EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSJJAG00000013301 (Gene tree)
Gene ID: 101597493
Gene Symbol: Syf2
Alias: 1110018L13Rik|Cbpin|D4Bwg1551e|Gcipip|Ntc31|mp29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Jaculus_jaculus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4955 bases
Position: chrJH725459.1:9612499-9617453
Accession: 101597493
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSJJAP00000009441	SYF2	PF08231.12	1.2e-54	1	1
ENSJJAP00000009436	SYF2	PF08231.12	1.3e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSJJAT00000015884	-	651	-	ENSJJAP00000009436	216 (aa)	-	-
ENSJJAT00000015889	-	636	XM_004673277	ENSJJAP00000009441	211 (aa)	XP_004673334	-

Gene Model

Click here to download ENSJJAG00000013301's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSJJAG00000013301's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.487	ENSG00000117614	SYF2	82	97.487	Homo_sapiens
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	84.925	ENSAPOG00000001174	syf2	84	84.925	Acanthochromis_polyacanthus
ENSJJAG00000013301	Syf2	92	96.410	ENSAMEG00000010134	-	100	96.410	Ailuropoda_melanoleuca
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.482	ENSAMEG00000010115	-	82	96.482	Ailuropoda_melanoleuca
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	82.412	ENSACIG00000023688	syf2	80	82.412	Amphilophus_citrinellus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	85.427	ENSAOCG00000022046	syf2	85	85.427	Amphiprion_ocellaris
ENSJJAG00000013301	Syf2	86	84.066	ENSAOCG00000010912	syf2	57	84.066	Amphiprion_ocellaris
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	85.427	ENSAPEG00000018858	syf2	77	85.427	Amphiprion_percula
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	83.920	ENSATEG00000007745	syf2	84	83.920	Anabas_testudineus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	88.945	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.945	Anas_platyrhynchos
ENSJJAG00000013301	Syf2	79	76.048	ENSACAG00000026777	-	94	76.433	Anolis_carolinensis
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	86.432	ENSACAG00000013653	-	98	86.432	Anolis_carolinensis
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.990	ENSANAG00000032473	SYF2	82	97.990	Aotus_nancymaae
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	82.412	ENSACLG00000019916	syf2	84	82.412	Astatotilapia_calliptera
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	83.417	ENSAMXG00000004051	syf2	84	83.417	Astyanax_mexicanus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.990	ENSBTAG00000001651	SYF2	84	97.990	Bos_taurus
ENSJJAG00000013301	Syf2	93	50.754	WBGene00019402	syf-2	85	50.754	Caenorhabditis_elegans
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.990	ENSCJAG00000046570	SYF2	82	97.990	Callithrix_jacchus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.482	ENSCAFG00000012895	-	81	96.482	Canis_familiaris
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	91.960	ENSCAFG00000030331	-	93	86.854	Canis_familiaris
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.482	ENSCAFG00020021091	-	81	96.482	Canis_lupus_dingo
ENSJJAG00000013301	Syf2	86	86.813	ENSCAFG00020021094	-	83	94.872	Canis_lupus_dingo
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.990	ENSCHIG00000020874	SYF2	83	97.990	Capra_hircus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	ENSTSYG00000005114	SYF2	82	96.985	Carlito_syrichta
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.970	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	96.970	Cavia_aperea
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	ENSCPOG00000005326	SYF2	82	96.985	Cavia_porcellus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.990	ENSCCAG00000022459	SYF2	82	97.990	Cebus_capucinus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	ENSCATG00000026917	SYF2	82	96.985	Cercocebus_atys
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.990	ENSCLAG00000008474	SYF2	82	97.990	Chinchilla_lanigera
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	ENSCSAG00000000948	SYF2	82	96.985	Chlorocebus_sabaeus
ENSJJAG00000013301	Syf2	61	89.147	ENSCHOG00000005273	-	79	89.147	Choloepus_hoffmanni
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	88.945	ENSCPBG00000025073	SYF2	80	88.945	Chrysemys_picta_bellii
ENSJJAG00000013301	Syf2	97	52.315	ENSCING00000003017	-	90	51.852	Ciona_intestinalis
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	51.741	ENSCSAVG00000006627	-	92	51.741	Ciona_savignyi
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	81.407	ENSCANG00000037322	SYF2	79	81.407	Colobus_angolensis_palliatus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.482	ENSCGRG00001020733	Syf2	82	96.482	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.482	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	96.482	Cricetulus_griseus_crigri
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	78.392	ENSCSEG00000000117	syf2	83	78.392	Cynoglossus_semilaevis
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	81.910	ENSCVAG00000019543	syf2	83	81.910	Cyprinodon_variegatus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	83.417	ENSDARG00000004706	syf2	84	83.417	Danio_rerio
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	95.980	ENSDNOG00000047605	SYF2	81	95.980	Dasypus_novemcinctus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.990	ENSDORG00000001274	Syf2	82	97.990	Dipodomys_ordii
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	59.000	FBgn0033556	CG12343	94	56.338	Drosophila_melanogaster
ENSJJAG00000013301	Syf2	88	77.838	ENSETEG00000015729	SYF2	81	77.838	Echinops_telfairi
ENSJJAG00000013301	Syf2	93	60.406	ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	Eptatretus_burgeri
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	83.920	ENSEASG00005004232	-	82	83.920	Equus_asinus_asinus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.487	ENSEASG00005004224	-	81	97.487	Equus_asinus_asinus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.487	ENSECAG00000010440	-	83	97.487	Equus_caballus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.990	ENSECAG00000012023	-	81	97.990	Equus_caballus
ENSJJAG00000013301	Syf2	65	84.058	ENSEEUG00000015084	SYF2	75	84.058	Erinaceus_europaeus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	86.432	ENSELUG00000003465	syf2	92	79.452	Esox_lucius
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	ENSFCAG00000043095	-	81	96.985	Felis_catus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.487	ENSFCAG00000010324	-	69	97.487	Felis_catus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	85.859	ENSFALG00000000460	SYF2	87	80.465	Ficedula_albicollis
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	ENSFDAG00000008310	SYF2	82	96.985	Fukomys_damarensis
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	66.000	ENSFHEG00000007238	syf2	88	66.000	Fundulus_heteroclitus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	84.422	ENSGMOG00000019138	syf2	89	84.422	Gadus_morhua
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	88.945	ENSGALG00000013639	SYF2	79	88.945	Gallus_gallus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	80.402	ENSGAFG00000019435	syf2	84	80.402	Gambusia_affinis
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	83.417	ENSGACG00000007305	syf2	83	83.417	Gasterosteus_aculeatus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	89.447	ENSGAGG00000010670	SYF2	80	89.447	Gopherus_agassizii
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.990	ENSGGOG00000012796	SYF2	82	97.990	Gorilla_gorilla
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	82.412	ENSHBUG00000020477	syf2	85	82.412	Haplochromis_burtoni
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	ENSHGLG00000014393	SYF2	82	96.985	Heterocephalus_glaber_female
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	83.417	ENSHGLG00000004304	-	82	80.905	Heterocephalus_glaber_female
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	ENSHGLG00100014722	SYF2	82	96.985	Heterocephalus_glaber_male
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	83.920	ENSHCOG00000012904	syf2	65	83.920	Hippocampus_comes
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	84.422	ENSIPUG00000019859	syf2	84	84.422	Ictalurus_punctatus
ENSJJAG00000013301	Syf2	69	95.890	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	95.890	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	82.412	ENSKMAG00000013856	syf2	84	82.412	Kryptolebias_marmoratus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	83.920	ENSLBEG00000014425	syf2	84	83.920	Labrus_bergylta
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	84.925	ENSLACG00000012064	SYF2	84	84.925	Latimeria_chalumnae
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	86.432	ENSLOCG00000002728	syf2	79	86.432	Lepisosteus_oculatus
ENSJJAG00000013301	Syf2	82	64.740	ENSLAFG00000030814	-	97	62.360	Loxodonta_africana
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	95.980	ENSLAFG00000023150	-	81	95.980	Loxodonta_africana
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	ENSMFAG00000041831	SYF2	82	96.985	Macaca_fascicularis
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	ENSMMUG00000002968	SYF2	82	96.985	Macaca_mulatta
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	ENSMNEG00000030180	SYF2	82	96.985	Macaca_nemestrina
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	ENSMLEG00000030248	SYF2	82	96.985	Mandrillus_leucophaeus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	81.910	ENSMAMG00000010403	syf2	83	81.910	Mastacembelus_armatus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	82.412	ENSMZEG00005006429	syf2	84	82.412	Maylandia_zebra
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	88.945	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.945	Meleagris_gallopavo
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.482	ENSMAUG00000018974	Syf2	82	96.482	Mesocricetus_auratus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.487	ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	Microcebus_murinus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.487	ENSMOCG00000022938	Syf2	82	97.487	Microtus_ochrogaster
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	80.402	ENSMMOG00000002396	syf2	83	80.402	Mola_mola
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	88.060	ENSMODG00000013951	-	88	88.060	Monodelphis_domestica
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	82.000	ENSMALG00000010706	syf2	89	78.140	Monopterus_albus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	82	96.985	Mus_caroli
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	ENSMUSG00000028821	Syf2	82	96.985	Mus_musculus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	82	96.985	Mus_pahari
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	82	96.985	Mus_spretus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.482	ENSMPUG00000015801	-	81	96.482	Mustela_putorius_furo
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.482	ENSMPUG00000015802	-	81	96.482	Mustela_putorius_furo
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.482	ENSMLUG00000001885	SYF2	82	96.482	Myotis_lucifugus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	ENSNGAG00000007912	Syf2	81	96.985	Nannospalax_galili
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	74.372	ENSNBRG00000010720	syf2	85	73.500	Neolamprologus_brichardi
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.990	ENSNLEG00000035185	SYF2	82	97.990	Nomascus_leucogenys
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.487	ENSOPRG00000012870	SYF2	82	97.487	Ochotona_princeps
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	84.422	ENSODEG00000014338	-	81	84.422	Octodon_degus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	ENSODEG00000017664	-	84	96.985	Octodon_degus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	81.910	ENSONIG00000008213	syf2	84	81.910	Oreochromis_niloticus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	91.960	ENSOANG00000009552	SYF2	99	91.960	Ornithorhynchus_anatinus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.487	ENSOCUG00000013050	SYF2	82	97.487	Oryctolagus_cuniculus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	83.417	ENSORLG00000028820	syf2	85	83.417	Oryzias_latipes
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	83.417	ENSORLG00020018333	syf2	84	83.417	Oryzias_latipes_hni
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	83.417	ENSORLG00015014665	syf2	84	83.417	Oryzias_latipes_hsok
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	83.920	ENSOMEG00000013911	syf2	84	83.920	Oryzias_melastigma
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.990	ENSOGAG00000009962	SYF2	82	97.990	Otolemur_garnettii
ENSJJAG00000013301	Syf2	92	66.154	ENSOARG00000006269	-	100	66.154	Ovis_aries
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.015	ENSOARG00000006348	-	81	97.015	Ovis_aries
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.990	ENSPPAG00000036579	SYF2	82	97.990	Pan_paniscus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	ENSPPRG00000001651	-	81	96.985	Panthera_pardus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.487	ENSPPRG00000001638	-	81	97.487	Panthera_pardus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	ENSPTIG00000007036	-	81	96.985	Panthera_tigris_altaica
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.487	ENSPTIG00000005711	-	73	97.487	Panthera_tigris_altaica
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.990	ENSPTRG00000000352	SYF2	82	97.990	Pan_troglodytes
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	ENSPANG00000008139	SYF2	82	96.985	Papio_anubis
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	84.925	ENSPKIG00000008130	syf2	85	84.925	Paramormyrops_kingsleyae
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	88.442	ENSPSIG00000011816	SYF2	77	88.442	Pelodiscus_sinensis
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	82.412	ENSPMGG00000008755	syf2	78	82.412	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	ENSPEMG00000008283	Syf2	82	96.985	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	94.472	ENSPCIG00000014235	SYF2	80	94.472	Phascolarctos_cinereus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	80.905	ENSPFOG00000004116	syf2	82	80.905	Poecilia_formosa
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	80.905	ENSPLAG00000006691	syf2	85	80.905	Poecilia_latipinna
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	77.387	ENSPMEG00000011684	syf2	85	77.387	Poecilia_mexicana
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	80.905	ENSPREG00000003009	syf2	84	80.905	Poecilia_reticulata
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.990	ENSPPYG00000001713	SYF2	82	97.990	Pongo_abelii
ENSJJAG00000013301	Syf2	75	77.358	ENSPCOG00000027011	SYF2	73	77.564	Propithecus_coquereli
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	83.417	ENSPVAG00000005841	SYF2	81	83.417	Pteropus_vampyrus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	82.412	ENSPNYG00000004979	syf2	84	82.412	Pundamilia_nyererei
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	85.427	ENSPNAG00000015570	syf2	84	85.427	Pygocentrus_nattereri
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	ENSRNOG00000060597	Syf2	82	96.985	Rattus_norvegicus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	93.970	ENSRBIG00000042970	SYF2	82	93.970	Rhinopithecus_bieti
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	ENSRROG00000001347	SYF2	82	96.985	Rhinopithecus_roxellana
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.487	ENSSBOG00000020184	SYF2	82	97.487	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSJJAG00000013301	Syf2	95	94.000	ENSSHAG00000007152	-	97	94.000	Sarcophilus_harrisii
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	93.467	ENSSHAG00000015630	-	80	93.467	Sarcophilus_harrisii
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	84.925	ENSSFOG00015023647	syf2	84	84.925	Scleropages_formosus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	81.910	ENSSMAG00000009867	syf2	84	81.910	Scophthalmus_maximus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	83.920	ENSSDUG00000013072	syf2	84	83.920	Seriola_dumerili
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	83.920	ENSSLDG00000012677	syf2	84	83.920	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSJJAG00000013301	Syf2	74	94.268	ENSSARG00000012889	SYF2	64	94.231	Sorex_araneus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	87.437	ENSSPUG00000005251	SYF2	79	87.437	Sphenodon_punctatus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	83.417	ENSSPAG00000009626	syf2	84	83.417	Stegastes_partitus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.487	ENSSSCG00000037481	SYF2	81	97.487	Sus_scrofa
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	81.407	ENSTRUG00000001499	syf2	80	81.407	Takifugu_rubripes
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	79.899	ENSTNIG00000016912	syf2	96	75.234	Tetraodon_nigroviridis
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	68.342	ENSTBEG00000017370	SYF2	78	67.839	Tupaia_belangeri
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.482	ENSTTRG00000003550	SYF2	82	96.482	Tursiops_truncatus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	95.980	ENSUAMG00000002897	SYF2	81	95.980	Ursus_americanus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	95.980	ENSUMAG00000013108	SYF2	81	95.980	Ursus_maritimus
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	95.980	ENSVPAG00000005705	SYF2	82	95.980	Vicugna_pacos
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.482	ENSVVUG00000027175	-	81	96.482	Vulpes_vulpes
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	95.477	ENSVVUG00000027181	-	80	95.477	Vulpes_vulpes
ENSJJAG00000013301	Syf2	95	86.500	ENSXETG00000022797	syf2	80	86.500	Xenopus_tropicalis
ENSJJAG00000013301	Syf2	94	80.905	ENSXMAG00000022698	syf2	84	80.905	Xiphophorus_maculatus