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Description

Ensembl ID: ENSIPUG00000023216 (Gene tree)
Gene ID: 108256363
Gene Symbol: ago1
Alias: Ago1|eif2c1|si:ch211-119n15.3
Full Name: protein argonaute-1
Gene Type: protein_coding
Species: Ictalurus_punctatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 25647 bases
Position: chr23:16165389-16191035
Accession: 108256363
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSIPUP00000034596	PAZ	PF02170.22	7.7e-29	1	1
ENSIPUP00000034581	PAZ	PF02170.22	8.2e-29	1	1
ENSIPUP00000034593	PAZ	PF02170.22	3e-16	1	1
ENSIPUP00000034581	Piwi	PF02171.17	1.8e-110	1	1
ENSIPUP00000034593	Piwi	PF02171.17	1.8e-110	1	1
ENSIPUP00000034596	Piwi	PF02171.17	8.7e-92	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSIPUT00000035955	-	2307	-	ENSIPUP00000034596	768 (aa)	-	-
ENSIPUT00000035940	-	6054	XM_017453142	ENSIPUP00000034581	858 (aa)	XP_017308631	A0A2D0PT80
ENSIPUT00000035952	-	2532	-	ENSIPUP00000034593	843 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSIPUG00000023216	ago1	99	81.988	ENSIPUG00000001018	ago2	99	81.988
ENSIPUG00000023216	ago1	100	82.494	ENSIPUG00000008548	ago3b	100	82.494
ENSIPUG00000023216	ago1	98	78.799	ENSIPUG00000023241	ago3a	99	79.083
ENSIPUG00000023216	ago1	98	82.093	ENSIPUG00000015600	ago4	99	81.515

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSIPUG00000023216	ago1	98	96.686	ENSG00000092847	AGO1	100	96.931	Homo_sapiens
ENSIPUG00000023216	ago1	100	99.417	ENSAPOG00000024299	ago1	100	99.417	Acanthochromis_polyacanthus
ENSIPUG00000023216	ago1	98	96.686	ENSAMEG00000000504	AGO1	100	96.154	Ailuropoda_melanoleuca
ENSIPUG00000023216	ago1	90	94.767	ENSACIG00000005298	ago1	98	94.767	Amphilophus_citrinellus
ENSIPUG00000023216	ago1	100	99.417	ENSAOCG00000017727	ago1	100	99.417	Amphiprion_ocellaris
ENSIPUG00000023216	ago1	100	99.417	ENSAPEG00000004458	ago1	100	99.417	Amphiprion_percula
ENSIPUG00000023216	ago1	100	99.417	ENSATEG00000008523	ago1	100	99.417	Anabas_testudineus
ENSIPUG00000023216	ago1	99	89.559	ENSAPLG00000010440	AGO1	99	89.559	Anas_platyrhynchos
ENSIPUG00000023216	ago1	100	92.720	ENSACAG00000029174	AGO1	100	96.803	Anolis_carolinensis
ENSIPUG00000023216	ago1	99	96.028	ENSANAG00000037711	AGO1	100	96.154	Aotus_nancymaae
ENSIPUG00000023216	ago1	100	99.184	ENSACLG00000000890	ago1	100	99.184	Astatotilapia_calliptera
ENSIPUG00000023216	ago1	88	95.197	ENSAMXG00000001917	ago1	98	99.854	Astyanax_mexicanus
ENSIPUG00000023216	ago1	98	96.686	ENSBTAG00000012253	AGO1	100	96.154	Bos_taurus
ENSIPUG00000023216	ago1	99	96.576	ENSCJAG00000032023	AGO1	100	96.154	Callithrix_jacchus
ENSIPUG00000023216	ago1	98	96.686	ENSCAFG00000003443	AGO1	100	96.154	Canis_familiaris
ENSIPUG00000023216	ago1	99	95.770	ENSCAFG00020009251	AGO1	100	98.095	Canis_lupus_dingo
ENSIPUG00000023216	ago1	99	96.222	ENSCHIG00000011848	-	100	95.365	Capra_hircus
ENSIPUG00000023216	ago1	100	75.758	ENSTSYG00000032426	-	99	78.000	Carlito_syrichta
ENSIPUG00000023216	ago1	99	96.576	ENSTSYG00000009767	-	100	96.154	Carlito_syrichta
ENSIPUG00000023216	ago1	89	92.116	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.441	Cavia_aperea
ENSIPUG00000023216	ago1	98	96.686	ENSCPOG00000011568	AGO1	100	96.154	Cavia_porcellus
ENSIPUG00000023216	ago1	98	96.686	ENSCCAG00000011823	AGO1	100	96.154	Cebus_capucinus
ENSIPUG00000023216	ago1	100	95.804	ENSCATG00000031521	AGO1	100	96.931	Cercocebus_atys
ENSIPUG00000023216	ago1	99	96.576	ENSCLAG00000011507	AGO1	100	96.154	Chinchilla_lanigera
ENSIPUG00000023216	ago1	98	96.686	ENSCSAG00000001091	AGO1	100	96.154	Chlorocebus_sabaeus
ENSIPUG00000023216	ago1	83	96.154	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	Choloepus_hoffmanni
ENSIPUG00000023216	ago1	100	96.037	ENSCPBG00000018594	AGO1	100	96.037	Chrysemys_picta_bellii
ENSIPUG00000023216	ago1	98	96.686	ENSCANG00000039798	AGO1	100	96.154	Colobus_angolensis_palliatus
ENSIPUG00000023216	ago1	99	96.235	ENSCGRG00001022708	Ago1	100	96.154	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSIPUG00000023216	ago1	99	96.576	ENSCGRG00000010386	Ago1	99	96.576	Cricetulus_griseus_crigri
ENSIPUG00000023216	ago1	99	97.335	ENSCSEG00000001051	ago1	100	97.335	Cynoglossus_semilaevis
ENSIPUG00000023216	ago1	100	99.068	ENSCVAG00000018173	ago1	100	99.068	Cyprinodon_variegatus
ENSIPUG00000023216	ago1	100	99.068	ENSDARG00000092644	ago1	100	99.068	Danio_rerio
ENSIPUG00000023216	ago1	100	92.976	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	96.931	Dasypus_novemcinctus
ENSIPUG00000023216	ago1	92	97.087	ENSDORG00000008494	Ago1	100	97.087	Dipodomys_ordii
ENSIPUG00000023216	ago1	84	89.474	ENSETEG00000007626	AGO1	100	89.197	Echinops_telfairi
ENSIPUG00000023216	ago1	99	96.576	ENSEASG00005012086	AGO1	100	96.154	Equus_asinus_asinus
ENSIPUG00000023216	ago1	98	96.686	ENSECAG00000024353	AGO1	100	96.154	Equus_caballus
ENSIPUG00000023216	ago1	100	84.547	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.564	Erinaceus_europaeus
ENSIPUG00000023216	ago1	100	95.402	ENSELUG00000016803	ago1	100	99.488	Esox_lucius
ENSIPUG00000023216	ago1	98	96.686	ENSFCAG00000000746	AGO1	100	96.154	Felis_catus
ENSIPUG00000023216	ago1	100	86.879	ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.816	Ficedula_albicollis
ENSIPUG00000023216	ago1	100	96.270	ENSFDAG00000017210	AGO1	100	96.270	Fukomys_damarensis
ENSIPUG00000023216	ago1	99	95.165	ENSFHEG00000017927	ago1	100	95.165	Fundulus_heteroclitus
ENSIPUG00000023216	ago1	96	82.133	ENSGMOG00000019413	ago1	100	86.382	Gadus_morhua
ENSIPUG00000023216	ago1	98	96.568	ENSGALG00000002249	AGO1	100	96.037	Gallus_gallus
ENSIPUG00000023216	ago1	100	99.301	ENSGAFG00000009775	ago1	100	99.301	Gambusia_affinis
ENSIPUG00000023216	ago1	96	94.814	ENSGACG00000012443	ago1	100	99.068	Gasterosteus_aculeatus
ENSIPUG00000023216	ago1	100	92.720	ENSGAGG00000012893	-	100	96.803	Gopherus_agassizii
ENSIPUG00000023216	ago1	100	95.688	ENSGGOG00000003316	AGO1	100	96.154	Gorilla_gorilla
ENSIPUG00000023216	ago1	100	99.184	ENSHBUG00000010459	ago1	100	99.184	Haplochromis_burtoni
ENSIPUG00000023216	ago1	99	96.576	ENSHGLG00000011540	AGO1	100	96.154	Heterocephalus_glaber_female
ENSIPUG00000023216	ago1	99	96.576	ENSHGLG00100005568	AGO1	100	96.154	Heterocephalus_glaber_male
ENSIPUG00000023216	ago1	99	99.410	ENSHCOG00000005708	ago1	100	99.410	Hippocampus_comes
ENSIPUG00000023216	ago1	99	95.902	ENSSTOG00000010857	AGO1	100	96.154	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSIPUG00000023216	ago1	100	96.154	ENSJJAG00000019449	Ago1	100	96.154	Jaculus_jaculus
ENSIPUG00000023216	ago1	100	99.301	ENSKMAG00000019464	ago1	100	99.301	Kryptolebias_marmoratus
ENSIPUG00000023216	ago1	100	99.417	ENSLBEG00000007694	ago1	100	99.417	Labrus_bergylta
ENSIPUG00000023216	ago1	99	90.824	ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.824	Latimeria_chalumnae
ENSIPUG00000023216	ago1	100	94.639	ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.639	Lepisosteus_oculatus
ENSIPUG00000023216	ago1	99	96.235	ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.235	Loxodonta_africana
ENSIPUG00000023216	ago1	98	96.686	ENSMFAG00000002846	AGO1	100	96.154	Macaca_fascicularis
ENSIPUG00000023216	ago1	99	91.972	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	92.052	Macaca_mulatta
ENSIPUG00000023216	ago1	100	92.976	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	96.931	Macaca_nemestrina
ENSIPUG00000023216	ago1	98	96.686	ENSMLEG00000038388	AGO1	100	96.154	Mandrillus_leucophaeus
ENSIPUG00000023216	ago1	100	99.417	ENSMAMG00000008381	ago1	100	99.417	Mastacembelus_armatus
ENSIPUG00000023216	ago1	100	99.184	ENSMZEG00005007996	ago1	100	99.184	Maylandia_zebra
ENSIPUG00000023216	ago1	99	90.603	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.603	Meleagris_gallopavo
ENSIPUG00000023216	ago1	98	96.686	ENSMAUG00000015189	Ago1	100	96.154	Mesocricetus_auratus
ENSIPUG00000023216	ago1	99	96.028	ENSMICG00000016147	AGO1	100	96.154	Microcebus_murinus
ENSIPUG00000023216	ago1	98	96.568	ENSMOCG00000000537	Ago1	100	96.037	Microtus_ochrogaster
ENSIPUG00000023216	ago1	85	94.635	ENSMMOG00000018459	ago1	93	99.403	Mola_mola
ENSIPUG00000023216	ago1	100	96.154	ENSMODG00000023335	AGO1	100	96.154	Monodelphis_domestica
ENSIPUG00000023216	ago1	99	99.292	ENSMALG00000011057	ago1	100	99.292	Monopterus_albus
ENSIPUG00000023216	ago1	98	96.686	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	97.649	Mus_caroli
ENSIPUG00000023216	ago1	98	96.686	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	97.649	Mus_musculus
ENSIPUG00000023216	ago1	98	96.686	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	97.649	Mus_pahari
ENSIPUG00000023216	ago1	98	96.686	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	97.649	Mus_spretus
ENSIPUG00000023216	ago1	92	93.046	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	97.493	Mustela_putorius_furo
ENSIPUG00000023216	ago1	61	94.646	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	94.646	Myotis_lucifugus
ENSIPUG00000023216	ago1	100	96.037	ENSNGAG00000017448	Ago1	100	96.037	Nannospalax_galili
ENSIPUG00000023216	ago1	100	95.530	ENSNBRG00000010867	ago1	100	99.616	Neolamprologus_brichardi
ENSIPUG00000023216	ago1	100	96.154	ENSNLEG00000011181	AGO1	100	96.154	Nomascus_leucogenys
ENSIPUG00000023216	ago1	84	91.429	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	91.429	Notamacropus_eugenii
ENSIPUG00000023216	ago1	93	98.480	ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.480	Ochotona_princeps
ENSIPUG00000023216	ago1	100	94.919	ENSODEG00000005321	AGO1	100	96.154	Octodon_degus
ENSIPUG00000023216	ago1	99	99.176	ENSONIG00000016345	ago1	100	99.176	Oreochromis_niloticus
ENSIPUG00000023216	ago1	100	88.269	ENSOANG00000002080	AGO1	100	88.269	Ornithorhynchus_anatinus
ENSIPUG00000023216	ago1	98	96.568	ENSOCUG00000023116	AGO1	100	96.037	Oryctolagus_cuniculus
ENSIPUG00000023216	ago1	100	99.301	ENSORLG00000014965	ago1	100	99.301	Oryzias_latipes
ENSIPUG00000023216	ago1	100	99.301	ENSORLG00020018253	ago1	100	99.301	Oryzias_latipes_hni
ENSIPUG00000023216	ago1	100	99.301	ENSORLG00015003287	ago1	100	99.301	Oryzias_latipes_hsok
ENSIPUG00000023216	ago1	100	99.301	ENSOMEG00000020528	ago1	100	99.301	Oryzias_melastigma
ENSIPUG00000023216	ago1	99	96.019	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	96.019	Otolemur_garnettii
ENSIPUG00000023216	ago1	98	96.686	ENSOARG00000019591	AGO1	100	96.154	Ovis_aries
ENSIPUG00000023216	ago1	100	95.688	ENSPPAG00000034838	AGO1	100	96.154	Pan_paniscus
ENSIPUG00000023216	ago1	98	96.686	ENSPPRG00000006475	AGO1	100	96.154	Panthera_pardus
ENSIPUG00000023216	ago1	98	96.450	ENSPTIG00000020991	AGO1	100	95.921	Panthera_tigris_altaica
ENSIPUG00000023216	ago1	100	95.688	ENSPTRG00000000528	AGO1	100	96.154	Pan_troglodytes
ENSIPUG00000023216	ago1	98	96.686	ENSPANG00000009060	AGO1	100	96.154	Papio_anubis
ENSIPUG00000023216	ago1	98	95.843	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.843	Pelodiscus_sinensis
ENSIPUG00000023216	ago1	88	94.737	ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.256	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSIPUG00000023216	ago1	99	95.906	ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.154	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSIPUG00000023216	ago1	100	96.154	ENSPCIG00000000172	AGO1	100	96.154	Phascolarctos_cinereus
ENSIPUG00000023216	ago1	100	99.301	ENSPFOG00000005867	ago1	100	99.301	Poecilia_formosa
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ENSIPUG00000023216	ago1	100	99.301	ENSPMEG00000001787	ago1	100	99.301	Poecilia_mexicana
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