EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSJJAG00000020731 (Gene tree)
Gene ID: 101604939
Gene Symbol: Polr1e
Alias: 53kDa|D030019D19Rik|Paf53|Praf1
Full Name: RNA polymerase I subunit E
Gene Type: protein_coding
Species: Jaculus_jaculus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 23673 bases
Position: chrJH725462.1:1617228-1640900
Accession: 101604939
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSJJAP00000019902	RNA_pol_I_A49	PF06870.12	1.8e-106	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSJJAT00000026440	-	1515	XM_004658459	ENSJJAP00000019902	434 (aa)	XP_004658516	-

Gene Model

Click here to download ENSJJAG00000020731's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSJJAG00000020731's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	81.295	ENSG00000137054	POLR1E	99	81.295	Homo_sapiens
ENSJJAG00000020731	Polr1e	95	42.512	ENSAPOG00000012452	polr1e	99	42.512	Acanthochromis_polyacanthus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	99	74.790	ENSAMEG00000010193	POLR1E	99	74.370	Ailuropoda_melanoleuca
ENSJJAG00000020731	Polr1e	90	44.924	ENSACIG00000009884	polr1e	99	44.924	Amphilophus_citrinellus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	94	45.255	ENSAOCG00000005665	polr1e	98	45.255	Amphiprion_ocellaris
ENSJJAG00000020731	Polr1e	94	45.012	ENSAPEG00000020581	polr1e	98	45.012	Amphiprion_percula
ENSJJAG00000020731	Polr1e	93	46.814	ENSATEG00000020609	polr1e	98	46.814	Anabas_testudineus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	77	54.474	ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	54.474	Anas_platyrhynchos
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	82.494	ENSANAG00000038046	POLR1E	99	82.494	Aotus_nancymaae
ENSJJAG00000020731	Polr1e	94	44.282	ENSACLG00000013685	polr1e	97	44.282	Astatotilapia_calliptera
ENSJJAG00000020731	Polr1e	95	42.067	ENSAMXG00000018181	polr1e	99	42.067	Astyanax_mexicanus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	82.734	ENSBTAG00000012243	POLR1E	99	82.734	Bos_taurus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	86	81.720	ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	81.720	Callithrix_jacchus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	84.173	ENSCAFG00000002377	POLR1E	99	84.173	Canis_familiaris
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	84.412	ENSCAFG00020017851	POLR1E	99	84.412	Canis_lupus_dingo
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	81.490	ENSCHIG00000019479	POLR1E	99	81.490	Capra_hircus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	82.494	ENSTSYG00000002075	POLR1E	99	82.494	Carlito_syrichta
ENSJJAG00000020731	Polr1e	66	86.411	ENSCAPG00000015653	POLR1E	99	86.411	Cavia_aperea
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	85.337	ENSCPOG00000009965	POLR1E	99	85.337	Cavia_porcellus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	75.060	ENSCCAG00000029460	POLR1E	99	75.060	Cebus_capucinus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	80.336	ENSCATG00000031732	POLR1E	99	83.186	Cercocebus_atys
ENSJJAG00000020731	Polr1e	86	87.903	ENSCLAG00000012701	POLR1E	98	87.903	Chinchilla_lanigera
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	80.096	ENSCSAG00000010782	POLR1E	99	80.096	Chlorocebus_sabaeus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	91	73.604	ENSCHOG00000013024	POLR1E	83	73.604	Choloepus_hoffmanni
ENSJJAG00000020731	Polr1e	94	65.610	ENSCPBG00000006923	POLR1E	99	65.854	Chrysemys_picta_bellii
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	79.856	ENSCANG00000036112	POLR1E	99	83.036	Colobus_angolensis_palliatus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	97	84.487	ENSCGRG00001006197	Polr1e	97	84.487	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSJJAG00000020731	Polr1e	97	84.010	ENSCGRG00000006430	Polr1e	97	84.010	Cricetulus_griseus_crigri
ENSJJAG00000020731	Polr1e	93	43.382	ENSCSEG00000005121	polr1e	98	43.382	Cynoglossus_semilaevis
ENSJJAG00000020731	Polr1e	93	42.647	ENSCVAG00000019759	polr1e	98	42.647	Cyprinodon_variegatus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	91	44.332	ENSDARG00000006434	polr1e	98	43.447	Danio_rerio
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	73.448	ENSDNOG00000010257	POLR1E	99	73.233	Dasypus_novemcinctus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	82	78.492	ENSETEG00000018204	POLR1E	99	78.492	Echinops_telfairi
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	84.892	ENSEASG00005000675	POLR1E	99	84.892	Equus_asinus_asinus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	84.892	ENSECAG00000014669	POLR1E	99	84.892	Equus_caballus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	91	71.320	ENSEEUG00000011928	POLR1E	84	71.320	Erinaceus_europaeus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	93	45.833	ENSELUG00000008150	polr1e	97	45.833	Esox_lucius
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	82.254	ENSFCAG00000013081	POLR1E	99	82.254	Felis_catus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	91	60.560	ENSFALG00000012950	POLR1E	99	60.560	Ficedula_albicollis
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	85.577	ENSFDAG00000016917	POLR1E	99	85.577	Fukomys_damarensis
ENSJJAG00000020731	Polr1e	94	44.310	ENSFHEG00000009801	polr1e	98	44.310	Fundulus_heteroclitus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	94	39.130	ENSGMOG00000003336	POLR1E	97	39.713	Gadus_morhua
ENSJJAG00000020731	Polr1e	95	61.259	ENSGALG00000005395	POLR1E	99	61.259	Gallus_gallus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	93	44.417	ENSGAFG00000004850	polr1e	98	44.417	Gambusia_affinis
ENSJJAG00000020731	Polr1e	93	42.892	ENSGACG00000016087	polr1e	98	42.892	Gasterosteus_aculeatus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	94	59.169	ENSGAGG00000001659	POLR1E	98	59.367	Gopherus_agassizii
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	81.055	ENSGGOG00000001882	POLR1E	99	82.301	Gorilla_gorilla
ENSJJAG00000020731	Polr1e	94	44.769	ENSHBUG00000002559	polr1e	97	44.769	Haplochromis_burtoni
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	87.019	ENSHGLG00000002036	POLR1E	99	87.019	Heterocephalus_glaber_female
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	87.260	ENSHGLG00100012784	POLR1E	99	87.260	Heterocephalus_glaber_male
ENSJJAG00000020731	Polr1e	93	45.343	ENSHCOG00000002774	polr1e	98	45.343	Hippocampus_comes
ENSJJAG00000020731	Polr1e	94	41.990	ENSIPUG00000003019	polr1e	98	41.990	Ictalurus_punctatus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	83.693	ENSSTOG00000009810	POLR1E	99	83.693	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	94	42.718	ENSKMAG00000000046	polr1e	98	42.718	Kryptolebias_marmoratus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	93	46.305	ENSLBEG00000003104	polr1e	97	46.173	Labrus_bergylta
ENSJJAG00000020731	Polr1e	82	62.604	ENSLACG00000003416	POLR1E	99	62.604	Latimeria_chalumnae
ENSJJAG00000020731	Polr1e	94	51.338	ENSLOCG00000012859	polr1e	98	51.338	Lepisosteus_oculatus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	97	82.898	ENSLAFG00000012831	POLR1E	100	82.898	Loxodonta_africana
ENSJJAG00000020731	Polr1e	98	79.765	ENSMFAG00000045465	POLR1E	99	83.186	Macaca_fascicularis
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	80.576	ENSMMUG00000017892	POLR1E	99	83.186	Macaca_mulatta
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	74.883	ENSMNEG00000040283	POLR1E	99	81.858	Macaca_nemestrina
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	80.576	ENSMLEG00000031135	POLR1E	99	83.186	Mandrillus_leucophaeus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	93	45.343	ENSMAMG00000001260	polr1e	97	45.343	Mastacembelus_armatus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	94	44.282	ENSMZEG00005021536	polr1e	97	44.282	Maylandia_zebra
ENSJJAG00000020731	Polr1e	100	81.797	ENSMAUG00000021044	Polr1e	100	81.797	Mesocricetus_auratus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	83.213	ENSMICG00000003673	POLR1E	99	83.213	Microcebus_murinus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	99	82.679	ENSMOCG00000012920	Polr1e	99	82.679	Microtus_ochrogaster
ENSJJAG00000020731	Polr1e	93	44.743	ENSMMOG00000007391	polr1e	98	44.743	Mola_mola
ENSJJAG00000020731	Polr1e	91	71.717	ENSMODG00000002884	POLR1E	97	71.717	Monodelphis_domestica
ENSJJAG00000020731	Polr1e	93	45.146	ENSMALG00000002665	polr1e	97	45.146	Monopterus_albus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	99	79.215	MGP_CAROLIEiJ_G0025967	Polr1e	97	81.934	Mus_caroli
ENSJJAG00000020731	Polr1e	99	79.677	ENSMUSG00000028318	Polr1e	97	82.188	Mus_musculus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	99	80.370	MGP_PahariEiJ_G0024114	Polr1e	97	82.952	Mus_pahari
ENSJJAG00000020731	Polr1e	99	79.446	MGP_SPRETEiJ_G0026930	Polr1e	97	81.934	Mus_spretus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	97	74.735	ENSMPUG00000006040	POLR1E	100	74.522	Mustela_putorius_furo
ENSJJAG00000020731	Polr1e	99	80.607	ENSMLUG00000012688	POLR1E	99	80.607	Myotis_lucifugus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	100	85.484	ENSNGAG00000002520	Polr1e	100	85.484	Nannospalax_galili
ENSJJAG00000020731	Polr1e	94	45.012	ENSNBRG00000016822	polr1e	97	45.012	Neolamprologus_brichardi
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	80.815	ENSNLEG00000003616	POLR1E	99	82.301	Nomascus_leucogenys
ENSJJAG00000020731	Polr1e	70	75.000	ENSMEUG00000015372	-	80	75.000	Notamacropus_eugenii
ENSJJAG00000020731	Polr1e	83	71.031	ENSOPRG00000014206	POLR1E	100	71.031	Ochotona_princeps
ENSJJAG00000020731	Polr1e	99	84.651	ENSODEG00000014565	POLR1E	100	84.651	Octodon_degus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	97	44.289	ENSONIG00000008921	polr1e	97	45.255	Oreochromis_niloticus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	82.974	ENSOCUG00000024773	POLR1E	99	82.974	Oryctolagus_cuniculus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	94	43.932	ENSORLG00000005143	polr1e	99	43.932	Oryzias_latipes
ENSJJAG00000020731	Polr1e	88	43.669	ENSORLG00020007271	polr1e	99	43.669	Oryzias_latipes_hni
ENSJJAG00000020731	Polr1e	94	43.447	ENSORLG00015000137	polr1e	99	43.447	Oryzias_latipes_hsok
ENSJJAG00000020731	Polr1e	93	43.382	ENSOMEG00000013264	polr1e	96	43.382	Oryzias_melastigma
ENSJJAG00000020731	Polr1e	98	82.824	ENSOGAG00000012981	POLR1E	99	82.824	Otolemur_garnettii
ENSJJAG00000020731	Polr1e	99	79.908	ENSOARG00000011465	POLR1E	99	79.908	Ovis_aries
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	81.055	ENSPPAG00000034566	POLR1E	99	83.186	Pan_paniscus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	82.014	ENSPPRG00000005649	POLR1E	99	82.014	Panthera_pardus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	82.014	ENSPTIG00000009774	POLR1E	99	82.014	Panthera_tigris_altaica
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	81.055	ENSPTRG00000020944	POLR1E	99	83.186	Pan_troglodytes
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	80.576	ENSPANG00000025563	POLR1E	99	83.186	Papio_anubis
ENSJJAG00000020731	Polr1e	94	46.265	ENSPKIG00000003562	polr1e	99	46.265	Paramormyrops_kingsleyae
ENSJJAG00000020731	Polr1e	88	63.708	ENSPSIG00000003274	POLR1E	90	63.708	Pelodiscus_sinensis
ENSJJAG00000020731	Polr1e	91	43.000	ENSPMGG00000024169	polr1e	96	43.000	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	100	82.028	ENSPEMG00000019151	-	100	82.028	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSJJAG00000020731	Polr1e	100	67.356	ENSPEMG00000022300	-	100	67.356	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSJJAG00000020731	Polr1e	91	71.465	ENSPCIG00000014798	POLR1E	97	71.465	Phascolarctos_cinereus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	94	43.218	ENSPFOG00000019627	polr1e	98	43.218	Poecilia_formosa
ENSJJAG00000020731	Polr1e	94	44.769	ENSPLAG00000022679	polr1e	98	44.769	Poecilia_latipinna
ENSJJAG00000020731	Polr1e	82	44.722	ENSPMEG00000022123	polr1e	93	44.722	Poecilia_mexicana
ENSJJAG00000020731	Polr1e	93	44.175	ENSPREG00000009470	polr1e	98	44.175	Poecilia_reticulata
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	80.096	ENSPPYG00000019061	POLR1E	99	80.096	Pongo_abelii
ENSJJAG00000020731	Polr1e	54	83.475	ENSPCAG00000004891	POLR1E	77	83.475	Procavia_capensis
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	83.933	ENSPCOG00000027448	POLR1E	99	83.933	Propithecus_coquereli
ENSJJAG00000020731	Polr1e	91	84.772	ENSPVAG00000007940	POLR1E	83	84.772	Pteropus_vampyrus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	94	44.526	ENSPNYG00000001032	polr1e	97	44.526	Pundamilia_nyererei
ENSJJAG00000020731	Polr1e	94	42.233	ENSPNAG00000006987	polr1e	99	42.233	Pygocentrus_nattereri
ENSJJAG00000020731	Polr1e	100	81.567	ENSRNOG00000012664	Polr1e	100	81.567	Rattus_norvegicus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	93	78.765	ENSRBIG00000034214	POLR1E	100	80.315	Rhinopithecus_bieti
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	80.096	ENSRROG00000031986	POLR1E	99	83.186	Rhinopithecus_roxellana
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	81.055	ENSSBOG00000021415	POLR1E	99	81.055	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSJJAG00000020731	Polr1e	82	69.081	ENSSHAG00000016084	POLR1E	99	69.081	Sarcophilus_harrisii
ENSJJAG00000020731	Polr1e	94	47.073	ENSSFOG00015002293	polr1e	98	47.073	Scleropages_formosus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	99	46.882	ENSSMAG00000011672	polr1e	96	46.296	Scophthalmus_maximus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	95	46.506	ENSSDUG00000022279	polr1e	98	46.506	Seriola_dumerili
ENSJJAG00000020731	Polr1e	95	47.115	ENSSLDG00000024918	polr1e	98	47.115	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSJJAG00000020731	Polr1e	62	71.983	ENSSARG00000009810	-	67	71.983	Sorex_araneus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	94	64.078	ENSSPUG00000009499	POLR1E	99	64.078	Sphenodon_punctatus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	94	46.472	ENSSPAG00000021240	polr1e	98	46.472	Stegastes_partitus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	85.372	ENSSSCG00000005347	POLR1E	99	85.372	Sus_scrofa
ENSJJAG00000020731	Polr1e	91	52.822	ENSTGUG00000007169	POLR1E	99	52.822	Taeniopygia_guttata
ENSJJAG00000020731	Polr1e	94	42.615	ENSTRUG00000020779	polr1e	99	43.307	Takifugu_rubripes
ENSJJAG00000020731	Polr1e	93	43.032	ENSTNIG00000017812	polr1e	98	43.032	Tetraodon_nigroviridis
ENSJJAG00000020731	Polr1e	97	81.324	ENSTBEG00000013786	POLR1E	89	81.324	Tupaia_belangeri
ENSJJAG00000020731	Polr1e	91	84.383	ENSTTRG00000008294	POLR1E	84	84.383	Tursiops_truncatus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	83.933	ENSUAMG00000012474	POLR1E	99	85.753	Ursus_americanus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	83.933	ENSUMAG00000011496	POLR1E	99	83.933	Ursus_maritimus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	79	78.886	ENSVPAG00000009048	POLR1E	81	78.886	Vicugna_pacos
ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	84.652	ENSVVUG00000019954	POLR1E	99	84.652	Vulpes_vulpes
ENSJJAG00000020731	Polr1e	95	51.208	ENSXETG00000006533	polr1e	99	51.208	Xenopus_tropicalis
ENSJJAG00000020731	Polr1e	93	44.660	ENSXCOG00000013706	polr1e	98	44.660	Xiphophorus_couchianus
ENSJJAG00000020731	Polr1e	93	45.146	ENSXMAG00000012484	polr1e	98	45.146	Xiphophorus_maculatus