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Description

Ensembl ID: ENSIPUG00000020088 (Gene tree)
Gene ID: 108267742
Gene Symbol: ACO1
Alias: IRP1|wu:fo75b03
Full Name: aconitase 1
Gene Type: protein_coding
Species: Ictalurus_punctatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 16853 bases
Position: chr7:13633444-13650296
Accession: 108267742
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSIPUP00000029725	Aconitase	PF00330.20	5.3e-182	1	1
ENSIPUP00000029762	Aconitase	PF00330.20	5.5e-182	1	1
ENSIPUP00000029725	Aconitase_C	PF00694.19	7.6e-45	1	1
ENSIPUP00000029762	Aconitase_C	PF00694.19	7.7e-45	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSIPUT00000030963	-	3054	-	ENSIPUP00000029762	892 (aa)	-	-
ENSIPUT00000030925	-	3048	XM_017472116	ENSIPUP00000029725	890 (aa)	XP_017327605	W5UIR2

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ipu00020	Citrate cycle (TCA cycle)	KEGG
ipu00630	Glyoxylate and dicarboxylate metabolism	KEGG
ipu01100	Metabolic pathways	KEGG
ipu01200	Carbon metabolism	KEGG
ipu01210	2-Oxocarboxylic acid metabolism	KEGG
ipu01230	Biosynthesis of amino acids	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	61.654	ENSIPUG00000014808	Ireb2	90	61.654

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.002	ENSG00000122729	ACO1	100	82.002	Homo_sapiens
ENSIPUG00000020088	ACO1	100	85.281	ENSAPOG00000008670	aco1	99	85.281	Acanthochromis_polyacanthus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.910	ENSAMEG00000003746	ACO1	100	81.910	Ailuropoda_melanoleuca
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	85.714	ENSACIG00000014377	aco1	99	85.714	Amphilophus_citrinellus
ENSIPUG00000020088	ACO1	100	86.180	ENSAOCG00000007699	aco1	99	86.180	Amphiprion_ocellaris
ENSIPUG00000020088	ACO1	100	86.180	ENSAPEG00000014370	aco1	99	86.180	Amphiprion_percula
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	86.937	ENSATEG00000000560	aco1	99	86.937	Anabas_testudineus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.849	ENSAPLG00000015490	ACO1	99	81.849	Anas_platyrhynchos
ENSIPUG00000020088	ACO1	97	81.628	ENSACAG00000001541	ACO1	99	82.105	Anolis_carolinensis
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	80.947	ENSANAG00000003359	ACO1	99	80.947	Aotus_nancymaae
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	85.602	ENSACLG00000007755	aco1	99	85.602	Astatotilapia_calliptera
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	90.889	ENSAMXG00000002499	aco1	99	90.889	Astyanax_mexicanus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.902	ENSBTAG00000000555	ACO1	100	82.902	Bos_taurus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.327	ENSCJAG00000007687	ACO1	100	81.327	Callithrix_jacchus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.414	ENSCAFG00000001786	ACO1	99	81.236	Canis_familiaris
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.414	ENSCAFG00020014553	ACO1	100	81.327	Canis_lupus_dingo
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	83.015	ENSCHIG00000007667	ACO1	100	83.015	Capra_hircus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.227	ENSTSYG00000004179	ACO1	99	82.227	Carlito_syrichta
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	66.817	ENSCAPG00000007254	ACO1	100	66.704	Cavia_aperea
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.227	ENSCPOG00000003768	ACO1	100	82.227	Cavia_porcellus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.327	ENSCCAG00000022465	ACO1	100	81.327	Cebus_capucinus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.665	ENSCATG00000045333	ACO1	100	81.665	Cercocebus_atys
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.327	ENSCLAG00000002487	ACO1	100	81.327	Chinchilla_lanigera
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.665	ENSCSAG00000009824	ACO1	99	81.665	Chlorocebus_sabaeus
ENSIPUG00000020088	ACO1	90	65.022	ENSCHOG00000008996	ACO1	90	64.865	Choloepus_hoffmanni
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	83.089	ENSCPBG00000008077	ACO1	99	83.089	Chrysemys_picta_bellii
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.552	ENSCANG00000014847	ACO1	100	81.552	Colobus_angolensis_palliatus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.452	ENSCGRG00001024337	Aco1	100	82.452	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.552	ENSCGRG00000004877	-	100	81.552	Cricetulus_griseus_crigri
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	83.240	ENSCSEG00000018262	aco1	99	83.240	Cynoglossus_semilaevis
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	78.266	ENSCVAG00000020264	aco1	99	78.266	Cyprinodon_variegatus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	87.402	ENSDARG00000026376	aco1	99	87.402	Danio_rerio
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.452	ENSDNOG00000003951	ACO1	100	82.452	Dasypus_novemcinctus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.227	ENSDORG00000014246	Aco1	100	82.227	Dipodomys_ordii
ENSIPUG00000020088	ACO1	86	63.684	ENSETEG00000012415	-	85	63.684	Echinops_telfairi
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	56.628	ENSEBUG00000015441	aco1	97	56.628	Eptatretus_burgeri
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.677	ENSEASG00005004602	ACO1	100	82.677	Equus_asinus_asinus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.565	ENSECAG00000014846	ACO1	100	82.565	Equus_caballus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	71.429	ENSEEUG00000015174	ACO1	100	71.429	Erinaceus_europaeus
ENSIPUG00000020088	ACO1	100	85.618	ENSELUG00000016812	aco1	97	85.618	Esox_lucius
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.115	ENSFCAG00000001293	ACO1	100	82.115	Felis_catus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.074	ENSFALG00000001167	ACO1	99	82.074	Ficedula_albicollis
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.115	ENSFDAG00000016058	ACO1	100	82.115	Fukomys_damarensis
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	85.264	ENSFHEG00000005619	aco1	99	85.264	Fundulus_heteroclitus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.440	ENSGMOG00000005514	aco1	99	81.440	Gadus_morhua
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.849	ENSGALG00000002162	ACO1	99	81.849	Gallus_gallus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	85.569	ENSGACG00000001637	aco1	99	85.569	Gasterosteus_aculeatus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.525	ENSGAGG00000023315	ACO1	99	82.525	Gopherus_agassizii
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.777	ENSGGOG00000016306	ACO1	100	81.777	Gorilla_gorilla
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	85.489	ENSHBUG00000008952	aco1	99	85.489	Haplochromis_burtoni
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.890	ENSHGLG00000018922	Aco1	100	81.890	Heterocephalus_glaber_female
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.890	ENSHGLG00100000149	Aco1	100	81.890	Heterocephalus_glaber_male
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.777	ENSHCOG00000015881	aco1	99	81.777	Hippocampus_comes
ENSIPUG00000020088	ACO1	100	82.472	ENSSTOG00000006942	ACO1	99	82.472	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.890	ENSJJAG00000013824	Aco1	100	81.890	Jaculus_jaculus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	85.006	ENSKMAG00000015759	aco1	99	85.006	Kryptolebias_marmoratus
ENSIPUG00000020088	ACO1	100	81.369	ENSLBEG00000013866	aco1	99	81.369	Labrus_bergylta
ENSIPUG00000020088	ACO1	75	70.623	ENSLACG00000000936	ACO1	99	70.448	Latimeria_chalumnae
ENSIPUG00000020088	ACO1	100	84.382	ENSLOCG00000011082	aco1	100	84.382	Lepisosteus_oculatus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	80.090	ENSLAFG00000013470	ACO1	100	80.090	Loxodonta_africana
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.777	ENSMFAG00000001702	ACO1	100	81.777	Macaca_fascicularis
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.890	ENSMMUG00000008196	ACO1	100	81.890	Macaca_mulatta
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.665	ENSMNEG00000045040	ACO1	100	81.665	Macaca_nemestrina
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.890	ENSMLEG00000005636	ACO1	100	81.890	Mandrillus_leucophaeus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	86.614	ENSMAMG00000002915	aco1	99	86.614	Mastacembelus_armatus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.083	ENSMZEG00005012733	aco1	99	81.747	Maylandia_zebra
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	66.704	ENSMGAG00000008851	ACO1	99	66.704	Meleagris_gallopavo
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.890	ENSMAUG00000021408	Aco1	100	81.890	Mesocricetus_auratus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.890	ENSMICG00000006540	ACO1	100	81.890	Microcebus_murinus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.677	ENSMOCG00000015393	Aco1	100	82.677	Microtus_ochrogaster
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	85.264	ENSMMOG00000020282	aco1	99	85.264	Mola_mola
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.777	ENSMODG00000004463	ACO1	100	81.777	Monodelphis_domestica
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	85.827	ENSMALG00000019764	aco1	99	85.827	Monopterus_albus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.902	MGP_CAROLIEiJ_G0025892	Aco1	100	82.902	Mus_caroli
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.790	ENSMUSG00000028405	Aco1	100	82.790	Mus_musculus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.565	MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	82.565	Mus_pahari
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.790	MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	82.790	Mus_spretus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.452	ENSMPUG00000004340	ACO1	100	82.452	Mustela_putorius_furo
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	80.540	ENSMLUG00000003029	ACO1	100	80.540	Myotis_lucifugus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.227	ENSNGAG00000005703	Aco1	100	82.227	Nannospalax_galili
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	67.978	ENSNBRG00000008973	aco1	99	67.753	Neolamprologus_brichardi
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.002	ENSNLEG00000003409	ACO1	100	82.002	Nomascus_leucogenys
ENSIPUG00000020088	ACO1	89	76.538	ENSMEUG00000014756	ACO1	90	76.538	Notamacropus_eugenii
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	78.065	ENSOPRG00000016791	ACO1	100	78.065	Ochotona_princeps
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	79.865	ENSODEG00000001240	-	100	79.865	Octodon_degus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	77.053	ENSODEG00000015432	-	100	76.603	Octodon_degus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	85.264	ENSONIG00000019869	aco1	99	85.264	Oreochromis_niloticus
ENSIPUG00000020088	ACO1	81	82.849	ENSOANG00000012132	ACO1	100	82.849	Ornithorhynchus_anatinus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.424	ENSOCUG00000015960	ACO1	100	81.201	Oryctolagus_cuniculus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	84.122	ENSORLG00000020656	aco1	99	84.122	Oryzias_latipes
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	83.784	ENSORLG00020010991	aco1	99	83.784	Oryzias_latipes_hni
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	83.671	ENSORLG00015011785	aco1	99	83.671	Oryzias_latipes_hsok
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.938	ENSOMEG00000000660	aco1	99	82.938	Oryzias_melastigma
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.565	ENSOGAG00000010522	ACO1	100	82.565	Otolemur_garnettii
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	83.015	ENSOARG00000014707	ACO1	98	83.015	Ovis_aries
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.002	ENSPPAG00000033498	ACO1	100	82.002	Pan_paniscus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.002	ENSPPRG00000009875	ACO1	100	82.002	Panthera_pardus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.890	ENSPTIG00000016606	ACO1	98	81.890	Panthera_tigris_altaica
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.002	ENSPTRG00000020843	ACO1	100	82.002	Pan_troglodytes
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.890	ENSPANG00000025270	ACO1	100	81.890	Papio_anubis
ENSIPUG00000020088	ACO1	100	84.719	ENSPKIG00000023168	aco1	99	84.719	Paramormyrops_kingsleyae
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	83.089	ENSPSIG00000008030	ACO1	99	83.089	Pelodiscus_sinensis
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	84.797	ENSPMGG00000020708	aco1	99	84.702	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.115	ENSPEMG00000018464	Aco1	100	82.115	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.440	ENSPCIG00000029321	ACO1	99	82.561	Phascolarctos_cinereus
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	83.784	ENSPFOG00000013405	aco1	99	83.690	Poecilia_formosa
ENSIPUG00000020088	ACO1	90	84.625	ENSPLAG00000023422	aco1	98	84.625	Poecilia_latipinna
ENSIPUG00000020088	ACO1	90	84.539	ENSPMEG00000011800	aco1	98	84.539	Poecilia_mexicana
ENSIPUG00000020088	ACO1	99	83.915	ENSPREG00000021791	aco1	99	83.915	Poecilia_reticulata
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