EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSIPUG00000014050 (Gene tree)
Gene ID: 108279040
Gene Symbol: ctif
Alias: zmp:0000001000
Full Name: cap binding complex dependent translation initiation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Ictalurus_punctatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 55107 bases
Position: chr18:6286892-6341998
Accession: 108279040
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSIPUP00000020769	MIF4G	PF02854.19	6.9e-25	1	1
ENSIPUP00000020829	MIF4G	PF02854.19	7.1e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSIPUT00000021722	-	1993	XM_017492947	ENSIPUP00000020829	664 (aa)	XP_017348436	-
ENSIPUT00000021660	-	1989	XM_017492950	ENSIPUP00000020769	662 (aa)	XP_017348439	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.830	ENSG00000134030	CTIF	100	55.735	Homo_sapiens
ENSIPUG00000014050	ctif	96	59.969	ENSAPOG00000020192	ctif	99	67.107	Acanthochromis_polyacanthus
ENSIPUG00000014050	ctif	88	51.757	ENSAMEG00000006759	CTIF	79	57.143	Ailuropoda_melanoleuca
ENSIPUG00000014050	ctif	96	67.896	ENSAOCG00000014275	ctif	99	68.326	Amphiprion_ocellaris
ENSIPUG00000014050	ctif	96	64.697	ENSAPEG00000016975	ctif	99	67.007	Amphiprion_percula
ENSIPUG00000014050	ctif	99	66.342	ENSATEG00000016752	ctif	99	66.912	Anabas_testudineus
ENSIPUG00000014050	ctif	99	59.768	ENSACAG00000018006	CTIF	100	60.837	Anolis_carolinensis
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.752	ENSANAG00000024925	CTIF	100	55.653	Aotus_nancymaae
ENSIPUG00000014050	ctif	99	61.622	ENSACLG00000005956	ctif	99	67.105	Astatotilapia_calliptera
ENSIPUG00000014050	ctif	99	75.664	ENSAMXG00000015964	ctif	99	76.274	Astyanax_mexicanus
ENSIPUG00000014050	ctif	90	77.049	ENSBTAG00000018901	CTIF	100	72.131	Bos_taurus
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.455	ENSCJAG00000004729	CTIF	100	55.344	Callithrix_jacchus
ENSIPUG00000014050	ctif	97	54.035	ENSCAFG00000019076	CTIF	100	55.425	Canis_familiaris
ENSIPUG00000014050	ctif	97	54.035	ENSCAFG00020026482	CTIF	100	55.865	Canis_lupus_dingo
ENSIPUG00000014050	ctif	99	53.258	ENSCHIG00000014455	CTIF	100	54.612	Capra_hircus
ENSIPUG00000014050	ctif	81	54.202	ENSTSYG00000030461	CTIF	96	55.835	Carlito_syrichta
ENSIPUG00000014050	ctif	99	50.210	ENSCAPG00000011865	CTIF	98	69.014	Cavia_aperea
ENSIPUG00000014050	ctif	99	53.186	ENSCPOG00000001049	CTIF	100	54.035	Cavia_porcellus
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.455	ENSCCAG00000022758	CTIF	100	55.344	Cebus_capucinus
ENSIPUG00000014050	ctif	99	55.035	ENSCATG00000038134	CTIF	98	69.014	Cercocebus_atys
ENSIPUG00000014050	ctif	99	55.289	ENSCLAG00000008174	CTIF	100	56.388	Chinchilla_lanigera
ENSIPUG00000014050	ctif	99	53.814	ENSCSAG00000018021	CTIF	100	54.741	Chlorocebus_sabaeus
ENSIPUG00000014050	ctif	90	81.967	ENSCPBG00000025654	CTIF	100	77.049	Chrysemys_picta_bellii
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.249	ENSCANG00000030916	CTIF	100	57.982	Colobus_angolensis_palliatus
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.196	ENSCGRG00001020158	Ctif	100	54.934	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSIPUG00000014050	ctif	99	50.557	ENSCGRG00000000052	Ctif	100	51.297	Cricetulus_griseus_crigri
ENSIPUG00000014050	ctif	99	64.017	ENSCVAG00000017158	ctif	99	64.568	Cyprinodon_variegatus
ENSIPUG00000014050	ctif	99	73.372	ENSDARG00000090617	ctif	100	74.566	Danio_rerio
ENSIPUG00000014050	ctif	68	53.783	ENSDNOG00000037310	CTIF	99	55.675	Dasypus_novemcinctus
ENSIPUG00000014050	ctif	99	53.541	ENSDORG00000003221	Ctif	100	54.839	Dipodomys_ordii
ENSIPUG00000014050	ctif	80	78.689	ENSEASG00005016094	CTIF	82	73.770	Equus_asinus_asinus
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.802	ENSECAG00000020473	CTIF	100	55.735	Equus_caballus
ENSIPUG00000014050	ctif	77	54.479	ENSEEUG00000012451	CTIF	91	56.571	Erinaceus_europaeus
ENSIPUG00000014050	ctif	99	64.295	ENSELUG00000008733	ctif	99	64.153	Esox_lucius
ENSIPUG00000014050	ctif	90	77.049	ENSFCAG00000000664	CTIF	100	72.131	Felis_catus
ENSIPUG00000014050	ctif	97	55.738	ENSFALG00000008943	CTIF	98	57.473	Ficedula_albicollis
ENSIPUG00000014050	ctif	99	53.889	ENSFDAG00000017379	CTIF	100	55.058	Fukomys_damarensis
ENSIPUG00000014050	ctif	85	84.000	ENSFHEG00000004334	ctif	97	95.122	Fundulus_heteroclitus
ENSIPUG00000014050	ctif	87	81.967	ENSGALG00000035912	-	100	77.049	Gallus_gallus
ENSIPUG00000014050	ctif	89	76.667	ENSGAFG00000011896	ctif	97	95.122	Gambusia_affinis
ENSIPUG00000014050	ctif	61	57.176	ENSGAGG00000020663	CTIF	96	61.619	Gopherus_agassizii
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.816	ENSGGOG00000015204	CTIF	100	55.718	Gorilla_gorilla
ENSIPUG00000014050	ctif	99	61.757	ENSHBUG00000018092	ctif	99	67.251	Haplochromis_burtoni
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.173	ENSHGLG00000005663	CTIF	100	55.523	Heterocephalus_glaber_female
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.173	ENSHGLG00100006976	CTIF	100	55.670	Heterocephalus_glaber_male
ENSIPUG00000014050	ctif	83	64.943	ENSHCOG00000011784	ctif	99	62.240	Hippocampus_comes
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.507	ENSSTOG00000001967	CTIF	100	55.718	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSIPUG00000014050	ctif	99	53.770	ENSJJAG00000013706	Ctif	100	54.286	Jaculus_jaculus
ENSIPUG00000014050	ctif	99	62.140	ENSKMAG00000014651	ctif	99	65.774	Kryptolebias_marmoratus
ENSIPUG00000014050	ctif	86	81.667	ENSLBEG00000018277	ctif	97	97.561	Labrus_bergylta
ENSIPUG00000014050	ctif	99	67.199	ENSLOCG00000011697	ctif	100	68.024	Lepisosteus_oculatus
ENSIPUG00000014050	ctif	99	48.560	ENSLAFG00000016335	CTIF	98	80.534	Loxodonta_africana
ENSIPUG00000014050	ctif	99	55.035	ENSMFAG00000037903	CTIF	98	69.014	Macaca_fascicularis
ENSIPUG00000014050	ctif	99	55.035	ENSMMUG00000020898	CTIF	98	69.014	Macaca_mulatta
ENSIPUG00000014050	ctif	99	55.035	ENSMNEG00000039395	CTIF	98	69.014	Macaca_nemestrina
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.880	ENSMLEG00000041132	CTIF	98	69.014	Mandrillus_leucophaeus
ENSIPUG00000014050	ctif	99	65.969	ENSMAMG00000014741	ctif	99	66.716	Mastacembelus_armatus
ENSIPUG00000014050	ctif	76	81.967	ENSMGAG00000001378	CTIF	96	72.727	Meleagris_gallopavo
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.533	ENSMAUG00000000656	Ctif	100	55.572	Mesocricetus_auratus
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.533	ENSMICG00000010167	CTIF	100	55.718	Microcebus_murinus
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.184	ENSMOCG00000020507	Ctif	100	54.919	Microtus_ochrogaster
ENSIPUG00000014050	ctif	99	66.234	ENSMMOG00000000831	ctif	99	66.040	Mola_mola
ENSIPUG00000014050	ctif	99	52.063	ENSMODG00000003464	CTIF	100	53.019	Monodelphis_domestica
ENSIPUG00000014050	ctif	60	74.667	ENSMALG00000020553	ctif	95	74.667	Monopterus_albus
ENSIPUG00000014050	ctif	99	53.095	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	100	53.627	Mus_caroli
ENSIPUG00000014050	ctif	99	52.949	ENSMUSG00000052928	Ctif	100	53.617	Mus_musculus
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.610	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	100	55.213	Mus_pahari
ENSIPUG00000014050	ctif	99	53.086	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	92	72.131	Mus_spretus
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.391	ENSMPUG00000000844	CTIF	100	55.572	Mustela_putorius_furo
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.119	ENSMLUG00000003025	CTIF	100	54.825	Myotis_lucifugus
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.533	ENSNGAG00000011452	Ctif	100	55.865	Nannospalax_galili
ENSIPUG00000014050	ctif	96	61.404	ENSNBRG00000008679	ctif	99	67.105	Neolamprologus_brichardi
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.880	ENSNLEG00000011503	CTIF	100	55.718	Nomascus_leucogenys
ENSIPUG00000014050	ctif	90	80.328	ENSMEUG00000000218	CTIF	90	75.410	Notamacropus_eugenii
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.237	ENSOPRG00000003558	CTIF	100	54.612	Ochotona_princeps
ENSIPUG00000014050	ctif	99	53.370	ENSODEG00000018390	CTIF	100	54.481	Octodon_degus
ENSIPUG00000014050	ctif	83	67.680	ENSONIG00000007750	ctif	99	59.912	Oreochromis_niloticus
ENSIPUG00000014050	ctif	79	51.545	ENSOANG00000001337	CTIF	100	53.480	Ornithorhynchus_anatinus
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.391	ENSOCUG00000024842	CTIF	100	54.948	Oryctolagus_cuniculus
ENSIPUG00000014050	ctif	99	63.725	ENSORLG00000005786	ctif	99	66.224	Oryzias_latipes
ENSIPUG00000014050	ctif	99	64.888	ENSORLG00020005385	ctif	99	65.778	Oryzias_latipes_hni
ENSIPUG00000014050	ctif	99	64.566	ENSORLG00015011872	ctif	99	65.634	Oryzias_latipes_hsok
ENSIPUG00000014050	ctif	99	64.266	ENSOMEG00000007917	ctif	99	66.419	Oryzias_melastigma
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.972	ENSOGAG00000013927	CTIF	100	56.176	Otolemur_garnettii
ENSIPUG00000014050	ctif	99	53.824	ENSOARG00000003754	CTIF	100	55.425	Ovis_aries
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.674	ENSPPAG00000023554	CTIF	98	69.014	Pan_paniscus
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.391	ENSPPRG00000002265	CTIF	100	56.012	Panthera_pardus
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.391	ENSPTIG00000013761	CTIF	100	55.865	Panthera_tigris_altaica
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.674	ENSPTRG00000010009	CTIF	98	69.014	Pan_troglodytes
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.880	ENSPANG00000017087	CTIF	98	69.014	Papio_anubis
ENSIPUG00000014050	ctif	76	61.377	ENSPKIG00000011234	ctif	100	67.632	Paramormyrops_kingsleyae
ENSIPUG00000014050	ctif	90	78.689	ENSPSIG00000006508	CTIF	100	73.770	Pelodiscus_sinensis
ENSIPUG00000014050	ctif	99	64.853	ENSPMGG00000022958	ctif	99	63.971	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSIPUG00000014050	ctif	99	53.824	ENSPEMG00000022746	Ctif	100	54.772	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSIPUG00000014050	ctif	72	55.058	ENSPCIG00000026247	CTIF	98	65.538	Phascolarctos_cinereus
ENSIPUG00000014050	ctif	99	62.413	ENSPFOG00000009243	ctif	99	62.927	Poecilia_formosa
ENSIPUG00000014050	ctif	99	62.552	ENSPLAG00000019171	ctif	99	63.885	Poecilia_latipinna
ENSIPUG00000014050	ctif	99	62.413	ENSPMEG00000020089	ctif	99	63.885	Poecilia_mexicana
ENSIPUG00000014050	ctif	99	62.102	ENSPREG00000017326	ctif	99	61.361	Poecilia_reticulata
ENSIPUG00000014050	ctif	79	56.614	ENSPPYG00000009147	CTIF	100	58.532	Pongo_abelii
ENSIPUG00000014050	ctif	99	53.107	ENSPCOG00000013391	CTIF	100	54.240	Propithecus_coquereli
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.880	ENSPVAG00000001965	CTIF	100	55.783	Pteropus_vampyrus
ENSIPUG00000014050	ctif	99	61.757	ENSPNYG00000007879	ctif	99	67.251	Pundamilia_nyererei
ENSIPUG00000014050	ctif	99	79.911	ENSPNAG00000029174	ctif	99	80.477	Pygocentrus_nattereri
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.339	ENSRNOG00000018342	Ctif	100	55.081	Rattus_norvegicus
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.391	ENSRBIG00000043937	CTIF	100	55.865	Rhinopithecus_bieti
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.738	ENSRROG00000006039	CTIF	100	55.718	Rhinopithecus_roxellana
ENSIPUG00000014050	ctif	90	78.689	ENSSBOG00000028468	CTIF	100	72.131	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSIPUG00000014050	ctif	99	52.211	ENSSHAG00000016321	CTIF	100	53.264	Sarcophilus_harrisii
ENSIPUG00000014050	ctif	99	71.014	ENSSFOG00015022594	ctif	100	71.624	Scleropages_formosus
ENSIPUG00000014050	ctif	96	54.419	ENSSMAG00000005707	ctif	99	67.656	Scophthalmus_maximus
ENSIPUG00000014050	ctif	88	72.619	ENSSDUG00000016033	ctif	99	67.622	Seriola_dumerili
ENSIPUG00000014050	ctif	99	55.137	ENSSPUG00000014734	CTIF	99	71.212	Sphenodon_punctatus
ENSIPUG00000014050	ctif	83	67.582	ENSSPAG00000003721	ctif	99	56.828	Stegastes_partitus
ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.314	ENSSSCG00000004506	CTIF	100	55.081	Sus_scrofa
ENSIPUG00000014050	ctif	99	55.322	ENSTGUG00000000030	CTIF	100	55.460	Taeniopygia_guttata
ENSIPUG00000014050	ctif	84	64.326	ENSTNIG00000018763	ctif	99	57.249	Tetraodon_nigroviridis
ENSIPUG00000014050	ctif	64	74.074	ENSTBEG00000002613	CTIF	87	70.423	Tupaia_belangeri
ENSIPUG00000014050	ctif	99	52.535	ENSTTRG00000004347	CTIF	100	53.666	Tursiops_truncatus
ENSIPUG00000014050	ctif	87	50.485	ENSUAMG00000007299	CTIF	88	51.852	Ursus_americanus
ENSIPUG00000014050	ctif	90	77.049	ENSUMAG00000002735	CTIF	100	72.131	Ursus_maritimus
ENSIPUG00000014050	ctif	88	75.556	ENSVVUG00000014347	CTIF	100	70.492	Vulpes_vulpes
ENSIPUG00000014050	ctif	74	73.518	ENSXETG00000026836	ctif	75	73.518	Xenopus_tropicalis
ENSIPUG00000014050	ctif	55	58.637	ENSXCOG00000002477	ctif	90	58.637	Xiphophorus_couchianus
ENSIPUG00000014050	ctif	99	62.291	ENSXMAG00000004236	ctif	99	62.857	Xiphophorus_maculatus