EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSIPUG00000022879 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rpp38
Alias: fc10d08|wu:fc10d08|zgc:92924
Full Name: ribonuclease P/MRP subunit p38
Gene Type: protein_coding
Species: Ictalurus_punctatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2211 bases
Position: chr23:15229747-15231957
Accession: 108256513
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSIPUP00000034054	Ribosomal_L7Ae	PF01248.26	4.2e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSIPUT00000035391	-	732	XM_017453451	ENSIPUP00000034054	243 (aa)	XP_017308940	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSIPUG00000022879	rpp38	99	42.086	ENSG00000152464	RPP38	88	43.243	Homo_sapiens
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	45.693	ENSAPOG00000001240	rpp38	95	43.123	Acanthochromis_polyacanthus
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	40.602	ENSAMEG00000018832	RPP38	88	41.296	Ailuropoda_melanoleuca
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	47.015	ENSACIG00000011592	rpp38	97	45.693	Amphilophus_citrinellus
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	44.444	ENSAOCG00000017293	rpp38	96	44.444	Amphiprion_ocellaris
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	47.710	ENSAPEG00000002315	rpp38	95	47.710	Amphiprion_percula
ENSIPUG00000022879	rpp38	98	47.426	ENSATEG00000000731	rpp38	91	47.347	Anabas_testudineus
ENSIPUG00000022879	rpp38	92	42.146	ENSAPLG00000002054	RPP38	89	41.767	Anas_platyrhynchos
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	47.876	ENSACLG00000016958	rpp38	96	50.198	Astatotilapia_calliptera
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	48.617	ENSACLG00000016962	rpp38	96	50.198	Astatotilapia_calliptera
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	57.851	ENSAMXG00000025023	rpp38	93	56.432	Astyanax_mexicanus
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	42.379	ENSBTAG00000007702	RPP38	89	42.063	Bos_taurus
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	43.820	ENSCAFG00000024373	RPP38	88	42.339	Canis_familiaris
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	43.820	ENSCAFG00020008008	RPP38	88	42.339	Canis_lupus_dingo
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	42.007	ENSCHIG00000012484	RPP38	88	41.833	Capra_hircus
ENSIPUG00000022879	rpp38	97	44.000	ENSCPOG00000003981	RPP38	89	42.745	Cavia_porcellus
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	40.892	ENSCLAG00000010194	RPP38	88	41.434	Chinchilla_lanigera
ENSIPUG00000022879	rpp38	92	39.695	ENSCSAG00000019055	RPP38	88	41.767	Chlorocebus_sabaeus
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	40.149	ENSCHOG00000004335	RPP38	88	41.200	Choloepus_hoffmanni
ENSIPUG00000022879	rpp38	90	41.732	ENSCGRG00001001395	Rpp38	87	41.224	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSIPUG00000022879	rpp38	90	41.732	ENSCGRG00000017441	Rpp38	87	41.224	Cricetulus_griseus_crigri
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	47.126	ENSCSEG00000001721	rpp38	96	46.743	Cynoglossus_semilaevis
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	42.804	ENSCVAG00000001676	rpp38	89	43.874	Cyprinodon_variegatus
ENSIPUG00000022879	rpp38	96	55.253	ENSDARG00000040350	rpp38	89	52.941	Danio_rerio
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	41.045	ENSDNOG00000040314	RPP38	88	40.800	Dasypus_novemcinctus
ENSIPUG00000022879	rpp38	96	42.105	ENSDORG00000009783	Rpp38	88	42.975	Dipodomys_ordii
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	41.132	ENSETEG00000002839	RPP38	88	42.972	Echinops_telfairi
ENSIPUG00000022879	rpp38	90	42.857	ENSEASG00005019783	RPP38	87	42.105	Equus_asinus_asinus
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	42.007	ENSEEUG00000014677	RPP38	89	40.784	Erinaceus_europaeus
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	44.483	ENSELUG00000010160	rpp38	97	43.599	Esox_lucius
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	41.729	ENSFCAG00000022449	RPP38	88	41.700	Felis_catus
ENSIPUG00000022879	rpp38	92	40.076	ENSFALG00000014804	RPP38	86	39.200	Ficedula_albicollis
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	39.852	ENSFDAG00000018669	RPP38	88	40.000	Fukomys_damarensis
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	42.754	ENSFHEG00000013741	rpp38	96	40.942	Fundulus_heteroclitus
ENSIPUG00000022879	rpp38	90	42.412	ENSGALG00000008794	RPP38	85	41.365	Gallus_gallus
ENSIPUG00000022879	rpp38	59	53.503	ENSGACG00000009258	rpp38	98	52.229	Gasterosteus_aculeatus
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	47.490	ENSHBUG00000010937	rpp38	96	49.802	Haplochromis_burtoni
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	39.033	ENSHGLG00000012144	RPP38	88	39.200	Heterocephalus_glaber_female
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	44.569	ENSSTOG00000025699	RPP38	86	45.565	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSIPUG00000022879	rpp38	97	42.049	ENSJJAG00000007523	Rpp38	89	41.176	Jaculus_jaculus
ENSIPUG00000022879	rpp38	90	45.038	ENSKMAG00000003986	rpp38	89	45.560	Kryptolebias_marmoratus
ENSIPUG00000022879	rpp38	98	46.350	ENSLBEG00000006853	rpp38	97	45.185	Labrus_bergylta
ENSIPUG00000022879	rpp38	93	41.758	ENSLACG00000006502	RPP38	89	40.530	Latimeria_chalumnae
ENSIPUG00000022879	rpp38	99	44.643	ENSLOCG00000018347	rpp38	89	43.874	Lepisosteus_oculatus
ENSIPUG00000022879	rpp38	97	42.182	ENSLAFG00000000509	RPP38	88	43.028	Loxodonta_africana
ENSIPUG00000022879	rpp38	92	40.076	ENSMMUG00000007679	RPP38	88	42.169	Macaca_mulatta
ENSIPUG00000022879	rpp38	96	50.965	ENSMAMG00000012774	rpp38	95	50.787	Mastacembelus_armatus
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	48.263	ENSMZEG00005003189	rpp38	96	50.593	Maylandia_zebra
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	47.876	ENSMZEG00005003200	rpp38	96	50.198	Maylandia_zebra
ENSIPUG00000022879	rpp38	90	40.467	ENSMGAG00000008217	RPP38	85	40.161	Meleagris_gallopavo
ENSIPUG00000022879	rpp38	90	41.502	ENSMAUG00000003644	Rpp38	87	40.081	Mesocricetus_auratus
ENSIPUG00000022879	rpp38	90	42.292	ENSMOCG00000007020	Rpp38	88	39.676	Microtus_ochrogaster
ENSIPUG00000022879	rpp38	96	45.865	ENSMMOG00000003446	rpp38	96	46.875	Mola_mola
ENSIPUG00000022879	rpp38	94	42.751	ENSMODG00000024091	RPP38	89	43.254	Monodelphis_domestica
ENSIPUG00000022879	rpp38	93	47.860	ENSMALG00000002356	rpp38	90	48.770	Monopterus_albus
ENSIPUG00000022879	rpp38	90	43.825	MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	88	42.683	Mus_caroli
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	41.509	ENSMUSG00000049950	Rpp38	88	42.915	Mus_musculus
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	42.642	MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	88	43.089	Mus_pahari
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	41.509	MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	88	43.373	Mus_spretus
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	41.353	ENSMPUG00000018523	RPP38	88	40.891	Mustela_putorius_furo
ENSIPUG00000022879	rpp38	92	40.000	ENSMLUG00000002153	RPP38	88	42.169	Myotis_lucifugus
ENSIPUG00000022879	rpp38	90	42.578	ENSNGAG00000011066	Rpp38	88	40.239	Nannospalax_galili
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	48.425	ENSNBRG00000006994	rpp38	97	50.394	Neolamprologus_brichardi
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	48.425	ENSONIG00000020467	rpp38	95	49.213	Oreochromis_niloticus
ENSIPUG00000022879	rpp38	92	38.911	ENSOCUG00000024367	-	88	40.486	Oryctolagus_cuniculus
ENSIPUG00000022879	rpp38	92	38.521	ENSOCUG00000022768	-	88	40.486	Oryctolagus_cuniculus
ENSIPUG00000022879	rpp38	90	49.219	ENSORLG00000009219	rpp38	91	46.215	Oryzias_latipes
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	48.881	ENSORLG00020011503	rpp38	86	46.429	Oryzias_latipes_hni
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	47.744	ENSORLG00015017702	rpp38	86	44.622	Oryzias_latipes_hsok
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	48.315	ENSOMEG00000005414	rpp38	90	47.809	Oryzias_melastigma
ENSIPUG00000022879	rpp38	97	41.007	ENSOGAG00000008059	RPP38	88	41.667	Otolemur_garnettii
ENSIPUG00000022879	rpp38	96	42.222	ENSOARG00000004534	RPP38	88	42.231	Ovis_aries
ENSIPUG00000022879	rpp38	99	41.935	ENSPPAG00000041577	RPP38	80	41.600	Pan_paniscus
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	42.105	ENSPPRG00000015329	RPP38	88	42.510	Panthera_pardus
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	41.729	ENSPTIG00000007188	RPP38	88	42.105	Panthera_tigris_altaica
ENSIPUG00000022879	rpp38	99	41.935	ENSPTRG00000002318	RPP38	80	41.600	Pan_troglodytes
ENSIPUG00000022879	rpp38	91	48.031	ENSPKIG00000025652	rpp38	88	46.371	Paramormyrops_kingsleyae
ENSIPUG00000022879	rpp38	100	40.845	ENSPSIG00000001527	RPP38	89	37.945	Pelodiscus_sinensis
ENSIPUG00000022879	rpp38	97	39.781	ENSPEMG00000008375	Rpp38	88	39.759	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSIPUG00000022879	rpp38	96	43.015	ENSPCIG00000009096	RPP38	84	43.825	Phascolarctos_cinereus
ENSIPUG00000022879	rpp38	63	52.439	ENSPFOG00000016823	rpp38	75	52.288	Poecilia_formosa
ENSIPUG00000022879	rpp38	99	40.283	ENSPLAG00000007626	rpp38	96	41.544	Poecilia_latipinna
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	39.453	ENSPMEG00000020392	rpp38	96	41.176	Poecilia_mexicana
ENSIPUG00000022879	rpp38	92	40.377	ENSPREG00000017744	rpp38	92	41.245	Poecilia_reticulata
ENSIPUG00000022879	rpp38	99	42.806	ENSPPYG00000002113	RPP38	88	42.400	Pongo_abelii
ENSIPUG00000022879	rpp38	92	37.736	ENSPVAG00000007155	RPP38	88	39.216	Pteropus_vampyrus
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	47.876	ENSPNYG00000004293	rpp38	96	50.198	Pundamilia_nyererei
ENSIPUG00000022879	rpp38	88	52.889	ENSPNAG00000010633	rpp38	94	52.720	Pygocentrus_nattereri
ENSIPUG00000022879	rpp38	90	44.800	ENSRNOG00000038025	Rpp38	88	43.388	Rattus_norvegicus
ENSIPUG00000022879	rpp38	96	42.751	ENSSHAG00000015529	RPP38	89	41.833	Sarcophilus_harrisii
ENSIPUG00000022879	rpp38	94	45.914	ENSSMAG00000018276	rpp38	90	45.902	Scophthalmus_maximus
ENSIPUG00000022879	rpp38	94	48.450	ENSSDUG00000001651	rpp38	96	49.416	Seriola_dumerili
ENSIPUG00000022879	rpp38	94	48.462	ENSSLDG00000014355	rpp38	96	49.035	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSIPUG00000022879	rpp38	96	40.784	ENSSARG00000012099	RPP38	86	40.086	Sorex_araneus
ENSIPUG00000022879	rpp38	97	42.086	ENSSPUG00000018363	-	89	40.945	Sphenodon_punctatus
ENSIPUG00000022879	rpp38	92	42.586	ENSSPUG00000005237	-	88	40.945	Sphenodon_punctatus
ENSIPUG00000022879	rpp38	92	39.695	ENSSPUG00000008560	-	90	38.492	Sphenodon_punctatus
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	47.656	ENSSPAG00000020387	rpp38	95	47.126	Stegastes_partitus
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	39.927	ENSSSCG00000027110	RPP38	88	39.216	Sus_scrofa
ENSIPUG00000022879	rpp38	92	40.996	ENSTGUG00000001366	RPP38	89	39.600	Taeniopygia_guttata
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	46.457	ENSTNIG00000001334	rpp38	96	47.012	Tetraodon_nigroviridis
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	43.116	ENSTTRG00000004420	RPP38	89	42.126	Tursiops_truncatus
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	41.418	ENSUAMG00000002618	RPP38	88	41.365	Ursus_americanus
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	41.045	ENSUMAG00000012382	RPP38	88	41.365	Ursus_maritimus
ENSIPUG00000022879	rpp38	95	43.820	ENSVVUG00000005272	RPP38	88	42.742	Vulpes_vulpes
ENSIPUG00000022879	rpp38	90	43.629	ENSXETG00000003419	rpp38	90	42.688	Xenopus_tropicalis