.157	Ficedula_albicollis
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	98	98.765	ENSFDAG00000009023	EFL1	100	95.741	Fukomys_damarensis
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	80.488	ENSFHEG00000017795	efl1	100	66.755	Fundulus_heteroclitus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	88	87.671	ENSGMOG00000005041	efl1	100	63.862	Gadus_morhua
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	84.146	ENSGALG00000006225	EFL1	100	76.599	Gallus_gallus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	79.268	ENSGAFG00000004687	-	84	79.268	Gambusia_affinis
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	94	79.487	ENSGACG00000012495	efl1	99	65.603	Gasterosteus_aculeatus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	82.927	ENSGAGG00000022841	EFL1	100	78.371	Gopherus_agassizii
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	93	94.805	ENSGGOG00000008894	-	97	76.923	Gorilla_gorilla
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	97	84.503	ENSGGOG00000005017	EFL1	100	84.594	Gorilla_gorilla
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	94	83.333	ENSHBUG00000022667	efl1	100	67.342	Haplochromis_burtoni
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	100	100.000	ENSHGLG00000011798	EFL1	100	96.273	Heterocephalus_glaber_female
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	94	85.897	ENSHCOG00000007325	efl1	99	67.632	Hippocampus_comes
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	95	83.544	ENSIPUG00000023360	EFTUD1	99	67.316	Ictalurus_punctatus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	100	97.590	ENSSTOG00000022945	EFL1	100	88.209	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	98	96.296	ENSSTOG00000030430	-	75	96.296	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	93.902	ENSJJAG00000018598	Efl1	100	89.530	Jaculus_jaculus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	78.049	ENSKMAG00000002771	-	97	68.404	Kryptolebias_marmoratus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	95	67.778	ENSLBEG00000009564	-	80	67.778	Labrus_bergylta
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	94	84.615	ENSLBEG00000015269	efl1	99	66.870	Labrus_bergylta
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	100	81.928	ENSLACG00000016121	EFL1	100	70.815	Latimeria_chalumnae
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	96	83.750	ENSLOCG00000012862	efl1	99	69.833	Lepisosteus_oculatus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	97.561	ENSLAFG00000012504	EFL1	100	87.234	Loxodonta_africana
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	95.122	ENSMFAG00000032657	-	100	89.716	Macaca_fascicularis
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	95.122	ENSMMUG00000023353	EFL1	100	87.005	Macaca_mulatta
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	95.122	ENSMNEG00000041671	-	99	89.894	Macaca_nemestrina
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	95.122	ENSMLEG00000033735	EFL1	100	89.982	Mandrillus_leucophaeus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	94	85.897	ENSMAMG00000011336	efl1	99	68.366	Mastacembelus_armatus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	94	84.615	ENSMZEG00005003012	efl1	100	67.577	Maylandia_zebra
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	84.146	ENSMGAG00000007991	EFL1	100	76.916	Meleagris_gallopavo
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	95.122	ENSMAUG00000010709	Efl1	100	89.450	Mesocricetus_auratus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	96.341	ENSMICG00000027853	EFL1	100	90.434	Microcebus_murinus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	91.463	ENSMOCG00000007470	Efl1	100	88.209	Microtus_ochrogaster
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	100	61.233	ENSMMOG00000015370	efl1	100	61.233	Mola_mola
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	98	95.062	ENSMODG00000019386	EFL1	100	82.244	Monodelphis_domestica
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	80.488	ENSMALG00000018810	efl1	100	67.311	Monopterus_albus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	90.244	MGP_CAROLIEiJ_G0029936	Efl1	100	93.033	Mus_caroli
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	100	91.566	ENSMUSG00000038563	Efl1	100	93.162	Mus_musculus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	91.463	MGP_PahariEiJ_G0013157	Efl1	100	92.735	Mus_pahari
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	100	90.741	MGP_SPRETEiJ_G0031038	Efl1	99	90.741	Mus_spretus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	95.122	ENSMPUG00000015494	EFL1	100	86.968	Mustela_putorius_furo
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	63	96.154	ENSMLUG00000001470	-	100	93.651	Myotis_lucifugus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	95.122	ENSNGAG00000017740	Efl1	100	89.982	Nannospalax_galili
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	96	63.095	ENSNLEG00000031827	-	97	68.571	Nomascus_leucogenys
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	93	90.057	ENSNLEG00000010679	EFL1	100	90.057	Nomascus_leucogenys
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	64	92.453	ENSMEUG00000012049	-	70	92.453	Notamacropus_eugenii
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	93.902	ENSOPRG00000001514	-	100	91.765	Ochotona_princeps
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	63	92.683	ENSOPRG00000012488	-	63	92.683	Ochotona_princeps
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	96.341	ENSODEG00000016193	EFL1	100	93.611	Octodon_degus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	94	84.615	ENSONIG00000003394	efl1	100	67.222	Oreochromis_niloticus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	59	61.224	ENSOANG00000011993	-	100	75.158	Ornithorhynchus_anatinus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	100	92.771	ENSOCUG00000012163	EFL1	100	89.096	Oryctolagus_cuniculus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	63	61.687	ENSORLG00000020390	efl1	100	61.687	Oryzias_latipes
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	94	83.333	ENSORLG00000029029	-	72	83.333	Oryzias_latipes
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	94	84.615	ENSORLG00015012031	efl1	99	66.372	Oryzias_latipes_hsok
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	94	83.333	ENSOMEG00000022784	efl1	99	67.139	Oryzias_melastigma
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	95.122	ENSOARG00000014452	EFL1	100	89.027	Ovis_aries
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	93.902	ENSPPAG00000039672	EFL1	100	84.752	Pan_paniscus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	96.341	ENSPPAG00000027322	-	97	88.589	Pan_paniscus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	95.122	ENSPPRG00000002193	EFL1	100	87.589	Panthera_pardus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	95.122	ENSPTIG00000007053	EFL1	100	87.500	Panthera_tigris_altaica
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	93.902	ENSPTRG00000050545	-	97	80.483	Pan_troglodytes
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	96.341	ENSPTRG00000007374	EFL1	100	90.603	Pan_troglodytes
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	95.122	ENSPANG00000015635	-	98	89.894	Papio_anubis
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	81.928	ENSPKIG00000018456	efl1	100	67.168	Paramormyrops_kingsleyae
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	81.707	ENSPSIG00000007790	EFL1	100	77.496	Pelodiscus_sinensis
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	93	61.909	ENSPMAG00000002026	efl1	100	61.816	Petromyzon_marinus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	98	93.827	ENSPCIG00000004372	EFL1	100	82.317	Phascolarctos_cinereus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	93	81.818	ENSPFOG00000018687	efl1	99	66.667	Poecilia_formosa
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	93	81.818	ENSPLAG00000001988	efl1	99	66.755	Poecilia_latipinna
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	93	81.818	ENSPMEG00000000402	efl1	99	67.257	Poecilia_mexicana
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	93	81.818	ENSPREG00000022085	efl1	99	67.551	Poecilia_reticulata
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	96.341	ENSPPYG00000006724	EFL1	100	90.603	Pongo_abelii
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	64	92.453	ENSPPYG00000006744	-	100	72.222	Pongo_abelii
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	96.341	ENSPCAG00000011842	-	99	96.154	Procavia_capensis
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	95	98.734	ENSPCOG00000017475	-	92	82.904	Propithecus_coquereli
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	100	95.181	ENSPVAG00000003189	EFL1	100	88.475	Pteropus_vampyrus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	94	83.333	ENSPNYG00000019406	efl1	100	62.731	Pundamilia_nyererei
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	95	81.013	ENSPNAG00000012104	efl1	99	68.805	Pygocentrus_nattereri
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	92.683	ENSRNOG00000032723	Efl1	100	88.652	Rattus_norvegicus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	93.902	ENSRBIG00000040576	EFL1	100	89.805	Rhinopithecus_bieti
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	93.902	ENSRROG00000031475	EFL1	100	87.223	Rhinopithecus_roxellana
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	82	67.647	YNL163C	RIA1	88	46.781	Saccharomyces_cerevisiae
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	100	95.181	ENSSBOG00000018280	EFL1	100	89.982	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	98	93.827	ENSSHAG00000018863	EFL1	100	77.768	Sarcophilus_harrisii
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	94	84.615	ENSSFOG00015016244	efl1	100	69.277	Scleropages_formosus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	93	81.818	ENSSMAG00000016928	efl1	99	66.813	Scophthalmus_maximus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	94	85.897	ENSSDUG00000013271	efl1	99	68.134	Seriola_dumerili
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	94	85.897	ENSSLDG00000014655	efl1	99	68.398	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	84.146	ENSSPUG00000000941	EFL1	100	76.224	Sphenodon_punctatus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	94	84.615	ENSSPAG00000011885	efl1	99	67.428	Stegastes_partitus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	98	97.531	ENSSSCG00000001792	EFL1	100	89.805	Sus_scrofa
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	84.146	ENSTGUG00000007850	EFL1	100	77.414	Taeniopygia_guttata
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	84.146	ENSTNIG00000003399	efl1	100	60.122	Tetraodon_nigroviridis
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	73	96.296	ENSTBEG00000011804	EFL1	79	96.296	Tupaia_belangeri
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	100	87.954	ENSTTRG00000011243	EFL1	100	87.954	Tursiops_truncatus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	96.341	ENSUAMG00000022106	EFL1	100	90.071	Ursus_americanus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	96.341	ENSUMAG00000010303	EFL1	100	90.248	Ursus_maritimus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	98	96.296	ENSVPAG00000005735	EFL1	93	97.131	Vicugna_pacos
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	98	95.062	ENSVVUG00000004967	EFL1	100	89.184	Vulpes_vulpes
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	95	86.076	ENSXETG00000015701	EFL1	100	73.392	Xenopus_tropicalis
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	78.049	ENSXCOG00000011639	-	96	77.465	Xiphophorus_couchianus
ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	78.049	ENSXMAG00000023705	efl1	100	67.311	Xiphophorus_maculatus