EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSIPUG00000021084 (Gene tree)
Gene ID: 108279080
Gene Symbol: rexo4
Alias: im:7156740|si:ch73-209e20.4
Full Name: REX4 homolog%2C 3'-5' exonuclease
Gene Type: protein_coding
Species: Ictalurus_punctatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7977 bases
Position: chr18:379140-387116
Accession: 108279080
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSIPUP00000031306	RNase_T	PF00929.24	5.5e-21	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSIPUT00000032558	-	6100	XM_017493045	ENSIPUP00000031306	413 (aa)	XP_017348534	A0A2D0T0T9

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	47.581	ENSG00000148300	REXO4	96	41.951	Homo_sapiens
ENSIPUG00000021084	rexo4	82	56.863	ENSAPOG00000019264	rexo4	86	56.216	Acanthochromis_polyacanthus
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	48.753	ENSAMEG00000011649	REXO4	84	47.207	Ailuropoda_melanoleuca
ENSIPUG00000021084	rexo4	85	56.757	ENSAOCG00000004087	rexo4	86	56.757	Amphiprion_ocellaris
ENSIPUG00000021084	rexo4	85	56.757	ENSAPEG00000009106	rexo4	86	55.851	Amphiprion_percula
ENSIPUG00000021084	rexo4	86	54.780	ENSATEG00000017662	rexo4	87	54.756	Anabas_testudineus
ENSIPUG00000021084	rexo4	57	67.797	ENSAPLG00000005865	REXO4	67	69.507	Anas_platyrhynchos
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	48.451	ENSANAG00000028404	REXO4	91	46.939	Aotus_nancymaae
ENSIPUG00000021084	rexo4	93	52.019	ENSACLG00000006007	rexo4	95	51.544	Astatotilapia_calliptera
ENSIPUG00000021084	rexo4	90	57.506	ENSAMXG00000013291	rexo4	97	56.393	Astyanax_mexicanus
ENSIPUG00000021084	rexo4	80	48.000	ENSBTAG00000019721	REXO4	83	47.143	Bos_taurus
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	47.368	ENSCJAG00000009774	REXO4	90	45.876	Callithrix_jacchus
ENSIPUG00000021084	rexo4	80	49.162	ENSCAFG00000019767	REXO4	52	66.063	Canis_familiaris
ENSIPUG00000021084	rexo4	80	49.721	ENSCAFG00020000983	-	50	66.516	Canis_lupus_dingo
ENSIPUG00000021084	rexo4	80	49.713	ENSCHIG00000009517	REXO4	83	49.138	Capra_hircus
ENSIPUG00000021084	rexo4	80	47.383	ENSTSYG00000027492	REXO4	91	45.432	Carlito_syrichta
ENSIPUG00000021084	rexo4	54	64.253	ENSCAPG00000014583	REXO4	63	64.253	Cavia_aperea
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	42.817	ENSCCAG00000027049	REXO4	90	41.688	Cebus_capucinus
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	48.767	ENSCATG00000028646	REXO4	91	46.766	Cercocebus_atys
ENSIPUG00000021084	rexo4	56	59.227	ENSCLAG00000006919	REXO4	68	59.227	Chinchilla_lanigera
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	47.354	ENSCSAG00000015280	REXO4	91	45.455	Chlorocebus_sabaeus
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	53.168	ENSCPBG00000021152	REXO4	86	52.747	Chrysemys_picta_bellii
ENSIPUG00000021084	rexo4	54	54.911	ENSCING00000010751	-	76	55.505	Ciona_intestinalis
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	49.176	ENSCANG00000029855	REXO4	91	47.132	Colobus_angolensis_palliatus
ENSIPUG00000021084	rexo4	80	47.727	ENSCGRG00001013126	Rexo4	89	45.918	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSIPUG00000021084	rexo4	80	47.727	ENSCGRG00000009819	Rexo4	92	45.918	Cricetulus_griseus_crigri
ENSIPUG00000021084	rexo4	87	54.188	ENSCSEG00000019343	rexo4	87	54.450	Cynoglossus_semilaevis
ENSIPUG00000021084	rexo4	57	68.487	ENSCVAG00000014963	rexo4	63	68.487	Cyprinodon_variegatus
ENSIPUG00000021084	rexo4	96	52.471	ENSDARG00000088619	rexo4	86	72.152	Danio_rerio
ENSIPUG00000021084	rexo4	80	41.646	ENSDNOG00000002429	REXO4	83	44.144	Dasypus_novemcinctus
ENSIPUG00000021084	rexo4	54	64.706	ENSDORG00000006190	Rexo4	62	64.706	Dipodomys_ordii
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	49.148	ENSECAG00000007896	REXO4	76	48.864	Equus_caballus
ENSIPUG00000021084	rexo4	83	55.703	ENSELUG00000003539	rexo4	95	52.113	Esox_lucius
ENSIPUG00000021084	rexo4	82	48.045	ENSFCAG00000011652	REXO4	81	47.592	Felis_catus
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	52.747	ENSFALG00000001520	REXO4	86	51.882	Ficedula_albicollis
ENSIPUG00000021084	rexo4	80	48.876	ENSFDAG00000016050	REXO4	91	45.316	Fukomys_damarensis
ENSIPUG00000021084	rexo4	84	55.278	ENSFHEG00000002413	rexo4	91	53.989	Fundulus_heteroclitus
ENSIPUG00000021084	rexo4	54	60.444	ENSGMOG00000012876	rexo4	66	60.444	Gadus_morhua
ENSIPUG00000021084	rexo4	71	45.912	ENSGAFG00000015404	-	95	45.597	Gambusia_affinis
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	58.754	ENSGACG00000008065	rexo4	80	58.754	Gasterosteus_aculeatus
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	55.114	ENSGAGG00000010260	REXO4	85	54.830	Gopherus_agassizii
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	47.312	ENSGGOG00000014508	REXO4	91	45.966	Gorilla_gorilla
ENSIPUG00000021084	rexo4	93	52.019	ENSHBUG00000000542	rexo4	95	51.544	Haplochromis_burtoni
ENSIPUG00000021084	rexo4	89	47.848	ENSHGLG00000016901	REXO4	91	46.970	Heterocephalus_glaber_female
ENSIPUG00000021084	rexo4	89	47.848	ENSHGLG00100017444	REXO4	91	46.970	Heterocephalus_glaber_male
ENSIPUG00000021084	rexo4	57	60.759	ENSHCOG00000018196	rexo4	61	60.759	Hippocampus_comes
ENSIPUG00000021084	rexo4	85	49.737	ENSSTOG00000003754	REXO4	87	49.602	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSIPUG00000021084	rexo4	80	49.858	ENSJJAG00000013002	Rexo4	89	45.865	Jaculus_jaculus
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	55.556	ENSKMAG00000015039	rexo4	94	52.273	Kryptolebias_marmoratus
ENSIPUG00000021084	rexo4	83	55.525	ENSLBEG00000025570	rexo4	83	55.525	Labrus_bergylta
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	53.631	ENSLACG00000012399	REXO4	83	53.631	Latimeria_chalumnae
ENSIPUG00000021084	rexo4	92	46.934	ENSLOCG00000003577	rexo4	93	49.268	Lepisosteus_oculatus
ENSIPUG00000021084	rexo4	85	46.419	ENSLAFG00000011274	REXO4	95	44.307	Loxodonta_africana
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	49.176	ENSMFAG00000042425	REXO4	91	47.132	Macaca_fascicularis
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	48.626	ENSMMUG00000000935	REXO4	91	46.633	Macaca_mulatta
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	49.036	ENSMNEG00000031604	REXO4	91	47.000	Macaca_nemestrina
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	48.889	ENSMLEG00000037716	REXO4	91	46.851	Mandrillus_leucophaeus
ENSIPUG00000021084	rexo4	85	55.000	ENSMAMG00000011251	rexo4	94	53.237	Mastacembelus_armatus
ENSIPUG00000021084	rexo4	99	50.351	ENSMZEG00005012336	rexo4	98	49.883	Maylandia_zebra
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	52.762	ENSMGAG00000006521	REXO4	98	50.546	Meleagris_gallopavo
ENSIPUG00000021084	rexo4	80	49.148	ENSMAUG00000015137	Rexo4	80	48.864	Mesocricetus_auratus
ENSIPUG00000021084	rexo4	86	48.177	ENSMICG00000008422	REXO4	82	49.441	Microcebus_murinus
ENSIPUG00000021084	rexo4	80	49.148	ENSMOCG00000020607	Rexo4	79	49.153	Microtus_ochrogaster
ENSIPUG00000021084	rexo4	83	49.206	ENSMODG00000012817	REXO4	84	48.691	Monodelphis_domestica
ENSIPUG00000021084	rexo4	85	54.987	ENSMALG00000019705	rexo4	85	53.369	Monopterus_albus
ENSIPUG00000021084	rexo4	80	48.000	MGP_CAROLIEiJ_G0023332	-	83	48.286	Mus_caroli
ENSIPUG00000021084	rexo4	85	46.667	ENSMUSG00000052406	Rexo4	89	46.736	Mus_musculus
ENSIPUG00000021084	rexo4	85	48.128	MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	89	47.781	Mus_pahari
ENSIPUG00000021084	rexo4	80	48.451	MGP_SPRETEiJ_G0024249	-	83	48.870	Mus_spretus
ENSIPUG00000021084	rexo4	53	64.545	ENSMPUG00000012315	REXO4	60	64.545	Mustela_putorius_furo
ENSIPUG00000021084	rexo4	92	47.028	ENSNGAG00000010700	Rexo4	95	47.028	Nannospalax_galili
ENSIPUG00000021084	rexo4	82	56.901	ENSNBRG00000011712	rexo4	83	56.901	Neolamprologus_brichardi
ENSIPUG00000021084	rexo4	84	48.138	ENSNLEG00000013130	-	93	46.359	Nomascus_leucogenys
ENSIPUG00000021084	rexo4	59	60.246	ENSNLEG00000007556	-	93	46.547	Nomascus_leucogenys
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	39.773	ENSMEUG00000006513	-	85	39.554	Notamacropus_eugenii
ENSIPUG00000021084	rexo4	74	50.456	ENSODEG00000015721	REXO4	92	49.848	Octodon_degus
ENSIPUG00000021084	rexo4	82	56.160	ENSONIG00000020052	rexo4	83	56.160	Oreochromis_niloticus
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	52.500	ENSOANG00000002453	REXO4	92	51.667	Ornithorhynchus_anatinus
ENSIPUG00000021084	rexo4	86	54.278	ENSORLG00000006904	rexo4	87	54.155	Oryzias_latipes
ENSIPUG00000021084	rexo4	86	53.743	ENSORLG00020013768	rexo4	87	54.595	Oryzias_latipes_hni
ENSIPUG00000021084	rexo4	86	54.987	ENSORLG00015012070	rexo4	87	54.865	Oryzias_latipes_hsok
ENSIPUG00000021084	rexo4	86	53.495	ENSOMEG00000018327	rexo4	86	53.369	Oryzias_melastigma
ENSIPUG00000021084	rexo4	82	47.899	ENSOGAG00000014040	REXO4	85	48.459	Otolemur_garnettii
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	48.753	ENSPPAG00000027911	REXO4	91	45.966	Pan_paniscus
ENSIPUG00000021084	rexo4	82	49.580	ENSPPRG00000002894	REXO4	86	49.577	Panthera_pardus
ENSIPUG00000021084	rexo4	82	44.253	ENSPTIG00000012007	REXO4	83	44.253	Panthera_tigris_altaica
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	49.020	ENSPTRG00000023363	REXO4	91	45.966	Pan_troglodytes
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	48.889	ENSPANG00000026040	REXO4	91	46.851	Papio_anubis
ENSIPUG00000021084	rexo4	98	51.515	ENSPKIG00000024761	rexo4	100	51.049	Paramormyrops_kingsleyae
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	53.973	ENSPSIG00000016908	REXO4	98	50.000	Pelodiscus_sinensis
ENSIPUG00000021084	rexo4	82	55.030	ENSPMGG00000005312	rexo4	81	53.804	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSIPUG00000021084	rexo4	80	48.011	ENSPEMG00000017982	Rexo4	83	48.011	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	51.872	ENSPCIG00000017379	REXO4	83	51.872	Phascolarctos_cinereus
ENSIPUG00000021084	rexo4	89	53.003	ENSPFOG00000017751	rexo4	100	51.306	Poecilia_formosa
ENSIPUG00000021084	rexo4	89	53.003	ENSPLAG00000010487	rexo4	100	51.294	Poecilia_latipinna
ENSIPUG00000021084	rexo4	89	54.450	ENSPMEG00000020767	rexo4	100	52.381	Poecilia_mexicana
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	55.874	ENSPREG00000021841	rexo4	92	52.564	Poecilia_reticulata
ENSIPUG00000021084	rexo4	84	48.404	ENSPPYG00000019735	REXO4	93	46.973	Pongo_abelii
ENSIPUG00000021084	rexo4	82	46.721	ENSPCAG00000010581	REXO4	85	46.995	Procavia_capensis
ENSIPUG00000021084	rexo4	80	49.718	ENSPCOG00000025466	REXO4	89	46.212	Propithecus_coquereli
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	43.059	ENSPVAG00000001429	REXO4	82	42.210	Pteropus_vampyrus
ENSIPUG00000021084	rexo4	93	52.257	ENSPNYG00000013712	rexo4	95	51.781	Pundamilia_nyererei
ENSIPUG00000021084	rexo4	89	61.856	ENSPNAG00000019227	rexo4	86	61.856	Pygocentrus_nattereri
ENSIPUG00000021084	rexo4	80	49.292	ENSRNOG00000027867	Rexo4	83	49.292	Rattus_norvegicus
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	49.315	ENSRBIG00000037515	REXO4	91	47.382	Rhinopithecus_bieti
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	49.315	ENSRROG00000028864	REXO4	91	47.382	Rhinopithecus_roxellana
ENSIPUG00000021084	rexo4	56	48.927	ENSSBOG00000032587	REXO4	89	37.755	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	50.552	ENSSHAG00000005827	REXO4	89	51.515	Sarcophilus_harrisii
ENSIPUG00000021084	rexo4	57	72.574	ENSSFOG00015017394	rexo4	65	72.574	Scleropages_formosus
ENSIPUG00000021084	rexo4	87	54.026	ENSSMAG00000015441	rexo4	88	53.906	Scophthalmus_maximus
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	56.831	ENSSDUG00000023346	rexo4	98	50.000	Seriola_dumerili
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	56.546	ENSSLDG00000011085	rexo4	99	50.801	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSIPUG00000021084	rexo4	83	52.033	ENSSPUG00000015868	REXO4	85	50.000	Sphenodon_punctatus
ENSIPUG00000021084	rexo4	85	55.496	ENSSPAG00000007221	rexo4	86	54.856	Stegastes_partitus
ENSIPUG00000021084	rexo4	80	48.883	ENSSSCG00000023173	REXO4	82	47.527	Sus_scrofa
ENSIPUG00000021084	rexo4	80	54.294	ENSTGUG00000005537	REXO4	95	51.538	Taeniopygia_guttata
ENSIPUG00000021084	rexo4	85	54.933	ENSTRUG00000013225	rexo4	86	59.006	Takifugu_rubripes
ENSIPUG00000021084	rexo4	85	54.642	ENSTNIG00000005873	rexo4	99	53.581	Tetraodon_nigroviridis
ENSIPUG00000021084	rexo4	81	48.753	ENSUAMG00000018676	REXO4	82	48.747	Ursus_americanus
ENSIPUG00000021084	rexo4	80	46.176	ENSUMAG00000023164	REXO4	93	46.154	Ursus_maritimus
ENSIPUG00000021084	rexo4	80	49.162	ENSVVUG00000027337	REXO4	50	65.611	Vulpes_vulpes
ENSIPUG00000021084	rexo4	74	50.157	ENSXETG00000023096	rexo4	88	50.000	Xenopus_tropicalis
ENSIPUG00000021084	rexo4	89	52.865	ENSXMAG00000013686	rexo4	98	52.488	Xiphophorus_maculatus