EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSIPUG00000001185 (Gene tree)
Gene ID: 108266422
Gene Symbol: ipo4
Alias: si:ch211-196f5.1
Full Name: importin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Ictalurus_punctatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 15469 bases
Position: chr1:4594643-4610111
Accession: 108266422
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSIPUP00000001708	IBN_N	PF03810.19	1.6e-14	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSIPUT00000001790	-	6098	XM_017469691	ENSIPUP00000001708	1085 (aa)	XP_017325180	A0A2D0R5U8

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	46.884	ENSG00000196497	IPO4	99	47.016	Homo_sapiens
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	72.284	ENSAPOG00000019018	ipo4	100	72.284	Acanthochromis_polyacanthus
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	45.741	ENSAMEG00000016271	IPO4	84	45.833	Ailuropoda_melanoleuca
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	71.912	ENSACIG00000004246	ipo4	100	71.993	Amphilophus_citrinellus
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	74.404	ENSAOCG00000004773	ipo4	100	74.495	Amphiprion_ocellaris
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	74.771	ENSAPEG00000002112	ipo4	100	74.862	Amphiprion_percula
ENSIPUG00000001185	ipo4	92	77.345	ENSATEG00000017082	ipo4	99	77.146	Anabas_testudineus
ENSIPUG00000001185	ipo4	84	47.198	ENSACAG00000003973	-	97	46.912	Anolis_carolinensis
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	46.698	ENSANAG00000037973	IPO4	99	46.777	Aotus_nancymaae
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	71.731	ENSACLG00000019742	ipo4	100	71.823	Astatotilapia_calliptera
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	79.078	ENSAMXG00000037878	ipo4	100	79.355	Astyanax_mexicanus
ENSIPUG00000001185	ipo4	98	47.059	ENSBTAG00000002707	IPO4	99	46.809	Bos_taurus
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	47.163	ENSCJAG00000006937	IPO4	99	47.238	Callithrix_jacchus
ENSIPUG00000001185	ipo4	98	47.757	ENSCAFG00000012049	IPO4	99	47.870	Canis_familiaris
ENSIPUG00000001185	ipo4	98	47.344	ENSCAFG00020002873	IPO4	99	46.175	Canis_lupus_dingo
ENSIPUG00000001185	ipo4	97	47.125	ENSCHIG00000009413	IPO4	96	46.852	Capra_hircus
ENSIPUG00000001185	ipo4	98	46.910	ENSTSYG00000002643	IPO4	99	47.081	Carlito_syrichta
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	47.407	ENSCPOG00000014783	IPO4	99	47.456	Cavia_porcellus
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	47.070	ENSCCAG00000037929	IPO4	99	47.145	Cebus_capucinus
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	46.977	ENSCATG00000040395	IPO4	99	47.145	Cercocebus_atys
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	47.500	ENSCLAG00000012817	IPO4	99	47.549	Chinchilla_lanigera
ENSIPUG00000001185	ipo4	90	46.294	ENSCPBG00000025757	IPO4	99	43.698	Chrysemys_picta_bellii
ENSIPUG00000001185	ipo4	92	36.559	ENSCING00000008639	-	99	36.043	Ciona_intestinalis
ENSIPUG00000001185	ipo4	91	37.475	ENSCSAVG00000011482	-	97	37.055	Ciona_savignyi
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	46.698	ENSCANG00000029513	IPO4	99	46.869	Colobus_angolensis_palliatus
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	45.328	ENSCGRG00001001217	Ipo4	99	45.471	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	45.328	ENSCGRG00000014404	Ipo4	99	45.471	Cricetulus_griseus_crigri
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	68.397	ENSCSEG00000009606	ipo4	100	68.015	Cynoglossus_semilaevis
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	67.036	ENSCVAG00000002281	ipo4	100	66.819	Cyprinodon_variegatus
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	80.773	ENSDARG00000041493	ipo4	100	80.773	Danio_rerio
ENSIPUG00000001185	ipo4	98	47.059	ENSDNOG00000000366	IPO4	99	46.809	Dasypus_novemcinctus
ENSIPUG00000001185	ipo4	98	46.542	ENSDORG00000009274	Ipo4	99	46.716	Dipodomys_ordii
ENSIPUG00000001185	ipo4	97	30.996	FBgn0042178	CG32165	98	30.423	Drosophila_melanogaster
ENSIPUG00000001185	ipo4	97	31.346	FBgn0042177	CG32164	98	31.006	Drosophila_melanogaster
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	45.956	ENSETEG00000018381	IPO4	99	45.587	Echinops_telfairi
ENSIPUG00000001185	ipo4	90	48.426	ENSEASG00005011954	IPO4	96	48.426	Equus_asinus_asinus
ENSIPUG00000001185	ipo4	98	47.712	ENSECAG00000009909	IPO4	99	47.315	Equus_caballus
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	79.266	ENSELUG00000020628	ipo4	100	79.633	Esox_lucius
ENSIPUG00000001185	ipo4	98	48.086	ENSFCAG00000005587	IPO4	99	47.161	Felis_catus
ENSIPUG00000001185	ipo4	98	43.645	ENSFDAG00000000725	IPO4	98	43.697	Fukomys_damarensis
ENSIPUG00000001185	ipo4	88	73.848	ENSFHEG00000009351	ipo4	97	74.321	Fundulus_heteroclitus
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	75.365	ENSGMOG00000001801	ipo4	99	76.265	Gadus_morhua
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	71.494	ENSGAFG00000005601	ipo4	100	71.311	Gambusia_affinis
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	72.007	ENSGACG00000002276	ipo4	99	72.007	Gasterosteus_aculeatus
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	46.884	ENSGGOG00000016062	IPO4	99	47.053	Gorilla_gorilla
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	73.020	ENSHBUG00000023269	ipo4	100	73.020	Haplochromis_burtoni
ENSIPUG00000001185	ipo4	98	47.235	ENSHGLG00000002923	IPO4	98	47.285	Heterocephalus_glaber_female
ENSIPUG00000001185	ipo4	98	46.954	ENSHGLG00100003725	IPO4	98	47.004	Heterocephalus_glaber_male
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	67.362	ENSHCOG00000016854	ipo4	99	67.271	Hippocampus_comes
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	47.315	ENSSTOG00000002288	IPO4	99	47.364	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSIPUG00000001185	ipo4	98	46.872	ENSJJAG00000019002	Ipo4	99	47.135	Jaculus_jaculus
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	71.717	ENSKMAG00000004627	ipo4	99	72.089	Kryptolebias_marmoratus
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	73.689	ENSLBEG00000024952	ipo4	100	73.781	Labrus_bergylta
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	52.368	ENSLACG00000001428	IPO4	100	51.792	Latimeria_chalumnae
ENSIPUG00000001185	ipo4	78	70.408	ENSLOCG00000001149	ipo4	85	69.133	Lepisosteus_oculatus
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	45.998	ENSLAFG00000015852	IPO4	99	45.906	Loxodonta_africana
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	46.977	ENSMFAG00000000743	IPO4	99	47.145	Macaca_fascicularis
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	46.977	ENSMMUG00000012481	IPO4	99	47.145	Macaca_mulatta
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	46.884	ENSMNEG00000043531	IPO4	99	47.053	Macaca_nemestrina
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	46.977	ENSMLEG00000042067	IPO4	99	47.145	Mandrillus_leucophaeus
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	72.099	ENSMAMG00000021976	ipo4	100	72.284	Mastacembelus_armatus
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	72.928	ENSMZEG00005017273	ipo4	100	73.020	Maylandia_zebra
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	46.531	ENSMAUG00000017565	Ipo4	99	46.630	Mesocricetus_auratus
ENSIPUG00000001185	ipo4	98	47.664	ENSMICG00000001719	IPO4	99	47.734	Microcebus_murinus
ENSIPUG00000001185	ipo4	98	45.794	ENSMOCG00000020462	Ipo4	99	46.445	Microtus_ochrogaster
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	72.777	ENSMMOG00000005264	ipo4	100	72.202	Mola_mola
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	44.651	ENSMODG00000003337	IPO4	96	44.475	Monodelphis_domestica
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	71.376	ENSMALG00000001587	ipo4	100	71.560	Monopterus_albus
ENSIPUG00000001185	ipo4	98	46.362	MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	98	48.886	Mus_caroli
ENSIPUG00000001185	ipo4	98	45.989	ENSMUSG00000002319	Ipo4	98	48.391	Mus_musculus
ENSIPUG00000001185	ipo4	98	46.032	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	98	48.451	Mus_pahari
ENSIPUG00000001185	ipo4	98	46.362	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	98	48.391	Mus_spretus
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	48.107	ENSMPUG00000005916	IPO4	99	47.763	Mustela_putorius_furo
ENSIPUG00000001185	ipo4	98	47.059	ENSMLUG00000025277	IPO4	85	46.716	Myotis_lucifugus
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	47.207	ENSNGAG00000019340	Ipo4	99	47.070	Nannospalax_galili
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	74.862	ENSNBRG00000005870	ipo4	100	74.954	Neolamprologus_brichardi
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	47.043	ENSOPRG00000016615	IPO4	99	47.043	Ochotona_princeps
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	47.222	ENSODEG00000002609	IPO4	99	47.271	Octodon_degus
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	74.678	ENSONIG00000014574	ipo4	100	74.678	Oreochromis_niloticus
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	46.809	ENSOCUG00000002881	IPO4	99	46.901	Oryctolagus_cuniculus
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	69.697	ENSORLG00000006457	ipo4	99	72.387	Oryzias_latipes
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	71.113	ENSORLG00020004286	ipo4	100	71.113	Oryzias_latipes_hni
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	71.205	ENSORLG00015021856	ipo4	100	71.205	Oryzias_latipes_hsok
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	70.911	ENSOMEG00000016203	ipo4	100	71.048	Oryzias_melastigma
ENSIPUG00000001185	ipo4	98	46.729	ENSOGAG00000010642	IPO4	99	46.759	Otolemur_garnettii
ENSIPUG00000001185	ipo4	97	46.321	ENSOARG00000019188	IPO4	99	46.075	Ovis_aries
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	46.791	ENSPPAG00000035476	IPO4	99	47.053	Pan_paniscus
ENSIPUG00000001185	ipo4	98	48.273	ENSPPRG00000023607	IPO4	99	47.344	Panthera_pardus
ENSIPUG00000001185	ipo4	98	48.179	ENSPTIG00000008720	IPO4	99	47.253	Panthera_tigris_altaica
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	46.884	ENSPTRG00000006200	IPO4	99	47.053	Pan_troglodytes
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	47.070	ENSPANG00000026278	IPO4	99	47.238	Papio_anubis
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	70.480	ENSPKIG00000007683	-	99	70.018	Paramormyrops_kingsleyae
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	70.604	ENSPKIG00000007830	ipo4	100	70.421	Paramormyrops_kingsleyae
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	66.728	ENSPMGG00000020871	ipo4	99	66.268	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	45.581	ENSPEMG00000016160	Ipo4	99	45.221	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSIPUG00000001185	ipo4	94	47.813	ENSPCIG00000010718	IPO4	97	47.624	Phascolarctos_cinereus
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	71.651	ENSPFOG00000009255	ipo4	100	71.468	Poecilia_formosa
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	71.743	ENSPLAG00000020556	ipo4	100	71.560	Poecilia_latipinna
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	71.651	ENSPMEG00000013102	ipo4	100	71.468	Poecilia_mexicana
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	70.917	ENSPREG00000017605	ipo4	100	70.917	Poecilia_reticulata
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	47.070	ENSPPYG00000005688	IPO4	99	47.145	Pongo_abelii
ENSIPUG00000001185	ipo4	99	47.535	ENSPCAG00000015669	IPO4	99	47.558	Procavia_capensis
ENSIPUG00000001185	ipo4	98	47.290	ENSPCOG00000015319	IPO4	99	47.222	Propithecus_coquereli
ENSIPUG00000001185	ipo4	98	47.004	ENSPVAG00000010755	IPO4	99	47.222	Pteropus_vampyrus
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	73.020	ENSPNYG00000021414	ipo4	100	73.112	Pundamilia_nyererei
ENSIPUG00000001185	ipo4	100	85.622	ENSPNAG00000027964	ipo4	100	85.806	Pygocentrus_nattereri
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