EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSIPUG00000020315 (Gene tree)
Gene ID: 108263725
Gene Symbol: urb2
Alias: fc13e02|si:dkey-162b3.2|wu:fc13e02
Full Name: URB2 ribosome biogenesis homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Ictalurus_punctatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 12893 bases
Position: chr3:13746113-13759005
Accession: 108263725
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSIPUP00000030077	Urb2	PF10441.9	1.3e-19	1	1
ENSIPUP00000030070	Urb2	PF10441.9	1.3e-19	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSIPUT00000031284	-	4992	XM_017464795	ENSIPUP00000030070	1520 (aa)	XP_017320284	A0A2D0QRD9
ENSIPUT00000031290	-	4711	-	ENSIPUP00000030077	1483 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSIPUG00000020315	urb2	99	36.410	ENSG00000135763	URB2	100	60.920	Homo_sapiens
ENSIPUG00000020315	urb2	89	42.956	ENSAPOG00000000608	urb2	95	43.095	Acanthochromis_polyacanthus
ENSIPUG00000020315	urb2	100	35.825	ENSAMEG00000009206	URB2	100	35.843	Ailuropoda_melanoleuca
ENSIPUG00000020315	urb2	100	43.071	ENSAOCG00000019961	urb2	100	43.131	Amphiprion_ocellaris
ENSIPUG00000020315	urb2	100	43.071	ENSAPEG00000005263	urb2	100	43.131	Amphiprion_percula
ENSIPUG00000020315	urb2	100	40.827	ENSATEG00000020930	urb2	100	41.325	Anabas_testudineus
ENSIPUG00000020315	urb2	97	37.696	ENSAPLG00000002998	URB2	99	37.696	Anas_platyrhynchos
ENSIPUG00000020315	urb2	99	37.563	ENSACAG00000001285	URB2	99	37.563	Anolis_carolinensis
ENSIPUG00000020315	urb2	99	36.527	ENSANAG00000033963	URB2	99	36.527	Aotus_nancymaae
ENSIPUG00000020315	urb2	89	42.164	ENSACLG00000009254	urb2	95	42.401	Astatotilapia_calliptera
ENSIPUG00000020315	urb2	99	63.123	ENSAMXG00000003474	urb2	99	63.123	Astyanax_mexicanus
ENSIPUG00000020315	urb2	100	35.930	ENSBTAG00000010180	URB2	100	35.930	Bos_taurus
ENSIPUG00000020315	urb2	95	58.741	ENSCJAG00000010968	URB2	99	36.761	Callithrix_jacchus
ENSIPUG00000020315	urb2	99	35.700	ENSCAFG00000012118	URB2	99	35.700	Canis_familiaris
ENSIPUG00000020315	urb2	93	34.438	ENSCAFG00020027217	URB2	99	34.323	Canis_lupus_dingo
ENSIPUG00000020315	urb2	100	35.967	ENSCHIG00000014513	URB2	100	35.967	Capra_hircus
ENSIPUG00000020315	urb2	100	35.930	ENSTSYG00000006924	URB2	100	36.188	Carlito_syrichta
ENSIPUG00000020315	urb2	61	45.946	ENSCPOG00000020777	-	99	45.946	Cavia_porcellus
ENSIPUG00000020315	urb2	99	36.977	ENSCCAG00000023932	URB2	99	37.147	Cebus_capucinus
ENSIPUG00000020315	urb2	99	36.776	ENSCATG00000043366	URB2	99	36.711	Cercocebus_atys
ENSIPUG00000020315	urb2	99	36.100	ENSCLAG00000006268	URB2	99	36.434	Chinchilla_lanigera
ENSIPUG00000020315	urb2	99	36.293	ENSCSAG00000010599	URB2	99	36.293	Chlorocebus_sabaeus
ENSIPUG00000020315	urb2	64	50.450	ENSCHOG00000010163	URB2	64	50.450	Choloepus_hoffmanni
ENSIPUG00000020315	urb2	99	39.440	ENSCPBG00000006191	URB2	99	39.440	Chrysemys_picta_bellii
ENSIPUG00000020315	urb2	99	36.183	ENSCANG00000023711	URB2	99	36.183	Colobus_angolensis_palliatus
ENSIPUG00000020315	urb2	99	35.851	ENSCGRG00001009591	Urb2	99	35.851	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSIPUG00000020315	urb2	99	35.851	ENSCGRG00000011259	Urb2	99	35.851	Cricetulus_griseus_crigri
ENSIPUG00000020315	urb2	100	38.842	ENSCSEG00000000299	urb2	100	38.805	Cynoglossus_semilaevis
ENSIPUG00000020315	urb2	100	41.394	ENSCVAG00000011011	urb2	100	41.394	Cyprinodon_variegatus
ENSIPUG00000020315	urb2	100	58.388	ENSDARG00000003217	urb2	100	70.667	Danio_rerio
ENSIPUG00000020315	urb2	97	32.296	ENSDNOG00000043064	URB2	99	32.543	Dasypus_novemcinctus
ENSIPUG00000020315	urb2	99	35.838	ENSDORG00000014975	Urb2	99	35.838	Dipodomys_ordii
ENSIPUG00000020315	urb2	95	38.732	ENSETEG00000002869	URB2	95	38.732	Echinops_telfairi
ENSIPUG00000020315	urb2	100	36.509	ENSEASG00005012060	URB2	100	36.456	Equus_asinus_asinus
ENSIPUG00000020315	urb2	97	50.262	ENSECAG00000012338	URB2	100	50.262	Equus_caballus
ENSIPUG00000020315	urb2	94	57.343	ENSEEUG00000002669	URB2	92	57.343	Erinaceus_europaeus
ENSIPUG00000020315	urb2	100	55.123	ENSELUG00000014647	urb2	100	55.123	Esox_lucius
ENSIPUG00000020315	urb2	100	35.403	ENSFCAG00000007662	URB2	100	35.399	Felis_catus
ENSIPUG00000020315	urb2	99	37.905	ENSFALG00000003385	URB2	99	37.905	Ficedula_albicollis
ENSIPUG00000020315	urb2	99	35.747	ENSFDAG00000021079	URB2	99	35.876	Fukomys_damarensis
ENSIPUG00000020315	urb2	100	41.292	ENSFHEG00000010357	urb2	100	41.195	Fundulus_heteroclitus
ENSIPUG00000020315	urb2	99	42.018	ENSGMOG00000012459	urb2	100	42.337	Gadus_morhua
ENSIPUG00000020315	urb2	99	38.995	ENSGALG00000011101	URB2	99	38.910	Gallus_gallus
ENSIPUG00000020315	urb2	100	44.965	ENSGACG00000016179	urb2	100	44.965	Gasterosteus_aculeatus
ENSIPUG00000020315	urb2	99	39.658	ENSGAGG00000021879	URB2	99	39.658	Gopherus_agassizii
ENSIPUG00000020315	urb2	99	36.667	ENSGGOG00000025643	URB2	99	36.667	Gorilla_gorilla
ENSIPUG00000020315	urb2	100	41.532	ENSHBUG00000018469	urb2	100	41.702	Haplochromis_burtoni
ENSIPUG00000020315	urb2	97	35.193	ENSHGLG00000016561	URB2	99	35.368	Heterocephalus_glaber_female
ENSIPUG00000020315	urb2	99	35.530	ENSHGLG00100001838	URB2	99	35.530	Heterocephalus_glaber_male
ENSIPUG00000020315	urb2	99	35.668	ENSSTOG00000025323	URB2	99	35.930	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSIPUG00000020315	urb2	99	36.236	ENSJJAG00000011998	Urb2	99	36.236	Jaculus_jaculus
ENSIPUG00000020315	urb2	100	40.505	ENSKMAG00000020129	urb2	100	40.625	Kryptolebias_marmoratus
ENSIPUG00000020315	urb2	99	41.011	ENSLACG00000002038	URB2	99	41.229	Latimeria_chalumnae
ENSIPUG00000020315	urb2	100	47.392	ENSLOCG00000015462	urb2	100	47.392	Lepisosteus_oculatus
ENSIPUG00000020315	urb2	99	34.855	ENSLAFG00000012484	URB2	100	34.855	Loxodonta_africana
ENSIPUG00000020315	urb2	99	36.416	ENSMFAG00000039905	URB2	99	36.352	Macaca_fascicularis
ENSIPUG00000020315	urb2	99	36.545	ENSMMUG00000009509	URB2	99	36.480	Macaca_mulatta
ENSIPUG00000020315	urb2	99	36.609	ENSMNEG00000038762	URB2	99	36.545	Macaca_nemestrina
ENSIPUG00000020315	urb2	99	36.480	ENSMLEG00000043252	URB2	99	36.416	Mandrillus_leucophaeus
ENSIPUG00000020315	urb2	100	41.371	ENSMAMG00000020365	urb2	100	41.430	Mastacembelus_armatus
ENSIPUG00000020315	urb2	100	42.001	ENSMZEG00005011027	urb2	100	42.206	Maylandia_zebra
ENSIPUG00000020315	urb2	93	36.889	ENSMGAG00000012073	URB2	99	36.821	Meleagris_gallopavo
ENSIPUG00000020315	urb2	95	55.944	ENSMAUG00000017980	Urb2	99	55.944	Mesocricetus_auratus
ENSIPUG00000020315	urb2	100	35.871	ENSMICG00000033302	URB2	100	35.871	Microcebus_murinus
ENSIPUG00000020315	urb2	99	35.714	ENSMOCG00000020369	Urb2	99	35.765	Microtus_ochrogaster
ENSIPUG00000020315	urb2	100	42.031	ENSMALG00000006529	urb2	100	42.031	Monopterus_albus
ENSIPUG00000020315	urb2	99	35.614	ENSMUSG00000031976	Urb2	99	35.664	Mus_musculus
ENSIPUG00000020315	urb2	99	36.152	ENSMPUG00000012438	URB2	99	36.152	Mustela_putorius_furo
ENSIPUG00000020315	urb2	99	35.705	ENSNGAG00000016524	Urb2	99	35.765	Nannospalax_galili
ENSIPUG00000020315	urb2	99	36.645	ENSNLEG00000014450	URB2	99	36.645	Nomascus_leucogenys
ENSIPUG00000020315	urb2	90	40.090	ENSMEUG00000016434	URB2	91	40.090	Notamacropus_eugenii
ENSIPUG00000020315	urb2	92	38.171	ENSOPRG00000009906	URB2	92	37.683	Ochotona_princeps
ENSIPUG00000020315	urb2	99	36.293	ENSODEG00000005593	URB2	99	36.652	Octodon_degus
ENSIPUG00000020315	urb2	100	43.959	ENSONIG00000017078	urb2	100	44.144	Oreochromis_niloticus
ENSIPUG00000020315	urb2	87	51.121	ENSOANG00000013732	URB2	100	33.571	Ornithorhynchus_anatinus
ENSIPUG00000020315	urb2	100	35.820	ENSOCUG00000010700	URB2	100	35.820	Oryctolagus_cuniculus
ENSIPUG00000020315	urb2	100	40.788	ENSORLG00000010915	urb2	100	41.291	Oryzias_latipes
ENSIPUG00000020315	urb2	100	41.088	ENSORLG00020003361	urb2	100	41.152	Oryzias_latipes_hni
ENSIPUG00000020315	urb2	100	41.392	ENSORLG00015001534	urb2	100	41.392	Oryzias_latipes_hsok
ENSIPUG00000020315	urb2	100	40.545	ENSOMEG00000010076	urb2	100	41.590	Oryzias_melastigma
ENSIPUG00000020315	urb2	100	35.321	ENSOGAG00000003021	URB2	100	35.321	Otolemur_garnettii
ENSIPUG00000020315	urb2	100	35.645	ENSOARG00000003102	URB2	100	35.645	Ovis_aries
ENSIPUG00000020315	urb2	99	36.538	ENSPPAG00000040629	URB2	99	36.707	Pan_paniscus
ENSIPUG00000020315	urb2	100	35.144	ENSPPRG00000012767	URB2	100	35.159	Panthera_pardus
ENSIPUG00000020315	urb2	97	53.030	ENSPTIG00000012577	URB2	100	53.030	Panthera_tigris_altaica
ENSIPUG00000020315	urb2	99	36.538	ENSPTRG00000002092	URB2	99	36.707	Pan_troglodytes
ENSIPUG00000020315	urb2	99	35.884	ENSPANG00000002245	URB2	99	35.820	Papio_anubis
ENSIPUG00000020315	urb2	99	50.162	ENSPKIG00000005787	urb2	99	50.292	Paramormyrops_kingsleyae
ENSIPUG00000020315	urb2	99	38.921	ENSPSIG00000002690	URB2	99	38.921	Pelodiscus_sinensis
ENSIPUG00000020315	urb2	96	35.243	ENSPEMG00000019551	Urb2	100	35.173	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSIPUG00000020315	urb2	99	37.742	ENSPCIG00000030071	URB2	99	37.742	Phascolarctos_cinereus
ENSIPUG00000020315	urb2	100	41.293	ENSPFOG00000014330	urb2	100	41.293	Poecilia_formosa
ENSIPUG00000020315	urb2	100	40.485	ENSPLAG00000014654	urb2	100	40.485	Poecilia_latipinna
ENSIPUG00000020315	urb2	100	40.835	ENSPMEG00000012356	urb2	100	40.762	Poecilia_mexicana
ENSIPUG00000020315	urb2	100	39.502	ENSPREG00000010268	urb2	100	39.502	Poecilia_reticulata
ENSIPUG00000020315	urb2	100	36.317	ENSPPYG00000000123	URB2	100	36.317	Pongo_abelii
ENSIPUG00000020315	urb2	100	36.639	ENSPCOG00000023537	URB2	100	36.574	Propithecus_coquereli
ENSIPUG00000020315	urb2	100	33.697	ENSPVAG00000002108	URB2	100	33.868	Pteropus_vampyrus
ENSIPUG00000020315	urb2	89	41.985	ENSPNYG00000016840	urb2	95	42.222	Pundamilia_nyererei
ENSIPUG00000020315	urb2	99	66.952	ENSPNAG00000013684	urb2	99	66.952	Pygocentrus_nattereri
ENSIPUG00000020315	urb2	99	35.604	ENSRNOG00000026853	Urb2	97	35.600	Rattus_norvegicus
ENSIPUG00000020315	urb2	99	36.585	ENSRBIG00000037937	URB2	99	36.585	Rhinopithecus_bieti
ENSIPUG00000020315	urb2	99	36.545	ENSRROG00000039854	URB2	99	36.545	Rhinopithecus_roxellana
ENSIPUG00000020315	urb2	99	36.551	ENSSBOG00000023055	URB2	99	36.551	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSIPUG00000020315	urb2	99	37.290	ENSSHAG00000014735	URB2	99	37.290	Sarcophilus_harrisii
ENSIPUG00000020315	urb2	97	48.996	ENSSFOG00015015432	urb2	98	49.130	Scleropages_formosus
ENSIPUG00000020315	urb2	89	42.490	ENSSMAG00000004984	urb2	95	42.490	Scophthalmus_maximus
ENSIPUG00000020315	urb2	100	42.499	ENSSDUG00000000902	urb2	100	42.732	Seriola_dumerili
ENSIPUG00000020315	urb2	99	38.657	ENSSPUG00000018549	URB2	99	38.720	Sphenodon_punctatus
ENSIPUG00000020315	urb2	100	42.686	ENSSPAG00000013632	urb2	100	42.746	Stegastes_partitus
ENSIPUG00000020315	urb2	100	36.181	ENSSSCG00000010186	URB2	100	36.010	Sus_scrofa
ENSIPUG00000020315	urb2	99	38.095	ENSTGUG00000009990	URB2	99	38.095	Taeniopygia_guttata
ENSIPUG00000020315	urb2	100	41.155	ENSTRUG00000008173	urb2	100	41.289	Takifugu_rubripes
ENSIPUG00000020315	urb2	92	48.929	ENSTNIG00000017689	urb2	100	42.638	Tetraodon_nigroviridis
ENSIPUG00000020315	urb2	96	71.429	ENSTTRG00000014864	URB2	96	71.429	Tursiops_truncatus
ENSIPUG00000020315	urb2	100	35.696	ENSUAMG00000015022	URB2	100	35.714	Ursus_americanus
ENSIPUG00000020315	urb2	100	35.664	ENSUMAG00000004728	URB2	100	35.682	Ursus_maritimus
ENSIPUG00000020315	urb2	52	59.722	ENSVPAG00000001750	-	51	59.722	Vicugna_pacos
ENSIPUG00000020315	urb2	99	35.677	ENSVVUG00000006747	URB2	99	35.677	Vulpes_vulpes
ENSIPUG00000020315	urb2	99	36.189	ENSXETG00000023331	urb2	99	36.189	Xenopus_tropicalis
ENSIPUG00000020315	urb2	100	39.608	ENSXMAG00000015059	urb2	100	40.074	Xiphophorus_maculatus