EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSJJAG00000018268 (Gene tree)
Gene ID: 101598961
Gene Symbol: Eftud2
Alias: 116kDa|Snrp116|U5-116kD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Jaculus_jaculus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 61916 bases
Position: chrJH725452.1:23093209-23155124
Accession: 101598961
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSJJAP00000016415	GTP_EFTU	PF00009.27	2.5e-45	1	1
ENSJJAP00000016415	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	9.8e-13	1	1
ENSJJAP00000016415	EFG_IV	PF03764.18	1.9e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSJJAT00000022925	-	3227	XM_004655313	ENSJJAP00000016415	936 (aa)	XP_004655370	-

Gene Model

Click here to download ENSJJAG00000018268's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSJJAG00000018268's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSJJAG00000018268	Eftud2	90	39.380	ENSJJAG00000017122	Eef2	99	39.380
ENSJJAG00000018268	Eftud2	59	34.074	ENSJJAG00000024278	Gfm2	68	34.074
ENSJJAG00000018268	Eftud2	53	32.639	ENSJJAG00000016447	Gfm1	59	32.639

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.573	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.913	ENSAPOG00000002433	eftud2	95	93.913	Acanthochromis_polyacanthus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	96	99.466	Ailuropoda_melanoleuca
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	90.109	ENSACIG00000009096	eftud2	95	90.109	Amphilophus_citrinellus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	91	88.118	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.118	Amphiprion_ocellaris
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	94.022	ENSAPEG00000003321	eftud2	95	94.022	Amphiprion_percula
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	94.239	ENSATEG00000000457	eftud2	95	94.239	Anabas_testudineus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	94.794	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	95	94.800	Anas_platyrhynchos
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	97.756	ENSACAG00000007637	EFTUD2	96	97.756	Anolis_carolinensis
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	ENSANAG00000025320	EFTUD2	96	99.466	Aotus_nancymaae
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.804	ENSACLG00000001296	eftud2	95	93.804	Astatotilapia_calliptera
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	94.336	ENSAMXG00000000568	eftud2	94	94.342	Astyanax_mexicanus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	96	99.466	Bos_taurus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	99	70.753	WBGene00001166	eftu-2	94	71.194	Caenorhabditis_elegans
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	96	99.466	Callithrix_jacchus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	96	99.466	Canis_familiaris
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	96	99.466	Canis_lupus_dingo
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	96	99.466	Capra_hircus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.252	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	96	99.252	Carlito_syrichta
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	98.825	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	96	98.825	Cavia_aperea
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	98.825	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	96	98.825	Cavia_porcellus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	96	99.466	Cebus_capucinus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	ENSCATG00000035809	EFTUD2	96	99.466	Cercocebus_atys
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	98.718	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	96	98.718	Chinchilla_lanigera
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	96	99.466	Chlorocebus_sabaeus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	95	86.824	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	Choloepus_hoffmanni
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	98.397	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	96	98.397	Chrysemys_picta_bellii
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	79.718	ENSCING00000009372	-	95	79.718	Ciona_intestinalis
ENSJJAG00000018268	Eftud2	99	79.553	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.717	Ciona_savignyi
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	ENSCANG00000026557	EFTUD2	96	99.466	Colobus_angolensis_palliatus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.786	ENSCGRG00001009904	Eftud2	96	99.786	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.786	ENSCGRG00000003825	Eftud2	96	99.786	Cricetulus_griseus_crigri
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.370	ENSCSEG00000016775	eftud2	95	93.370	Cynoglossus_semilaevis
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	94.130	ENSCVAG00000012537	eftud2	95	94.130	Cyprinodon_variegatus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.464	ENSDARG00000012261	eftud2	95	93.471	Danio_rerio
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	98.825	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	96	98.825	Dasypus_novemcinctus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	ENSDORG00000011566	Eftud2	96	99.466	Dipodomys_ordii
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	75.906	FBgn0039566	CG4849	94	76.881	Drosophila_melanogaster
ENSJJAG00000018268	Eftud2	91	99.457	ENSETEG00000005678	EFTUD2	88	99.457	Echinops_telfairi
ENSJJAG00000018268	Eftud2	77	93.035	ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	Eptatretus_burgeri
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	ENSEASG00005010321	EFTUD2	96	99.466	Equus_asinus_asinus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.359	ENSECAG00000019363	EFTUD2	89	99.359	Equus_caballus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	86	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.152	ENSELUG00000017169	eftud2	95	93.152	Esox_lucius
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.573	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	96	99.573	Felis_catus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	97.970	ENSFALG00000007551	EFTUD2	96	97.970	Ficedula_albicollis
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.573	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	96	99.573	Fukomys_damarensis
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	94.130	ENSFHEG00000013479	eftud2	95	94.130	Fundulus_heteroclitus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.370	ENSGMOG00000014277	eftud2	95	93.370	Gadus_morhua
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	98.077	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.491	Gallus_gallus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	94.022	ENSGAFG00000002263	eftud2	95	94.022	Gambusia_affinis
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.370	ENSGACG00000009163	eftud2	95	93.370	Gasterosteus_aculeatus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	96	99.466	Gorilla_gorilla
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.804	ENSHBUG00000023546	eftud2	95	93.804	Haplochromis_burtoni
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.252	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	96	99.252	Heterocephalus_glaber_female
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.252	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	96	99.252	Heterocephalus_glaber_male
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.261	ENSHCOG00000017689	eftud2	95	93.261	Hippocampus_comes
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.906	ENSIPUG00000023182	Eftud2	95	93.906	Ictalurus_punctatus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	97	97.158	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	97.158	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.261	ENSKMAG00000021027	eftud2	95	93.261	Kryptolebias_marmoratus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	93	93.371	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	Labrus_bergylta
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	95.874	ENSLACG00000012918	EFTUD2	95	95.874	Latimeria_chalumnae
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	94.457	ENSLOCG00000011460	eftud2	95	94.457	Lepisosteus_oculatus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.679	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	96	99.679	Loxodonta_africana
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	96	99.466	Macaca_fascicularis
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	96	99.466	Macaca_nemestrina
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	96	99.466	Mandrillus_leucophaeus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	94.239	ENSMAMG00000022190	eftud2	95	94.239	Mastacembelus_armatus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.804	ENSMZEG00005022885	eftud2	95	93.804	Maylandia_zebra
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	97.974	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	96	97.974	Meleagris_gallopavo
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.786	ENSMAUG00000021178	Eftud2	96	99.786	Mesocricetus_auratus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	ENSMICG00000016592	EFTUD2	96	99.466	Microcebus_murinus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.893	ENSMOCG00000009039	-	96	99.893	Microtus_ochrogaster
ENSJJAG00000018268	Eftud2	90	81.146	ENSMOCG00000017653	-	84	81.168	Microtus_ochrogaster
ENSJJAG00000018268	Eftud2	91	93.882	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	93.882	Mola_mola
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.252	ENSMODG00000011347	EFTUD2	96	99.252	Monodelphis_domestica
ENSJJAG00000018268	Eftud2	91	92.118	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.118	Monopterus_albus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.573	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	96	99.573	Mus_caroli
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.573	ENSMUSG00000020929	Eftud2	96	99.573	Mus_musculus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.573	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	96	99.573	Mus_pahari
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.573	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	96	99.573	Mus_spretus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	97	99.449	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	87	99.449	Mustela_putorius_furo
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	96	99.466	Myotis_lucifugus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.786	ENSNGAG00000017834	Eftud2	96	99.786	Nannospalax_galili
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.696	ENSNBRG00000020081	eftud2	95	93.696	Neolamprologus_brichardi
ENSJJAG00000018268	Eftud2	97	97.569	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	92	97.569	Nomascus_leucogenys
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	95.874	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	95	95.874	Notamacropus_eugenii
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	91.205	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	95	91.205	Ochotona_princeps
ENSJJAG00000018268	Eftud2	91	79.741	ENSODEG00000003385	-	94	79.741	Octodon_degus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	98.718	ENSODEG00000018041	-	96	98.718	Octodon_degus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.804	ENSONIG00000000912	eftud2	95	93.804	Oreochromis_niloticus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.679	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	96	99.679	Oryctolagus_cuniculus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.587	ENSORLG00000003109	eftud2	95	93.587	Oryzias_latipes
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.587	ENSORLG00020009865	eftud2	95	93.587	Oryzias_latipes_hni
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.587	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.573	Oryzias_latipes_hsok
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	97.115	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	96	97.115	Otolemur_garnettii
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	ENSOARG00000009078	EFTUD2	94	99.466	Ovis_aries
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.573	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	96	99.573	Pan_paniscus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	96	99.466	Panthera_pardus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	96	99.466	Panthera_tigris_altaica
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.573	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	96	99.573	Pan_troglodytes
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	ENSPANG00000021284	EFTUD2	96	99.466	Papio_anubis
ENSJJAG00000018268	Eftud2	93	97.015	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	95	97.015	Pelodiscus_sinensis
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	85.978	ENSPMGG00000007281	eftud2	95	85.978	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.786	ENSPEMG00000005129	Eftud2	96	99.786	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.252	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	96	99.252	Phascolarctos_cinereus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	94.022	ENSPFOG00000008515	eftud2	95	94.022	Poecilia_formosa
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	94.022	ENSPLAG00000010393	eftud2	95	94.022	Poecilia_latipinna
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	94.022	ENSPMEG00000005087	eftud2	95	94.022	Poecilia_mexicana
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	97.970	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	96	97.970	Pongo_abelii
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	95.765	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	95	95.765	Procavia_capensis
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.359	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	96	99.359	Propithecus_coquereli
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	94.897	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	95	94.897	Pteropus_vampyrus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.696	ENSPNYG00000012448	eftud2	95	93.696	Pundamilia_nyererei
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	94.124	ENSPNAG00000012490	eftud2	95	94.124	Pygocentrus_nattereri
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.679	ENSRNOG00000002818	Eftud2	96	99.679	Rattus_norvegicus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.359	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	96	99.359	Rhinopithecus_bieti
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.359	ENSRROG00000042925	EFTUD2	96	99.359	Rhinopithecus_roxellana
ENSJJAG00000018268	Eftud2	94	34.424	YKL173W	SNU114	91	34.672	Saccharomyces_cerevisiae
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	96	99.466	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.252	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	99	99.252	Sarcophilus_harrisii
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	94.022	ENSSFOG00015023272	eftud2	95	94.022	Scleropages_formosus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.370	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	90.353	Scophthalmus_maximus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.913	ENSSDUG00000022675	eftud2	95	93.913	Seriola_dumerili
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	94.022	ENSSLDG00000001595	eftud2	95	94.022	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	90.705	ENSSARG00000008664	EFTUD2	96	90.705	Sorex_araneus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	97.436	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	96	97.436	Sphenodon_punctatus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.913	ENSSPAG00000016235	eftud2	94	93.913	Stegastes_partitus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	96	99.466	Sus_scrofa
ENSJJAG00000018268	Eftud2	87	97.317	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	99	97.317	Taeniopygia_guttata
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	92.935	ENSTRUG00000016422	eftud2	95	92.935	Takifugu_rubripes
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	88.203	ENSTNIG00000005346	eftud2	94	88.095	Tetraodon_nigroviridis
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	93.590	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	96	93.590	Tupaia_belangeri
ENSJJAG00000018268	Eftud2	94	96.368	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	96.368	Tursiops_truncatus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	98.504	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	96	98.504	Ursus_americanus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	96	99.466	Ursus_maritimus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	84	100.000	Vicugna_pacos
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	96	99.466	Vulpes_vulpes
ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	94.872	ENSXETG00000003394	eftud2	98	95.865	Xenopus_tropicalis
ENSJJAG00000018268	Eftud2	84	93.495	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	Xiphophorus_couchianus
ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	94.022	ENSXMAG00000008494	eftud2	95	94.022	Xiphophorus_maculatus