EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSHGLG00100016848 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: MSI1
Alias: -
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Heterocephalus_glaber_male
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 24617 bases
Position: chrJH168708.1:171145-195761
Accession: 7330
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSHGLP00100022910	RRM_1	PF00076.22	6.7e-29	1	2
ENSHGLP00100022910	RRM_1	PF00076.22	6.7e-29	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSHGLT00100023150	MSI1-201	4788	-	ENSHGLP00100022910	328 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSHGLG00100016848	MSI1	68	61.607	ENSHGLG00100003744	MSI2	100	65.066
ENSHGLG00100016848	MSI1	51	34.848	ENSHGLG00100014781	TARDBP	54	33.553
ENSHGLG00100016848	MSI1	51	41.250	ENSHGLG00100002588	DAZAP1	51	40.860
ENSHGLG00100016848	MSI1	57	35.567	ENSHGLG00100017719	-	77	34.940
ENSHGLG00100016848	MSI1	50	40.000	ENSHGLG00100001336	-	51	40.000
ENSHGLG00100016848	MSI1	50	43.103	ENSHGLG00100005996	HNRNPD	90	42.169
ENSHGLG00100016848	MSI1	50	41.212	ENSHGLG00100006677	-	52	41.212

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	ENSG00000135097	MSI1	98	99.695	Homo_sapiens
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	85.061	ENSAPOG00000003191	MSI1	94	85.061	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	85.061	ENSAPOG00000023458	-	94	85.061	Acanthochromis_polyacanthus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	81.053	ENSAMEG00000013302	MSI1	100	81.053	Ailuropoda_melanoleuca
ENSHGLG00100016848	MSI1	96	81.587	ENSACIG00000017754	-	78	81.587	Amphilophus_citrinellus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	76.220	ENSAOCG00000009031	-	95	76.524	Amphiprion_ocellaris
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	85.061	ENSAOCG00000003804	MSI1	94	85.061	Amphiprion_ocellaris
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	85.061	ENSAPEG00000003245	MSI1	94	85.061	Amphiprion_percula
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	85.061	ENSAPEG00000006857	-	79	85.061	Amphiprion_percula
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	84.756	ENSATEG00000017059	MSI1	95	84.756	Anabas_testudineus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	82.067	ENSATEG00000023779	-	93	82.067	Anabas_testudineus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	96.646	ENSACAG00000002762	MSI1	94	96.646	Anolis_carolinensis
ENSHGLG00100016848	MSI1	80	95.833	ENSANAG00000027901	-	92	95.833	Aotus_nancymaae
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	ENSANAG00000027151	MSI1	98	99.695	Aotus_nancymaae
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	84.451	ENSACLG00000000117	-	100	84.451	Astatotilapia_calliptera
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	84.451	ENSACLG00000011230	MSI1	94	84.451	Astatotilapia_calliptera
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	83.537	ENSAMXG00000038960	msi1	76	83.537	Astyanax_mexicanus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	ENSBTAG00000009800	MSI1	100	99.695	Bos_taurus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	ENSCJAG00000008578	MSI1	98	99.695	Callithrix_jacchus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.390	ENSCAFG00000010283	MSI1	98	99.390	Canis_familiaris
ENSHGLG00100016848	MSI1	99	99.678	ENSCAFG00020020585	MSI1	100	99.678	Canis_lupus_dingo
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	93.731	ENSCHIG00000024304	MSI1	98	93.731	Capra_hircus
ENSHGLG00100016848	MSI1	99	99.694	ENSTSYG00000033949	MSI1	95	99.694	Carlito_syrichta
ENSHGLG00100016848	MSI1	99	89.457	ENSCAPG00000003919	MSI1	89	89.457	Cavia_aperea
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	ENSCPOG00000012361	MSI1	100	99.695	Cavia_porcellus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	ENSCCAG00000035567	MSI1	98	99.695	Cebus_capucinus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	ENSCATG00000030019	MSI1	98	99.695	Cercocebus_atys
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	ENSCLAG00000011329	MSI1	100	99.695	Chinchilla_lanigera
ENSHGLG00100016848	MSI1	72	95.473	ENSCSAG00000002265	MSI1	89	95.473	Chlorocebus_sabaeus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	95.732	ENSCPBG00000011349	MSI1	94	95.732	Chrysemys_picta_bellii
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	ENSCANG00000040651	MSI1	100	99.695	Colobus_angolensis_palliatus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	ENSCGRG00001018883	Msi1	98	99.695	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	ENSCGRG00000002191	Msi1	73	99.695	Cricetulus_griseus_crigri
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	84.756	ENSCSEG00000005834	-	94	84.756	Cynoglossus_semilaevis
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	83.537	ENSCSEG00000008352	-	94	83.537	Cynoglossus_semilaevis
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	77.134	ENSCSEG00000011032	MSI1	100	77.134	Cynoglossus_semilaevis
ENSHGLG00100016848	MSI1	70	68.398	ENSCVAG00000017463	-	89	68.398	Cyprinodon_variegatus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	85.061	ENSCVAG00000009100	MSI1	94	85.061	Cyprinodon_variegatus
ENSHGLG00100016848	MSI1	88	81.659	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	89	81.659	Danio_rerio
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	81.098	ENSDARG00000010710	msi1	100	84.581	Danio_rerio
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	89.634	ENSDNOG00000005713	MSI1	91	89.634	Dasypus_novemcinctus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	ENSDORG00000005610	Msi1	93	99.695	Dipodomys_ordii
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	95.427	ENSETEG00000004756	MSI1	100	95.427	Echinops_telfairi
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	ENSEASG00005004736	MSI1	98	99.695	Equus_asinus_asinus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	ENSECAG00000017526	MSI1	98	99.695	Equus_caballus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	80.183	ENSELUG00000023280	-	100	79.878	Esox_lucius
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	79.310	ENSELUG00000023219	MSI1	92	79.310	Esox_lucius
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	ENSFCAG00000011007	MSI1	98	99.695	Felis_catus
ENSHGLG00100016848	MSI1	99	95.498	ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.498	Ficedula_albicollis
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	100.000	ENSFDAG00000019586	MSI1	100	100.000	Fukomys_damarensis
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	85.061	ENSFHEG00000003560	-	94	85.061	Fundulus_heteroclitus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	85.366	ENSFHEG00000022446	MSI1	94	85.366	Fundulus_heteroclitus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	76.524	ENSGMOG00000017838	-	90	76.524	Gadus_morhua
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	82.622	ENSGMOG00000001006	MSI1	94	82.317	Gadus_morhua
ENSHGLG00100016848	MSI1	99	94.872	ENSGALG00000007227	MSI1	96	85.994	Gallus_gallus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	68.085	ENSGAFG00000005860	-	89	68.085	Gambusia_affinis
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	84.451	ENSGAFG00000021522	MSI1	94	84.451	Gambusia_affinis
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	83.841	ENSGACG00000012679	MSI1	94	83.841	Gasterosteus_aculeatus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	80.793	ENSGACG00000008674	-	94	80.793	Gasterosteus_aculeatus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	95.732	ENSGAGG00000016037	MSI1	94	95.732	Gopherus_agassizii
ENSHGLG00100016848	MSI1	99	99.682	ENSGGOG00000010328	MSI1	100	99.682	Gorilla_gorilla
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	84.451	ENSHBUG00000021921	MSI1	94	84.451	Haplochromis_burtoni
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	84.451	ENSHBUG00000011841	-	94	84.451	Haplochromis_burtoni
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	100.000	ENSHGLG00000012782	MSI1	98	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	79.878	ENSHCOG00000012019	MSI1	100	79.878	Hippocampus_comes
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	83.537	ENSHCOG00000012067	-	89	83.537	Hippocampus_comes
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	82.927	ENSIPUG00000001976	msi1	99	79.268	Ictalurus_punctatus
ENSHGLG00100016848	MSI1	99	99.678	ENSSTOG00000009799	MSI1	100	99.678	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	ENSJJAG00000010463	Msi1	98	99.695	Jaculus_jaculus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	82.622	ENSJJAG00000010643	-	94	82.317	Jaculus_jaculus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	82.622	ENSKMAG00000019877	-	100	82.622	Kryptolebias_marmoratus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	84.146	ENSKMAG00000011251	MSI1	94	84.146	Kryptolebias_marmoratus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	84.451	ENSLBEG00000001375	-	94	84.451	Labrus_bergylta
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	84.451	ENSLBEG00000008789	MSI1	94	84.451	Labrus_bergylta
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	86.585	ENSLACG00000018287	MSI1	100	86.585	Latimeria_chalumnae
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	89.091	ENSLAFG00000009412	MSI1	100	89.091	Loxodonta_africana
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	ENSMFAG00000001798	MSI1	100	99.695	Macaca_fascicularis
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	ENSMMUG00000031527	MSI1	96	99.695	Macaca_mulatta
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	ENSMNEG00000040034	MSI1	98	99.695	Macaca_nemestrina
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	ENSMLEG00000003921	MSI1	100	99.695	Mandrillus_leucophaeus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	85.061	ENSMAMG00000018426	-	94	85.061	Mastacembelus_armatus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	83.841	ENSMAMG00000002279	MSI1	94	83.841	Mastacembelus_armatus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	84.451	ENSMZEG00005000340	-	94	84.451	Maylandia_zebra
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	84.451	ENSMZEG00005026892	MSI1	94	84.451	Maylandia_zebra
ENSHGLG00100016848	MSI1	63	98.225	ENSMGAG00000016518	-	100	98.225	Meleagris_gallopavo
ENSHGLG00100016848	MSI1	70	99.563	ENSMAUG00000016820	Msi1	100	99.563	Mesocricetus_auratus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	ENSMICG00000033181	MSI1	98	99.695	Microcebus_murinus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.390	ENSMOCG00000002286	Msi1	98	99.390	Microtus_ochrogaster
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	81.707	ENSMMOG00000012265	-	99	81.707	Mola_mola
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	75.000	ENSMMOG00000010492	MSI1	96	75.000	Mola_mola
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	67.674	ENSMODG00000003189	-	100	67.674	Monodelphis_domestica
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	84.451	ENSMALG00000017889	MSI1	94	84.451	Monopterus_albus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	84.146	ENSMALG00000001426	-	100	84.146	Monopterus_albus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.085	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	98	99.085	Mus_caroli
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.085	ENSMUSG00000054256	Msi1	98	99.085	Mus_musculus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	98.780	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	98	98.780	Mus_pahari
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.085	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	98	99.085	Mus_spretus
ENSHGLG00100016848	MSI1	99	99.678	ENSMPUG00000003168	MSI1	100	99.678	Mustela_putorius_furo
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	89.851	ENSMLUG00000010313	MSI1	100	89.851	Myotis_lucifugus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	ENSNGAG00000014508	Msi1	91	99.695	Nannospalax_galili
ENSHGLG00100016848	MSI1	97	77.043	ENSNBRG00000018012	MSI1	99	77.043	Neolamprologus_brichardi
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	84.451	ENSNBRG00000000841	-	94	84.451	Neolamprologus_brichardi
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	89.329	ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.329	Nomascus_leucogenys
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	77.744	ENSMEUG00000015759	MSI1	100	77.744	Notamacropus_eugenii
ENSHGLG00100016848	MSI1	96	91.746	ENSOPRG00000016879	MSI1	100	91.746	Ochotona_princeps
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	ENSODEG00000006328	MSI1	100	99.695	Octodon_degus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	84.756	ENSONIG00000019452	-	94	84.756	Oreochromis_niloticus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	84.451	ENSONIG00000011182	MSI1	94	84.451	Oreochromis_niloticus
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ENSHGLG00100016848	MSI1	100	85.061	ENSORLG00000019978	-	94	85.061	Oryzias_latipes
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	85.061	ENSORLG00020001208	-	67	85.061	Oryzias_latipes_hni
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ENSHGLG00100016848	MSI1	100	85.061	ENSORLG00015013672	-	71	81.402	Oryzias_latipes_hsok
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ENSHGLG00100016848	MSI1	100	85.976	ENSOMEG00000002272	-	97	85.976	Oryzias_melastigma
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ENSHGLG00100016848	MSI1	88	92.140	ENSPSIG00000009621	-	100	92.140	Pelodiscus_sinensis
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ENSHGLG00100016848	MSI1	96	80.635	ENSPMGG00000000514	MSI1	97	80.635	Periophthalmus_magnuspinnatus
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ENSHGLG00100016848	MSI1	100	83.232	ENSPNAG00000019337	msi1	94	83.232	Pygocentrus_nattereri
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ENSHGLG00100016848	MSI1	100	81.098	ENSSLDG00000018706	-	96	82.371	Seriola_lalandi_dorsalis
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ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.390	ENSSSCG00000029365	MSI1	100	99.357	Sus_scrofa
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ENSHGLG00100016848	MSI1	100	75.610	ENSTRUG00000015636	-	79	75.610	Takifugu_rubripes
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	60.819	ENSTNIG00000019814	-	95	60.819	Tetraodon_nigroviridis
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ENSHGLG00100016848	MSI1	99	89.011	ENSTBEG00000007182	MSI1	100	89.011	Tupaia_belangeri
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ENSHGLG00100016848	MSI1	71	92.237	ENSUAMG00000015514	MSI1	94	92.237	Ursus_americanus
ENSHGLG00100016848	MSI1	99	92.089	ENSUMAG00000006176	MSI1	90	92.089	Ursus_maritimus
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ENSHGLG00100016848	MSI1	100	91.489	ENSXETG00000012216	msi1	95	91.541	Xenopus_tropicalis
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	70.427	ENSXCOG00000017605	MSI1	89	70.427	Xiphophorus_couchianus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	85.061	ENSXMAG00000027103	MSI1	95	78.419	Xiphophorus_maculatus
ENSHGLG00100016848	MSI1	100	84.756	ENSXMAG00000018237	-	94	84.756	Xiphophorus_maculatus