EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSIPUG00000023182 (Gene tree)
Gene ID: 108260784
Gene Symbol: Eftud2
Alias: wu:fi20f05|zgc:66214
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Ictalurus_punctatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 19852 bases
Position: chr2:6756757-6776608
Accession: 108260784
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSIPUP00000034543	GTP_EFTU	PF00009.27	1.8e-45	1	1
ENSIPUP00000034543	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.5e-12	1	1
ENSIPUP00000034543	EFG_IV	PF03764.18	1.2e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSIPUT00000035899	-	4671	XM_017461351	ENSIPUP00000034543	971 (aa)	XP_017316840	W5U5Z2

Gene Model

Click here to download ENSIPUG00000023182's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ipu03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSIPUG00000023182's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSIPUG00000023182	Eftud2	85	30.166	ENSIPUG00000023360	EFTUD1	96	30.166
ENSIPUG00000023182	Eftud2	87	38.014	ENSIPUG00000007921	eef2l2	98	38.014
ENSIPUG00000023182	Eftud2	86	38.266	ENSIPUG00000000950	-	98	38.266

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.748	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	94.748	Acanthochromis_polyacanthus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	92.078	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	91.358	Ailuropoda_melanoleuca
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.555	ENSACIG00000009096	eftud2	100	91.555	Amphilophus_citrinellus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	88	90.941	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	90.941	Amphiprion_ocellaris
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.851	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	94.851	Amphiprion_percula
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.748	ENSATEG00000000457	eftud2	100	94.748	Anabas_testudineus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	99	88.774	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	88.157	Anas_platyrhynchos
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.564	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.049	Anolis_carolinensis
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	91.358	Aotus_nancymaae
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.542	ENSACLG00000001296	eftud2	100	94.542	Astatotilapia_calliptera
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	97.134	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	97.134	Astyanax_mexicanus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	92.284	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	91.358	Bos_taurus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	99	70.455	WBGene00001166	eftu-2	99	70.041	Caenorhabditis_elegans
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	91.358	Callithrix_jacchus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	92.078	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	91.358	Canis_familiaris
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	92.078	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.358	Canis_lupus_dingo
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	92.284	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	91.358	Capra_hircus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	91.564	Carlito_syrichta
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	92.078	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	91.255	Cavia_aperea
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	92.078	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	91.255	Cavia_porcellus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	91.358	Cebus_capucinus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	91.358	Cercocebus_atys
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	92.078	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.358	Chinchilla_lanigera
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	91.358	Chlorocebus_sabaeus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	91	81.194	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.194	Choloepus_hoffmanni
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.667	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	90.947	Chrysemys_picta_bellii
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	78.234	ENSCING00000009372	-	100	78.234	Ciona_intestinalis
ENSIPUG00000023182	Eftud2	99	78.039	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.599	Ciona_savignyi
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	91.358	Colobus_angolensis_palliatus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.770	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.770	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.770	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	91.770	Cricetulus_griseus_crigri
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.542	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	94.542	Cynoglossus_semilaevis
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.233	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	94.233	Cyprinodon_variegatus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	96.197	ENSDARG00000012261	eftud2	100	96.197	Danio_rerio
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.872	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	91.255	Dasypus_novemcinctus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	92.078	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.461	Dipodomys_ordii
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	75.077	FBgn0039566	CG4849	100	74.256	Drosophila_melanogaster
ENSIPUG00000023182	Eftud2	92	97.826	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	Echinops_telfairi
ENSIPUG00000023182	Eftud2	74	93.532	ENSEBUG00000004047	-	96	88.317	Eptatretus_burgeri
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	92.078	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	91.358	Equus_asinus_asinus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	91.255	Equus_caballus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	83	99.153	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	Erinaceus_europaeus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.954	ENSELUG00000017169	eftud2	100	94.851	Esox_lucius
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.461	Felis_catus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.461	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.049	Ficedula_albicollis
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	91.461	Fukomys_damarensis
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.233	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	94.233	Fundulus_heteroclitus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	95.160	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	95.160	Gadus_morhua
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.564	ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.798	Gallus_gallus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.027	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	94.027	Gambusia_affinis
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.439	ENSGACG00000009163	eftud2	100	94.439	Gasterosteus_aculeatus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	91.358	Gorilla_gorilla
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.439	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	94.439	Haplochromis_burtoni
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.770	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	91.564	Heterocephalus_glaber_female
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.770	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	91.564	Heterocephalus_glaber_male
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	93.724	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	93.724	Hippocampus_comes
ENSIPUG00000023182	Eftud2	91	93.243	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	91.038	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	95	93.906	ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.906	Jaculus_jaculus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.027	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	94.027	Kryptolebias_marmoratus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	95	94.060	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	95.529	Labrus_bergylta
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	92.379	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.379	Latimeria_chalumnae
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.336	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	94.336	Lepisosteus_oculatus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.872	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.564	Loxodonta_africana
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	91.358	Macaca_fascicularis
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	91.358	Macaca_nemestrina
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	91.358	Mandrillus_leucophaeus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.851	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	94.851	Mastacembelus_armatus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.542	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	94.542	Maylandia_zebra
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.376	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	90.760	Meleagris_gallopavo
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.872	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	91.667	Mesocricetus_auratus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	91.358	Microcebus_murinus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.872	ENSMOCG00000009039	-	100	91.667	Microtus_ochrogaster
ENSIPUG00000023182	Eftud2	92	75.281	ENSMOCG00000017653	-	90	74.944	Microtus_ochrogaster
ENSIPUG00000023182	Eftud2	88	96.941	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	96.941	Mola_mola
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	91.358	Monodelphis_domestica
ENSIPUG00000023182	Eftud2	88	94.941	ENSMALG00000014501	eftud2	100	94.941	Monopterus_albus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.872	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	91.667	Mus_caroli
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.872	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	91.667	Mus_musculus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.872	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	91.667	Mus_pahari
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.872	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	91.667	Mus_spretus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	97	91.631	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	91.102	Mustela_putorius_furo
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	92.078	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	91.358	Myotis_lucifugus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.564	Nannospalax_galili
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.439	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	94.439	Neolamprologus_brichardi
ENSIPUG00000023182	Eftud2	97	89.904	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	89.267	Nomascus_leucogenys
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	88.272	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	87.654	Notamacropus_eugenii
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	84.465	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	83.642	Ochotona_princeps
ENSIPUG00000023182	Eftud2	93	75.610	ENSODEG00000003385	-	100	75.718	Octodon_degus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	92.181	ENSODEG00000018041	-	100	91.255	Octodon_degus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.542	ENSONIG00000000912	eftud2	100	94.542	Oreochromis_niloticus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	92.078	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	91.564	Oryctolagus_cuniculus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	93.615	ENSORLG00000003109	eftud2	100	93.615	Oryzias_latipes
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	93.512	ENSORLG00020009865	eftud2	100	93.512	Oryzias_latipes_hni
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	93.512	ENSORLG00015002611	eftud2	100	96.078	Oryzias_latipes_hsok
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	90.226	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	89.609	Otolemur_garnettii
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	92.284	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	91.358	Ovis_aries
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	91.461	Pan_paniscus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	92.078	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	91.358	Panthera_pardus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	92.078	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	91.358	Panthera_tigris_altaica
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	91.461	Pan_troglodytes
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	91.358	Papio_anubis
ENSIPUG00000023182	Eftud2	93	89.967	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	89.305	Pelodiscus_sinensis
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	86.200	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	86.200	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	91.564	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	91.358	Phascolarctos_cinereus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.027	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	94.027	Poecilia_formosa
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.027	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	94.027	Poecilia_latipinna
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.027	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	94.027	Poecilia_mexicana
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	90.638	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.021	Pongo_abelii
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	88.169	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	87.551	Procavia_capensis
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	91.358	Propithecus_coquereli
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	87.860	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	86.934	Pteropus_vampyrus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.542	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	94.542	Pundamilia_nyererei
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	97.322	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	97.322	Pygocentrus_nattereri
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.761	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	91.761	Rattus_norvegicus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.872	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	91.255	Rhinopithecus_bieti
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.872	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.255	Rhinopithecus_roxellana
ENSIPUG00000023182	Eftud2	97	34.055	YKL173W	SNU114	91	34.534	Saccharomyces_cerevisiae
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	91.358	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSIPUG00000023182	Eftud2	95	93.906	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.906	Sarcophilus_harrisii
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	96.087	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	95.778	Scleropages_formosus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.439	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	94.439	Scophthalmus_maximus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.645	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	94.645	Seriola_dumerili
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.748	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	94.748	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	84.156	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	83.230	Sorex_araneus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.049	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	90.638	Sphenodon_punctatus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.439	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	94.439	Stegastes_partitus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.872	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.770	Sus_scrofa
ENSIPUG00000023182	Eftud2	82	92.777	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.777	Taeniopygia_guttata
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	93.512	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	93.512	Takifugu_rubripes
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	89.026	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	89.026	Tetraodon_nigroviridis
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	86.626	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.008	Tupaia_belangeri
ENSIPUG00000023182	Eftud2	91	90.011	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	90.011	Tursiops_truncatus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	90.947	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.731	Ursus_americanus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	92.078	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	91.358	Ursus_maritimus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	92.078	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	91.358	Vulpes_vulpes
ENSIPUG00000023182	Eftud2	97	91.898	ENSXETG00000003394	eftud2	98	93.043	Xenopus_tropicalis
ENSIPUG00000023182	Eftud2	81	96.429	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	96.429	Xiphophorus_couchianus
ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.027	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	94.027	Xiphophorus_maculatus