EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSHGLG00100014722 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Heterocephalus_glaber_male
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 35462 bases
Position: chrJH170405.1:472425-507886
Accession: 101696385
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHGLP00100019972	SYF2	PF08231.12	1e-53	1	1
ENSHGLP00100019971	SYF2	PF08231.12	1.2e-51	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHGLT00100020184	-	2274	-	ENSHGLP00100019972	244 (aa)	XP_012929870	A0A0P6JFT7
ENSHGLT00100020183	-	3505	-	ENSHGLP00100019971	244 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSHGLG00100014722's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSHGLG00100014722's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	93.443	ENSG00000117614	SYF2	100	93.443	Homo_sapiens
ENSHGLG00100014722	SYF2	91	83.784	ENSAPOG00000001174	syf2	93	83.784	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHGLG00100014722	SYF2	97	92.437	ENSAMEG00000010115	-	98	92.437	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHGLG00100014722	SYF2	80	95.897	ENSAMEG00000010134	-	100	95.897	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHGLG00100014722	SYF2	91	81.532	ENSACIG00000023688	syf2	89	81.532	Amphilophus_citrinellus
ENSHGLG00100014722	SYF2	89	78.899	ENSAOCG00000010912	syf2	64	82.927	Amphiprion_ocellaris
ENSHGLG00100014722	SYF2	91	84.234	ENSAOCG00000022046	syf2	94	84.234	Amphiprion_ocellaris
ENSHGLG00100014722	SYF2	91	84.234	ENSAPEG00000018858	syf2	86	84.234	Amphiprion_percula
ENSHGLG00100014722	SYF2	89	83.410	ENSATEG00000007745	syf2	93	82.432	Anabas_testudineus
ENSHGLG00100014722	SYF2	82	89.500	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.500	Anas_platyrhynchos
ENSHGLG00100014722	SYF2	84	85.784	ENSACAG00000013653	-	100	85.784	Anolis_carolinensis
ENSHGLG00100014722	SYF2	68	76.048	ENSACAG00000026777	-	94	76.433	Anolis_carolinensis
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	93.852	ENSANAG00000032473	SYF2	100	93.852	Aotus_nancymaae
ENSHGLG00100014722	SYF2	91	81.081	ENSACLG00000019916	syf2	100	76.639	Astatotilapia_calliptera
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	77.049	ENSAMXG00000004051	syf2	100	77.049	Astyanax_mexicanus
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	92.653	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	93.644	Bos_taurus
ENSHGLG00100014722	SYF2	85	50.952	WBGene00019402	syf-2	99	47.414	Caenorhabditis_elegans
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	93.852	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	93.852	Callithrix_jacchus
ENSHGLG00100014722	SYF2	98	83.613	ENSCAFG00000030331	-	97	84.322	Canis_familiaris
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	91.057	ENSCAFG00000012895	-	100	92.276	Canis_familiaris
ENSHGLG00100014722	SYF2	74	87.912	ENSCAFG00020021094	-	83	96.154	Canis_lupus_dingo
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	91.057	ENSCAFG00020021091	-	100	92.276	Canis_lupus_dingo
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	92.653	ENSCHIG00000020874	SYF2	100	92.653	Capra_hircus
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	92.213	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	92.213	Carlito_syrichta
ENSHGLG00100014722	SYF2	81	97.980	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	Cavia_aperea
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	94.672	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	94.672	Cavia_porcellus
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	93.852	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	93.852	Cebus_capucinus
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	93.033	ENSCATG00000026917	SYF2	100	93.033	Cercocebus_atys
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	96.311	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	96.311	Chinchilla_lanigera
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	93.033	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	93.033	Chlorocebus_sabaeus
ENSHGLG00100014722	SYF2	71	79.310	ENSCHOG00000005273	-	96	79.310	Choloepus_hoffmanni
ENSHGLG00100014722	SYF2	92	89.286	ENSCPBG00000025073	SYF2	99	84.211	Chrysemys_picta_bellii
ENSHGLG00100014722	SYF2	86	53.052	ENSCING00000003017	-	89	52.582	Ciona_intestinalis
ENSHGLG00100014722	SYF2	86	51.174	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.174	Ciona_savignyi
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	80.328	ENSCANG00000037322	SYF2	100	80.328	Colobus_angolensis_palliatus
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	90.164	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.164	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSHGLG00100014722	SYF2	80	95.408	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	94.975	Cricetulus_griseus_crigri
ENSHGLG00100014722	SYF2	89	78.440	ENSCSEG00000000117	syf2	93	77.130	Cynoglossus_semilaevis
ENSHGLG00100014722	SYF2	91	81.900	ENSCVAG00000019543	syf2	100	77.049	Cyprinodon_variegatus
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	77.869	ENSDARG00000004706	syf2	100	77.869	Danio_rerio
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	92.245	ENSDNOG00000047605	SYF2	100	92.245	Dasypus_novemcinctus
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	92.623	ENSDORG00000001274	Syf2	100	92.623	Dipodomys_ordii
ENSHGLG00100014722	SYF2	93	55.652	FBgn0033556	CG12343	99	55.652	Drosophila_melanogaster
ENSHGLG00100014722	SYF2	91	76.923	ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.522	Echinops_telfairi
ENSHGLG00100014722	SYF2	81	59.204	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.204	Eptatretus_burgeri
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	92.653	ENSEASG00005004224	-	100	92.653	Equus_asinus_asinus
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	81.148	ENSEASG00005004232	-	100	81.148	Equus_asinus_asinus
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	92.653	ENSECAG00000012023	-	100	92.653	Equus_caballus
ENSHGLG00100014722	SYF2	96	93.220	ENSECAG00000010440	-	99	93.220	Equus_caballus
ENSHGLG00100014722	SYF2	75	78.689	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	78.689	Erinaceus_europaeus
ENSHGLG00100014722	SYF2	94	82.051	ENSELUG00000003465	syf2	98	82.051	Esox_lucius
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	93.089	ENSFCAG00000010324	-	85	93.089	Felis_catus
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	92.276	ENSFCAG00000043095	-	100	92.276	Felis_catus
ENSHGLG00100014722	SYF2	84	86.275	ENSFALG00000000460	SYF2	93	81.624	Ficedula_albicollis
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	95.902	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	95.902	Fukomys_damarensis
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	60.887	ENSFHEG00000007238	syf2	99	66.964	Fundulus_heteroclitus
ENSHGLG00100014722	SYF2	89	83.028	ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.186	Gadus_morhua
ENSHGLG00100014722	SYF2	92	88.839	ENSGALG00000013639	SYF2	100	81.746	Gallus_gallus
ENSHGLG00100014722	SYF2	91	79.279	ENSGAFG00000019435	syf2	93	79.279	Gambusia_affinis
ENSHGLG00100014722	SYF2	88	83.721	ENSGACG00000007305	syf2	99	76.763	Gasterosteus_aculeatus
ENSHGLG00100014722	SYF2	92	89.732	ENSGAGG00000010670	SYF2	92	88.646	Gopherus_agassizii
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	93.852	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	93.852	Gorilla_gorilla
ENSHGLG00100014722	SYF2	96	78.632	ENSHBUG00000020477	syf2	99	78.632	Haplochromis_burtoni
ENSHGLG00100014722	SYF2	93	87.225	ENSHGLG00000004304	-	100	82.787	Heterocephalus_glaber_female
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	100.000	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	78.279	ENSHCOG00000012904	syf2	78	78.279	Hippocampus_comes
ENSHGLG00100014722	SYF2	89	83.945	ENSIPUG00000019859	syf2	92	83.945	Ictalurus_punctatus
ENSHGLG00100014722	SYF2	60	96.575	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSHGLG00100014722	SYF2	82	96.985	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	Jaculus_jaculus
ENSHGLG00100014722	SYF2	91	81.532	ENSKMAG00000013856	syf2	94	81.532	Kryptolebias_marmoratus
ENSHGLG00100014722	SYF2	90	83.562	ENSLBEG00000014425	syf2	94	82.511	Labrus_bergylta
ENSHGLG00100014722	SYF2	92	83.556	ENSLACG00000012064	SYF2	95	83.556	Latimeria_chalumnae
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	80.738	ENSLOCG00000002728	syf2	95	80.738	Lepisosteus_oculatus
ENSHGLG00100014722	SYF2	75	65.217	ENSLAFG00000030814	-	100	65.217	Loxodonta_africana
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	92.245	ENSLAFG00000023150	-	100	92.245	Loxodonta_africana
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	93.443	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	93.443	Macaca_fascicularis
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	93.033	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	93.033	Macaca_mulatta
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	93.443	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	93.443	Macaca_nemestrina
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	93.033	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	93.033	Mandrillus_leucophaeus
ENSHGLG00100014722	SYF2	89	82.028	ENSMAMG00000010403	syf2	97	75.820	Mastacembelus_armatus
ENSHGLG00100014722	SYF2	94	78.298	ENSMZEG00005006429	syf2	99	78.298	Maylandia_zebra
ENSHGLG00100014722	SYF2	82	89.950	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.950	Meleagris_gallopavo
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	90.984	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.984	Mesocricetus_auratus
ENSHGLG00100014722	SYF2	82	97.487	ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	Microcebus_murinus
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	91.803	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	91.803	Microtus_ochrogaster
ENSHGLG00100014722	SYF2	96	76.923	ENSMMOG00000002396	syf2	97	76.496	Mola_mola
ENSHGLG00100014722	SYF2	92	89.381	ENSMODG00000013951	-	99	89.381	Monodelphis_domestica
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	77.551	ENSMALG00000010706	syf2	100	77.959	Monopterus_albus
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	90.574	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	90.574	Mus_caroli
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	90.574	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	90.574	Mus_musculus
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	90.574	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	90.574	Mus_pahari
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	90.574	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	90.574	Mus_spretus
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	91.870	ENSMPUG00000015802	-	100	91.870	Mustela_putorius_furo
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	91.870	ENSMPUG00000015801	-	100	91.870	Mustela_putorius_furo
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	89.754	ENSMLUG00000001885	SYF2	97	89.754	Myotis_lucifugus
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	92.308	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.308	Nannospalax_galili
ENSHGLG00100014722	SYF2	95	71.186	ENSNBRG00000010720	syf2	99	71.186	Neolamprologus_brichardi
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	93.852	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	93.852	Nomascus_leucogenys
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	90.984	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	90.984	Ochotona_princeps
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	84.016	ENSODEG00000014338	-	99	85.532	Octodon_degus
ENSHGLG00100014722	SYF2	98	94.118	ENSODEG00000017664	-	99	95.319	Octodon_degus
ENSHGLG00100014722	SYF2	91	81.081	ENSONIG00000008213	syf2	100	76.639	Oreochromis_niloticus
ENSHGLG00100014722	SYF2	83	90.594	ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.594	Ornithorhynchus_anatinus
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	95.492	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	95.492	Oryctolagus_cuniculus
ENSHGLG00100014722	SYF2	94	80.000	ENSORLG00000028820	syf2	99	80.000	Oryzias_latipes
ENSHGLG00100014722	SYF2	91	81.982	ENSORLG00020018333	syf2	94	81.982	Oryzias_latipes_hni
ENSHGLG00100014722	SYF2	89	83.028	ENSORLG00015014665	syf2	92	83.028	Oryzias_latipes_hsok
ENSHGLG00100014722	SYF2	91	82.883	ENSOMEG00000013911	syf2	93	82.883	Oryzias_melastigma
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	94.672	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	94.672	Otolemur_garnettii
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	92.713	ENSOARG00000006348	-	100	92.713	Ovis_aries
ENSHGLG00100014722	SYF2	80	67.179	ENSOARG00000006269	-	100	67.179	Ovis_aries
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	93.852	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	93.852	Pan_paniscus
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	92.276	ENSPPRG00000001651	-	100	92.276	Panthera_pardus
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	91.870	ENSPPRG00000001638	-	100	91.870	Panthera_pardus
ENSHGLG00100014722	SYF2	93	95.133	ENSPTIG00000005711	-	80	98.624	Panthera_tigris_altaica
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	92.276	ENSPTIG00000007036	-	100	92.276	Panthera_tigris_altaica
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	93.852	ENSPTRG00000000352	SYF2	100	93.852	Pan_troglodytes
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	93.443	ENSPANG00000008139	SYF2	100	93.443	Papio_anubis
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	77.869	ENSPKIG00000008130	syf2	100	77.869	Paramormyrops_kingsleyae
ENSHGLG00100014722	SYF2	96	85.532	ENSPSIG00000011816	SYF2	91	85.532	Pelodiscus_sinensis
ENSHGLG00100014722	SYF2	95	79.310	ENSPMGG00000008755	syf2	90	79.310	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	91.393	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	91.393	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSHGLG00100014722	SYF2	92	94.196	ENSPCIG00000014235	SYF2	100	87.600	Phascolarctos_cinereus
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	74.590	ENSPFOG00000004116	syf2	99	74.590	Poecilia_formosa
ENSHGLG00100014722	SYF2	96	77.350	ENSPLAG00000006691	syf2	99	77.350	Poecilia_latipinna
ENSHGLG00100014722	SYF2	98	73.750	ENSPMEG00000011684	syf2	99	73.750	Poecilia_mexicana
ENSHGLG00100014722	SYF2	89	81.481	ENSPREG00000003009	syf2	99	76.667	Poecilia_reticulata
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	93.852	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	93.852	Pongo_abelii
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	63.525	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	63.115	Propithecus_coquereli
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	80.408	ENSPVAG00000005841	SYF2	100	80.408	Pteropus_vampyrus
ENSHGLG00100014722	SYF2	91	81.081	ENSPNYG00000004979	syf2	99	77.021	Pundamilia_nyererei
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	80.738	ENSPNAG00000015570	syf2	100	80.738	Pygocentrus_nattereri
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	90.574	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	90.574	Rattus_norvegicus
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	90.984	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	90.984	Rhinopithecus_bieti
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	93.443	ENSRROG00000001347	SYF2	100	93.443	Rhinopithecus_roxellana
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	92.623	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	92.623	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	86.345	ENSSHAG00000015630	-	100	87.149	Sarcophilus_harrisii
ENSHGLG00100014722	SYF2	84	94.660	ENSSHAG00000007152	-	100	94.660	Sarcophilus_harrisii
ENSHGLG00100014722	SYF2	91	83.710	ENSSFOG00015023647	syf2	93	83.710	Scleropages_formosus
ENSHGLG00100014722	SYF2	91	81.081	ENSSMAG00000009867	syf2	93	81.081	Scophthalmus_maximus
ENSHGLG00100014722	SYF2	89	83.028	ENSSDUG00000013072	syf2	100	76.639	Seriola_dumerili
ENSHGLG00100014722	SYF2	89	83.028	ENSSLDG00000012677	syf2	100	76.639	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSHGLG00100014722	SYF2	99	72.428	ENSSARG00000012889	SYF2	99	72.428	Sorex_araneus
ENSHGLG00100014722	SYF2	94	86.900	ENSSPUG00000005251	SYF2	91	86.900	Sphenodon_punctatus
ENSHGLG00100014722	SYF2	91	82.432	ENSSPAG00000009626	syf2	93	82.432	Stegastes_partitus
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	92.653	ENSSSCG00000037481	SYF2	100	92.653	Sus_scrofa
ENSHGLG00100014722	SYF2	61	58.940	ENSTGUG00000001126	SYF2	87	58.192	Taeniopygia_guttata
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	76.230	ENSTRUG00000001499	syf2	95	76.349	Takifugu_rubripes
ENSHGLG00100014722	SYF2	91	79.730	ENSTNIG00000016912	syf2	99	79.730	Tetraodon_nigroviridis
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	70.082	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.672	Tupaia_belangeri
ENSHGLG00100014722	SYF2	99	91.358	ENSTTRG00000003550	SYF2	99	92.593	Tursiops_truncatus
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	91.057	ENSUAMG00000002897	SYF2	100	91.057	Ursus_americanus
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	90.244	ENSUMAG00000013108	SYF2	100	91.463	Ursus_maritimus
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	92.653	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	92.653	Vicugna_pacos
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	91.057	ENSVVUG00000027175	-	100	92.276	Vulpes_vulpes
ENSHGLG00100014722	SYF2	100	87.903	ENSVVUG00000027181	-	100	89.113	Vulpes_vulpes
ENSHGLG00100014722	SYF2	97	82.278	ENSXETG00000022797	syf2	95	82.278	Xenopus_tropicalis
ENSHGLG00100014722	SYF2	88	81.395	ENSXMAG00000022698	syf2	93	79.279	Xiphophorus_maculatus