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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSJJAG00000010244 (Gene tree)
Gene ID: 101601288
Gene Symbol: Tnpo1
Alias: D13Ertd688e|Kpnb2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Jaculus_jaculus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 66049 bases
Position: chrJH725441.1:25467061-25533109
Accession: 101601288
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSJJAP00000005299	IBN_N	PF03810.19	5.4e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSJJAT00000011647	-	5221	XM_004651542	ENSJJAP00000005299	921 (aa)	XP_004651599	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	96	84.615	ENSJJAG00000016820	Tnpo2	99	84.615

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.775	ENSG00000083312	TNPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	93.933	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.933	Acanthochromis_polyacanthus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	98	98.786	ENSAMEG00000007147	TNPO1	100	98.786	Ailuropoda_melanoleuca
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	84	93.023	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.023	Amphilophus_citrinellus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	94.045	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	94.045	Amphiprion_ocellaris
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	94.045	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	94.045	Amphiprion_percula
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	93.596	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.596	Anabas_testudineus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	95	92.559	ENSAPLG00000009619	-	97	93.563	Anas_platyrhynchos
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	96.854	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.854	Anolis_carolinensis
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	88.690	ENSANAG00000025351	-	99	88.690	Aotus_nancymaae
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.217	ENSANAG00000022453	-	99	99.217	Aotus_nancymaae
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	64.262	ENSANAG00000027118	-	99	64.040	Aotus_nancymaae
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	91.685	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.685	Astatotilapia_calliptera
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	92.825	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.489	Astyanax_mexicanus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.441	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	99.441	Bos_taurus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.329	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	99.329	Callithrix_jacchus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	93	99.533	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.533	Canis_familiaris
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	96.629	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.629	Canis_lupus_dingo
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.329	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	99.329	Capra_hircus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	94.961	ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.961	Carlito_syrichta
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.326	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.326	Cebus_capucinus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.775	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	99.775	Cercocebus_atys
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.326	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.326	Chinchilla_lanigera
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.553	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	99.553	Chlorocebus_sabaeus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	92	86.714	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	86.714	Choloepus_hoffmanni
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	97.324	ENSCPBG00000000260	TNPO1	95	97.324	Chrysemys_picta_bellii
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	96	75.758	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.309	Ciona_savignyi
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.664	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	99.664	Colobus_angolensis_palliatus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.553	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	99.553	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	93	99.649	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	99.649	Cricetulus_griseus_crigri
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	92.360	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.360	Cynoglossus_semilaevis
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	93.483	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.483	Cyprinodon_variegatus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	92.705	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.368	Danio_rerio
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	93.415	ENSDNOG00000006647	TNPO1	100	93.415	Dasypus_novemcinctus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	90	99.518	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.517	Dipodomys_ordii
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	96	57.788	FBgn0035693	CG8219	99	57.449	Drosophila_melanogaster
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	84	99.625	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	99.625	Echinops_telfairi
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	91	85.119	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	Eptatretus_burgeri
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.775	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	99.775	Equus_asinus_asinus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.441	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	99.441	Equus_caballus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	86.710	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.275	Esox_lucius
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.775	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	99.775	Felis_catus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	97.528	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.528	Ficedula_albicollis
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.329	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	99.329	Fukomys_damarensis
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	93.827	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.827	Fundulus_heteroclitus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	90.089	ENSGMOG00000000347	tnpo1	100	90.089	Gadus_morhua
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	96.742	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.742	Gallus_gallus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	92.489	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.489	Gambusia_affinis
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	92.953	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.953	Gasterosteus_aculeatus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	97.640	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.640	Gopherus_agassizii
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.775	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	99.775	Gorilla_gorilla
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	83.128	ENSGGOG00000022535	-	99	83.128	Gorilla_gorilla
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	93.258	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.258	Haplochromis_burtoni
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	98	98.665	ENSHGLG00000000970	-	99	98.993	Heterocephalus_glaber_female
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	93	98.949	ENSHGLG00100017090	-	99	98.949	Heterocephalus_glaber_male
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	75.531	ENSHGLG00100000963	-	99	74.972	Heterocephalus_glaber_male
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	93.708	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.708	Kryptolebias_marmoratus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	88	90.259	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	89.889	Labrus_bergylta
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	93	89.302	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.302	Latimeria_chalumnae
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	95.526	ENSLOCG00000011092	tnpo1	98	95.526	Lepisosteus_oculatus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	94	98.961	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.961	Loxodonta_africana
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.664	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	99.664	Macaca_fascicularis
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.664	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	99.664	Macaca_mulatta
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.664	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	99.664	Macaca_nemestrina
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.664	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	99.664	Mandrillus_leucophaeus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	93.596	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.596	Mastacembelus_armatus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	93.034	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.034	Maylandia_zebra
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.664	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	95.857	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.857	Microcebus_murinus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	98	99.444	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	100	99.444	Microtus_ochrogaster
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	84	92.655	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.655	Mola_mola
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	96	97.872	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	Monodelphis_domestica
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	92.472	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.472	Monopterus_albus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.438	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	100.000	Mus_caroli
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.663	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	100.000	Mus_musculus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.441	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	Mus_pahari
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.329	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	100.000	Mus_spretus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.553	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	99.553	Mustela_putorius_furo
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	93	99.069	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.069	Myotis_lucifugus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.664	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	99.664	Nannospalax_galili
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	84	92.894	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.894	Neolamprologus_brichardi
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.775	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	99.775	Nomascus_leucogenys
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	88	92.879	ENSOPRG00000012390	TNPO1	90	92.879	Ochotona_princeps
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.104	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	99.104	Octodon_degus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	98	91.814	ENSONIG00000011151	tnpo1	100	91.814	Oreochromis_niloticus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	89	98.049	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	98.049	Ornithorhynchus_anatinus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	93	93.107	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.107	Oryctolagus_cuniculus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	84	92.866	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.866	Oryzias_latipes
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	96	93.123	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.123	Oryzias_latipes_hni
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	96	93.236	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.236	Oryzias_latipes_hsok
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	96	93.123	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.123	Oryzias_melastigma
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.553	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	99.553	Otolemur_garnettii
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	98	98.782	ENSOARG00000005038	TNPO1	85	98.782	Ovis_aries
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.664	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	99.664	Pan_paniscus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.775	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	99.775	Panthera_pardus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.775	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	99.775	Panthera_tigris_altaica
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.664	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	99.664	Pan_troglodytes
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	91	86.878	ENSPTRG00000047731	-	100	86.878	Pan_troglodytes
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.664	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	99.664	Papio_anubis
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	90.674	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.674	Paramormyrops_kingsleyae
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	97.531	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	97.531	Pelodiscus_sinensis
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	90.685	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.572	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	93	99.649	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.649	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	98.202	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.202	Phascolarctos_cinereus
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	93.393	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	93.393	Poecilia_formosa
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	93.393	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.393	Poecilia_latipinna
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	93.596	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.596	Poecilia_mexicana
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	93.498	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.498	Poecilia_reticulata
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.553	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	99.553	Pongo_abelii
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.776	ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	99.776	Propithecus_coquereli
ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.329	ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	99.329	Pteropus_vampyrus
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