EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSHGLG00100013432 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Heterocephalus_glaber_male
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 31785 bases
Position: chrJH170545.1:385217-417001
Accession: 101709324
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHGLP00100018222	GTP_EFTU	PF00009.27	3.4e-45	1	1
ENSHGLP00100018221	GTP_EFTU	PF00009.27	3.6e-45	1	1
ENSHGLP00100018222	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	9.7e-13	1	1
ENSHGLP00100018221	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1e-12	1	1
ENSHGLP00100018222	EFG_IV	PF03764.18	2.3e-23	1	1
ENSHGLP00100018221	EFG_IV	PF03764.18	2.5e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHGLT00100018411	-	7204	-	ENSHGLP00100018221	1001 (aa)	-	-
ENSHGLT00100018412	-	7117	-	ENSHGLP00100018222	972 (aa)	XP_004859249	G5BJ06

Gene Model

Click here to download ENSHGLG00100013432's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSHGLG00100013432's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	87	38.717	ENSHGLG00100015891	EEF2	99	38.717
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	74	34.507	ENSHGLG00100010319	EFTUD1	100	36.047
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	51	33.333	ENSHGLG00100013049	GFM1	58	33.333

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.868	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	91.975	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	91.975	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.971	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	98.971	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	88.477	ENSACIG00000009096	eftud2	100	88.477	Amphilophus_citrinellus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	87	88.118	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.118	Amphiprion_ocellaris
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	92.078	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	92.078	Amphiprion_percula
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	92.387	ENSATEG00000000457	eftud2	100	92.387	Anabas_testudineus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	99	93.821	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	93.821	Anas_platyrhynchos
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	96.914	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	96.914	Anolis_carolinensis
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.765	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	98.765	Aotus_nancymaae
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	91.975	ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.975	Astatotilapia_calliptera
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	91.300	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	92.025	Astyanax_mexicanus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	99.280	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	99.280	Bos_taurus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	99	70.145	WBGene00001166	eftu-2	99	69.731	Caenorhabditis_elegans
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.765	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	98.765	Callithrix_jacchus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.971	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	98.971	Canis_familiaris
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.971	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	98.971	Canis_lupus_dingo
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	99.280	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.280	Capra_hircus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.663	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	98.663	Carlito_syrichta
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.868	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	98.868	Cavia_aperea
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.868	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.868	Cavia_porcellus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.765	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	98.765	Cebus_capucinus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.765	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	98.765	Cercocebus_atys
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.868	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.868	Chinchilla_lanigera
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.765	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	98.765	Chlorocebus_sabaeus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	91	86.486	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.486	Choloepus_hoffmanni
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.148	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.148	Chrysemys_picta_bellii
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	77.949	ENSCING00000009372	-	100	77.846	Ciona_intestinalis
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	99	77.947	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.481	Ciona_savignyi
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.765	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	98.765	Colobus_angolensis_palliatus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	99.074	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.074	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	99.074	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	99.074	Cricetulus_griseus_crigri
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	91.358	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.358	Cynoglossus_semilaevis
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	92.284	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.181	Cyprinodon_variegatus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	90.750	ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.684	Danio_rerio
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.148	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	98.148	Dasypus_novemcinctus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	99.074	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.074	Dipodomys_ordii
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	74.974	FBgn0039566	CG4849	100	74.564	Drosophila_melanogaster
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	92	99.457	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	Echinops_telfairi
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	74	93.035	ENSEBUG00000004047	-	96	87.065	Eptatretus_burgeri
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.971	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	98.971	Equus_asinus_asinus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.868	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	98.868	Equus_caballus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	91.049	ENSELUG00000017169	eftud2	100	91.152	Esox_lucius
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.868	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	98.868	Felis_catus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	97.531	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.531	Ficedula_albicollis
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	99.588	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.588	Fukomys_damarensis
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	92.387	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	92.284	Fundulus_heteroclitus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	90.741	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.461	Gadus_morhua
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	97.428	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.168	Gallus_gallus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	92.387	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	92.284	Gambusia_affinis
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	91.461	ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.255	Gasterosteus_aculeatus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.765	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	98.765	Gorilla_gorilla
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	91.872	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.872	Haplochromis_burtoni
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	100.000	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	90.844	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.059	Hippocampus_comes
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	91.564	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.770	Ictalurus_punctatus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	93.107	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.107	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	96	99.252	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.252	Jaculus_jaculus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	91.564	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.358	Kryptolebias_marmoratus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	95	91.478	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	Labrus_bergylta
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	93.827	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.450	Latimeria_chalumnae
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	92.387	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	92.695	Lepisosteus_oculatus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.663	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	98.663	Loxodonta_africana
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.765	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	98.765	Macaca_fascicularis
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.765	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.765	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	98.765	Macaca_nemestrina
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.765	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	98.765	Mandrillus_leucophaeus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	92.181	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	92.181	Mastacembelus_armatus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	91.975	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	91.975	Maylandia_zebra
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	97.433	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.433	Meleagris_gallopavo
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	99.074	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	99.074	Mesocricetus_auratus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.765	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	98.765	Microcebus_murinus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	92	81.573	ENSMOCG00000017653	-	90	81.573	Microtus_ochrogaster
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	99.177	ENSMOCG00000009039	-	100	99.177	Microtus_ochrogaster
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	87	93.882	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	93.882	Mola_mola
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.663	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	98.663	Monodelphis_domestica
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	87	92.118	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.118	Monopterus_albus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	99.074	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	99.074	Mus_caroli
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	99.074	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	99.074	Mus_musculus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	99.074	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.074	Mus_pahari
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	99.074	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	99.074	Mus_spretus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	97	98.941	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	98.941	Mustela_putorius_furo
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.971	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	98.971	Myotis_lucifugus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	99.280	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.280	Nannospalax_galili
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	91.872	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.872	Neolamprologus_brichardi
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	97	96.918	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	96.918	Nomascus_leucogenys
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	94.959	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	96	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	90.741	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	90.741	Ochotona_princeps
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	93	79.885	ENSODEG00000003385	-	100	79.885	Octodon_degus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.765	ENSODEG00000018041	-	100	98.765	Octodon_degus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	91.975	ENSONIG00000000912	eftud2	100	91.975	Oreochromis_niloticus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.971	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	98.971	Oryctolagus_cuniculus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	91.358	ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.358	Oryzias_latipes
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	91.461	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.461	Oryzias_latipes_hni
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	91.461	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.355	Oryzias_latipes_hsok
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	96.605	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	96.605	Otolemur_garnettii
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	99.280	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	99.280	Ovis_aries
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.868	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	98.868	Pan_paniscus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.971	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	98.971	Panthera_pardus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.971	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	98.971	Panthera_tigris_altaica
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.868	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	98.868	Pan_troglodytes
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.765	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	98.765	Papio_anubis
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	93	96.803	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.803	Pelodiscus_sinensis
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	84.053	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	84.671	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	99.280	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	99.280	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.663	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	98.663	Phascolarctos_cinereus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	92.387	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	92.284	Poecilia_formosa
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	92.387	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	92.284	Poecilia_latipinna
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	92.387	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	92.284	Poecilia_mexicana
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	97.325	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	97.325	Pongo_abelii
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	94.444	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	96	100.000	Procavia_capensis
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.663	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	98.663	Propithecus_coquereli
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	94.342	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.342	Pteropus_vampyrus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	91.872	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	91.872	Pundamilia_nyererei
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	92.078	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	91.975	Pygocentrus_nattereri
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	99.177	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.177	Rattus_norvegicus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.663	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	98.663	Rhinopithecus_bieti
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.663	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	98.663	Rhinopithecus_roxellana
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	97	33.893	YKL173W	SNU114	97	33.564	Saccharomyces_cerevisiae
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.765	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	98.765	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	97	98.721	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	98.721	Sarcophilus_harrisii
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	91.152	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.872	Scleropages_formosus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	91.564	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.564	Scophthalmus_maximus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	92.078	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.078	Seriola_dumerili
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	92.181	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	92.181	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	90.329	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	90.329	Sorex_araneus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	97.016	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.016	Sphenodon_punctatus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	92.181	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	92.181	Stegastes_partitus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.971	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	98.971	Sus_scrofa
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	84	96.959	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	96.959	Taeniopygia_guttata
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	91.152	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.152	Takifugu_rubripes
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	86.680	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.680	Tetraodon_nigroviridis
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	93.107	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.107	Tupaia_belangeri
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	90.535	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.535	Tursiops_truncatus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	97.844	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	97.844	Ursus_americanus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.971	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	98.971	Ursus_maritimus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.971	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	98.971	Vulpes_vulpes
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	96	94.872	ENSXETG00000003394	eftud2	98	95.865	Xenopus_tropicalis
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	81	93.495	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.622	Xiphophorus_couchianus
ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	92.387	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.284	Xiphophorus_maculatus