EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSIPUG00000024394 (Gene tree)
Gene ID: 108258411
Gene Symbol: XPO1
Alias: im:7151655
Full Name: exportin-1-like
Gene Type: protein_coding
Species: Ictalurus_punctatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 17664 bases
Position: chr26:16076649-16094312
Accession: 108258411
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSIPUP00000036420	CRM1_C	PF08767.11	4.6e-133	1	1
ENSIPUP00000036424	CRM1_C	PF08767.11	4.6e-133	1	1
ENSIPUP00000036427	CRM1_C	PF08767.11	4.6e-133	1	1
ENSIPUP00000036436	CRM1_C	PF08767.11	4.6e-133	1	1
ENSIPUP00000036435	CRM1_C	PF08767.11	4.8e-133	1	1
ENSIPUP00000036420	Xpo1	PF08389.12	1.1e-41	1	1
ENSIPUP00000036424	Xpo1	PF08389.12	1.1e-41	1	1
ENSIPUP00000036427	Xpo1	PF08389.12	1.1e-41	1	1
ENSIPUP00000036436	Xpo1	PF08389.12	1.1e-41	1	1
ENSIPUP00000036435	Xpo1	PF08389.12	1.1e-41	1	1
ENSIPUP00000036420	IBN_N	PF03810.19	1.7e-10	1	1
ENSIPUP00000036424	IBN_N	PF03810.19	1.7e-10	1	1
ENSIPUP00000036427	IBN_N	PF03810.19	1.7e-10	1	1
ENSIPUP00000036436	IBN_N	PF03810.19	1.7e-10	1	1
ENSIPUP00000036435	IBN_N	PF03810.19	2.8e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSIPUT00000037862	-	3288	-	ENSIPUP00000036435	1095 (aa)	-	-
ENSIPUT00000037863	-	3950	-	ENSIPUP00000036436	1071 (aa)	-	W5UB73
ENSIPUT00000037851	-	7007	-	ENSIPUP00000036424	1071 (aa)	-	W5UB73
ENSIPUT00000037847	-	7007	XM_017457020	ENSIPUP00000036420	1071 (aa)	XP_017312509	W5UB73
ENSIPUT00000037854	-	7007	-	ENSIPUP00000036427	1071 (aa)	-	W5UB73

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ipu03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
ipu03013	RNA transport	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	95.145	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	95.145

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	93.371	ENSG00000082898	XPO1	100	93.371	Homo_sapiens
ENSIPUG00000024394	XPO1	88	92.660	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	92.660	Acanthochromis_polyacanthus
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.771	ENSAPOG00000004984	-	100	94.771	Acanthochromis_polyacanthus
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.123	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	94.123	Ailuropoda_melanoleuca
ENSIPUG00000024394	XPO1	88	94.787	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	94.787	Amphilophus_citrinellus
ENSIPUG00000024394	XPO1	88	96.170	ENSACIG00000010818	-	100	96.170	Amphilophus_citrinellus
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.771	ENSAOCG00000010121	-	100	94.771	Amphiprion_ocellaris
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.491	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	94.491	Amphiprion_ocellaris
ENSIPUG00000024394	XPO1	91	94.748	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	94.748	Amphiprion_percula
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.771	ENSAPEG00000007038	-	100	94.771	Amphiprion_percula
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.771	ENSATEG00000008816	-	100	94.771	Anabas_testudineus
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.491	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	94.491	Anabas_testudineus
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.304	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	94.304	Anas_platyrhynchos
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.118	ENSACAG00000002501	XPO1	100	94.118	Anolis_carolinensis
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	93.371	ENSANAG00000020802	XPO1	100	93.371	Aotus_nancymaae
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.585	ENSACLG00000015192	-	100	94.585	Astatotilapia_calliptera
ENSIPUG00000024394	XPO1	88	95.106	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	95.106	Astatotilapia_calliptera
ENSIPUG00000024394	XPO1	88	96.186	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	96.186	Astyanax_mexicanus
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	95.051	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	95.051	Astyanax_mexicanus
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.211	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	94.211	Bos_taurus
ENSIPUG00000024394	XPO1	98	52.211	WBGene00002078	xpo-1	98	52.211	Caenorhabditis_elegans
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	93.371	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	93.371	Callithrix_jacchus
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.211	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	94.211	Canis_familiaris
ENSIPUG00000024394	XPO1	93	94.790	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	94.790	Canis_lupus_dingo
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.211	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	94.211	Capra_hircus
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.211	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	94.211	Carlito_syrichta
ENSIPUG00000024394	XPO1	53	90.248	ENSCAPG00000006454	-	100	90.248	Cavia_aperea
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	92.810	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	92.810	Cavia_porcellus
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	75.510	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	75.696	Cebus_capucinus
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	91.620	ENSCATG00000032674	XPO1	100	94.681	Cercocebus_atys
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.024	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	94.024	Chinchilla_lanigera
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	93.371	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	93.371	Chlorocebus_sabaeus
ENSIPUG00000024394	XPO1	83	95.071	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	95.071	Choloepus_hoffmanni
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.211	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	94.211	Chrysemys_picta_bellii
ENSIPUG00000024394	XPO1	99	81.132	ENSCING00000024562	-	99	81.132	Ciona_intestinalis
ENSIPUG00000024394	XPO1	99	79.533	ENSCSAVG00000005965	-	99	79.533	Ciona_savignyi
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	89.356	ENSCANG00000028883	XPO1	100	93.972	Colobus_angolensis_palliatus
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	93.277	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	93.277	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	93.277	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	93.277	Cricetulus_griseus_crigri
ENSIPUG00000024394	XPO1	88	95.106	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.106	Cynoglossus_semilaevis
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	93.464	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	93.464	Cyprinodon_variegatus
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.678	ENSCVAG00000016788	-	100	94.678	Cyprinodon_variegatus
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	96.172	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	97.988	Danio_rerio
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	95.425	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	95.425	Danio_rerio
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.304	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	94.304	Dasypus_novemcinctus
ENSIPUG00000024394	XPO1	92	91.153	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	91.153	Dipodomys_ordii
ENSIPUG00000024394	XPO1	99	70.599	FBgn0020497	emb	99	70.599	Drosophila_melanogaster
ENSIPUG00000024394	XPO1	94	92.804	ENSETEG00000018045	XPO1	94	92.804	Echinops_telfairi
ENSIPUG00000024394	XPO1	90	78.734	ENSEBUG00000012580	-	100	87.242	Eptatretus_burgeri
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.211	ENSEASG00005007223	XPO1	100	94.211	Equus_asinus_asinus
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.211	ENSECAG00000024920	XPO1	100	95.034	Equus_caballus
ENSIPUG00000024394	XPO1	92	95.833	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	95.833	Erinaceus_europaeus
ENSIPUG00000024394	XPO1	88	97.447	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	97.447	Esox_lucius
ENSIPUG00000024394	XPO1	87	92.827	ENSELUG00000014306	-	99	92.827	Esox_lucius
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.211	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	94.211	Felis_catus
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.118	ENSFALG00000010989	XPO1	100	94.118	Ficedula_albicollis
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	92.717	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	92.717	Fukomys_damarensis
ENSIPUG00000024394	XPO1	53	80.674	ENSFHEG00000018974	-	100	80.674	Fundulus_heteroclitus
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	93.651	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	93.651	Fundulus_heteroclitus
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	95.518	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	95.518	Gadus_morhua
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	88.515	ENSGMOG00000019063	-	100	88.515	Gadus_morhua
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.304	ENSGALG00000029476	XPO1	100	94.304	Gallus_gallus
ENSIPUG00000024394	XPO1	88	94.681	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	94.681	Gambusia_affinis
ENSIPUG00000024394	XPO1	91	95.572	ENSGAFG00000003355	-	98	95.572	Gambusia_affinis
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.865	ENSGACG00000002743	-	100	94.865	Gasterosteus_aculeatus
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.304	ENSGACG00000019736	xpo1a	100	94.304	Gasterosteus_aculeatus
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.118	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	94.118	Gopherus_agassizii
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	93.371	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	93.371	Gorilla_gorilla
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.585	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	94.585	Haplochromis_burtoni
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.678	ENSHBUG00000020037	-	100	94.678	Haplochromis_burtoni
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	93.931	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	93.931	Heterocephalus_glaber_female
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	93.931	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	93.931	Heterocephalus_glaber_male
ENSIPUG00000024394	XPO1	88	95.000	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	95.000	Hippocampus_comes
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.024	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	94.024	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.118	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	94.118	Jaculus_jaculus
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.304	ENSKMAG00000016218	-	100	94.304	Kryptolebias_marmoratus
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	93.838	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	93.838	Kryptolebias_marmoratus
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.678	ENSLBEG00000005740	-	100	94.678	Labrus_bergylta
ENSIPUG00000024394	XPO1	88	92.373	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	92.373	Labrus_bergylta
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	73.315	ENSLACG00000018213	XPO1	100	73.315	Latimeria_chalumnae
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	95.051	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	95.051	Lepisosteus_oculatus
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	93.838	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	93.838	Loxodonta_africana
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	93.371	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	93.371	Macaca_fascicularis
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	93.371	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	93.371	Macaca_mulatta
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	93.371	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	93.371	Macaca_nemestrina
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	91.628	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	91.628	Mandrillus_leucophaeus
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.491	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	94.491	Mastacembelus_armatus
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.865	ENSMAMG00000010568	-	99	96.060	Mastacembelus_armatus
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.585	ENSMZEG00005018158	-	98	95.469	Maylandia_zebra
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.585	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	94.585	Maylandia_zebra
ENSIPUG00000024394	XPO1	68	95.455	ENSMGAG00000001496	-	100	95.455	Meleagris_gallopavo
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	93.277	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	93.277	Mesocricetus_auratus
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.211	ENSMICG00000027770	XPO1	100	94.211	Microcebus_murinus
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	93.464	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	93.464	Microtus_ochrogaster
ENSIPUG00000024394	XPO1	88	95.106	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	95.106	Mola_mola
ENSIPUG00000024394	XPO1	87	95.411	ENSMMOG00000008001	-	99	95.411	Mola_mola
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	93.091	ENSMODG00000002831	XPO1	100	93.091	Monodelphis_domestica
ENSIPUG00000024394	XPO1	88	93.411	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	93.411	Monopterus_albus
ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.491	ENSMALG00000007085	-	100	94.491	Monopterus_albus
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