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Description

Ensembl ID: ENSIPUG00000020627 (Gene tree)
Gene ID: 108274219
Gene Symbol: pelo
Alias: wu:fa12c12|wu:fb97f07|zgc:56550
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Ictalurus_punctatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7980 bases
Position: chr13:26035148-26043127
Accession: 108274219
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSIPUP00000030615	eRF1_2	PF03464.15	7.6e-33	1	1
ENSIPUP00000030592	eRF1_2	PF03464.15	8e-33	1	1
ENSIPUP00000030592	eRF1_3	PF03465.15	9.7e-24	1	1
ENSIPUP00000030615	eRF1_3	PF03465.15	9.3e-14	1	1
ENSIPUP00000030615	eRF1_1	PF03463.15	4e-53	1	1
ENSIPUP00000030592	eRF1_1	PF03463.15	8.9e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSIPUT00000031845	-	1101	-	ENSIPUP00000030615	366 (aa)	-	-
ENSIPUT00000031822	-	3896	XM_017484233	ENSIPUP00000030592	385 (aa)	XP_017339722	W5U8Y4

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ipu03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.740	ENSG00000152684	PELO	100	79.740	Homo_sapiens
ENSIPUG00000020627	pelo	67	91.903	ENSAPOG00000023700	-	90	91.903	Acanthochromis_polyacanthus
ENSIPUG00000020627	pelo	67	91.903	ENSAPOG00000000616	pelo	90	91.903	Acanthochromis_polyacanthus
ENSIPUG00000020627	pelo	100	89.870	ENSAPOG00000023072	pelo	100	89.870	Acanthochromis_polyacanthus
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.481	ENSAMEG00000007734	PELO	100	79.481	Ailuropoda_melanoleuca
ENSIPUG00000020627	pelo	97	84.182	ENSACIG00000014386	pelo	97	89.645	Amphilophus_citrinellus
ENSIPUG00000020627	pelo	100	90.130	ENSAOCG00000023717	pelo	100	90.130	Amphiprion_ocellaris
ENSIPUG00000020627	pelo	100	90.130	ENSAPEG00000011235	pelo	100	90.130	Amphiprion_percula
ENSIPUG00000020627	pelo	100	89.870	ENSATEG00000019550	pelo	100	89.870	Anabas_testudineus
ENSIPUG00000020627	pelo	77	70.470	ENSAPLG00000013265	PELO	100	70.470	Anas_platyrhynchos
ENSIPUG00000020627	pelo	97	79.733	ENSACAG00000004352	PELO	100	79.481	Anolis_carolinensis
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.481	ENSANAG00000014096	PELO	100	79.481	Aotus_nancymaae
ENSIPUG00000020627	pelo	100	89.091	ENSACLG00000010305	pelo	100	89.091	Astatotilapia_calliptera
ENSIPUG00000020627	pelo	97	94.370	ENSAMXG00000020299	pelo	100	93.523	Astyanax_mexicanus
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.481	ENSBTAG00000003268	PELO	99	79.481	Bos_taurus
ENSIPUG00000020627	pelo	97	60.267	WBGene00011280	pelo-1	98	60.267	Caenorhabditis_elegans
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.221	ENSCJAG00000035190	PELO	100	79.221	Callithrix_jacchus
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.740	ENSCAFG00020023234	PELO	100	79.740	Canis_lupus_dingo
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.221	ENSCHIG00000016410	PELO	99	79.221	Capra_hircus
ENSIPUG00000020627	pelo	100	80.000	ENSTSYG00000005203	PELO	100	80.000	Carlito_syrichta
ENSIPUG00000020627	pelo	100	80.000	ENSCPOG00000027406	PELO	100	80.000	Cavia_porcellus
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.221	ENSCCAG00000035600	PELO	100	79.221	Cebus_capucinus
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.481	ENSCATG00000011829	PELO	100	79.481	Cercocebus_atys
ENSIPUG00000020627	pelo	100	80.000	ENSCLAG00000005043	PELO	100	80.000	Chinchilla_lanigera
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.481	ENSCSAG00000016692	PELO	100	79.481	Chlorocebus_sabaeus
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.740	ENSCHOG00000000523	PELO	100	79.740	Choloepus_hoffmanni
ENSIPUG00000020627	pelo	97	79.467	ENSCPBG00000007544	PELO	100	79.221	Chrysemys_picta_bellii
ENSIPUG00000020627	pelo	96	65.676	ENSCING00000001979	-	100	65.195	Ciona_intestinalis
ENSIPUG00000020627	pelo	100	66.753	ENSCSAVG00000006158	-	100	66.753	Ciona_savignyi
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.481	ENSCANG00000023382	PELO	100	79.481	Colobus_angolensis_palliatus
ENSIPUG00000020627	pelo	97	80.429	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	80.260	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSIPUG00000020627	pelo	97	80.965	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	80.779	Cricetulus_griseus_crigri
ENSIPUG00000020627	pelo	100	89.351	ENSCSEG00000008807	pelo	100	89.351	Cynoglossus_semilaevis
ENSIPUG00000020627	pelo	100	89.091	ENSCVAG00000016082	pelo	100	89.091	Cyprinodon_variegatus
ENSIPUG00000020627	pelo	100	92.468	ENSDARG00000055477	pelo	100	92.468	Danio_rerio
ENSIPUG00000020627	pelo	96	78.919	ENSDNOG00000036721	PELO	96	78.919	Dasypus_novemcinctus
ENSIPUG00000020627	pelo	100	81.039	ENSDORG00000016689	Pelo	100	81.039	Dipodomys_ordii
ENSIPUG00000020627	pelo	96	65.946	FBgn0011207	pelo	97	64.230	Drosophila_melanogaster
ENSIPUG00000020627	pelo	71	78.947	ENSEBUG00000004955	pelo	99	78.947	Eptatretus_burgeri
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.740	ENSEASG00005013348	PELO	100	79.740	Equus_asinus_asinus
ENSIPUG00000020627	pelo	100	89.870	ENSELUG00000023229	pelo	100	89.870	Esox_lucius
ENSIPUG00000020627	pelo	100	80.260	ENSFCAG00000032341	PELO	100	80.260	Felis_catus
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.740	ENSFALG00000004559	PELO	100	79.740	Ficedula_albicollis
ENSIPUG00000020627	pelo	78	81.338	ENSFDAG00000002076	PELO	88	81.338	Fukomys_damarensis
ENSIPUG00000020627	pelo	100	88.571	ENSFHEG00000009769	pelo	100	88.828	Fundulus_heteroclitus
ENSIPUG00000020627	pelo	98	89.125	ENSGMOG00000005849	pelo	100	88.571	Gadus_morhua
ENSIPUG00000020627	pelo	100	88.312	ENSGAFG00000019350	pelo	100	88.312	Gambusia_affinis
ENSIPUG00000020627	pelo	100	88.831	ENSGACG00000007245	pelo	100	88.831	Gasterosteus_aculeatus
ENSIPUG00000020627	pelo	97	79.733	ENSGAGG00000004018	PELO	100	79.481	Gopherus_agassizii
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.481	ENSGGOG00000012635	PELO	100	79.481	Gorilla_gorilla
ENSIPUG00000020627	pelo	100	89.091	ENSHBUG00000005866	pelo	100	89.091	Haplochromis_burtoni
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.740	ENSHGLG00000005932	PELO	100	79.740	Heterocephalus_glaber_female
ENSIPUG00000020627	pelo	100	77.662	ENSHGLG00100017627	PELO	100	77.662	Heterocephalus_glaber_male
ENSIPUG00000020627	pelo	100	87.273	ENSHCOG00000016782	pelo	100	87.273	Hippocampus_comes
ENSIPUG00000020627	pelo	100	80.260	ENSSTOG00000027378	PELO	100	80.260	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSIPUG00000020627	pelo	100	77.922	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	77.922	Jaculus_jaculus
ENSIPUG00000020627	pelo	100	88.831	ENSKMAG00000021305	pelo	100	88.831	Kryptolebias_marmoratus
ENSIPUG00000020627	pelo	100	89.351	ENSLBEG00000022399	pelo	100	89.351	Labrus_bergylta
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.481	ENSLAFG00000020551	PELO	100	79.481	Loxodonta_africana
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.481	ENSMFAG00000000651	PELO	100	79.481	Macaca_fascicularis
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.481	ENSMMUG00000039101	PELO	100	79.481	Macaca_mulatta
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.481	ENSMNEG00000035538	PELO	100	79.481	Macaca_nemestrina
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.481	ENSMLEG00000039113	PELO	100	79.481	Mandrillus_leucophaeus
ENSIPUG00000020627	pelo	97	90.885	ENSMAMG00000013260	pelo	100	90.390	Mastacembelus_armatus
ENSIPUG00000020627	pelo	100	89.091	ENSMZEG00005014258	pelo	100	89.091	Maylandia_zebra
ENSIPUG00000020627	pelo	100	80.779	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	80.779	Mesocricetus_auratus
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.740	ENSMICG00000044040	PELO	100	79.740	Microcebus_murinus
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.740	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	79.740	Microtus_ochrogaster
ENSIPUG00000020627	pelo	100	89.091	ENSMMOG00000001324	pelo	100	89.091	Mola_mola
ENSIPUG00000020627	pelo	100	89.091	ENSMALG00000008194	pelo	100	89.091	Monopterus_albus
ENSIPUG00000020627	pelo	100	80.000	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	80.000	Mus_caroli
ENSIPUG00000020627	pelo	100	80.000	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	80.000	Mus_musculus
ENSIPUG00000020627	pelo	100	80.260	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	80.260	Mus_pahari
ENSIPUG00000020627	pelo	100	80.000	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	80.000	Mus_spretus
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.481	ENSMLUG00000024132	PELO	100	79.481	Myotis_lucifugus
ENSIPUG00000020627	pelo	100	81.039	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	81.039	Nannospalax_galili
ENSIPUG00000020627	pelo	100	89.091	ENSNBRG00000011799	pelo	100	89.091	Neolamprologus_brichardi
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.481	ENSNLEG00000035970	PELO	100	79.481	Nomascus_leucogenys
ENSIPUG00000020627	pelo	100	78.961	ENSMEUG00000005468	PELO	100	78.961	Notamacropus_eugenii
ENSIPUG00000020627	pelo	98	78.892	ENSOPRG00000018793	PELO	100	78.892	Ochotona_princeps
ENSIPUG00000020627	pelo	100	81.039	ENSODEG00000017579	PELO	100	81.039	Octodon_degus
ENSIPUG00000020627	pelo	96	89.218	ENSONIG00000011511	pelo	100	88.831	Oreochromis_niloticus
ENSIPUG00000020627	pelo	100	80.260	ENSOCUG00000023902	PELO	100	80.260	Oryctolagus_cuniculus
ENSIPUG00000020627	pelo	100	87.532	ENSORLG00000005827	pelo	100	87.532	Oryzias_latipes
ENSIPUG00000020627	pelo	100	87.273	ENSORLG00020016456	pelo	100	87.273	Oryzias_latipes_hni
ENSIPUG00000020627	pelo	100	87.273	ENSORLG00015014447	pelo	100	87.500	Oryzias_latipes_hsok
ENSIPUG00000020627	pelo	100	88.571	ENSOMEG00000021567	pelo	100	88.571	Oryzias_melastigma
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.740	ENSOGAG00000027940	PELO	100	79.740	Otolemur_garnettii
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.481	ENSOARG00000008324	PELO	99	79.481	Ovis_aries
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.481	ENSPPAG00000038951	PELO	100	79.481	Pan_paniscus
ENSIPUG00000020627	pelo	100	80.260	ENSPPRG00000018800	PELO	100	80.260	Panthera_pardus
ENSIPUG00000020627	pelo	100	80.260	ENSPTIG00000019988	PELO	100	80.260	Panthera_tigris_altaica
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.481	ENSPTRG00000034409	PELO	100	79.481	Pan_troglodytes
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.481	ENSPANG00000010902	PELO	100	79.481	Papio_anubis
ENSIPUG00000020627	pelo	100	90.909	ENSPKIG00000015190	pelo	100	90.909	Paramormyrops_kingsleyae
ENSIPUG00000020627	pelo	97	79.733	ENSPSIG00000004971	PELO	100	79.481	Pelodiscus_sinensis
ENSIPUG00000020627	pelo	69	90.945	ENSPMGG00000014561	pelo	94	90.945	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSIPUG00000020627	pelo	100	80.260	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	80.260	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSIPUG00000020627	pelo	100	80.260	ENSPCIG00000004880	PELO	100	80.260	Phascolarctos_cinereus
ENSIPUG00000020627	pelo	100	88.831	ENSPFOG00000007277	pelo	100	88.831	Poecilia_formosa
ENSIPUG00000020627	pelo	100	89.091	ENSPLAG00000020787	pelo	100	89.091	Poecilia_latipinna
ENSIPUG00000020627	pelo	100	88.831	ENSPMEG00000016964	pelo	100	88.831	Poecilia_mexicana
ENSIPUG00000020627	pelo	100	89.091	ENSPREG00000023071	pelo	100	89.091	Poecilia_reticulata
ENSIPUG00000020627	pelo	97	80.161	ENSPPYG00000015451	PELO	96	79.740	Pongo_abelii
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.740	ENSPCOG00000021178	PELO	100	79.740	Propithecus_coquereli
ENSIPUG00000020627	pelo	100	89.091	ENSPNYG00000017325	pelo	100	89.091	Pundamilia_nyererei
ENSIPUG00000020627	pelo	97	94.370	ENSPNAG00000012458	pelo	99	93.247	Pygocentrus_nattereri
ENSIPUG00000020627	pelo	100	80.779	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	80.779	Rattus_norvegicus
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.481	ENSRBIG00000007299	PELO	100	79.481	Rhinopithecus_bieti
ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.481	ENSRROG00000035507	PELO	100	79.481	Rhinopithecus_roxellana
ENSIPUG00000020627	pelo	94	32.440	YNL001W	-	96	32.440	Saccharomyces_cerevisiae
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