EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSIPUG00000019981 (Gene tree)
Gene ID: 108255717
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC108255717
Gene Type: protein_coding
Species: Ictalurus_punctatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 16850 bases
Position: chr22:4093294-4110143
Accession: 108255717
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSIPUP00000029558	MMR_HSR1	PF01926.23	1.8e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSIPUT00000030756	-	1344	XM_017451882	ENSIPUP00000029558	447 (aa)	XP_017307371	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	96	58.140	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	97	58.195
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	70	63.492	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	70	63.492

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	57.871	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	57.871	Acanthochromis_polyacanthus
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	78.396	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	78.396	Acanthochromis_polyacanthus
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	78.174	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	78.174	Amphilophus_citrinellus
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	57.576	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	58.643	Amphilophus_citrinellus
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	100	57.965	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	57.965	Amphiprion_ocellaris
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	78.619	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	78.619	Amphiprion_ocellaris
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	78.396	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	78.396	Amphiprion_percula
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	100	57.965	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	57.965	Amphiprion_percula
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	78.174	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	78.174	Anabas_testudineus
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	100	58.186	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	58.186	Anabas_testudineus
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	100	58.057	ENSACAG00000028632	-	100	58.057	Anolis_carolinensis
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	58.351	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	59.300	Astatotilapia_calliptera
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	77.060	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	77.060	Astatotilapia_calliptera
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	81.514	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	81.514	Astyanax_mexicanus
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	100	57.556	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	100	57.111	Astyanax_mexicanus
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	77	60.580	ENSCING00000020807	-	91	60.580	Ciona_intestinalis
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	98	53.636	ENSCSAVG00000009987	-	98	53.759	Ciona_savignyi
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	77.803	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	75.650	Cynoglossus_semilaevis
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	100	57.812	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	58.667	Cynoglossus_semilaevis
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	100	58.407	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	58.407	Cyprinodon_variegatus
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	77.728	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	77.728	Cyprinodon_variegatus
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	98	83.409	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	83.409	Danio_rerio
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	100	59.071	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	72.959	Danio_rerio
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	81	53.867	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	97	53.867	Eptatretus_burgeri
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	76.392	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	76.392	Esox_lucius
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	77.728	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	77.728	Fundulus_heteroclitus
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	100	58.667	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	58.667	Fundulus_heteroclitus
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	71	61.755	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	88	57.183	Gadus_morhua
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	100	57.330	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	57.743	Gambusia_affinis
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	77.060	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	77.060	Gambusia_affinis
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	82	63.514	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	92	63.514	Gasterosteus_aculeatus
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	58	90.734	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	90.734	Gasterosteus_aculeatus
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	77.060	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	77.060	Haplochromis_burtoni
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	58.568	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	59.519	Haplochromis_burtoni
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	100	58.407	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	100	58.407	Hippocampus_comes
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	75.510	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	75.510	Hippocampus_comes
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	77.951	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	77.951	Kryptolebias_marmoratus
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	100	57.965	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	57.965	Kryptolebias_marmoratus
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	75.947	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	75.947	Labrus_bergylta
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	100	61.470	ENSLACG00000004899	-	100	61.470	Latimeria_chalumnae
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	65.843	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	98	65.843	Latimeria_chalumnae
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	58.427	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	99	59.284	Latimeria_chalumnae
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	70.246	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	70.246	Lepisosteus_oculatus
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	77.283	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	77.283	Mastacembelus_armatus
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	96	58.295	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	97	58.353	Mastacembelus_armatus
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	77.060	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	77.060	Maylandia_zebra
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	58.134	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	99	59.081	Maylandia_zebra
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	57.301	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	57.301	Mola_mola
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	98	76.888	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	76.888	Monopterus_albus
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ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	96	58.784	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	96	59.861	Neolamprologus_brichardi
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	77.852	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	77.852	Neolamprologus_brichardi
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	57.238	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	99	57.428	Oreochromis_niloticus
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	77.728	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	77.728	Oreochromis_niloticus
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	100	57.363	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	57.965	Oryzias_latipes
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	73.274	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	73.274	Oryzias_latipes
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	100	57.048	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	99	57.743	Oryzias_latipes_hni
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	76.169	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	76.169	Oryzias_latipes_hni
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	100	57.837	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	99	57.965	Oryzias_latipes_hsok
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ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	100	59.111	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Oryzias_melastigma
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	77.951	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	77.951	Oryzias_melastigma
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	73.719	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	73.719	Paramormyrops_kingsleyae
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	100	57.143	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	100	57.778	Paramormyrops_kingsleyae
ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	100	55.044	ENSPKIG00000023918	-	98	55.799	Paramormyrops_kingsleyae
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